כדי להתחיל, להוסיף 150 מיליליטר של חרוזי זכוכית נקיים חמישה מ"מ לצנצנת נקייה לסגור את המכסה. מכסים את הצנצנת הסגורה ברדיד אלומיניום מספיק כדי להסתיר את המכסה לצומת הצנצנת ולאוטוקלאבה ב-121 מעלות צלזיוס למשך 20 דקות. כאשר השתילים מוכנים להעברה לצנצנת על הספסל הסטרילי, הסירו את רדיד האלומיניום ואת מכסה הצנצנת.
מוסיפים לצנצנת 35 מיליליטר של מורשיג בחצי חוזק ומדיום סקוג של pH 5.7 עד 5.9, ומערבבים את החרוזים לציפוי אחיד עם המדיום. הכניסו שלושה עד חמישה שתילים לצנצנת, וודאו שמערכות השורשים ממוקמות בין חרוזי הזכוכית. התאימו את החרוזים בעזרת מלקחיים סטריליים או כפות כדי לכסות את השורשים ולהרים את העלים מהמדיום.
הדביקו שתי רצועות של סרט מיקרו-נקבוביות בקוטר 1.25 ס"מ לאורך החלק העליון של הצנצנת והניחו את המכסה בעדינות מעליה. אטמו את הרווח בין המכסה לצנצנת עם סרט מיקרו-נקבוביות בקוטר 2.5 ס"מ כדי לשמור על סטריליות תוך מתן אפשרות להחלפת אוויר, והכניסו את הצנצנת לתא גדילה. כאשר הצמחים מגיעים לגיל הרצוי, הסירו את סרט המיקרו-נקבוביות והמכסה מהצנצנת.
Aliquot 20 מיקרוליטר של מדיום גידול על צלחת אגר LB לבדיקת סטריליות. באמצעות פיפטה נפחית של 25 מיליליטר, להסיר כמה שיותר מדיום צמיחה מבלי לפגוע בשורשים. הוסיפו 50 מיליליטר של אמצעי איסוף לאורך דופן הצנצנת כדי למנוע הרטבת העלים.
סוגרים את הצנצנת עם מכסה ודגרים בתנאים סטריליים למשך שעתיים. לאחר הדגירה, להסיר את הכמות הרצויה של אמצעי איסוף לתוך צינורות. מודדים את משקל השורש ונובטים מהצמח בצנצנת אחת כדי לנרמל את הפרשת השורש לפי משקל הצמח.
צמחי Arabidopsis thaliana נראו בריאים בשתי מעבדות שונות. מערכת קנקני הזכוכית הוכיחה את עצמה כמתאימה למיני צמחים שונים ולשלבי התפתחות. לחיטה היו משקלי המצנח הגבוהים ביותר, ואחריה דורה ועגבנייה.
בעוד דורה היו בעלי משקל השורש הגבוה ביותר, ואחריו חיטה ו Medicago truncatula. חיסון של Arabidopsis thaliana עם חיידקים commensal לא שינה את הפנוטיפ של הצמח, וחיידקים מחוסנים נשארו במערכת לפחות 12 ימים עם עלייה קלה ביחידות יוצרות מושבה.
