Name: bacterial delivery of rnai effectors: transkingdom rnai
Uploaded: 2010-08-18T17:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Bacterial Delivery of RNAi Effectors: Transkingdom RNAi at JoVE.com

Werk werd ondersteund door subsidie ​​niet. 01GU0615 van het &quot;Bundesministerium für Forschung und Technologie (BMBF).

1) Bacteriële Levering van shRNAs <ol><li> Alvorens te beginnen met de bacteriecultuur, moet men zich voor te bereiden LB-medium en LB-agar. </li><li> Voor de LB-medium afwegen gistextract (0,5% w / v), Bacto trypton (1,0% w / v), en NaCl (0,6% w / v) en verdun deze componenten in aqua bidest. De bereide oplossingen moeten worden gesteriliseerd in een autoclaaf en zijn dan klaar voor gebruik. </li><li> Voor de LB-agar platen Bacto agar (1,5% w / v) moet worden toegevoegd aan het LB-medium voorafgaand aan sterilisatie...

<ol>
	<li>Kr&#252;hn, A., Wang, A., Fruehauf, J. H., Lage, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Delivery+of+short+hairpin+RNAs+by+transkingdom+RNA+interference+modulates+the+classical+ABCB1-mediated+multidrug-resistant+phenotype+of+cancer+cells.">Delivery of short hairpin RNAs by transkingdom RNA interference modulates the classical ABCB1-mediated multidrug-resistant phenotype of cancer cells.</a> Cell Cycle. 8, 3349-3354 (2009).</li><li>Lage, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MDR1/P-glycoprotein+(ABCB1)+as+target+for+RNA+interference-mediated+reversal+of+multidrug+resistance.">MDR1/P-glycoprotein (ABCB1) as target for RNA interference-mediated reversal of multidrug resistance.</a> Curr. Drug Targets. 7, 813-821 (2006).</li><li>Lage, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+overview+of+cancer+multidrug+resistance:+a+still+unsolved+problem.">An overview of cancer multidrug resistance: a still unsolved problem.</a> Cell. Mol. Life Sci. 65, 3145-3167 (2008).</li><li>Lage, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Therapeutic+potential+of+RNA+interference+in+drug-resistant+cancers.">Therapeutic potential of RNA interference in drug-resistant cancers.</a> Fut. Oncol. 5, 169-185 (2009).</li><li>Nguyen, T. A., Fruehauf, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transkingdom+RNA+interference+(tkRNAi):+a+novel+method+to+induce+therapeutic+gene+silencing.">Transkingdom RNA interference (tkRNAi): a novel method to induce therapeutic gene silencing.</a> Methods Mol. Biol. 514, 27-34 (2009).</li><li>Nieth, C., Priebsch, A., Stege, A., Lage, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modulation+of+the+classical+multidrug+resistance+(MDR)+phenotype+by+RNA+interference+(RNAi.">Modulation of the classical multidrug resistance (MDR) phenotype by RNA interference (RNAi.</a> FEBS Lett. 545, 144-150 (2003).</li><li>Stege, A., Priebsch, A., Nieth, C., Lage, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stable+and+complete+overcoming+of+MDR1/P-glycoprotein-mediated+multidrug+resistance+in+human+gastric+carcinoma+cells+by+RNA+interference.">Stable and complete overcoming of MDR1/P-glycoprotein-mediated multidrug resistance in human gastric carcinoma cells by RNA interference.</a> Cancer Gene Ther. 11, 699-706 (2004).</li><li>Stein, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Complete+in+vivo+reversal+of+the+multidrug+resistance+(MDR)+phenotype+by+jet-injection+of+anti-MDR1+short+hairpin+RNA-encoding+plasmid+DNA.">Complete in vivo reversal of the multidrug resistance (MDR) phenotype by jet-injection of anti-MDR1 short hairpin RNA-encoding plasmid DNA.</a> Mol. Ther. 16, 178-186 (2008).</li><li>Xiang, S., Fruehauf, J., Li, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Short+hairpin+RNA-expressing+bacteria+elicit+RNA+interference+in+mammals.">Short hairpin RNA-expressing bacteria elicit RNA interference in mammals.</a> Nat. Biotechnol. 24, 697-702 (2006).</li></ol>

