Name: purification of hsp104, a protein disaggregase
Uploaded: 2011-09-30T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Purification of Hsp104, a Protein Disaggregase at JoVE.com

وأيد هذا العمل عن طريق منحة من المعاهد القومية للصحة (5T32GM008275 - 22) ، وزمالة جمعية القلب الاميركية predoctoral (لقمة شرق آسيا) ، وزمالة واجهة الكيمياء ، علم الأحياء من المعاهد الوطنية للصحة (2T32GM071339 - 06A1) (لMED) ، والمنح المقدمة من المعاهد الوطنية للصحة (1DP2OD002177 - 01 - 0110 وNS067354) ، والمؤسسة الطبية إليسون ، ومؤسسة بيل وميليندا غيتس (للشبيبة).

1. التعبير عن Hsp104 <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> وتستخدم لتنقية البلازميد في E. القولونية ، pPROEX - HTB - Hsp104 ، يحتوي على Hsp104 مفتوح القراءة الإطار تحت سيطرة محرض لجنة الحقيقة والمصالحة المروج 26. وتنتج Hsp104 البلازميد مع N - محطة صاحب العلامة - <...

الجدول الزمني : بالنسبة للنشاط Hsp104 القصوى من المستحسن أن يتم الانتهاء من خطة لتنقية كامل في أسرع وقت ممكن. ومع ذلك ، فإن عددا من الخطوات لتنقية جدول زمني يجعل المطالبة التي قد لا تكون دائما عملية. إذا نفذت الخطوات تنقية في أسرع وقت ممكن ، والوقت من نهاية التعبير من ?...

<table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><th> اسم كاشف </th><th> شركة </th><th> فهرس العدد </th></tr><tr><td> BL21 - CodonPlus - RIL الخلايا المختصة </td><td> Stratagene ، اجيلنت تكنولوجيز </td><td> 230255 </td></tr><tr><td> 2XYT مرق </td><td> USB </td><td> 75864 </td></tr><tr><td> كاملة ، صغير ، مثبط البروتياز EDTA خالية اقراص </td><td> روش </td><td> 1836170 </td></tr><tr><td> Pepstatin A </td><td> سيغما </td><td> P4265 </td></tr><tr><td> NI - 6 Sepharose التدفق السريع </td><td> جنرال إلكتريك للرعاية الصحية </td><td> 17-5318-02 </td></tr><tr><td> Amicon الترا 15 وحدة تصفية الطرد المركزي (MWCO 30،000) </td><td> ميليبور </td><td> UFC903008 </td></tr><tr><td> الموارد س -- العمود 6ml </td><td> جنرال إلكتريك للرعاية الصحية </td><td> 17-1179-01 </td></tr><tr><td> proTEV البروتياز </td><td> Promega </td><td> V6052 </td></tr><tr><td> AcTEV البروتياز </td><td> Invitrogen </td><td> 12575015 </td></tr><tr><td> 6 Superose 10/300 GL </td><td> جنرال إلكتريك للرعاية الصحية </td><td> 17-5172-01 </td></tr><tr><td> Hsp40 </td><td> مقايسة تصاميم </td><td> SPP - 400 </td></tr><tr><td> Hsp72 </td><td> مقايسة تصاميم </td><td> ADI - NSP - 555 </td></tr></tbody></table>

