Name: a rapid high-throughput method for mapping ribonucleoproteins (rnps) on human pre-mrna
Uploaded: 2009-12-02T15:46:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about A Rapid High-throughput Method for Mapping Ribonucleoproteins RNPs on Human pre-mRNA at JoVE.com

تصميم حمام سباحة والانتعاش بنسبة ضئيلة <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> الخطوة الأولى هي لتصميم تجمع قبل مرنا لدراستها. ويمكن القيام بذلك باستخدام متصفح الجينوم UCSC وتحميله جينات معينة ، تقاطعات لصق ، أو غيرها من مجالات الاهتمام. </li><li style=";text-align:right;dir...

عندما تفعل هذا الإجراء مهم لنتذكر أن إنشاء تجمع مرنة وقابلة للتعديل في الحمض النووي الريبي إما أو مستوى البروتين. ويمكن على مستوى الحمض النووي الريبي الأخذ orthologous المناطق ، والطفرات المرض ، وتعدد الأشكال ، أو الطفرات العشوائية في تسلسل قليل النوكليوتيد. ويمكن في مست?...

a rapid high-throughput method for mapping ribonucleoproteins (rnps) on human pre-mrna

التسلسل الرناوات التي شاركت في immunoprecipitate (CO - IP) مع البروتينات الحمض النووي الريبي ملزمة زاد فهمنا الربط وذلك بإثبات أن يؤثر في كثير من الأحيان ملزمة الموقع وظيفة عامل الربط. ومع ذلك ، كما هو الحال مع أي استراتيجية أخذ العينات من فرصة يعتبر تحديد الحمض النووي الريبي منضمة إلى عامل الربط يتناسب وفرة الخلوية. وقد وضعنا في رواية نهج المختبر عن درس خصوصية ملزمة للخلاف عابرة قبل مرنا. هذا النهج يستخدم مجموعة المصممة خصيصا قليل النوكليوتيد أن البلاط عبر الإنترونات ، exons متماثلة ، تقاطعات لصق ، أو غيرها من قبل مرنا. يخضع تجمع إلى نوع من التحديد الجزيئي. هنا ، ونحن لشرح الطريقة التي تفصل في جزء قليل النوكليوتيد مقيدة وغير منضم والاستفادة من مجموعة واللون two استراتيجية لتسجيل كل عمليات تخصيب قليل النوكليوتيد في جزء محدد. بيانات مجموعة يولد خرائط عالية الدقة مع القدرة على تحديد تسلسل محدد من المحددات الهيكلية وبروتين نووي ريبوزي (RNP) ملزمة للمرنا المسبق. وهناك ميزة فريدة من نوعها لهذا الأسلوب هو قدرته على تجنب التحيز مرنا تجاه أخذ العينات المرتبطة بالملكية الفكرية والتقنيات الحالية سيليكس ، كما تم تصميمه خصيصا للسباحة وتوليفها من قبل مرنا التسلسل. مرونة تجمع قليل النوكليوتيد ميزة أخرى منذ المجرب الذي يختار لدراسة المناطق والبلاط عبر والخياطة تجمع لاحتياجاتهم الفردية. باستخدام هذه التقنية ، يمكن للمرء أن فحص آثار الأشكال ، أو طفرات على ملزمة على نطاق واسع أو استنساخ في مكتبة مراسل الربط الوظيفي وتحديد [أليغنوكليوتيد] التي هي المخصب في جزء المدرجة. هذه الرواية ذات الدقة العالية في المختبر نظام رسم الخرائط يوفر وسيلة فريدة لدراسة التفاعلات RNP مع الأنواع قبل مرنا عابرة ، الذي منخفضة وفرة يجعل من الصعب دراسة مع التقنيات الحالية في الجسم الحي.

Watch this Scientific Journal Video about A Rapid High-throughput Method for Mapping Ribonucleoproteins RNPs on Human pre-mRNA at JoVE.com

A Rapid High-throughput Method for Mapping Ribonucleoproteins RNPs on Human pre-mRNA

نظرا لطبيعة عابرة للمرنا المسبق ، يمكن أن يكون من الصعب عزل ودراسة<em&gt; في الجسم الحي</em&gt;. هنا ، فإننا نقدم رواية<em&gt; في المختبر</em&gt; نهج لتحقيق RNA البروتين التفاعلات باستخدام مجموعة جزئية الاصطناعية التي البلاط عبر مناطق مختارة من مرنا المسبق.