Het aantal cellen gezaaid voor infectie en de bijbehorende MOI gebruikte mate afhangen van de cellijnen onder observatie en hun snelheid van de groei. Om te weten een optimale cel nummers voor het zaaien, zijn pre-experimenten om de snelheid van de groei te bepalen sterk aanbevolen. Daarnaast moeten verschillende MOIS worden getest vanwege de beperkte mate waarin de cellen kan de bacteriële invasie staan ​​zonder te sterven van de stress. De optimale tijdstip waar de down regulatie van het gen onder observatie kan ...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Agar</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Biochrom AG</td>
<td>214050</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Amphotericin B</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Biochrom AG</td>
<td>A2612</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Dulbecco's Phosphate Buffered Saline-PBS (10 x)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen GmbH</td>
<td>14080048</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>E. coli ceq221</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cequent Pharmaceuticals Inc.</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>No catalogue available, direct order</td>
</tr>
<tr>
<td>Gentamycin</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Biochrom AG</td>
<td>A2710</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Penicillin/Streptomycin</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen GmbH</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Contains 5,000 units of penicillin (base) and 5,000 &mu;g of streptomycin (base)/ml utilizing penicillin G (sodium salt) and streptomycin sulfate in 0.85% saline.</td>
</tr>
<tr>
<td>Sodium chloride</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Merck KgaA</td>
<td>1064060500</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Tryptone</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Difco Laboratories</td>
<td>211705</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Yeast Extract</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Difco Laboratories</td>
<td>212750</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

bacterial delivery of rnai effectors: transkingdom rnai

RNA-interferentie (RNAi) staat voor een hoog effectief mechanisme voor de specifieke remming van mRNA-expressie. Naast zijn potentieel als een krachtig laboratorium instrument, de RNAi pathway lijkt veelbelovend te zijn voor therapeutische gebruik. Voor de ontwikkeling van RNA-interferentie (RNAi)-gebaseerde therapieën, levering van de RNAi-bemiddelen agenten om target cellen is een van de belangrijkste obstakels. Een nieuwe strategie om deze horde te overwinnen is transkingdom RNAi (tk RNAi). Deze technologie maakt gebruik van niet-pathogene bacteriën, zoals Escherichia coli, te produceren en therapeutische short hairpin RNA (shRNA) leveren in doel-cellen om RNAi induceren. Een van de eerste generatie tk RNAi-vector bemiddelen, TRIP, bevat de bacteriofaag T7 promoter voor expressie regulatie van een therapeutisch shRNA van belang. Bovendien TRIP heeft de Inv locus van Yersinia pseudotuberculosis dat invasin codeert, die natuurlijk niet-invasieve bacteriën vergunningen in te voeren β1-integrine-positieve zoogdiercellen en het HlyA gen van Listeria monocytogenes, die produceert listeriolysin O. Dit enzym kan de therapeutische shRNA om te ontsnappen aan entry blaasjes in het cytoplasma van de doelcel. TRIP constructen worden geïntroduceerd in een bevoegde niet-pathogene Escherichia coli stam, die T7 RNA polymerase die noodzakelijk zijn voor de T7 promoter gedreven synthese van shRNAs codeert. Een goed gekarakteriseerd kanker-geassocieerde doelwitmolecule voor de verschillende strategieën RNAi is ABCB1 (MDR1/P-glycoprotein, MDR1/P-gp). Dit ABC-transporter werkt als een drug extrusie pomp en bemiddelt de &quot;klassieke&quot; ABCB1-gemedieerde multidrug resistance (MDR) fenotype van menselijke kankercellen die wordt gekenmerkt door een specifieke cross resistentiepatroon. Verschillende ABCB1 expressie MDR kankercellen werden behandeld met anti-ABCB1 shRNA expressievector met E. coli. Deze procedure resulteerde in de activering van de RNAi trajecten in de kankercellen en een aanzienlijke neerwaartse regulatie van de ABCB1 codering mRNA, alsmede de bijbehorende drug extrusie pomp. Bijgevolg werd accumulatie van het geneesmiddel versterkt in de ongerepte resistente kankercellen en de MDR-fenotype werd teruggedraaid. Door middel van dit model de gegevens te verstrekken van de proof-of-concept dat tk RNAi is geschikt voor de modulatie van kanker-geassocieerde factoren, zoals ABCB1, in menselijke kankercellen.

