Name: Micro-Colony Forming Unit Assay to Quantify Mycobacteria
Uploaded: 2023-07-28T13:10:00
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micro-colony forming unit assay to quantify mycobacteria

माइक्रो-सीएफयू विधि का उपयोग करके तपेदिक निर्धारण में तेजी लाना

Tuberculosis (TB) is the leading cause of death worldwide by a single infectious agent, bacterium Mycobacterium tuberculosis (M.tb), killing more people than any other pathogen. In 2021, TB was responsible for 1.6 million deaths and was surpassed by COVID-19 during the 2019-2021 pandemic1. Moreover, according to the World Health Organization&#180;s global TB report of 2022, the COVID-19 pandemic was responsible for an increase in new TB cases. The WHO also reports large drops in the number of people diagnosed with TB during this period, which could increase further the number of TB cases1.
The Bacillus Calmette-Gu&#233;rin (BCG) is a live-attenuated strain of the pathogenic Mycobacterium bovis, used for the first time as a vaccine more than 100 years ago. This is the only vaccine against TB and is the oldest licensed vaccine in the world still in use2,3. Currently, there are 12 vaccines in different phases of clinical trials4, and dozens of vaccines are under pre-clinical development5,6. Pre-clinical assessment of vaccines against TB includes the evaluation of the safety and immunogenicity7, which can be obtained in diverse animal models such as zebrafish, mice, guinea pigs, rabbits, cattle, and non-human primates8,9,10. Additionally, assessing the capacity of a vaccine to induce protection against M.tb infection and/or transmission, i.e., the vaccine efficacy, requires an M.tb challenge in vivo5,11. Interestingly, BCG vaccination induces non-specific effects that affect the survival of other bacterial and viral pathogens12,13&#160;through the mechanism of trained immunity14. To quantify the viable bacterial burden in an infected animal, the method of choice is the enumeration of bacterial colonies through the colony-forming units (CFU) assay5,15. CFU is a unit that estimates the number of microorganisms (bacteria or fungi) that form colonies under specific growth conditions. CFUs originate from viable and replicative microorganisms, and the absolute number of living microorganisms within each colony is difficult to estimate. It is uncertain whether a colony has originated from one or more microorganisms. The CFU unit reflects this uncertainty, hence a great variability can be observed in replicates of the same sample. This time-consuming assay requires specialized technicians trained to work in a biosafety level 3 (BSL3) facility, substantial laboratory and incubator space, takes from 4 to 6 weeks to conclude, and is prone to contamination.
In this study, we describe an optimized method for colony enumeration, the micro-CFU (mCFU), and offer a simple and rapid solution to analyze the results15,16,17,18,19,20. The mCFU assay requires tenfold fewer reagents, reduces the incubation period threefold, taking 1 to 2 weeks to conclude, reduces lab space and reagent cost, and minimizes the health and safety risks associated with working with large numbers of M.tb. We propose that this method should be universally adopted for pre-clinical studies of vaccine efficacy determination, ultimately leading to time reduction in the development of vaccines against TB. Finally, this optimized method of CFU enumeration has been used to quantify not only Mycobacteria but also other bacteria, such as Escherichia coli and Ralstonia solanacearum21.

लेखक स्पॉटलाइट: टीबी वैक्सीन प्रभावकारिता और एंटीजन प्रस्तुति विश्लेषण के कुशल मूल्यांकन के लिए सीएफयू निर्धारण का अनुकूलन 

क्षय रोग के खिलाफ टीकों की प्रभावकारिता मूल्यांकन के लिए माइक्रो-कॉलोनी बनाने वाली इकाई परख

