Name: global gene expression analysis using a zebrafish oligonucleotide microarray platform
Uploaded: 2009-08-10T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Global Gene Expression Analysis Using a Zebrafish Oligonucleotide Microarray Platform at JoVE.com

<p class="jove_title"> भाग 1: प्रतिदीप्त लेबल के सीडीएनए </p><p class="jove_content"> Cy3 माइक्रोएरे प्रयोग में इस्तेमाल किया डाई तस्वीर क्षरण करने के लिए संवेदनशील है. प्रक्रिया प्रकाश की एक न्यूनतम राशि में जगह ले जाना चाहिए. लेबलिंग BioPrime ऐरे CGH ?...

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	<li>. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> <em style='font-style: italic'>BioPrime Array CGH Genomic Labeling System Manual</em>. , (2004).</li><li>. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> <em style='font-style: italic'>Roche NimbleGen Arrays User's Guide for Gene Expression Analysis</em>. , (2008).</li></ol>

<p class="jove_content"> यहाँ विस्तृत सहित कई माइक्रोएरे प्रोटोकॉल, मापने और बढ़ाता संकरण के एक साधन के के रूप में उपयोग फ्लोरोसेंट रंजक. Cy3 फ्लोरोसेंट रंजक फोटो और ओजोन क्षरण के प्रति संवेदनशील है. यह अनुशंसा की जाती है कि प्र?...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Array Microcentrifuge Dryer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>ISC Bioexpress</td>
<td>C-1303-T</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>BioPrime Array CGH Genomic Labeling System</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>18095-011</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Cyanine 3-dCTP</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>PerkinElmer</td>
<td>NEL576</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>GenePix 4000B</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Molecular Devices</td>
<td>GENEPIX 4000B</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Microcon YM-30</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Millipore</td>
<td>42411</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>NimbleGen Array Processing Accessories</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche NimbleGen</td>
<td>5223539001</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>NimbleGen Hybridization Kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche NimbleGen</td>
<td>5223474001</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>NimbleGen Hybridization System 4</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche NimbleGen</td>
<td>5223652001</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>NimbleGen Wash Buffer Kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche NimbleGen</td>
<td>5223504001</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>X1 Mixers</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche NimbleGen</td>
<td>5223725001</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

global gene expression analysis using a zebrafish oligonucleotide microarray platform

<p class="jove_content">जीन माइक्रोएरे प्रौद्योगिकी एक जीनोम चौड़ा आधार पर मात्रात्मक और प्रतिलेख के स्तर के जीन अभिव्यक्ति की रूपरेखा माप परमिट. जीन माइक्रोएरे प्रौद्योगिकी विकास मंच के संबंध में वैश्विक जीन अभिव्यक्ति विश्लेषण एक रोग राज्य सहित आवेदनों की एक किस्म में कई जैविक विषयों में प्रयोग किया जाता है, और विषाक्त प्रतिक्रिया में. इस के साथ साथ, हम वैश्विक जीन अभिव्यक्ति एक व्यापक zebrafish विशिष्ट oligonucleotide माइक्रोएरे मंच का उपयोग विश्लेषण के प्रदर्शन में शामिल हैं. zebrafish अभिव्यक्ति माइक्रोएरे मंच 385.000 जांच, लंबाई में 60 आधार जोड़े, के साथ 37,157 लक्ष्य पूछताछ लक्ष्य प्रति 12 जांच करने के लिए शामिल हैं. इस मंच के लिए, सभी सीडीएनए और जीनोमिक zebrafish के लिए उपलब्ध जानकारी (http://www.ensembl.org) Ensembl, वेगा (http://vega.sanger.ac.uk), UCSC सहित विभिन्न जीनोमिक डेटाबेस से एकत्र किया गया था ( http://genome.ucsc.edu), और ZFIN (http://www.zfin.org). एक परिणाम के रूप में इस अभिव्यक्ति सरणी वर्तमान zebrafish transcriptome की पूरी कवरेज प्रदान करता है. zebrafish अभिव्यक्ति माइक्रोएरे Roche NimbleGen (मैडिसन, WI) के द्वारा मुद्रित किया गया था. यह तकनीकी प्रदर्शन एक सीडीएनए उत्पाद के फ्लोरोसेंट लेबलिंग, लेबल सीडीएनए उत्पाद के माइक्रोएरे मंच करने के लिए संकरण, और संकेत अधिग्रहण के लिए एक रंग विश्लेषण रणनीति का उपयोग सरणी स्कैनिंग शामिल हैं.</p>

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Global Gene Expression Analysis Using a Zebrafish Oligonucleotide Microarray Platform