Watch this Scientific Journal Video about Bacterial Delivery of RNAi Effectors: Transkingdom RNAi at JoVE.com

Bacterial Delivery of RNAi Effectors: Transkingdom RNAi

Voor de ontwikkeling van RNA-interferentie (RNAi)-gebaseerde therapieën, was een nieuwe strategie ontwikkeld, transkingdom RNAi (tkRNAi). Deze technologie maakt gebruik van niet-pathogene bacteriën te produceren en therapeutische short hairpin RNA (shRNA) leveren in doelcellen. Hier werd tkRNAi met succes toegepast voor omkering van de klassieke ABCB1-gemedieerde multidrug resistance (MDR) van kankercellen.

Bacteriële Levering van RNAi effectors: Transkingdom RNAi

RNA interference (RNAi) represents a high effective mechanism for specific inhibition of mRNA expression. Besides its potential as a powerful laboratory ...

Research

JoVE Journal

Biology

Protocol for RNAi Assays in Adult Mosquitoes (A. gambiae)

Protocol for RNAi Assays in Adult Mosquitoes A. gambiae

Protocol voor RNAi Testen in volwassen muggen (A. gambiae)

Reverse genetic approaches have proven extremely useful for determining  which genes underly resistance to vector pathogens in mosquitoes.  This video ...

Localized RNAi and Ectopic Gene Expression in the Medicinal Leech

Gelokaliseerde RNAi en ectopische genexpressie in de medicinale bloedzuiger

In this video, we show the use of a pneumatic capillary gun for the accurate biolistic delivery of reagents into live tissue. We use the procedure to ...

Identification of Growth Inhibition Phenotypes Induced by Expression of Bacterial Type III Effectors in Yeast

Identificatie van groeiremming fenotypes geïnduceerd door expressie van bacteriële type III Effector in gist

Many Gram-negative pathogenic bacteria use a type III secretion system to translocate a suite of effector proteins into the cytosol of host cells. Within ...

MISSION esiRNA for RNAi Screening in Mammalian Cells

MISSIE esiRNA voor RNAi Screening in zoogdiercellen

RNA interference (RNAi) is a basic cellular mechanism for the control of gene expression. RNAi is induced by short double-stranded RNAs also known as ...

RNAi Interference by dsRNA Injection into Drosophila Embryos

RNAi Interference by dsRNA Injection into Drosophila Embryos

RNAi Interferentie door dsRNA Injectie in Drosophila Embryo&#39;s

Genetic screening is one of the most powerful methods available for gaining insights into complex biological process 1. Over the years many improvements ...

RNAi Mediated Gene Knockdown and Transgenesis by Microinjection in the Necromenic Nematode Pristionchus pacificus

RNAi Mediated Gene Knockdown and Transgenesis by Microinjection in the Necromenic Nematode Pristionchus pacificus

RNAi Mediated Gene Knockdown en Transgenese door micro-injectie in de Necromenic Nematode Pristionchus pacificus</em

Although it is increasingly affordable for emerging model organisms to obtain completely sequenced genomes, further in-depth gene function and expression ...

RNAi Screening to Identify Postembryonic Phenotypes in C. elegans

RNAi Screening to Identify Postembryonic Phenotypes in C. elegans

RNAi screening Postembryonic fenotypes Leg in C. elegans</em

C. elegans has proven to be a valuable model system for the discovery and functional characterization of many genes and gene pathways1. More sophisticated ...

Quantitative and Automated High-throughput Genome-wide RNAi Screens in C. elegans

Quantitative and Automated High-throughput Genome-wide RNAi Screens in C. elegans

Kwantitatieve en geautomatiseerde high-throughput genoomwijde RNAi schermen in C. elegans</em

RNA interference is a powerful method to understand gene function, especially when conducted at a whole-genome scale and in a quantitative context. In C. ...

RNAi-mediated Gene Knockdown and In Vivo Diuresis Assay in Adult Female Aedes aegypti Mosquitoes

RNAi-mediated Gene Knockdown and In Vivo Diuresis Assay in Adult Female Aedes aegypti Mosquitoes

RNAi-gemedieerde Gene Knockdown en<em&gt; In Vivo</em&gt; Urineproductie Assay in het volwassenenonderwijs Vrouw<em&gt; Aedes aegypti</em&gt; Muggen

This video protocol demonstrates an effective technique to knockdown a particular gene in an insect and conduct a novel bioassay to measure excretion ...

Phosphopeptide Analysis of Rodent Epididymal Spermatozoa

Fosfopeptide Analyse van knaagdieren Epididymal Spermatozoa

Spermatozoa are quite unique amongst cell types. Although produced in the testis, both nuclear gene transcription and translation are switched off once ...