Name: large scale zebrafish-based in vivo small molecule screen
Uploaded: 2010-12-30T17:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Large Scale Zebrafish-Based In vivo Small Molecule Screen at JoVE.com

1) Zebrafish अंडे संग्रह <ol><li> रासायनिक स्क्रीन के दिन से पहले दोपहर में 10 से 20 zebrafish प्रजनन टैंक सेट. प्रत्येक टैंक जलीय कृषि प्रणाली से पानी के साथ भरें. एक मछली जाल का प्रयोग, प्रत्येक प्रजनन टैंक में आंतरिक कंटे?...

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	<li>Bayliss, P. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+modulation+of+receptor+signaling+inhibits+regenerative+angiogenesis+in+adult+zebrafish.">Chemical modulation of receptor signaling inhibits regenerative angiogenesis in adult zebrafish.</a> Nature chemical biology. 2, 265-273 (2006).</li><li>Burns, C. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+assay+for+small+molecules+that+modulate+zebrafish+embryonic+heart+rate.">High-throughput assay for small molecules that modulate zebrafish embryonic heart rate.</a> Nature chemical biology. 1, 263-264 (2005).</li><li>Hao, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+structure-activity+relationship+study+of+dorsomorphin+analogues+identifies+selective+VEGF+and+BMP+inhibitors.">In vivo structure-activity relationship study of dorsomorphin analogues identifies selective VEGF and BMP inhibitors.</a> ACS chemical biology. 5, 245-253 (2010).</li><li>Hong, C. C., Peterson, Q. P., Hong, J. Y., Peterson, R. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Artery/vein+specification+is+governed+by+opposing+phosphatidylinositol-3+kinase+and+MAP+kinase/ERK+signaling.">Artery/vein specification is governed by opposing phosphatidylinositol-3 kinase and MAP kinase/ERK signaling.</a> Curr Biol. 16, 1366-1372 (2006).</li><li>Milan, D. J., Peterson, T. A., Ruskin, J. N., Peterson, R. T., MacRae, C. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Drugs+that+induce+repolarization+abnormalities+cause+bradycardia+in+zebrafish.">Drugs that induce repolarization abnormalities cause bradycardia in zebrafish.</a> Circulation. 107, 1355-1358 (2003).</li><li>Peterson, R. T., Link, B. A., Dowling, J. E., Schreiber, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Small+molecule+developmental+screens+reveal+the+logic+and+timing+of+vertebrate+development.">Small molecule developmental screens reveal the logic and timing of vertebrate development.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97, 12965-12969 (2000).</li><li>Yu, P. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dorsomorphin+inhibits+BMP+signals+required+for+embryogenesis+and+iron+metabolism.">Dorsomorphin inhibits BMP signals required for embryogenesis and iron metabolism.</a> Nature chemical biology. 4, 33-41 (2008).</li><li>Zon, L. I., Peterson, R. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+drug+discovery+in+the+zebrafish.">In vivo drug discovery in the zebrafish.</a> Nature reviews. 4, 35-44 (2005).</li><li>Stern, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Small+molecules+that+delay+S+phase+suppress+a+zebrafish+bmyb+mutant.">Small molecules that delay S phase suppress a zebrafish bmyb mutant.</a> Nature chemical biology. 1, 366-370 (2005).</li><li>Peterson, R. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+suppression+of+a+genetic+mutation+in+a+zebrafish+model+of+aortic+coarctation.">Chemical suppression of a genetic mutation in a zebrafish model of aortic coarctation.</a> Nature biotechnology. 22, 595-599 (2004).</li></ol>

जब एक रासायनिक zebrafish आधारित स्क्रीन की योजना बना, विशेष रूप से ध्यान विचाराधीन phenotype और ऐसे phenotype की पृष्ठभूमि दर की मजबूती के लिए भुगतान किया जाना चाहिए. यह एक प्रेरित phenotype के रासायनिक दमन के लिए स्क्रीन के लि...