<p class="jove_content">जीन डीएनए जीन अभिव्यक्ति की रूपरेखा में एक जीनोम चौड़ा स्तर पर शक्तिशाली उपकरण हैं. इस प्रौद्योगिकी विकास जीव विज्ञान और विष विज्ञान सहित जैविक विषयों की एक किस्म में आवेदन किया है. इस वीडियो में, हम वैश्विक जीन अभिव्यक्ति zebrafish के लिए एक व्यापक oligonucleotide माइक्रोएरे मंच का उपयोग विश्लेषण के लिए एक प्रोटोकॉल विस्तार.</p>

वैश्विक जीन एक्सप्रेशन विश्लेषण एक Zebrafish Oligonucleotide माइक्रोएरे प्लेटफार्म का उपयोग करना

Gene microarray technology permits quantitative measurement and gene expression profiling of transcript levels on a genome-wide basis. Gene microarray ...

Research

JoVE Journal

Biology

Bacterial Gene Expression Analysis Using Microarrays

बैक्टीरियल जीन एक्सप्रेशन प्रोटीन का उपयोग विश्लेषण

The Preparation of Primary Hematopoietic Cell Cultures From Murine Bone Marrow for Electroporation

प्राथमिक electroporation के लिए murine अस्थि मज्जा से hematopoietic सेल संस्कृतियों की तैयारी

It is becoming increasingly apparent that electroporation is the most effective way to introduce plasmid DNA or siRNA into primary cells. The Gene Pulser ...

RNA Isolation from Embryonic Zebrafish and cDNA Synthesis for Gene Expression Analysis

भ्रूणीय Zebrafish और सीडीएनए संश्लेषण से जीन एक्सप्रेशन विश्लेषण के लिए शाही सेना अलगाव

Many important and complex laboratory procedures require an input of high quality, intact RNA.  A degraded sample or the presence of impurities can lead ...

Using the Gene Pulser MXcell Electroporation System to Transfect Primary Cells with High Efficiency

जीन Pulser MXcell electroporation प्रणाली का उपयोग करने के लिए उच्च क्षमता के साथ प्राथमिक कोशिकाओं transfect

Using an Automated Cell Counter to Simplify Gene Expression Studies: siRNA Knockdown of IL-4 Dependent Gene Expression in Namalwa Cells

एक स्वचालित सेल काउंटर का उपयोग करने के लिए जीन एक्सप्रेशन अध्ययन सरल: आईएल-4 निर्भर जीन एक्सप्रेशन के Namalwa कक्ष में siRNA नॉकडाउन

The use of siRNA mediated gene knockdown is continuing to be an important tool in studies of gene expression.  siRNA studies are being conducted not only ...

Analysis of Gene Expression in Emerald Ash Borer (<em>Agrilus planipennis</em>) Using Quantitative Real Time-PCR

Analysis of Gene Expression in Emerald Ash Borer Agrilus planipennis Using Quantitative Real Time-PCR

जीन एक्सप्रेशन का पन्ना ऐश छिद्रक में विश्लेषण (<em> Agrilus planipennis</emपीसीआर ->) का प्रयोग मात्रात्मक रीयल टाइम

Emerald ash borer (EAB, Agrilus planipennis) is an exotic invasive pest, which has killed millions of ash trees (Fraxinus spp) in North America. EAB ...

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के आयल - एंबेडेड और जमे हुए वर्गों<em> ड्रोसोफिला</em> वयस्क स्नायु

The molecular characterization of muscular dystrophies and myopathies in humans has revealed the complexity of muscle disease and genetic analysis of ...

Determining Genetic Expression Profiles in <em>C. elegans</em> Using Microarray and Real-time PCR

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में आनुवंशिक अभिव्यक्ति प्रोफाइल निर्धारण<em> सी. एलिगेंस</em> माइक्रोएरे और वास्तविक समय पीसीआर का उपयोग

Synapses are composed of a presynaptic active zone in the signaling cell and a postsynaptic terminal in the target cell. In the case of chemical synapses, ...

<em>In vitro</em> Reconstitution of the Active <em>T. castaneum</em> Telomerase

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सक्रिय <em>टी.</em> के पुनर्गठन <em>इन विट्रो में castaneum</em> टेलोमिरेज

Efforts to isolate the catalytic subunit of telomerase, TERT, in sufficient quantities for structural studies, have been met with limited success for more ...

Gene Trapping Using Gal4 in Zebrafish

Zebrafish में Gal4 का प्रयोग जीन फँसाने

Large clutch size and external development of optically transparent embryos make zebrafish an exceptional vertebrate model system for in vivo insertional ...