Till att börja med delas den renade, outspädda CNS-cellsuspensionen från möss i två fraktioner för ytterligare isolering av mikroglia och oligodendrocyter. Tillsätt sedan magnetiskt märkta mikropärlor som är specifika för ytantigenet för olika CNS-celltyper till respektive cellsuspension. Placera kolonnen i magnetfältet, likställ kolonnen och lägg sedan till den resulterande cellsuspensionen på kolonnen.
Magnetiskt märkta celler behålls i kolumnen och omärkta celler körs igenom. Efter att ha tagit bort kolonnen från magnetfältet, spola ut magnetiskt märkta celler från kolonnen i ett rör som den positivt valda cellfraktionen. Dela upp det negativa flödet från oligodendrocyterna i två fraktioner för ytterligare isolering av neuroner och astrocyter.
Flödescytometrianalys med hjälp av celltypsspecifika markörer i kombination med diskriminering av levande eller döda celler gav mikroglia, oligodendrocyter, astrocyter och neuroner. Fenotypisk karakterisering av de olika cellpopulationerna visade att encellssuspensioner med cirka 90 % renhet och viabilitet erhölls för alla huvudcelltyper som är bosatta i CNS.