Name: heterogeneity mapping of protein expression in tumors using quantitative immunofluorescence
Uploaded: 2011-10-25T13:00:00
Duration: 7 min 54 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Heterogeneity Mapping of Protein Expression in Tumors using Quantitative Immunofluorescence at JoVE.com

עבודה זו נתמכה בחלקה על ידי מימון המועצה הסקוטית (מספר גרנט HR07005; <a href="http://www.sfc.ac.uk/">http://www.sfc.ac.uk/</a> ), למחקר רפואי סקוטלנד ( <a href="http://www.medicalresearchscotland.org.uk/">http://www.medicalresearchscotland.org.uk/</a> ), הסרטן מחקר בבריטניה Experimental Medicine מרכז הסרטן ( <a href="http://www.cancerresearchuk.org/">http://www.cancerresearchuk.org/</a> ), וכן סרטן השד פריצת דרך ( <a href="http://breakthrough.org.uk/">http://breakthrough.org.uk/</a> ).

<ol>
	<li>Gutierrez, M. L., Sayagues, J. M., Del Mar, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cytogenetic+heterogeneity+of+pancreatic+ductal+adenocarcinomas:+identification+of+intratumoral+pathways+of+clonal+evolution.">Cytogenetic heterogeneity of pancreatic ductal adenocarcinomas: identification of intratumoral pathways of clonal evolution.</a> Histopathology. 58, 486-497 (2011).</li><li>Yachida, S., Jones, S., Bozic, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Distant+metastasis+occurs+late+during+the+genetic+evolution+of+pancreatic+cancer.">Distant metastasis occurs late during the genetic evolution of pancreatic cancer.</a> Nature. 467, 1114-1117 (2010).</li><li>Gutierrez, M. L., Sayagues, J. M., Del Mar, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cytogenetic+heterogeneity+of+pancreatic+ductal+adenocarcinomas:+identification+of+intratumoral+pathways+of+clonal+evolution.">Cytogenetic heterogeneity of pancreatic ductal adenocarcinomas: identification of intratumoral pathways of clonal evolution.</a> Histopathology. 58, 486-497 (2011).</li><li>Yachida, S., Jones, S., Bozic, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Distant+metastasis+occurs+late+during+the+genetic+evolution+of+pancreatic+cancer.">Distant metastasis occurs late during the genetic evolution of pancreatic cancer.</a> Nature. 467, 1114-1117 (2010).</li><li>Liu, J., Lau, S. K., Varma, V. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+mapping+of+tumor+heterogeneity+on+clinical+tissue+specimens+with+multiplexed+quantum+dots.">Molecular mapping of tumor heterogeneity on clinical tissue specimens with multiplexed quantum dots.</a> ACS Nano. 4, 2755-2765 (2010).</li><li>Camp, R. L., Chung, G. G., Rimm, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Automated+subcellular+localization+and+quantification+of+protein+expression+in+tissue+microarrays.">Automated subcellular localization and quantification of protein expression in tissue microarrays.</a> Nat. Med. 8, 1323-1327 (2002).</li><li>Simpson, E. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measurement+of+biodiversity.">Measurement of biodiversity.</a> Nature. 163, 688-68 (1949).</li><li>Gustavson, M. D., Bourke-Martin, B., Reilly, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+an+unsupervised+pixel-based+clustering+algorithm+for+compartmentalization+of+immunohistochemical+expression+using+Automated+Quantitative+Analysis.">Development of an unsupervised pixel-based clustering algorithm for compartmentalization of immunohistochemical expression using Automated Quantitative Analysis.</a> Appl. Immunohistochem. Mol. Morphol. 17, 329-337 (2009).</li><li>. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Paclitaxel+plus+carboplatin+versus+standard+chemotherapy+with+either+single-agent+carboplatin+or+cyclophosphamide,+doxorubicin,+and+cisplatin+in+women+with+ovarian+cancer:+the+ICON3+randomised+trial.">Paclitaxel plus carboplatin versus standard chemotherapy with either single-agent carboplatin or cyclophosphamide, doxorubicin, and cisplatin in women with ovarian cancer: the ICON3 randomised trial.</a> Lancet. 360, 505-515 (2002).</li><li>McGuire, W. P., Hoskins, W. J., Brady, M. