Til at begynde med tilsættes 150 ml rene fem millimeter glasperler til den rene krukke og lukker låget. Dæk den lukkede krukke med nok aluminiumsfolie til at skjule låget til krukkeforbindelsen og autoklave ved 121 grader Celsius i 20 minutter. Når frøplanterne er klar til at overføre til krukken på den sterile bænk, skal du fjerne aluminiumsfolien og låget på krukken.
Tilsæt 35 ml halv styrke Murashige og Skoog-medium med pH 5,7 til 5,9 til krukken, og rør perlerne for at belægge jævnt med mediet. Indfør tre til fem frøplanter i krukken, og sørg for, at rodsystemerne placeres mellem glasperlerne. Juster perlerne med sterile tang eller skeer for at dække rødderne og løft bladene ud af mediet.
Fastgør to strimler med 1,25 centimeter mikroporetape på tværs af toppen af krukken, og læg forsigtigt låget ovenpå. Forsegl mellemrummet mellem låget og krukken med 2,5 centimeter mikroporetape for at opretholde sterilitet, samtidig med at der tillades luftudveksling, og læg krukken i et vækstkammer. Når planterne når den ønskede alder, skal du fjerne mikroporebåndet og låget fra krukken.
Alikvote 20 mikroliter vækstmedium på LB agarplade til sterilitetstest. Brug en 25 ml volumetrisk pipette til at fjerne så meget vækstmedium som muligt uden at beskadige rødderne. Tilsæt 50 ml opsamlingsmedium langs krukkevæggen for at forhindre befugtning af bladene.
Luk krukken med et låg og inkuber under sterile forhold i to timer. Efter inkubation fjernes den ønskede mængde opsamlingsmedium i rør. Mål vægten af roden og skyd fra planten i en krukke for at normalisere roden ekssudater efter plantevægt.
Arabidopsis thaliana planter så sunde ud på tværs af to forskellige laboratorier. Glasbeholdersystemet viste sig at kunne tilpasses forskellige plantearter og udviklingsstadier. Hvede havde de højeste rendevægte, efterfulgt af sorghum og tomat.
Mens sorghum havde de højeste rodvægte, efterfulgt af hvede og Medicago truncatula. Podning af Arabidopsis thaliana med kommensale bakterier ændrede ikke plantefænotypen, og podede bakterier fortsatte i systemet i mindst 12 dage med en lille stigning i kolonidannende enheder.