Begynd med at overføre en milliliter rå fraktion af RAW 264.7 mitokondrier til et 15 ml konisk rør. Tilsæt 7 ml saltet mitokondriebuffer suppleret med 150 millimolært natriumchlorid. Til suspensionen tilsættes 50 mikroliter TOM22-perler og inkuberes derefter røret på et roterende hjul ved lav hastighed.
Placer en søjle på magneten og ekvilibrer søjlen med otte ml saltet mitokondriebuffer. Kassér gennemstrømningen. Efter prøveinkubation overføres den til kolonnen og kasseres gennemstrømningen.
Vask derefter kolonnen tre gange med otte ml saltet mitokondriebuffer. Fjern søjlen fra magneten og læg den i et 15 ml konisk rør. For at eluere mitokondrierne tilsættes 1,5 ml saltet mitokondriebuffer og påføres straks et stempel for at eluere den rensede fraktion i røret.
Overfør den eluerede fraktion til et nyt 1, 5 ml rør og udfør centrifugering ved 21.000 G i 10 minutter ved 4 grader Celsius. Kassér den dannede supernatant, og opbevar den brune rene mitokondriepille ved 20 grader Celsius til fremtidige undersøgelser. Immunoblot-analyse af de oprensede mitokondrieekstrakter viste berigelse af mitokondriecitratsyntase og udtømning af proteiner fra andre celleorganeller.
Mitokondrieintegritetsundersøgelser ved hjælp af elektronmikroskopi afslørede mitokondrier med en klassisk oval form og intakt cristae omgivet af elektrontætte antistofbelagte perler. Endvidere viste proteomanalyse berigelse af mitokondrieproteiner og to forskellige populationer svarende til mitokondrie og ikke-mitokondrieproteiner.