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cyclophosphamide+and+cisplatin+compared+with+paclitaxel+and+cisplatin+in+patients+with+stage+III+and+stage+IV+ovarian+cancer.">Cyclophosphamide and cisplatin compared with paclitaxel and cisplatin in patients with stage III and stage IV ovarian cancer.</a> N. Engl. J. Med. 334, 1-6 (1996).</li><li>Muggia, F. M., Braly, P. S., Brady, M. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phase+III+randomized+study+of+cisplatin+versus+paclitaxel+versus+cisplatin+and+paclitaxel+in+patients+with+suboptimal+stage+III+or+IV+ovarian+cancer:+a+gynecologic+oncology+group+study.">Phase III randomized study of cisplatin versus paclitaxel versus cisplatin and paclitaxel in patients with suboptimal stage III or IV ovarian cancer: a gynecologic oncology group study.</a> J. Clin. Oncol. 18, 106-115 (2000).</li><li>Piccart, M. J., Bertelsen, K., James, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Randomized+intergroup+trial+of+cisplatin-paclitaxel+versus+cisplatin-cyclophosphamide+in+women+with+advanced+epithelial+ovarian+cancer:+three-year+results.">Randomized intergroup trial of cisplatin-paclitaxel versus cisplatin-cyclophosphamide in women with advanced epithelial ovarian cancer: three-year results.</a> J. Natl. Cancer. Inst. 92, 699-708 (2000).</li><li>Cannistra, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cancer+of+the+ovary.">Cancer of the ovary.</a> N. Engl. J. Med. 351, 2519-2529 (2004).</li><li>Baker, A. F., Dragovich, T., Ihle, N. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stability+of+phosphoprotein+as+a+biological+marker+of+tumor+signaling.">Stability of phosphoprotein as a biological marker of tumor signaling.</a> Clin. Cancer. Res. 11, 4338-4340 (2005).</li><li>Espina, V., Edmiston, K. H., Heiby, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+portrait+of+tissue+phosphoprotein+stability+in+the+clinical+tissue+procurement+process.">A portrait of tissue phosphoprotein stability in the clinical tissue procurement process.</a> Mol. Cell. Proteomics. 7, 1998-2018 (2008).</li><li>Klymkowsky, M. W., Savagner, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Epithelial-mesenchymal+transition:+a+cancer+researcher's+conceptual+friend+and+foe.">Epithelial-mesenchymal transition: a cancer researcher's conceptual friend and foe.</a> Am. J. Pathol. 174, 1588-1593 (2009).</li><li>Kurrey, N. K., Jalgaonkar, S. P., Joglekar, A. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Snail+and+slug+mediate+radioresistance+and+chemoresistance+by+antagonizing+p53-mediated+apoptosis+and+acquiring+a+stem-like+phenotype+in+ovarian+cancer+cells.">Snail and slug mediate radioresistance and chemoresistance by antagonizing p53-mediated apoptosis and acquiring a stem-like phenotype in ovarian cancer cells.</a> Stem. Cells. 27, 2059-2068 (2009).</li><li>Creighton, C. J., Li, X., Landis, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Residual+breast+cancers+after+conventional+therapy+display+mesenchymal+as+well+as+tumor-initiating+features.">Residual breast cancers after conventional therapy display mesenchymal as well as tumor-initiating features.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 106, 13820-13825 (2009).</li><li>Aitken, S. J., Thomas, J. S., Langdon, S. P., Harrison, D. J., Faratian, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+analysis+of+changes+in+ER,+PR+and+HER2+expression+in+primary+breast+cancer+and+paired+nodal+metastases.">Quantitative analysis of changes in ER, PR and HER2 expression in primary breast cancer and paired nodal metastases.</a> Ann. Oncol. 21, 1254-1261 (2010).</li><li>Sayagues, J. M., Abad, M. M., Melchor, H. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intratumoural+cytogenetic+heterogeneity+of+sporadic+colorectal+carcinomas+suggests+several+pathways+to+liver+metastasis.">Intratumoural cytogenetic heterogeneity of sporadic colorectal carcinomas suggests several pathways to liver metastasis.</a> J. Pathol. 221, 308-319 (2010).</li></ol>