<ol><li> वांछित जीनोटाइप के वयस्क zebrafish के 20 जोड़े की न्यूनतम. </li><li> मछली जाल, हटाने योग्य आंतरिक कंटेनर और डिवाइडर (एक्वाटिक निवास) के साथ प्रजनन टैंक. </li><li> पेट्री डिश (10 सेमी). </li><li> प्लास्टिक चाय का झरनी. </li><li> बोतल containg भ्रूण पानी धो लें. </li><li> प्रयोज्य पॉलीथीन हस्तांतरण pipettes. </li><li> Polystyrene 96 अच्छी तरह गोल नीचे परख प्लेटें (Corning costar, लोवेल, एमए). </li><li> ग्लास पाश्चर विंदुक (फिशर साइंटिफिक). </li><li> मैनुअल विंदुक पंप, 10 एमएल (उत्पाद बेल कला, Pequannock, न्यू जर्सी). </li><li> E3 भ्रूण मध्यम: 5 मिमी NaCl, .17 मिमी KCl, .33 मिमी 2 CaCl, .33 मिमी MgSO 4, 0.003% PTU (phenylthio - carbamide, सिग्मा, सेंट लुइस, MO) युक्त. PTU E3 भ्रूण मीडिया के 1 एल में 0.3 छ PTU भंग के द्वारा एक 10x समाधान के रूप में तैयार किया जा सकता है. PTU युक्त समाधान एल्यूमीनियम पन्नी के साथ कवर द्वारा प्रकाश से रक्षा की जानी चाहिए. </li><li> 12 चैनल pipettes, 2-20 μL (Eppendorf). </li><li> 12 चैनल pipettes, 3-300 μL (Eppendorf). </li><li> प्रयोज्य polystyrene विंदुक बेसिन, 50 एमएल (फिशर साइंटिफिक). </li><li> संरचनात्मक विविध DMSO में 10 मिमी शेयर पर 96 डब्ल्यूएलएल प्रारूप में arrayed यौगिकों के छोटे अणु पुस्तकालय. प्रत्येक मास्टर प्लेट 96 अच्छी तरह polypropylene भंडारण प्लेट (Corning) में aliquoted है, और -80 ° उपयोग पर जब तक सी संग्रहीत. </li><li> एल्यूमिनियम 96 अच्छी तरह से प्लेटों के लिए टेप सील (Nunc, Rochester, NY). </li><li> DMSO (सिग्मा, सेंट लुइस, MO). </li><li> बेसिक इनक्यूबेटर, 28.5 डिग्री सेल्सियस (फिशर साइंटिफिक). </li><li> प्रेषित प्रकाश आधार (Leica माइक्रोसिस्टम्स, Bannockburn, आईएल) के साथ stereomicroscope. </li></ol>

large scale zebrafish-based in vivo small molecule screen

उनके छोटे भ्रूण आकार, तेजी से विकास, पारदर्शिता, उपजाऊपन, और स्तनधारियों के लिए कई आणविक, morphological और शारीरिक समानता को देखते हुए, zebrafish एक शक्तिशाली रूप में उभरा है<em&gt; Vivo में</em&gt; Phenotype आधारित दवा स्क्रीन और रासायनिक आनुवांशिक विश्लेषण के लिए मंच. यहाँ, हम बड़े पैमाने पर zebrafish भ्रूण का उपयोग कर छोटे अणुओं की स्क्रीनिंग के लिए एक सरल, व्यावहारिक विधि प्रदर्शित करता है.

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Large Scale Zebrafish-Based In vivo Small Molecule Screen

Zebrafish एक शक्तिशाली रूप में उभरा है<em&gt; Vivo में</em&gt; Phenotype आधारित दवा स्क्रीन और रासायनिक आनुवांशिक विश्लेषण के लिए मंच. यहाँ, हम बड़े पैमाने पर zebrafish भ्रूण का उपयोग कर छोटे अणुओं की स्क्रीनिंग के लिए एक सरल, व्यावहारिक विधि प्रदर्शित करता है.

बड़े पैमाने पर Zebrafish आधारित Vivo में लघु अणु स्क्रीन

Given their small embryo size, rapid development, transparency, fecundity, and numerous molecular, morphological and physiological similarities to ...

Research

JoVE Journal

Biology

Large Scale Zebrafish-Based In vivo Small Molecule Screen

Large-Scale Screens of Metagenomic Libraries

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Batch Immunostaining for Large-Scale Protein Detection in the Whole Monkey Brain

साबुत बंदर के मस्तिष्क में बड़े पैमाने पर प्रोटीन पता लगाने के लिए बैच Immunostaining

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High-throughput Screening for Small-molecule Modulators of Inward Rectifier Potassium Channels

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Specific members of the inward rectifier potassium (Kir) channel family are postulated drug targets for a variety of disorders, including hypertension, ...

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बड़े पैमाने पर SNP जीनोटाइपिंग अनुप्रयोगों के लिए इंफिनियम परख

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A Strategy for Sensitive, Large Scale Quantitative Metabolomics

संवेदनशील, बड़े पैमाने पर मात्रात्मक Metabolomics के लिए एक रणनीति

Metabolite profiling has been a valuable asset in the study of metabolism in health and disease. However, current platforms have different limiting ...

A Manual Small Molecule Screen Approaching High-throughput Using Zebrafish Embryos

Zebrafish भ्रूण का उपयोग उच्च throughput आ मैनुअल छोटे अणु स्क्रीन

Zebrafish have become a widely used model organism to investigate the mechanisms that underlie developmental biology and to study human disease pathology ...

Novel Production Protocol for Small-scale Manufacture of Probiotic Fermented Foods

छोटे पैमाने पर प्रोबायोटिक किण्वित खाद्य पदार्थों के निर्माण के लिए उपन्यास उत्पादन प्रोटोकॉल

A novel dried bacterial consortium of Lactobacillus rhamnosus yoba 2012 and Streptococcus thermophilus C106 is cultured in 1 L of milk. This fresh starter ...