For at begynde skal du placere en stålkasse med et låg udstyret med en ventil til en vakuumpumpeforbindelse på en kogeplade. Fyld kassen op til cirka to centimeter med paraffin og vent, indtil den er helt smeltet. Tag de monterede kerner ud af transportkassen.
Placer holderne med kernerne i den flydende paraffin og luk låget. Start derefter vakuumpumpen, og påfør et konstant let vakuum på beholderen. Når du har stoppet vakuumpumpen, skal du åbne låget.
Tag holderne ud med kernerne, læg dem på et gitter og lad dem køle af. Fjern om nødvendigt overskydende paraffin fra siderne af holderen. Fjern de monterede kerner fra transportkassen eller paraffinbadet.
Placer holderen med kernen i prøveholderen på et kernemikrotom. Sørg for, at ringenes latewood vender mod klingen. Spænd nu skruerne på prøveholderen, indtil kerneholderen er helt fast.
Løft prøveholderen, indtil kernen rører klingen lidt. Træk bladet over hele kernen for at skære den første del af toppen af. Skub derefter kniven tilbage bag kernen, og løft prøveholderen et par mikron.
Når overfladen er skåret efter hensigten, fjernes kerneholderen fra mikrotomets prøveholder.
