まず、150ミリリットルのきれいな5ミリメートルのガラスビーズをきれいな瓶に入れ、蓋を閉めます。閉じた瓶を十分なアルミホイルで覆い、蓋を瓶の接合部に隠し、摂氏121度で20分間オートクレーブします。苗木を滅菌ベンチの瓶に移す準備ができたら、瓶のアルミホイルと蓋を取り外します。
pH 5.7〜5.9の半強度の村重とスクーグの培地35ミリリットルを瓶に入れ、ビーズをかき混ぜて培地で均一にコーティングします。3〜5本の苗木を瓶に入れ、根系がガラスビーズの間に配置されていることを確認します。滅菌鉗子またはスプーンでビーズを調整して根を覆い、葉を培地から持ち上げます。
1.25センチのマイクロポアテープを2枚瓶の上部に固定し、蓋を上にそっと置きます。蓋とジャーの間の隙間を2.5センチのマイクロポアテープで塞ぎ、空気交換を可能にしながら無菌性を維持し、ジャーを成長チャンバーに入れます。植物が希望の年齢に達したら、瓶からマイクロポアテープと蓋をはがします。
20マイクロリットルの増殖培地をLB寒天培地に分注し、無菌試験を行います。25ミリリットルの容積式ピペットを使用して、根を傷つけることなく、できるだけ多くの増殖培地を取り除きます。葉を濡らさないように、瓶の壁に沿って50ミリリットルの収集培地を追加します。
蓋をして瓶を閉じ、滅菌状態で2時間インキュベートします。インキュベーション後、所望の量の収集培地をチューブに移します。根の重さを測定し、1つの瓶で植物から芽を出し、根の滲出液を植物の重さで正規化します。
シロイヌナズナの植物は、2つの異なる研究所で健康に見えました。ガラス瓶システムは、さまざまな植物種や発達段階に適応できることが証明されました。シュート重量が最も多かったのは小麦で、ソルガムとトマトがそれに続いた。
一方、モロコシは根の重さが最も高く、小麦とメディカゴ・トランカチュラがそれに続いた。シロイヌナズナに共生細菌を接種しても植物の表現型は変化せず、接種された細菌は少なくとも12日間系内に留まり、コロニー形成単位がわずかに増加した。