細菌のコロニーからコミュニティの DNA の抽出

ソース: ドクターペッパー イアン博士チャールズ Gerba - アリゾナ大学所
示す著者: ルイーザ Ikner

土壌内の微生物群集の解析の従来の方法は通常どちらかの文化の試金希釈の利用と選択的な差動媒体または直接カウントの試金の方法論をめっきを関与しています。直接カウントは存在する細菌の総数に関する情報を提供が、数や人口の地域内に存在の多様性についての情報を与えない。プレート カウントは、文化全体の列挙または選択した文化集団、したがって別の集団の存在に関する情報を提供します。しかし、土壌細菌の 1% 未満は容易に培養可能なので文化情報は画像の一部だけを提供します。培養できるコミュニティの実際の割合は、文化カウント中の選択に依存します。1 つのメディアは、特定の媒体に最適です集団の選択されます。

近年、土壌サンプルから抽出したコミュニティ DNA を学ぶメリットが明らかになります。この nonculture ベースのアプローチは文化ベースのアプローチよりもより実際のコミュニティの存在の代表と考えられています。現在人口の種類についての情報を提供することに加えてこのアプローチはまた彼らの遺伝的潜在能力について情報を提供できます。あらゆる技術と DNA の抽出で得ることができるデータには制限があります。したがって、多くの研究者は環境サンプルから得られたデータを最大限に今直接、文化的なカウントと共に DNA の抽出を使用します。