JoVE Logo

Sign In

Extraction de biomarqueurs à partir de sédiments - Extraction accélérée par solvant

Overview

Source : Laboratoire de Jeff Sanoussi - University of Massachusetts Amherst

La distribution d’un groupe de biomarqueurs organiques appelée glycérol-dialkyl glycérol-tetraethers (GDGTs), produit par une suite d’archaea et bactéries, ont été trouvés dans des sédiments modernes à changer d’une manière prévisible en réponse à l’air ou l’eau température1,2. Par conséquent, la distribution de ces biomarqueurs dans une séquence de sédiments d’âge connu peut servir à reconstituer l’évolution de la température de l’air et/ou l’eau sur des échelles de temps décennales au millénaire (Figure 1). La production d’enregistrements de temps à haute résolution des climats passés, appelés paléoclimatologie, dépend de l’analyse rapide des centaines, peut-être des milliers d’échantillons. Des techniques d’extraction plus âgés, comme la sonication ou Soxhlet, sont trop lents. Cependant, la technique de Accelerated Solvent Extraction plus récente a été conçue avec efficacité à l’esprit.

Figure 1
Figure 1. Un exemple d’enregistrement paléoclimat indiquant des changements dans la température de surface de mer (SST) dans l’est de la mer Méditerranée au cours des dernières années ~ 27 0003. Ce disque comprend ~ 115 échantillons et repose sur l’isoprenoidal proxy86 SST GDGT basé sur TEX.

Procedure

1. collecte des matériaux nécessaires

  1. Extraire des échantillons. Échantillons (dans ce cas, sédiments) sont gelés, lyophilisés, écrasés et homogénéisés avant l’extraction et extraite en groupes afin de maximiser l’efficacité.
  2. Selon la taille de l’échantillon, utiliser les flacons de collection avec des volumes de 40 ou 60 mL. Pour cette expérience, les flacons en verre de borosilicate (40 mL) et solvants sécuritaires casquettes sont utilisés. Brûler les flacons, pipettes en v...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Results

À la fin de l’extraction, il y a un extrait de lipides totaux (TLE) pour chaque échantillon. Chaque flacon contient maintenant la matière organique extractible de sédiment, sol ou des tissus végétaux. Ces DFIT peut être analysés et leurs constituants chimiques identifiés et quantifiés.

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Application and Summary

Le DFIT des échantillons extraits contiennent un large éventail de différents composés organiques, y compris les GDGTs qui serviront à reconstruire les températures antiques. Glycérol-dialkyl glycérol-tetraethers sont une grande suite de biomarqueurs qui montrent la sensibilité aux températures de croissance. Il y a deux groupes de GDGTs, ramifiés et isoprénoïdes, qui se distinguent par le caractère des patrons des ramification sur les groupes alkyles de base ()Figure 3). D...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

References
  1. Schouten, S. et al. Distributional variations in marine crenarchaeotal membrane lipids: a new tool for reconstructing ancient sea water temperatures?, Earth and Planetary Science Letters204(1-2), 265-274 (2002).
  2. Weijers, J. W. H. et al. Environmental controls on bacterial tetraether membrane lipid distribution in soils, Geochimica et Cosmochimica Acta71(3), 703-713 (2007).
  3. Castaneda, I. S. et al. Millennial-scale sea surface temperature changes in the eastern Mediterranean (Nile River Delta region) over the last 27,000 years, Paleoceanography, 25, 13 (2010).
  4. Damste, J. S. S. et al. Crenarchaeol: the characteristic core glycerol dibiphytanyl glycerol tetraether membrane lipid of cosmopolitan pelagic crenarchaeota, J Lipid Res, 43(10), 1641-1651 (2002).
  5. Hopmans, E. C. et al. A novel proxy for terrestrial organic matter in sediments based on branched and isoprenoid tetraether lipids, Earth and Planetary Science Letters224(1-2), 107-116 (2004).
  6. Tierney, J. E., Russell J. M. Distributions of branched GDGTs in a tropical lake system: Implications for lacustrine application of the MBT/CBT paleoproxy, Organic Geochemistry40(9), 1032-1036 (2009).
  7. Damste, J. S. S. et al. 13,16-Dimethyl Octacosanedioic Acid (iso-Diabolic Acid), a Common Membrane-Spanning Lipid of Acidobacteria Subdivisions 1 and 3, Appl Environ Microb, 77(12), 4147-4154 (2011).
Tags
ExtractionBiomarkersSedimentsAccelerated Solvent ExtractionASE MethodOrganic BiomarkersGeological Sediment SamplesSonicationSoxhletPaleoclimate ReconstructionHigh TemperaturesHigh PressureMultiple SamplesFast Preparation RunVideo TutorialSteel CellsCarouselCollection VialsInternal OvenSolvent Bottle

Skip to...

0:00

Overview

1:05

Principles of Accelerated Solvent Extraction

2:23

Collection of Sample Materials and Preparation of ASE Cells

3:48

Preparation of Collection Vials and Extraction

4:49

Applications

6:18

Summary

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved