Name: large scale zebrafish-based in vivo small molecule screen
Uploaded: 2010-12-30T17:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Large Scale Zebrafish-Based In vivo Small Molecule Screen at JoVE.com

1) جمع بيض اسماك الزرد <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> بعد ظهر يوم قبل يوم من الشاشة الكيميائية ، وإعداد 10-20 الدبابات تربية الزرد. ملء كل صهريج ماء من نظام تربية الأحياء المائية. باستخدام صافي الأسماك ، نقل أحد الذكور والإناث البالغين الكبار 1-2 إلى حاو...

<ol>
	<li>Bayliss, P. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+modulation+of+receptor+signaling+inhibits+regenerative+angiogenesis+in+adult+zebrafish.">Chemical modulation of receptor signaling inhibits regenerative angiogenesis in adult zebrafish.</a> Nature chemical biology. 2, 265-273 (2006).</li><li>Burns, C. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+assay+for+small+molecules+that+modulate+zebrafish+embryonic+heart+rate.">High-throughput assay for small molecules that modulate zebrafish embryonic heart rate.</a> Nature chemical biology. 1, 263-264 (2005).</li><li>Hao, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+structure-activity+relationship+study+of+dorsomorphin+analogues+identifies+selective+VEGF+and+BMP+inhibitors.">In vivo structure-activity relationship study of dorsomorphin analogues identifies selective VEGF and BMP inhibitors.</a> ACS chemical biology. 5, 245-253 (2010).</li><li>Hong, C. C., Peterson, Q. P., Hong, J. Y., Peterson, R. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Artery/vein+specification+is+governed+by+opposing+phosphatidylinositol-3+kinase+and+MAP+kinase/ERK+signaling.">Artery/vein specification is governed by opposing phosphatidylinositol-3 kinase and MAP kinase/ERK signaling.</a> Curr Biol. 16, 1366-1372 (2006).</li><li>Milan, D. J., Peterson, T. A., Ruskin, J. N., Peterson, R. T., MacRae, C. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Drugs+that+induce+repolarization+abnormalities+cause+bradycardia+in+zebrafish.">Drugs that induce repolarization abnormalities cause bradycardia in zebrafish.</a> Circulation. 107, 1355-1358 (2003).</li><li>Peterson, R. T., Link, B. A., Dowling, J. E., Schreiber, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Small+molecule+developmental+screens+reveal+the+logic+and+timing+of+vertebrate+development.">Small molecule developmental screens reveal the logic and timing of vertebrate development.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97, 12965-12969 (2000).</li><li>Yu, P. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dorsomorphin+inhibits+BMP+signals+required+for+embryogenesis+and+iron+metabolism.">Dorsomorphin inhibits BMP signals required for embryogenesis and iron metabolism.</a> Nature chemical biology. 4, 33-41 (2008).</li><li>Zon, L. I., Peterson, R. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+drug+discovery+in+the+zebrafish.">In vivo drug discovery in the zebrafish.</a> Nature reviews. 4, 35-44 (2005).</li><li>Stern, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Small+molecules+that+delay+S+phase+suppress+a+zebrafish+bmyb+mutant.">Small molecules that delay S phase suppress a zebrafish bmyb mutant.</a> Nature chemical biology. 1, 366-370 (2005).</li><li>Peterson, R. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+suppression+of+a+genetic+mutation+in+a+zebrafish+model+of+aortic+coarctation.">Chemical suppression of a genetic mutation in a zebrafish model of aortic coarctation.</a> Nature biotechnology. 22, 595-599 (2004).</li></ol>

عند التخطيط لشاشة الكيميائية الزرد مقرها ، يجب إيلاء اهتمام خاص لمتانة النمط الظاهري قيد النظر ، ومعدل خلفية النمط الظاهري من هذا القبيل. وهذا أمر مهم لا سيما بالنسبة للشاشات المكثفات الكيميائية من النمط الظاهري المستحث. على سبيل المثال ، عن النمط الظاهري التي تسببه...

<ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> الحد الأدنى من 20 زوجا من الزرد البالغين من النمط الجيني المطلوب. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> شباك الصيد ، وخزانات تربية ، مع الحاويات الداخلية القابلة للإزالة ، والمقسمات (الموائل المائية). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> أطباق بتري (10 سم). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> البلاستيك مصفاة الشاي. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تغسل زجاجة ماء الجنين containg. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> المتاح ماصات نقل البولي ايثيلين. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> البوليسترين 96 - جيدا لوحات فحص الجولة القاع (كورنينج COSTAR ؛ ويل ، MA). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> الزجاج ماصة باستير (فيشر العلمية). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> دليل مضخة ماصة ، 10 مل (بلجيكا أحدث المنتجات ، Pequannock ، ونيو جيرسي). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> E3 المتوسطة الجنين : 5 مم كلوريد الصوديوم ، 0.17 ملي بوكل ، 0.33 ملي CaCl 2 ، 0.33 ملي MgSO 4 ، تحتوي على 0.003 ٪ PTU (phenylthio - كارباميد ، سيغما ؛ سانت لويس ، MO). يمكن إعداد PTU كحل 10X عن طريق إذابة 0.3 جم PTU في 1 لتر من وسائل الإعلام الجنين E3. يجب حماية المحاليل المحتوية على PTU من الضوء من خلال تغطية بورق الألمنيوم. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> 12 قناة ماصات ، 20-20 ميكرولتر (إيبندورف). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> 12 قناة ماصات ، 300-300 ميكرولتر (إيبندورف). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> البوليسترين القابل للتصرف ماصة الحوض ، 50 مل (فيشر العلمية). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> مكتبة صغيرة جزيء من المركبات المتنوعة هيكليا المحتشدة في شكل 96 - WLL في الأسهم 10 ملم في DMSO. كل لوحة هي aliquoted الماجستير في 96 - جيدا لوحات تخزين البولي بروبلين (كورنينج) ، وتخزينها في -80 درجة مئوية حتى الاستخدام. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> الالومنيوم ختم الشريط ل96 - جيدا لوحات (نونك ، روتشستر ، نيويورك). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> DMSO (سيغما ، وسانت لويس ، MO). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> الحاضنة الأساسية ، 28.5 درجة مئوية (فيشر العلمية). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Stereomicroscope مع قاعدة الضوء المرسل (لايكا مايكروسيستمز ، بانوكبورن ، IL). </li></ol>

large scale zebrafish-based in vivo small molecule screen

نظرا لحجمها الصغير الجنين ، التطور السريع ، والشفافية ، والخصوبة ، والعديد من أوجه الشبه الجزيئي ، المورفولوجية والفسيولوجية للثدييات ، برز الزرد وقوية<em&gt; في الجسم الحي</em&gt; منصة لشاشات المخدرات النمط الظاهري القائم على التحليل الكيميائي والجيني. هنا ، علينا أن نظهر بسيطة ، طريقة عملية واسعة النطاق لفحص الجزيئات الصغيرة باستخدام الأجنة الزرد.

Watch this Scientific Journal Video about Large Scale Zebrafish-Based In vivo Small Molecule Screen at JoVE.com

Large Scale Zebrafish-Based In vivo Small Molecule Screen

كما برز الزرد قوية<em&gt; في الجسم الحي</em&gt; منصة لشاشات المخدرات النمط الظاهري القائم على التحليل الكيميائي والجيني. هنا ، علينا أن نظهر بسيطة ، طريقة عملية واسعة النطاق لفحص الجزيئات الصغيرة باستخدام الأجنة الزرد.

اسماك الزرد نطاق واسع ، واستنادا في الجسم الحي شاشة جزيء صغير

Given their small embryo size, rapid development, transparency, fecundity, and numerous molecular, morphological and physiological similarities to ...

Research

JoVE Journal

Biology

Large Scale Zebrafish-Based In vivo Small Molecule Screen

Large-Scale Screens of Metagenomic Libraries

على نطاق واسع من شاشات مكتبات Metagenomic

Metagenomic libraries archive large fragments of contiguous genomic sequences from microorganisms without requiring prior cultivation.  Generating a ...

Batch Immunostaining for Large-Scale Protein Detection in the Whole Monkey Brain

Immunostaining دفعي للكشف عن البروتين واسعة النطاق في الدماغ القرد الجامعة

Immunohistochemistry (IHC) is one of the most widely used laboratory techniques for the detection of target proteins in situ. Questions concerning the ...

Isolation and Large Scale Expansion of Adult Human Endothelial Colony Forming Progenitor Cells

العزلة وتوقعات بنمو كبير من الكبار الإنسان خلايا غشائي السلف تشكيل مستعمرة

This paper introduces a novel recovery strategy for endothelial colony forming progenitor cells (ECFCs) from heparinized but otherwise unmanipulated adult ...

Efficient Derivation of Human Cardiac Precursors and Cardiomyocytes from Pluripotent Human Embryonic Stem Cells with Small Molecule Induction

كفاءة اشتقاق السلائف القلب البشري وافرة القوة العضلية من خلايا المنشأ الجنينية البشرية التعريفي مع جزيء صغير

To date, the lack of a suitable human cardiac cell source has been the major setback in regenerating the human myocardium, either by cell-based ...

Small-scale Nuclear Extracts for Functional Assays of Gene-expression Machineries

على نطاق صغير مقتطفات النووية لفحوصات وظيفي من الجينات التعبير عن مكائن

A great deal of progress in understanding gene expression has been made using in vitro systems.  For most studies, functional assays are carried out using ...

High-throughput Screening for Small-molecule Modulators of Inward Rectifier Potassium Channels

الفرز الفائق الإنتاجية الصغيرة للجزيء المغيرون من الداخل قنوات البوتاسيوم المعدل

Specific members of the inward rectifier potassium (Kir) channel family are postulated drug targets for a variety of disorders, including hypertension, ...

Infinium Assay for Large-scale SNP Genotyping Applications

Infinium الفحص على نطاق واسع لتطبيقات SNP التنميط الجيني

Genotyping variants in the human genome has proven to be an efficient method to identify genetic associations with phenotypes. The distribution of ...

A Strategy for Sensitive, Large Scale Quantitative Metabolomics

استراتيجية للحساسية، مقياس كبيرة الكمية الايض

Metabolite profiling has been a valuable asset in the study of metabolism in health and disease. However, current platforms have different limiting ...

A Manual Small Molecule Screen Approaching High-throughput Using Zebrafish Embryos

دليل جزيء صغير شاشة تقترب عالية الإنتاجية عن طريق الزرد الأجنة

Zebrafish have become a widely used model organism to investigate the mechanisms that underlie developmental biology and to study human disease pathology ...

Novel Production Protocol for Small-scale Manufacture of Probiotic Fermented Foods

بروتوكول إنتاج رواية لتصنيع على نطاق صغير من بروبيوتيك المخمرة للأغذية

A novel dried bacterial consortium of Lactobacillus rhamnosus yoba 2012 and Streptococcus thermophilus C106 is cultured in 1 L of milk. This fresh starter ...