JC, MG, CJ, ו CS עובדים של HistoRx, Inc

השיטה המתוארת להלן היתרי כימות הטרוגניות מולקולרית ברמת פורמלין-קבוע, פרפין, משובצים קטעים היסטולוגית של חומר הגידול. השיטה מאפשרת הערך יוקצו מידת ההטרוגניות בקטע הרקמה, כך זה עשוי אז להילקח בחשבון כמשתנה בפיתוח סמן ביולוגי וניתוח. אמנם באופן כללי עדיף כי הם סמנים רקמה הומוגנית מבחינת הביטוי, כך assay הוא פחות רגישים טעות הדגימה או משוא פנים, זה עלול בנסיבות מסוימות להיות שימושי לכמת ההטרוגניות כפרמטר. לדוגמה, כפי שמוצג בדוגמה המחשה של ER ו - HER2, סמנים נפוצים להראות הטרוגניות רבה ביטוי זה כרגע לא ידוע אם זה מהווה גורם מנבא עצמאי או חזוי לגבי התוצאה הקלינית או התגובה לטיפול, בהתאמה. כמו כן, כפי שמודגם, הטיפול עצמו עלול לשנות באופן דינמיאוכלוסיות המרכיבים של תאים, ולכן מדידה של העשרה היעד עשוי להיות שימושי המנחה החלטות הטיפול. עם זאת, הטכניקה היא מוגבלת על ידי אותם גורמים אשר מגבילים מנתח histopathological או סמנים ביולוגיים (כגון immunohistochemical) המסורתית. התוצאה היא תלויה בסוג, גודל, איכות של הרקמה להיות מנותח, ולכן קטע רקמה יחיד לא יכול להיות נציג של הגידול כולו. ואכן, המדד סימפסון עשוי להיות מוטה יתר על המידה על ידי גודל של הרקמה (מספר מסגרות בשבי עשרות AQUA נמדד). Immunogenicity של epitopes הנמדדים עשויים להיות כפופים טרום ניתוח גורמים בלתי נשלט אשר artifactually לשנות את הביטוי שלהם על פני קטע הרקמה (כגון זמן איסכמיה קר, או את האורך של קיבעון, ו חפץ קצה). זוהי בעיה במיוחד עבור-epitopes phospho, אשר ידוע לשמצה יציב 14, 15. לכן הטכניקה עשוי להיות מתאים יותרעל דגימות ביופסיה כריתה ולא קטן, שבוצעו על מספר מקטעים ולא רק אחד. בסופו של דבר, 3D שיטות הדמיה עשויות להציע הזדמנות טובה יותר לכמת בפרמטר זה. הטכניקה כפי שהוצגה עשוי להיות מוגבל על ידי גורמים ביולוגיים, כגון השתנות בביטוי של epitope מיסוך cytokeratin. זה עלול להיות מדאיג במיוחד בסוגי סרטן אלה, כולל סרטן השחלות וסרטן השד, אשר עוברים אפיתל ל-mesenchymal המעבר (EMT) או מועשרים שאינם אפיתל רכיבים או בתאי גזע 16, כמו לאחרונה הוכח להתרחש כימותרפיה טיפול בסרטן השחלות ב 17 במבחנה, ועל חולי סרטן השד בעקבות טיפול 18. מגבלה זו ניתן להתגבר באמצעות נוגדנים מיסוך חלופה (או קוקטיילים של נוגדנים), כגון cytokeratin פלוס vimentin, אשר שהוגברו ב EMT 16. בנוסף, מאז רכיבים אחרים של הרקמה (את המיקרופוןroenvironment), כגון fibroblasts או בתאי האנדותל בכלי הדם הם גם יותר ויותר ממוקדים על ידי טיפולים ביולוגיים, הטכניקה עשויה גם להיות מורחבת כדי להבקיע רכיבים אלה, באמצעות מסכות ספציפיות תאים של עניין, כגון PECAM / CD31 להכתים עבור לתאי אנדותל של כלי הדם . למרות העיבוד של מדד סימפסון שימש כמדד ההטרוגניות בפרוטוקול הנוכחי בשל פשטותה, אמצעים אחרים של ההטרוגניות יכול לשמש, כגון מדידות פשוטה של ​​נטייה מרכזית (ממוצע, חציון השונות, וכו &#39;). בנוסף, חישובי מדד סימפסון יכול להיות שונה כדי להתאים טוב יותר אוכלוסייה מבחן בפרט. השימוש Z-ציון טרנספורמציות מאפשר הניקוד יהיה רלוונטי יותר עבור מספר רב של סמנים מאז ההטרוגניות מבוסס על סטיית סביב הממוצע עבור ערכת נתונים. עם זאת, בטווח הכולל של מניה יכולה להיות מוגבלת בסוג זה של טרנספורמציה. עיצובים מסוימים עשויים להיות מתאימים יותרפשוט בן עשרות AQUA בפועל עבור כל דגימות של קבוצה סמן מסוים. בחירת מספר פחי הפסקות גם הגבלה בטווח של ערכים אשר עלולה לגרום ועלול להיות מותאם עיצובים ניסיוניים חלופיים. השתמשנו ER ו HER2 במחקר הנוכחי כמו סמנים מועמד, כיוון שהם משמשים כבר במרפאה, לעזור לענות על שאלות קליניות רלוונטי לגבי היעילות של טיפולים ממוקדים, ידועים להפגין ההטרוגניות שינוי ניכר והן הראשוני רחוק המחלה 19. עם זאת, סמן אופטימלי של ההטרוגניות נותר נחוש. אפשרויות אחרות עשויות לכלול סמנים cytogenetic של clonality, כגון אלו המשמשים בעבר במחקרים FISH שלבי הביניים 20. הגישה דורשת אימות נוסף, קבוצות גדולות קליניים המבואר טוב או ניסויים קליניים על מנת להמשיך ולבסס את הרלוונטיות של פרמטר זה בביולוגיה של הסרטן.

