Sign In

A subscription to JoVE is required to view this content.

live

Speed

×

MEDIA_ELEMENT_ERROR: Format error

הפקת סוניקציה של סמנים ביולוגיים שומנים ממ משקעים

Overview

מקור: המעבדה של ג'ף סלקופ - אוניברסיטת מסצ'וסטס אמהרסט

החומר הכולל את החלק "האורגני" החי של כל מערכת אקולוגית (עלים, פטריות, קליפה, רקמה; איור 1) שונה ביסודו מהחומר של החלק "הלא אורגני" הלא חי (סלעים והמינרלים המרכיבים שלהם, חמצן, מים, מתכות). חומר אורגני מכיל פחמן המקושר לסדרה של מולקולות פחמן ומימן אחרות (איור 2),המבדילות אותו מחומר אנאורגני. טווח הערך הרחב של Carbon (-4 עד +4) מאפשר לו ליצור עד ארבעה קשרים קוולנטיים נפרדים עם אטומים שכנים, בדרך כלל C, H, O, N, S ו- P. הוא יכול גם לחלוק עד שלושה קשרים קוולנטיים עם אטום אחד אחר, כגון הקשר המשולש בקבוצה ציאניד רעיל לעתים קרובות, או ניטריל. במהלך 4.6 מיליארד השנים האחרונות, גמישות זו הובילה למגוון מדהים של מבנים כימיים, המשתנים בגודלם, במורכבותם, בקוטביות, בצורה ובתפקודם. התחום המדעי של הגיאוכימיה האורגנית עוסק בזיהוי ואפיון של כל מגוון התרכובות האורגניות הניתנות לגילוי, הנקראות סמנים ביולוגיים, המיוצרים על ידי החיים על פני כדור הארץ, כמו גם אחרים, באמצעות זמן גיאולוגי.

Figure 1
איור 1. חומרים אורגניים, כגון עצים, עלים וטחב, נבדלים מבחינה כימית וחזותית מחומר אנאורגני, כגון מדרכה.

Procedure

1. איסוף החומרים הדרושים

  1. דגימות (עלים, לכלוך, פטריות, קליפה, רקמה), בדרך כלל קפוא, מיובש בהקפאה, כתוש, הומוגני לפני החילוץ, מופק בקבוצות כדי למקסם את היעילות. לחלץ שלוש דגימות.
  2. בהתאם לגודל המדגם, בקבוקונים עם נפחים הנעים בין 4-60 מ"ל עשויים לשמש. לניסוי זה, בקבוקוני זכוכית בורוסיליקט (40 ...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Results

בסוף החילוץ, תמצית שומנים הכוללת (TLE) עבור כל מדגם ניכר. כל מקטורן מכיל את החומר האורגני שניתן לחלץ ממ משקעים, אדמה או רקמת צמח. TLEs אלה עכשיו ניתן לנתח ואת המרכיבים הכימיים שלהם מזוהים וכימות.

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Application and Summary

סוגים שונים של סמנים ביולוגיים להקנות מידע על היבטים ספציפיים של מערכת כדור הארץ. לדוגמה, בחיתוליו, גיאוכימיה אורגנית עסקה בעיקר בהיווצרות, הגירה ושינוי של נפט, ורבים מהכלים הכימיים שהגיאוכימאים האורגניים משתמשים בהם כיום מבוססים על אותן חקירות ראשוניות. באמצעות חקירה של סוג של תרכובות ה...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Skip to...

0:00

Overview

0:59

Principles of Lipid Extraction by Sonication

2:35

Sample Collection and Glassware Preparation

3:26

Sonication

5:13

Applications

6:55

Summary

We use cookies to enhance your experience on our website.

By continuing to use our website or clicking “Continue”, you are agreeing to accept our cookies.

Learn More