Name: small volume (1-3l) filtration of coastal seawater samples
Uploaded: 2009-06-19T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples at JoVE.com

<p class="jove_content"> Vi vill tacka det kanadensiska institutet för innovation, British Columbia Kunskap utvecklingsfonden och Statens Sciences and Engineering Research Council (NSERC) i Kanada för att stödja pågående studier på låg syre regioner i kustnära och öppna hav vatten. DAW stöddes av stipendier från NSERC, Killam och Tula stiftelsen finansierade Centrum för Mikrobiell diversitet och evolution. </p>

<ol><li> <strong>Sätt upp av filtreringsapparaten</strong> <ol><li> Före filtrering, först torka bort kondens från den fulla flaskor och väga dem </li><li> Placera en autoklav bin på ena sidan av pumpen, och avfallet kolven på den andra. </li><li> Placera därefter en full prov flaska i autoklaven bin, men inte tar bort locket på flaskan ännu. </li><li> Passera slangen genom peristaltiska pumpen så att luer-änden av slangen i kolven. </li><li> Använda pincett, ta bort bomull från en steril 25 ml-pipett och sätt pipetten i andra ä...

<p class="jove_content"> Det är viktigt att torka av bänkar och pumpar med en fuktig handduk efter användning för att ta bort eventuella kvardröjande spår av salt vatten som annars skulle korrodera utrustning. Även om förfarandet är enkelt, kan den tid som kravet omfattande beroende på koncentrationen av biomassa eller skräp i provet filtreras. </p>

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Peristaltic pump</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Masterflex (Cole Palmer)</td>
<td>77913-20, 77200-62, 77200-04</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Tygon LFL tubing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Masterflex (Cole Palmer)</td>
<td>06429-24</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Hose clamps</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>0683204</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>1/4&#x201D; x 3/16&#x201D;  pipe adaptors</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>31702-20</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Polypropylene prefilter housing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>ADVANTEC</td>
<td>501200</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Metal luer fitting (Hose end to Male luer lock)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>31507-27</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>2&#x201C; Magnets</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>3 port carboy caps</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>GV 0.22 &mu;m STERIVIX filters</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Millipore</td>
<td>SVGV01R5</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>47 mm diameter 2.7 &mu;m GF/D filters</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Whatman</td>
<td>1823047</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Lysis buffer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>0.75 M sucrose, 40 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.3)</td>
</tr>
<tr>
<td>0.1 % HCl</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For post-filtration rinse</td>
</tr>
<tr>
<td>Autoclaved water</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For post-filtration rinse</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

small volume (1-3l) filtration of coastal seawater samples

<p class="jove_content">Arbetsflödet börjar med insamling av kustnära marina vatten för nedströms mikrobiella, närings-och spårgas analyser. För dagens s demonstration togs från däcket på HMS John Strickland verksamma i Saanich Inlet. Denna video dokument liten mängd (~ 1 l) filtrering av mikrobiella biomassan från vattnet. Protokollet är en förlängning av den stora volymen provtagningsprotokoll beskrivits tidigare, med en viktig skillnad: här finns det ingen förfiltrering steg, så alla storleksklasser av biomassa samlas ner till 0,22 ìm filter cut-off. Prover som tagits på detta sätt är idealiska för nukleinsyra analys. Upplägget, filtrering, och sanering steg varje tar cirka 20-30 minuter. Om du använder två peristaltiska pumpar samtidigt, upp till 8 prover kan filtreras på samma gång. För att förhindra att biofilm bildas mellan provtagning resor måste all utrustning för filtrering sköljas med utspädd HCl och avjoniserat vatten och autoklaveras direkt efter användning.</p>

Watch this Scientific Journal Video about Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples at JoVE.com

Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples

<p class="jove_content">Denna video dokument liten mängd (~ 1 l) filtrering av mikrobiella biomassan från vattnet.</p>

Liten mängd (1-3L) Filtrering av Coastal Havsvatten Prover

The workflow begins with the collection of coastal marine waters for downstream microbial community, nutrient and trace gas analyses. For today s ...

Research

Education

JoVE Core

JoVE Journal

Analytical Chemistry

Biology

Unit 1

Small Volume (1-3L) Filtration of Coastal Seawater Samples

Introduction to Separation Methods

SCIENTISTS IN ACTION

Seawater Sampling and Collection

Havsvatten Provtagning och insamling

This video documents methods for collecting coastal marine water samples and processing them for various downstream applications including biomass ...

Large Volume (20L+) Filtration of Coastal Seawater Samples

Large Volume 20L+ Filtration of Coastal Seawater Samples

Stor volym (20L +) Filtrering av Coastal Havsvatten Prover

The workflow begins with the collection of coastal marine waters for downstream microbial community, nutrient and trace gas analyses. For this method, ...

Absolute Quantum Yield Measurement of Powder Samples

Absolut Quantum Yield Mätning av Pulver prov

Measurement of fluorescence quantum yield has become an important tool in the search for new solutions in the development, evaluation, quality control and ...

Substrate Generation for Endonucleases of CRISPR/Cas Systems

Substrat för skapandet endonukleaser av CRISPR / CAS Systems

The  interaction of viruses and their prokaryotic hosts shaped the evolution of  bacterial and archaeal life. Prokaryotes developed several strategies to ...

A High-throughput Method for Measurement of Glomerular Filtration Rate in Conscious Mice

En hög genomströmning metod för mätning av glomerulär filtration Rate i medveten möss

The measurement of  glomerular filtration rate (GFR) is the gold standard in kidney function  assessment. Currently, investigators determine GFR by ...

Rapid Isolation And Purification Of Mitochondria For Transplantation By Tissue Dissociation And Differential Filtration

Snabb Isolering och rening av Mitokondrier För Transplantation Av vävnadsdissociering Och Differential Filtration

Previously described mitochondrial isolation methods using differential centrifugation and/or Ficoll gradient centrifugation require 60 to 100 min to ...

Physiology Lab Demonstration: Glomerular Filtration Rate in a Rat

Fysiologi Lab Demonstration: Glomerular Filtration Rate i en råtta

Measurements of glomerular filtration rate (GFR), and the fractional excretion of sodium (Na) and potassium (K) are critical in assessing renal function ...

Measuring Pressure Volume Loops in the Mouse

Tryckmätning Volym loopar i musen

Understanding the causes and progression of heart disease presents a significant challenge to the biomedical community. The genetic flexibility of the ...

Filtration Isolation of Nucleic Acids:  A Simple and Rapid DNA Extraction Method

Filtrering Isolering av nukleinsyror: En enkel och snabb DNA-extraktion metod

FINA, filtration isolation of nucleic acids, is a novel extraction method which utilizes vertical filtration via a separation membrane and absorbent pad ...

Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS Super-region Volume Segmentation Workbench

Volym segmentering och analys av biologiska material använda Workbench för SuRVoS (Super region volym segmentering)

Segmentation is the process of isolating specific regions or objects within an imaged volume, so that further study can be undertaken on these areas of ...