<table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td> שם מגיב </td><td> חברה </td><td> מספר קטלוגי </td><td> תגובות </td></tr><tr><td> ScanScope פלורידה </td><td> Aperio </td><td> ScanScope פלורידה </td><td> משמש מצויד כמו מהספק </td></tr><tr><td> ספקטרום </td><td> Aperio </td><td> ספקטרום </td><td> מספרים תצורה קטלוג ישתנו כיצד מוסדות מקומיים להקים מסד הנתונים שלהם ו-IT מבנה. </td></tr><tr><td> AQUAnalysis, בשיתוף עם AQUAjustment </td><td> HistoRx </td><td> V2.3 </td><td> החבילה מאפשרת AQUAjustment AQUAnalysis להשתמש בתמונות המאוחסנות ספקטרום. </td></tr><tr><td> HER2 </td><td> Dako </td><td> A0485 </td><td> 1 בדילול 400 </td></tr><tr><td> עכבר אנטי מחבת cytokeratin </td><td> Dako </td><td> M3515 </td><td> 1 בדילול 50 </td></tr><tr><td> נוגדן diluent </td><td> Dako </td&gt; <td> S0809 </td><td></td></tr><tr><td> Envision עזים ארנב HRP </td><td> Dako </td><td> K4003 </td><td></td></tr><tr><td> חלבון לחסום </td><td> Dako </td><td> X0909 </td><td></td></tr><tr><td> עיזים אנטי עכבר Alexa555 </td><td> Invitrogen </td><td> A21422 </td><td></td></tr><tr><td> DAPI בינוני הרכבה </td><td> Invitrogen </td><td> P36931 </td><td></td></tr><tr><td> Cy5 Tyramide </td><td> HistoRx </td><td> AQ-EMR1-00001 </td><td></td></tr><tr><td> Sequenza מרכז Immunostaining </td><td> Thermo Scientific Shandon </td><td> 73300001 </td><td> משמש כאן מכתים הספסל העליון immunofluorescence </td></tr></tbody></table>

heterogeneity mapping of protein expression in tumors using quantitative immunofluorescence