CFU determination is necessary to measure the efficacy of the immune response against bacteria. However, it is very low throughput and becomes cumbersome and expensive when applied to pathogenic bacteria such as Mycobacterium tuberculosis. This is a significant limitation when we need to test large panels of treatments.The research focuses on tuberculosis and on the assessments of TB vaccines. It explores safety, immunogenicity, and efficacy of vaccines against Mycobacterium tuberculosis. The study presents an optimized method to micro-CFU for enumerating bacterial colonies to assess vaccine efficacy in preclinical studies.This protocol aims to optimize CFU determination by generating results from a small droplet similar to those from a regular Petri dish. Quantifying bacteria viability from such a small sample allows us to analyze thousands of data points using a fraction of the materials and time necessary for the classical method. Our research aims to dissect the antigen presentation machinery and to identify the most relevant antigens to optimize antigen presentation.This will inform us to design and develop better vaccines to improve or replace the current TB vaccine, which is BCG.

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Micro-Colony Forming Unit Assay to Quantify Mycobacteria  

माइकोबैक्टीरिया की मात्रा निर्धारित करने के लिए माइक्रो-कॉलोनी बनाने वाली इकाई परख

एक अच्छी तरह से थाली का उपयोग धारावाहिक कमजोर पड़ने प्रदर्शन करने के लिए, पहली जगह एक 96 अच्छी तरह से थाली की पंक्तियों ए और ई पर माइकोबैक्टीरियम निलंबन. धारावाहिक कमजोर पड़ने की प्रक्रिया के लिए शेष कुओं में विआयनीकृत पानी के 180 माइक्रोलीटर जोड़ें। एक 12 चैनल विंदुक का उपयोग, पंक्ति ए में निलंबन resuspended और पंक्ति B.Repeat पंक्तियों बी और सी के लिए निलंबन हस्तांतरण जब तक अंतिम कमजोर पड़ने पंक्ति में पहुँच गया है डी माइक्रो छोटी बूंद चढ़ाना के लिए, ठोस मध्यम वर्ग प्लेट के लिए 96 अच्छी तरह से थाली की प्रत्येक पंक्ति से पांच microliters हस्तांतरण पतली सुझावों के साथ एक 0.5 करने के लिए 10 माइक्रोलीटर बहु चैनल विंदुक का उपयोग करें.बूंदों को अगर को थोड़ा छूने की अनुमति दें, उचित हस्तांतरण सुनिश्चित करें और टिप के अंदर तरल प्रतिधारण को कम करें। बूंदों को सूखने दें और अगर प्लेट को बंद कर दें। बैक्टीरिया के विकास की निगरानी करते हुए इसे 37 डिग्री सेल्सियस पर इनक्यूबेट करें।वैकल्पिक रूप से, अगर प्लेटों को सूखने से रोकने के लिए एक सील प्लास्टिक बैग में रखें। इनक्यूबेशन के छह से 10 दिनों के बाद, नग्न आंखों को दिखाई देने वाली अलग-अलग कॉलोनियों की जांच करें। सबसे कम आवर्धन उद्देश्य का उपयोग कर एक उल्टे खुर्दबीन के तहत थाली रखें.वैकल्पिक रूप से, छोटी बूंद की तस्वीर लेने के लिए एक कैमरे का उपयोग करें, और स्वचालित कॉलोनी गिनती के लिए ImageJ का उपयोग कर कंप्यूटर पर मैन्युअल रूप से कालोनियों की गिनती. माइक्रो कॉलोनी बनाने इकाई या माइक्रो CFU परख अगर प्लेटों की एक छोटी राशि से डेटा की उच्च मात्रा का उत्पादन करने के लिए इस्तेमाल किया गया था. सैक्विनावीर डिलीवरी के लिए लिपोसोम का उपयोग करने से विभिन्न दवा प्रतिरोधों के साथ माइक्रोबैक्टीरियम उपभेदों के खिलाफ उपचार की प्रभावकारिता बढ़ गई।

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Medicine

Micro-Colony Forming Unit Assay to Quantify Mycobacteria

Micro-Colony Forming Unit Assay for Efficacy Evaluation of Vaccines Against Tuberculosis

Tuberculosis (TB), the leading cause of death worldwide by an infectious agent, killed 1.6 million people in 2022, only being surpassed by COVID-19 during ...