Name: small volume (1-3l) filtration of coastal seawater samples
Uploaded: 2009-06-19T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples at JoVE.com

<p class="jove_content" style=";text-align:right;direction:rtl"> ברצוננו להודות לקרן קנדית עבור חדשנות, פיתוח קולומביה הבריטית קרן ידע מדעי הלאומי וההנדסה מועצת המחקר (NSERC) של קנדה לתמיכה מחקרים מתמשכים על אזורים חמצן נמוכה של מים חופי האוקיינוס ​​הפתוח. דאו נתמכה על ידי מלגות של NSERC, Killam ויסוד טולה מרכז מימנה עבור גיוון התפתחות חיידקים. </p>

<ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> <strong>הגדרת מנגנון סינון</strong> <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לפני סינון, תחילה למחות כל התעבות של בקבוקים מלאים ולשקול אותם </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הצב בן החיטוי בצד אחד של המשאבה, ואת בקבוק פסולת מאידך. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אז ב...

<p class="jove_content" style=";text-align:right;direction:rtl"> זה הכרחי כדי לנגב את ספסלי משאבות במגבת לחה לאחר השימוש כדי להסיר כל עקבות המתמשכת של מי מלח שאחרת לשיתוק ציוד. למרות ההליך הוא פשוט, הדרישה זמן יכול להיות נרחב תלוי בריכוז של ביומסה או פסולת במדגם להיות מסונן. </p>

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Peristaltic pump</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Masterflex (Cole Palmer)</td>
<td>77913-20, 77200-62, 77200-04</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Tygon LFL tubing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Masterflex (Cole Palmer)</td>
<td>06429-24</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Hose clamps</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>0683204</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>1/4&#x201D; x 3/16&#x201D;  pipe adaptors</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>31702-20</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Polypropylene prefilter housing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>ADVANTEC</td>
<td>501200</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Metal luer fitting (Hose end to Male luer lock)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>31507-27</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>2&#x201C; Magnets</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>3 port carboy caps</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>GV 0.22 &mu;m STERIVIX filters</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Millipore</td>
<td>SVGV01R5</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>47 mm diameter 2.7 &mu;m GF/D filters</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Whatman</td>
<td>1823047</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Lysis buffer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>0.75 M sucrose, 40 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.3)</td>
</tr>
<tr>
<td>0.1 % HCl</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For post-filtration rinse</td>
</tr>
<tr>
<td>Autoclaved water</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For post-filtration rinse</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

small volume (1-3l) filtration of coastal seawater samples

<p class="jove_content">עבודה מתחיל עם איסוף המים ימית החוף למען הקהילה חיידקים במורד הזרם, מנתח גז מזין עקבות. לקבלת דוגמיות הפגנה של היום נאספו סיפון ההפעלה ג&#39;ון סטריקלנד HMS ב Inlet Saanich. זה מסמכים וידאו נפח קטן (~ 1 L) סינון של ביומסה של חיידקים מעמודת המים. הפרוטוקול הוא הרחבה של פרוטוקול גדול הדגימה נפח שתוארו קודם לכן, עם הבדל אחד משמעותי: כאן, אין שום צעד סינון מראש, ולכן כל המעמדות גודל של ביומסה נאספים עד 0.22 מיקרומטר לסנן חתוכים. דוגמאות שנאספו בדרך זו הם אידיאליים עבור ניתוח חומצות גרעין. הצעדים הגדרת, סינון, ו לנקות כל אחד לקחת על 20-30 דקות. אם באמצעות שתי משאבות peristaltic בו זמנית, עד 8 דגימות ניתן לסנן באותו זמן. כדי למנוע היווצרות biofilm בין טיולים הדגימה, כל הציוד סינון חייב להיות שטוף עם HCl לדלל במים deionized ו autoclaved מיד לאחר השימוש.</p>

Watch this Scientific Journal Video about Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples at JoVE.com

Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples

<p class="jove_content">זה מסמכים וידאו נפח קטן (~ 1 L) סינון של ביומסה של חיידקים מעמודת המים.</p>

נפח קטן (1-3L) סינון של דגימות מי ים החוף

The workflow begins with the collection of coastal marine waters for downstream microbial community, nutrient and trace gas analyses. For today s ...

Research

Education

JoVE Core

JoVE Journal

Analytical Chemistry

Biology

Unit 1

Small Volume (1-3L) Filtration of Coastal Seawater Samples

Introduction to Separation Methods

SCIENTISTS IN ACTION

Seawater Sampling and Collection

מי ים דגימה אוסף

This video documents methods for collecting coastal marine water samples and processing them for various downstream applications including biomass ...

Large Volume (20L+) Filtration of Coastal Seawater Samples

Large Volume 20L+ Filtration of Coastal Seawater Samples

נפח גדול (20L +) סינון של דגימות מי ים החוף

The workflow begins with the collection of coastal marine waters for downstream microbial community, nutrient and trace gas analyses. For this method, ...

Absolute Quantum Yield Measurement of Powder Samples

מדידה אבסולוטית קוונטית תשואה של דוגמאות אבקת

Measurement of fluorescence quantum yield has become an important tool in the search for new solutions in the development, evaluation, quality control and ...

Substrate Generation for Endonucleases of CRISPR/Cas Systems

דור מצע לEndonucleases של מערכות CRISPR / קאש

The  interaction of viruses and their prokaryotic hosts shaped the evolution of  bacterial and archaeal life. Prokaryotes developed several strategies to ...

A High-throughput Method for Measurement of Glomerular Filtration Rate in Conscious Mice

שיטת תפוקה גבוהה למדידה של קצב סינון הגלומרולרי בעכברים בהכרה

The measurement of  glomerular filtration rate (GFR) is the gold standard in kidney function  assessment. Currently, investigators determine GFR by ...

Rapid Isolation And Purification Of Mitochondria For Transplantation By Tissue Dissociation And Differential Filtration

בידוד מהיר וטיהור של מיטוכונדריה להשתלה על ידי דיסוציאציה רקמות ודיפרנציאל סינון

Previously described mitochondrial isolation methods using differential centrifugation and/or Ficoll gradient centrifugation require 60 to 100 min to ...

Physiology Lab Demonstration: Glomerular Filtration Rate in a Rat

הפגנת מעבדה לפיזיולוגיה: גלומרולרי סינון שיעור בחולדה

Measurements of glomerular filtration rate (GFR), and the fractional excretion of sodium (Na) and potassium (K) are critical in assessing renal function ...

Measuring Pressure Volume Loops in the Mouse

מדידת לולאות נפח לחץ העכבר

Understanding the causes and progression of heart disease presents a significant challenge to the biomedical community. The genetic flexibility of the ...

Filtration Isolation of Nucleic Acids:  A Simple and Rapid DNA Extraction Method

בידוד סינון של חומצות גרעין: שיטת הפקת DNA פשוטה ומהירה

FINA, filtration isolation of nucleic acids, is a novel extraction method which utilizes vertical filtration via a separation membrane and absorbent pad ...

Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS Super-region Volume Segmentation Workbench

נפח פילוח וניתוח של חומרים ביולוגיים באמצעות SuRVoS (סופר-אזור אחסון פילוח) עבודה, שעליו מונחים

Segmentation is the process of isolating specific regions or objects within an imaged volume, so that further study can be undertaken on these areas of ...