ההטרוגניות מורפולוגיים בתוך הגידול הפרט היא מוכרת היטב על ידי histopathologists בפועל כירורגית. אמנם זה לוקח בדרך כלל צורה של אזורים של בידול מובהק לתוך תת היסטולוגית מוכר, או כיתה פתולוגיים שונים, לעתים קרובות ישנם הבדלים דקים יותר פנוטיפ אשר להתריס סיווג מדויק (איור 1). בסופו של דבר, מאז מורפולוגיה מוכתב על ידי פנוטיפ המולקולרית הבסיסית, אזורים עם הבדלים נראים צפויים להיות מלווה ההבדלים בביטוי של חלבונים אשר לתזמר פונקציה התנהגות הסלולר, ולכן המראה. המשמעות של ההטרוגניות (מולקולרית) נראים ובלתי נראים על הפרוגנוזה אינו ידוע, אך הראיות האחרונות עולה כי, לפחות ברמה הגנטית, קיימת הטרוגניות 1,2 הגידול הראשוני, וכמה אלה משנה שיבוטים להצמיח גרורתי ( וקטלני לכן) המחלה. יתר על כן, חלבונים מסוימיםכפי שנמדד על סמנים כי הם מטרות הטיפול (למשל עבור ER ו HER2 עבור טמוקסיפן ו trastuzumab (הרצפטין), בהתאמה). אם חלבונים אלו מראים ביטוי משתנה בתוך הגידול אז התגובות טיפולית יכול להיות גם משתנה. תוכניות בשימוש נרחב הבקיע היסטופתולוגיות עבור אימונוהיסטוכימיה או להתעלם, או מספרית homogenize כימות של ביטוי חלבונים. באופן דומה, טכניקות הרסניות, שבו דגימות הגידול הם הומוגני (כגון פרופיל ביטוי גנים), מידע כמותי ניתן הובהר, אך מידע מרחבי אבוד. מיפוי גנטי ההטרוגניות גישות בסרטן הלבלב יש לסמוך גם על דור של השעיה תא בודד 3, או 4 macrodissection. מחקר שנערך לאחרונה השתמשה נקודות קוונטיות כדי למפות ההטרוגניות מורפולוגיים מולקולרית ברקמת סרטן הערמונית 5, לספק הוכחה של עקרון זה מיפוי מורפולוגיה מולקולרית אינו ריאלי, אבל נפילה שלhort של לכימות ההטרוגניות. מאז אימונוהיסטוכימיה הוא, במקרה הטוב, רק חצי כמותית ובכפוף ההטיה התוך והבין הצופה, יותר רגישים ו - מתודולוגיות כמותיות נדרשים על מנת למפות במדויק ולכמת ההטרוגניות רקמות באתרם. פיתחנו מתודולוגיה ויושמו ניסויים סטטיסטיים על מנת לכמת את ההטרוגניות באופן שיטתי ביטוי חלבון בסעיפים רקמה שלמה של גידולים, בהתבסס על ניתוח כמותי אוטומטי (AQUA) מערכת 6. סעיפים רקמות מסומנים עם נוגדנים ספציפיים כנגד cytokeratins ויעדים של עניין, מצמידים את fluorophore שכותרתו נוגדנים משני. שקופיות הם צילמו באמצעות סורק כל שקופית פלואורסצנטי. תמונות מחולקים מאות עד אלפי אריחים, וכל אריח מוקצה אז ציון AQUA שהיא מדד של ריכוז חלבון בתוך הרכיב (גידולים) של רקמת האפיתל. Heatmaps נוצרות לייצג ביטוי רקמות של חלבונים ציון ההטרוגניות מוקצה, באמצעות מדד סטטיסטי של ההטרוגניות ששימשו במקור אקולוגיה, בהתבסס על מדד סימפסון המגוון הביולוגי 7. עד כה לא היו ניסיונות שיטתי למפות ולכמת את השתנות בד בבד עם ביטוי חלבון, בהכנות היסטולוגית. כאן, אנו ממחישים את השימוש הראשון בשיטה להחיל ER ו HER2 ביטוי סמן ביולוגי בסרטן השחלות. באמצעות שיטה זו סוללת את הדרך לניתוח ההטרוגניות כמשתנה בלתי תלוי מחקרים הביטוי סמן במחקרים translational, כדי להקים את המשמעות של ההטרוגניות על הפרוגנוזה וחיזוי התגובות לטיפול.

Watch this Scientific Journal Video about Heterogeneity Mapping of Protein Expression in Tumors using Quantitative Immunofluorescence at JoVE.com

Heterogeneity Mapping of Protein Expression in Tumors using Quantitative Immunofluorescence

כאן אנו מתארים שיטה לכמת הטרוגניות מולקולרית בסעיפים היסטולוגית של חומר הגידול באמצעות immunofluorescence כמותיים, ניתוח תמונה, מדד סטטיסטי של הטרוגניות. השיטה מיועדת לשימוש בפיתוח סמן ביולוגי ניתוח קליני.

