Utfør enkeltmolekylavbildningen i et kommersielt oppsett, og kombiner optisk pinsett med to stråler med konfokalmikroskopi. Bruk injiseringskanal én for perlefangst, kanal to for DNA-proteinkompleksbinding, kanal tre for å kontrollere tilstedeværelsen av CMG og kanal fire og fem som proteinreservoarer og bufferutvekslingssteder. Flyt alle løsninger inn i strømningscellen med et konstant trykk på 0,5 bar i injeksjonsporten.
Slå deretter av strømmen i kanal fire og fem. Etter å ha strømmet alle løsningene, reduser trykket til 0,2 bar. Flytt fangstlasere til kanal én til én perle er fanget i hver optiske felle.
Flytt fastklemte perler til kanal to ved å flytte styrespaken mens du trykker på avtrekkeren. Ved å bruke joysticken uten å trykke på avtrekkeren fisker du et DNA CMG-kompleks ved å flytte høyre perle mot og bort fra venstre perle til en DNA-tjoring er fanget. Flytt perlene til kanal tre og stopp umiddelbart strømmen i alle kanaler.
Juster lasereffekten på 561 nanometer til fire mikrowatt i eksitasjonslaserpanelet og ta deretter en testskanning av DNA i kanal tre. Hvis den er tilstede, vil CMG vises som todimensjonale diffraksjonsbegrensede flekker. I dette tilfellet, flytt DNA-tauet til enten kanal fire eller fem for bildediagnostikk.
Ellers slår du på strømmen igjen, kaster perlene og gjentar trinnene. I kanal fire eller fem legger du inn to pikonewtoner i kraftspektroskopipanelet, og klikk på aktiveringsknappen for å starte en kraftklemme. Når den første spenningen når to pikonewtoner, deaktiverer du kraftklemmen før avbildning ved å klikke igjen på aktiveringsknappen i kraftspektroskopipanelet.
Klikk på Start skanning-knappen i bildeskanningspanelet. Avbilder fluorescerende CMG hvert femte sekund med en 561 nanometer laser med en effekt på fire mikrowatt målt ved objektivet. I en aggregeringsfri reaksjon fremsto CMG som diskrete, symmetriske diffraksjonsbegrensede flekker som tynt trengte DNA.
Tvert imot er aggregater mindre diskrete, noen ganger asymmetriske klumper som trengs sammen med en større lengde av DNA. Hvis analysen ble vellykket utført og høy renhet av de rensede proteinene ble oppnådd, kunne langdistansebevegelse av CMG i nærvær av ATP observeres.
