Name: small volume (1-3l) filtration of coastal seawater samples
Uploaded: 2009-06-19T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples at JoVE.com

<p class="jove_content"> Yenilik, British Columbia Bilgi Kalkınma Fonu ve Ulusal Bilimler ve Mühendislik Araştırma Konseyi (NSERC) Kanada Kanada Vakfı Biz, kıyı ve açık okyanus sularında düşük oksijen bölgelerde devam eden çalışmalar destek için teşekkür etmek istiyorum. DAW NSERC, Killam ve TULA vakıf Mikrobiyal Çeşitlilik ve Evrim finanse Merkezi burs tarafından desteklenmiştir. </p>

<ol><li> <strong>Filtrasyon aparatı ayarlayın</strong> <ol><li> Filtreleme önce, herhangi bir yoğunlaşma ilk tam şişelerden uzak silin ve onları tartmak </li><li> Pompanın bir tarafta diğer tarafta bir otoklav bin, ve atık şişesi koyun. </li><li> Sonra tam bir örnek otoklav bin şişe yerleştirin; ancak, henüz şişe kapağını çıkarmayın. </li><li> Boru luer ucundaki balon olduğunu peristaltik pompa ile boru iletin. </li><li> 25 ml steril bir pipetle cımbız kullanarak, pamuk kaldırmak ve pipet Hortumun diğer ucunu tak?...

<p class="jove_content"> Tezgahları ve pompalar, aksi takdirde ekipman paslanmasına neden olur tuzlu su herhangi bir kalıcı izlerini kaldırmak için kullanımdan sonra nemli bir havlu ile temizlemek için şarttır. Işlem basit olmasına rağmen, zaman gereksinimi süzülen örnek biyokütle ya da enkaz konsantrasyonuna bağlı olarak geniş olabilir. </p>

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Peristaltic pump</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Masterflex (Cole Palmer)</td>
<td>77913-20, 77200-62, 77200-04</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Tygon LFL tubing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Masterflex (Cole Palmer)</td>
<td>06429-24</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Hose clamps</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>0683204</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>1/4&#x201D; x 3/16&#x201D;  pipe adaptors</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>31702-20</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Polypropylene prefilter housing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>ADVANTEC</td>
<td>501200</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Metal luer fitting (Hose end to Male luer lock)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>31507-27</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>2&#x201C; Magnets</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>3 port carboy caps</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>GV 0.22 &mu;m STERIVIX filters</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Millipore</td>
<td>SVGV01R5</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>47 mm diameter 2.7 &mu;m GF/D filters</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Whatman</td>
<td>1823047</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Lysis buffer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>0.75 M sucrose, 40 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.3)</td>
</tr>
<tr>
<td>0.1 % HCl</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For post-filtration rinse</td>
</tr>
<tr>
<td>Autoclaved water</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For post-filtration rinse</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

small volume (1-3l) filtration of coastal seawater samples

<p class="jove_content">İş akışı downstream mikrobiyal topluluk için kıyı deniz sularında, besin ve iz gaz analizleri toplanması ile başlar. Bugün s gösteri örnekleri için Saanich&#39;dan Giriş HMS John Strickland işletim güverte toplanmıştır. Bu video belgeleri küçük hacimli (~ 1 L) su sütunu mikrobiyal biyokütle filtrasyon. Biyokütle tüm boyut sınıfları 0.22 mikron filtre cut-off toplanır, bu nedenle burada, herhangi bir ön filtrasyon adım vardır: protokolü, büyük hacimli örnekleme protokolü önemli bir fark, daha önce açıklanan bir uzantısı. Örnekler bu şekilde toplanan nükleik asit analizi için idealdir. Set-up, filtrasyon, ve temiz adımlarla, her biri 20-30 dakika sürer. 8 örnekleri aynı zamanda filtre olabilir, aynı anda iki peristaltik pompa kullanıyorsanız. Örnekleme gezileri arasında biyofilm oluşumunu önlemek için tüm filtrasyon ekipmanları seyreltik HCl ve deiyonize su ile durulanır ve kullanımdan hemen sonra otoklava olmalıdır.</p>