הטרוגניות מיפוי של ביטוי חלבון בתוך גידולים באמצעות immunofluorescence כמותי

Morphologic heterogeneity within an individual tumor is well-recognized by histopathologists in surgical practice. While this often takes the form of ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Establishment and Propagation of Human Retinoblastoma Tumors in Immune Deficient Mice

הקמה התפשטות של גידולים רטינובלסטומה האדם עכברים החיסון לקויה

Culturing retinoblastoma tumor cells in defined stem cell media gives rise to primary tumorspheres that can be grown and maintained for only a limited ...

Evaluation of Nanoparticle Uptake in Tumors in Real Time Using Intravital Imaging

הערכה של ספיגת nanoparticle ב גידולים בזמן אמת באמצעות הדמיה Intravital

Current technologies for tumor imaging, such as ultrasound, MRI, PET and CT, are unable to yield high-resolution images for the assessment of nanoparticle ...

MicroRNA Detection in Prostate Tumors by Quantitative Real-time PCR (qPCR)

MicroRNA Detection in Prostate Tumors by Quantitative Real-time PCR qPCR

MicroRNA איתור גידולים הערמונית ב כמותי בזמן אמת PCR (QPCR)

MicroRNAs (miRNAs) are single-stranded, 18&#x2013;24 nucleotide long, non-coding RNA molecules. They are involved in virtually every cellular process ...

Identification of Sleeping Beauty Transposon Insertions in Solid Tumors using Linker-mediated PCR

Identification of Sleeping Beauty Transposon Insertions in Solid Tumors using Linker-mediated PCR

זיהוי<em&gt; יפהפה נרדם</em&gt; הוספות Transposon בגידולים מוצקים באמצעות PCR לינקר בתיווך

Genomic, proteomic, transcriptomic, and epigenomic analyses of human tumors indicate that there are thousands of anomalies within each cancer genome ...

In vitro Organoid Culture of Primary Mouse Colon Tumors

In vitro Organoid Culture of Primary Mouse Colon Tumors

בתרבות Organoid מבחנה של גידולים במעי גס עכבר העיקרי

Several  human and murine colon cancer cell lines have been established, physiologic  integrity of colon tumors such as multiple cell layers, basal-apical ...

The Use of Reverse Phase Protein Arrays (RPPA) to Explore Protein Expression Variation within Individual Renal Cell Cancers

The Use of Reverse Phase Protein Arrays RPPA to Explore Protein Expression Variation within Individual Renal Cell Cancers

השימוש במערכי חלבון שלב הפוכים (RPPA) לחקור וריאצית ביטוי חלבון בתוך הסרטן של תאי כליה בודד

Currently there is no curative treatment for metastatic clear cell renal cell cancer, the commonest variant of the disease. A key factor in this treatment ...

In Vivo Optical Imaging of Brain Tumors and Arthritis Using Fluorescent SapC-DOPS Nanovesicles

In Vivo Optical Imaging of Brain Tumors and Arthritis Using Fluorescent SapC-DOPS Nanovesicles

בדימות אופטי Vivo של גידולים במוח ודלקת פרקים באמצעות פלורסנט SapC-DOPS nanovesicles

We describe a multi-angle rotational optical imaging (MAROI) system for in vivo monitoring of physiopathological processes labeled with a fluorescent ...

Coordinate Mapping of Hyolaryngeal Mechanics in Swallowing

לתאם מיפוי של מכניקת Hyolaryngeal בבליעה

Characterizing hyolaryngeal movement is important to dysphagia research. Prior methods require multiple measurements to obtain one kinematic measurement ...

Quantitative Mass Spectrometric Profiling of Cancer-cell Proteomes Derived From Liquid and Solid Tumors

Mass כמותי spectrometric פרופיל של Proteomes סרטן התאים נגזרים מנוזלים וגידולים מוצקים

In-depth analyses of cancer cell proteomes are needed to elucidate oncogenic pathomechanisms, as well as to identify potential drug targets and diagnostic ...

Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization

Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization

ניתוח Clinicopathological ביטוי מירנה שד רקמות סרטן על ידי שימוש מירנה<em&gt; באתרו</em&gt; כלאה

In this article, we describe a detailed protocol for miRNA detection in breast cancer tissue using in situ hybridization with a digoxigenin-labelled LNA ...