purification of hsp104, a protein disaggregase

Hsp104 هو hexameric AAA + البروتين 1 من الخميرة ، والتي المائي ATP الأزواج على تصنيفها بروتين 20-10 (الشكل 1). يضفي هذا النشاط الانتقائي ميزتان الرئيسية. أولا ، استعادة الطبيعة من المجاميع التي المختلين Hsp104 يخول بقاء الخميرة بعد تشدد البروتين misfolding المختلفة ، بما في ذلك الصدمة الحرارية 3،5،11،12. ثانيا ، إعادة تشكيل الألياف اميلويد بيتا عبر Hsp104 التي تمكن من استغلال الخميرة البريونات لا تعد ولا تحصى (amyloids المعدية) كمستودع للفائدة وراثية الاختلاف المظهري 13-22. بشكل ملحوظ ، ويعيد تشكيل Hsp104 مباشرة oligomers preamyloid والألياف اميلويد ، بما فيها تلك التي تتكون من بروتينات بريون الخميرة وSup35 Ure2 23-30. هذه الوظيفة اميلويد هو إعادة تشكيل الوجه المتخصصة Hsp104 الخميرة. وهاء orthologue القولونية ، ClpB ، فشل أو يعيد oligomers preamyloid ييفات اميلويد 26،31،32. تم العثور على orthologues Hsp104 في جميع ممالك الحياة باستثناء perplexingly والحيوانات. في الواقع ، ما إذا كانت الخلايا الحيوانية تمتلك أي نظام الأنزيمية أن الأزواج تصنيفها البروتين لاستعادة الطبيعة (بدلا من التدهور) لا يزال غير معروف 33-35. وبالتالي ، اقترحنا وغيرها التي يمكن وضعها Hsp104 كعامل العلاجية لمختلف الأمراض العصبية مرتبطة misfolding من بروتينات معينة في oligomers preamyloid السامة والألياف اميلويد 4،7،23،36-38. لا توجد علاجات التي تستهدف بشكل مباشر الأنواع المجمعة المرتبطة بهذه الأمراض. حتى الآن ، ويذوب Hsp104 oligomers السامة ويتألف من الألياف اميلويد synuclein ألفا ، والتي ترتبط مع مرض باركنسون 23 فضلا عن أشكال من الأميلويد بي ار بي 39. الأهم من ذلك ، يقلل Hsp104 تجميع البروتين وإلى التقليل من تنكس عصبي في نماذج من القوارض مرض باركنسون 23 و 38 مرض هنتنغتون. من الناحية المثالية ، لتحسين العلاج والتقليل من الآثار الجانبية ، ستكون هندستها وHsp104 potentiated لإعادة انتقائي المجاميع الخاصة المركزية لهذا المرض في السؤال 4،7. ومع ذلك ، فإن الفهم المحدود الهيكلية والميكانيكية لليقسم Hsp104 كيف يمكن لمثل ذخيرة متنوعة من هياكل مجمعة والبروتينات لا علاقة لها يحبط هذه المساعي 30،40-42. لفهم بنية وآلية Hsp104 ، فإنه لا بد من دراسة هذا البروتين النقي وإعادة نشاطها disaggregase بمكونات ضئيلة. Hsp104 هو بروتين 102kDa مع الباياء من ~ 5.3 ، الذي hexamerizes في وجود أو ADP ATP ، أو على تركيزات عالية من البروتين في غياب 43-46 النوكليوتيدات. هنا ، نحن تصف بروتوكول الأمثل لتنقية Hsp104 ، نشطة للغاية مستقرة من E. القولونية. استخدام E. القولونية يسمح مبسطة على نطاق واسع الإنتاج ويمكن أن يؤديها لدينا وسيلة سريعة وموثوق بها عن المتغيرات Hsp104 عديدة. بروتوكول لدينا زيادات Hsp104 النقاء ويبسط له 6 - إزالة علامة مقارنة طريقة تنقية السابقة من E. 47 القولونية. وعلاوة على ذلك ، والبروتوكول لدينا أكثر من سهلة ومريحة بروتوكولين أكثر حداثة 26،48.

Watch this Scientific Journal Video about Purification of Hsp104, a Protein Disaggregase at JoVE.com

Purification of Hsp104, a Protein Disaggregase

هنا ، نحن تصف وضع بروتوكول لتنقية نشطة للغاية Hsp104 ، وهو AAA + hexameric البروتين من الخميرة ، والتي المائي ATP الأزواج على تصنيفها البروتين. هذا المخطط يستغل بناء His6 الموسومة لتنقية تقارب من<em&gt; E. القولونية</em&gt; تليها أنيون تبادل اللوني ، His6 ، مع إزالة علامة TEV البروتيني ، واللوني الحجم الاستبعاد.

