Till att börja med, producera kristaller inom NC2-plattorna. Logga sedan in på I-SPY B-systemet med det medföljande Diamond Fed-ID:t och välj Förslag. Bläddra i listan eller skriv in förslagsnumret i sökfältet för att hitta önskat förslag.
När offerten har hittats väljer du försändelse från rullgardinsmenyn under förslagsnumret. Försändelsens fönster öppnas och visar alla försändelser som är relaterade till förslaget. Om du vill skapa en ny försändelse klickar du på plus lägg till försändelse i det övre högra hörnet av skärmen och anger ett namn för försändelsen.
Välj sedan automated imager och klicka på knappen Lägg till försändelse längst ner till vänster på skärmen för att bekräfta försändelsen. Navigera till sändningsfönstret och klicka på plus lägg till behållare, vilket gör att sidan Lägg till behållare visas. Välj nu en lämplig tallrikstyp från rullgardinsmenyn för behållartyp.
Ange en streckkod och ett containernamn enligt instruktionerna från strålrörspersonalen för experimentplattorna. Välj VMXi-kameran för 20 grader Celsius i listrutan för den begärda bildenheten och välj sedan Fibonacci-bildschemat i listrutan bildschema. Från rullgardinsmenyn kristalliseringsskärmen väljer du kristalliseringsskärmen.
Välj sedan rätt användarnamn från rullgardinsmenyn för ägare. Klicka på visa och ange den korrekta kontaktadressen i e-postrutan. Ange detaljerna om plattan i kommentarsfältet.
Välj det relevanta provet från rullgardinsmenyn för proteinet och använd den akronym som är registrerad i UAS och godkänd av Diamond i det experimentella förslaget. Ange samma namn i rutan exempelnamn och lämna de återstående rutorna tomma. Klicka på plusikonen för att replikera exemplet över hela plattan och fylla i hela behållaren med gröna fyrkanter.
Klicka på plus lägg till behållare längst ned på sidan för att registrera plattan. Överför plåten till lämplig bildgivare där den kommer att lagras och avbildas. Ett besök genereras när behållaren lagras i imager, och användaren får ett e-postmeddelande med en länk till plattan och dess bilder.
Om du vill visa avbildningsresultaten navigerar du till det förslag som är av intresse. Välj containrar i listrutan under förslagsnumret och visa listan över tillgängliga behållare. Välj filter, plattor, om andra sample hållartyper finns.
Om du vill begränsa sökningen använder du alternativet Min container för att endast visa relevanta behållare som är associerade med det aktuella användar-ID:t. Placera markören över linjen och vänsterklicka för att välja önskad behållare. Då visas ett nytt fönster som visar en översikt över plattan.
Välj en droppe till vänster om plåtrepresentationen för att visa den senaste bilden. Navigera mellan droppar med hjälp av piltangenterna eller välj dem individuellt med musen eller markören. För att manuellt lägga till punkter för datainsamling, tryck på plusmarkeringsknappen.
Placera markören över önskad intressepunkt. Gör valet och vänta tills ett rött kryss visas. När alla punkter är markerade klickar du på plusknappen Slutför.
Klicka på plusmarkeringsknappen för region för att lägga till regioner för datainsamling med rutnätsskanningar. Klicka på den övre vänstra punkten, dra den nedåt till höger för att skapa ett område som kommer att skannas på strålröret. Klicka på plusknappen när alla önskade regioner är etablerade.
Leta efter de blå kryssen på droppbilderna, som representerar kristallina objekt som automatiskt lokaliseras av CHIMPANS. Om du vill visa CHIMP-bedömningen för kristallisationsdroppar markerar du visa automatiska poäng och väljer kristall i listrutan klass. När alla punkter och områden har markerats med avseende på droppar, klicka på knappen förbered för datainsamling längst ner på sidan.
Granska listan över förvalda eller automatiskt identifierade prover. För att lägga till enskilda punkter eller regioner, tryck på plusknappen eller klicka på knappen Lägg till aktuell sida i kö för att lägga till alla visade prover. Klicka sedan på punktfiltret och markera kryssrutan markera alla för att tillämpa samma parametrar på alla prover i den aktuella köade provlistan.
Använd filter för punkt, region, manuell och auto. För regioner, välj rutnätsskanning, DMM 10 mikronsteg, 100 % överföring. För andra punktexperiment väljer du lämpliga alternativ i listrutan.
För insamling av oscillationsdata, välj omega scan DMM 10 grader, 10 % transmission för att maximera datainsamlingen. När du har valt rätt experimentella parametrar för alla exempel klickar du på knappen köbehållare. När plattan når toppen av kön kommer den att presenteras för strålröret för datainsamling och sedan returneras till provlagring.
Leta sedan efter ett e-postmeddelande med en länk för att få tillgång till relevanta uppgifter. Välj exempel på grupphantering i listrutan under förslagsnumret och leta efter en lista över grupper om andra användare redan har skapat dem. Om du vill skapa en ny grupp klickar du på plusknappen Skapa exempelgrupp.
Klicka på en försändelse i rullgardinsmenyn på sidan Skapa provgrupp för att se provvisningsprogrammet. När du har klickat på en behållare letar du efter en bild som visar en översikt över plattan. Klicka på den enskilda droppen eller den relevanta radbokstaven eller kolumnnumret.
När du har valt alla brunnar som är associerade med en enskild grupp anger du ett namn för gruppen i rutan för exempelgruppnamn och klickar på knappen Spara provgrupp. Klicka på knappen Visa exempelgrupp på den här sidan för att återgå till listan över redan genererade exempelgrupper som är associerade med förslaget och fortsätta med databehandlingen.
