Para começar, lave suavemente as bainhas foliares de milho inoculadas com esporos de fungos em água deionizada. Coloque a bainha em uma lâmina limpa de microscópio de vidro com a superfície adaxial voltada para baixo e a superfície abaxial mais superior. Usando uma lâmina de barbear de borda única, corte aproximadamente um centímetro das extremidades da bainha e remova a maior parte do tecido da lâmina em ambos os lados da nervura central.
Segure a lâmina de barbear em um ângulo de 90 graus para raspar o tecido da nervura central abaxial, expondo a camada epidérmica na superfície adaxial acima do ponto inoculado. Levante cuidadosamente a seção da bainha de uma borda e transfira-a para uma nova lâmina com a superfície adaxial voltada para a parte superior mais próxima da lente objetiva. Aplique 60 microlitros de água deionizada na seção e coloque uma tampa de vidro sem introduzir bolhas de ar.
Stenocarpella maydis invadiu rapidamente as células epidérmicas diretamente através de edemas hifais indiferenciados. Enquanto Colletotrichum graminicola produziu apressórios melanizados. A coloração com azul de tripano revelou a natureza e a extensão da colonização das hifas fúngicas, com C.graminicola inicialmente invadindo através de hifas primárias espessas e posteriormente mudando para um estágio necrotrófico.
C.graminicola invade células vivas de milho usando hifas primárias espessas separadas do citoplasma do hospedeiro por uma membrana. Em contraste, S.maydis produz uma fitotoxina que mata as células epidérmicas antes de invadi-las. Em C. graminicola, a produção de precipitado marrom-escuro nas bainhas foliares do milho indicou uma explosão oxidativa relacionada a uma resposta de resistência do hospedeiro.