تنقية Hsp104 ، وهو بروتين Disaggregase

Hsp104 is a hexameric AAA+ protein1 from yeast, which couples ATP hydrolysis to protein disaggregation2-10 (Fig. 1). This activity imparts two key ...

Research

JoVE Journal

Biology

Staining of Proteins in Gels with Coomassie G-250 without Organic Solvent and Acetic Acid

تلطيخ من البروتينات في الهلام مع Coomassie G - 250 دون عضوي حمض الخليك والمذيبات

In classical protein staining protocols using Coomassie Brilliant Blue (CBB), solutions with high contents of toxic and flammable organic solvents ...

Purification of the M. magneticum Strain AMB-1 Magnetosome Associated Protein MamA&Delta;41

Purification of the M. magneticum Strain AMB-1 Magnetosome Associated Protein MamAÃƒÅ½Ã¢â‚¬Â41

تنقية م. magneticum سلالة AMB - 1 بروتين المرتبطين Magnetosome MamAΔ41

Magnetotactic bacteria comprise a diverse group of aquatic microorganisms that are able to orientate themselves along geomagnetic fields. This behavior is ...

Expression, Detergent Solubilization, and Purification of a Membrane Transporter, the MexB Multidrug Resistance Protein

التعبير ، Solubilization منظفات ، وتنقية من الناقل الأغشية ، ومقاومة الأدوية المتعددة MexB البروتين

Multidrug resistance (MDR), the ability of a cancer cell or pathogen to be resistant to a wide range of structurally and functionally unrelated ...

Automated Hydrophobic Interaction Chromatography Column Selection for Use in Protein Purification

آلية التفاعل اللوني مسعور اختيار عمود للاستخدام في تنقية البروتين

In contrast to other chromatographic methods for purifying proteins (e.g. gel filtration, affinity, and ion exchange), hydrophobic interaction ...

Chromatographic Purification of Highly Active Yeast Ribosomes

الكروماتوغرافي تنقية ريبوسوم الخميرة نشطة للغاية

Eukaryotic ribosomes are much more labile as compared to their eubacterial and archael counterparts, thus posing a significant challenge to researchers.  ...

Orthogonal Protein Purification Facilitated by a Small Bispecific Affinity Tag

متعامد تنقية البروتين الميسر عن طريق بطاقات تقارب Bispecific الصغيرة

Due to the high costs associated with purification of recombinant proteins the protocols need to be rationalized. For high-throughput efforts there is a ...

Identification of Protein Interacting Partners Using Tandem Affinity Purification

تحديد الشركاء البروتين عن طريق التفاعل جنبا الى جنب الانجذاب تنقية

A critical and often limiting step in understanding the function of host and viral proteins is the identification of interacting cellular or viral protein ...

Generation, Purification, and Characterization of Cell-invasive DISC1 Protein Species

جيل وتنقية، وتوصيف الأنواع الغازية خلية البروتين DISC1

Protein aggregation is seen as a general hallmark of chronic, degenerative brain conditions like, for example, in the neurodegenerative diseases ...

Protein Purification-free Method of Binding Affinity Determination by Microscale Thermophoresis

البروتين طريقة خالية من تنقية تجليد تحديد الانجذاب من قبل Thermophoresis الميكروسكيل

Quantitative characterization of protein  interactions is essential in practically any field of life sciences,  particularly drug discovery. Most of ...

Identifying Protein-protein Interaction in Drosophila Adult Heads by Tandem Affinity Purification (TAP)

Identifying Protein-protein Interaction in Drosophila Adult Heads by Tandem Affinity Purification TAP

تحديد البروتين البروتين التفاعل في<em&gt; ذبابة الفاكهة</em&gt; رؤساء الكبار حسب جنبا الى جنب الانجذاب تنقية (وات)

Genetic screens conducted using Drosophila melanogaster (fruit fly) have made numerous milestone discoveries in the advance of biological sciences. ...