Watch this Scientific Journal Video about Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples at JoVE.com

Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples

<p class="jove_content">Bu video belgeleri küçük hacimli (~ 1 L) su sütunu mikrobiyal biyokütle filtrasyon.</p>

Kıyı Deniz suyu Örnekleri Küçük Hacim (1-3L) Filtrasyon

The workflow begins with the collection of coastal marine waters for downstream microbial community, nutrient and trace gas analyses. For today s ...

Research

Education

JoVE Core

JoVE Journal

Analytical Chemistry

Biology

Unit 1

Small Volume (1-3L) Filtration of Coastal Seawater Samples

Introduction to Separation Methods

SCIENTISTS IN ACTION

Seawater Sampling and Collection

Deniz suyu Örnekleme ve Tahsilat

This video documents methods for collecting coastal marine water samples and processing them for various downstream applications including biomass ...

Large Volume (20L+) Filtration of Coastal Seawater Samples

Large Volume 20L+ Filtration of Coastal Seawater Samples

Büyük Hacimli Kıyı Deniz suyu Örnekleri (20L +) Filtrasyon

The workflow begins with the collection of coastal marine waters for downstream microbial community, nutrient and trace gas analyses. For this method, ...

Absolute Quantum Yield Measurement of Powder Samples

Toz numuneler mutlak Kuantum Verimi Ölçümü

Measurement of fluorescence quantum yield has become an important tool in the search for new solutions in the development, evaluation, quality control and ...

Substrate Generation for Endonucleases of CRISPR/Cas Systems

CRISPR / Cas Sistemleri Endonükleazlar için Substrat Üretimi

The  interaction of viruses and their prokaryotic hosts shaped the evolution of  bacterial and archaeal life. Prokaryotes developed several strategies to ...

A High-throughput Method for Measurement of Glomerular Filtration Rate in Conscious Mice

Bilinçli Farelerde Glomerüler Filtrasyon Hızı Ölçümü için bir Yüksek verimli Yöntemi

The measurement of  glomerular filtration rate (GFR) is the gold standard in kidney function  assessment. Currently, investigators determine GFR by ...

Rapid Isolation And Purification Of Mitochondria For Transplantation By Tissue Dissociation And Differential Filtration

Doku Ayrışma Ve Diferansiyel süzülerek Nakli İçin Mitokondri Of Rapid İzolasyon ve saflaştırma

Previously described mitochondrial isolation methods using differential centrifugation and/or Ficoll gradient centrifugation require 60 to 100 min to ...

Physiology Lab Demonstration: Glomerular Filtration Rate in a Rat

Fizyoloji Laboratuvarı Gösteri: Bir Sıçan Glomerüler Filtrasyon Hızı

Measurements of glomerular filtration rate (GFR), and the fractional excretion of sodium (Na) and potassium (K) are critical in assessing renal function ...

Measuring Pressure Volume Loops in the Mouse

Fare Basınç Hacim Döngüler Ölçme

Understanding the causes and progression of heart disease presents a significant challenge to the biomedical community. The genetic flexibility of the ...

Filtration Isolation of Nucleic Acids:  A Simple and Rapid DNA Extraction Method

Nükleik Asitlerin süzülmesi İzolasyonu: basit ve hızlı DNA izolasyonu,

FINA, filtration isolation of nucleic acids, is a novel extraction method which utilizes vertical filtration via a separation membrane and absorbent pad ...

Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS Super-region Volume Segmentation Workbench

Birim segmentasyon ve SuRVoS (süper bölge birim segmentasyon) tezgah kullanarak biyolojik malzemelerin analizi

Segmentation is the process of isolating specific regions or objects within an imaged volume, so that further study can be undertaken on these areas of ...