سريع سرعة عالية طريقة لرسم الخرائط Ribonucleoproteins (RNPs) على مرنا ما قبل الإنسان

Sequencing RNAs that co-immunoprecipitate (co-IP) with RNA binding proteins has increased our understanding of splicing by demonstrating that binding ...

Research

JoVE Journal

Biology

A Rapid High-throughput Method for Mapping Ribonucleoproteins (RNPs) on Human pre-mRNA

A high-throughput method to globally study the organelle morphology in S. cerevisiae

أسلوب الإنتاجية العالية عالميا لدراسة مورفولوجية عضية في البيرة س.

High-throughput methods to examine protein localization or organelle morphology is an effective tool for studying protein interactions and can help ...

A High-Throughput Method For Zebrafish Sperm Cryopreservation and In Vitro Fertilization

A High-Throughput Method For Zebrafish Sperm Cryopreservation and In Vitro Fertilization

أسلوب الإنتاجية العالية للحصول على الحيوانات المنوية الحفظ بالتبريد واسماك الزرد في المختبر التسميد

This is a method for zebrafish sperm cryopreservation that is an adaptation of the Harvey method (Harvey et al., 1982).  We have introduced two changes to ...

Ice-Cap: A Method for Growing Arabidopsis and Tomato Plants in 96-well Plates for High-Throughput Genotyping

Ice-Cap: A Method for Growing Arabidopsis and Tomato Plants in 96-well Plates for High-Throughput Genotyping

الايس كاب : منهج في تزايد Arabidopsis الطماطم والنباتات في لوحات 96 - جيدا لالرفيع المناولة التنميط الجيني

It is becoming common for plant scientists to develop projects that require the genotyping of large numbers of plants. The first step in any genotyping ...

High-throughput Crystallization of Membrane Proteins Using the Lipidic Bicelle Method

الإنتاجية العالية للبروتينات غشاء البلورة باستخدام أسلوب Bicelle Lipidic

Membrane proteins (MPs) play a critical role in many physiological processes such as pumping specific molecules across the otherwise impermeable membrane ...

Mapping the After-effects of Theta Burst Stimulation on the Human Auditory Cortex with Functional Imaging

تعيين آثار ما بعد من ثيتا انفجار تحفيز على القشرة السمعية الإنسان مع التصوير الوظيفي

Auditory cortex pertains to the processing of sound, which is at the basis of speech or music-related processing1. However, despite considerable recent ...

High-throughput Physical Mapping of Chromosomes using Automated in situ Hybridization

High-throughput Physical Mapping of Chromosomes using Automated in situ Hybridization

الإنتاجية العالية لرسم الخرائط المادية للالكروموسومات باستخدام الآلي<em&gt; في الموقع</em&gt; التهجين

Projects to obtain whole-genome sequences for 10,000 vertebrate species1 and for 5,000 insect and related arthropod species2 are expected to take place ...

Biochemical and High Throughput Microscopic Assessment of Fat Mass in Caenorhabditis Elegans

Biochemical and High Throughput Microscopic Assessment of Fat Mass in Caenorhabditis Elegans

الكيمياء الحيوية والعليا تقييم مجهرية مرت من كتلة الدهون في<em&gt; Caenorhabditis ايليجانس</em

The nematode C. elegans has emerged as an important  model for the study of conserved genetic pathways regulating fat metabolism as  it relates to human ...

Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)

Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing ChIP-seq

جيل من جودة عالية لونين القالب الحمض النووي مناعي لتسلسل عالية الإنتاجية (رقاقة وما يليها)

ChIP-sequencing (ChIP-seq) methods directly  offer whole-genome coverage, where combining chromatin immunoprecipitation  (ChIP) and massively parallel ...

A High-throughput Method for Measurement of Glomerular Filtration Rate in Conscious Mice

وهناك طريقة عالية الإنتاجية لقياس معدل الترشيح الكبيبي في الفئران وإدراكا

The measurement of  glomerular filtration rate (GFR) is the gold standard in kidney function  assessment. Currently, investigators determine GFR by ...

High Throughput Microinjections of Sea Urchin Zygotes

عالية الإنتاجية إبر دقيقة جدا لقنفذ البحر بيضات ملقحة

Microinjection into cells and embryos is a common technique that is used to study a wide range of biological processes. In this method a small amount of ...