Name: in vitro uncoating of hiv-1 cores
Uploaded: 2011-11-08T13:00:00
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HIV - 1 에이 킨 실험실에서 uncoating 연구는 NIH 보조금 AI40364, AI50423 및 AI076121 지원했다. p24 엘리사에 사용되는 시약을 포함한 몇 가지 주요 자료, NIH AIDS 연구 및 레퍼런스 프로그램, 에이즈 학부, NIAID, NIH에 의해 제공되었다.

1. HIV - 1 입자의 제작 진행하기 전에 허가를 받아야하고 감염 HIV에 대한 승인 biosafety 시설에서 작업에 기관의 Biosafety 사무실에서 지침을 따르십시오. 그 적절한 치료를 보장해야하며, 안전 조치가 biosafety 연구실에 근무하는 동안 따라하고 있습니다. HIV - 1 입자의 생산은 일반적으로 칼슘 인산염 transfection 방법 7, 8을 사용하여 HIV - 1 proviral DNA로 293...

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	<li>Ganser, B. K., Li, S., Klishko, V. Y., Finch, J. T., Sundquist, W. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assembly+and+analysis+of+conical+models+for+the+HIV-1+core.">Assembly and analysis of conical models for the HIV-1 core.</a> Science. 283, 80-83 (1999).</li><li>Li, S., Hill, C. P., Sundquist, W. I., Finch, J. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Image+reconstructions+of+helical+assemblies+of+the+HIV-1+CA+protein.">Image reconstructions of helical assemblies of the HIV-1 CA protein.</a> Nature. 407, 409-413 (2000).</li><li>Aiken, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Viral+and+cellular+factors+that+regulate+HIV-1+uncoating.">Viral and cellular factors that regulate HIV-1 uncoating.</a> Curr. Opin. HIV. AIDS. 1, 194-199 (2006).</li><li>Forshey, B. M., Schwedler, U. v. o. n., Sundquist, W. I., Aiken, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Formation+of+a+human+immunodeficiency+virus+type+1+core+of+optimal+stability+is+crucial+for+viral+replication.">Formation of a human immunodeficiency virus type 1 core of optimal stability is crucial for viral replication.</a> J. Virol. 76, 5667-5677 (2002).</li><li>Forshey, B. M., Aiken, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Disassembly+of+human+immunodeficiency+virus+type+1+cores+in+vitro+reveals+association+of+Nef+with+the+subviral+ribonucleoprotein+complex.">Disassembly of human immunodeficiency virus type 1 cores in vitro reveals association of Nef with the subviral ribonucleoprotein complex.</a> J. Virol. 77, 4409-4414 (2003).</li><li>Wacharapornin, P., Lauhakirti, D., Auewarakul, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+capsid+mutations+on+HIV-1+uncoating.">The effect of capsid mutations on HIV-1 uncoating.</a> Virology. 358, 48-54 (2007).</li><li>Chen, C., Okayama, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-efficiency+transformation+of+mammalian+cells+by+plasmid+DNA.">High-efficiency transformation of mammalian cells by plasmid DNA.</a> Mol Cell Biol. 7, 2745-2752 (1987).</li><li>Aiken, C., Prasad, V. R., Ganjam, K. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Methods in Molecular Biology. 485, 41-53 (2009).</li><li>Kotov, A., Zhou, J., Flicker, P., Aiken, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Association+of+Nef+with+the+human+immunodeficiency+virus+type+1+core.">Association of Nef with the human immunodeficiency virus type 1 core.</a> J. Virol. 73, 8824-8830 (1999).</li><li>Kewalramani, V. N., Emerman, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Vpx+association+with+mature+core+structures+of+HIV-2.">Vpx association with mature core structures of HIV-2.</a> Virology. 218, 159-168 (1996).</li><li>Wehrly, K., Chesebro, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=p24+antigen+capture+assay+for+quantification+of+human+immunodeficiency+virus+using+readily+available+inexpensive+reagents.">p24 antigen capture assay for quantification of human immunodeficiency virus using readily available inexpensive reagents.</a> Methods. 12, 288-293 (1997).</li><li>Welker, R., Hohenberg, H., Tessmer, U., Huckhagel, C., Kr&#228;usslich, H. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biochemical+and+structural+analysis+of+isolated+mature+cores+of+human+immunodeficiency+virus+type+1.">Biochemical and structural analysis of isolated mature cores of human immunodeficiency virus type 1.</a> J. Virol. 74, 1168-1177 (2000).</li><li>Briggs, J. A., Wilk, T., Welker, R., Kr&#228;usslich, H. G., Fuller, S. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+organization+of+authentic,+mature+HIV-1+virions+and+cores.">Structural organization of authentic, mature HIV-1 virions and cores.</a> EMBO J. 22, 1707-1715 (2003).</li><li>Auewarakul, P., Wacharapornin, P., Srichatrapimuk, S., Chutipongtanate, S., Puthavathana, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Uncoating+of+HIV-1+requires+cellular+activation.">Uncoating of HIV-1 requires cellular activation.</a> Virology. 337, 93-101 (2005).</li><li>Accola, M. A., Ohagen, A., G&#246;ttlinger, H. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+human+immunodeficiency+virus+type+1+cores:+retention+of+Vpr+in+the+absence+of+p6(gag.">Isolation of human immunodeficiency virus type 1 cores: retention of Vpr in the absence of p6(gag.</a> J. Virol. 74, 6198-6202 (2000).</li></ol>

이 메서드는 대상 세포에서 HIV - 1 uncoating을 분석 검증 방법 unavailability 특히 인해 HIV - 1 수명주기의이 단계를 공부하는 데 유용합니다 체외에서 uncoating 공부 HIV - 1 코어를 정화하려면 여기를 설명했다. 이 방법은 코어를 정화 평형 ultracentrifugation를 사용하지만, 다른 사람들이 한때 용해 후 직접 pelleting를 사용한 1퍼센트 트리톤 - X - 100 12, 13 또는 0.1 % 트리톤 - X - 100 14, 15 겹쳐 자당...

<table border="1"><tbody><tr><td width="190"> 시약의 이름 </td><td width="197"> 회사 </td><td width="114"> 카탈로그 번호 </td><td width="161"> 댓글 (옵션) </td></tr><tr><td> DMEM </td><td> Cellgro </td><td> 10-013 - 이력서 </td><td></td></tr><tr><td> PBS </td><td> Cellgro </td><td> 21-031 - 이력서 </td><td></td></tr><tr><td> 트리톤 - X - 100 </td><td> Mallinckrodt 베이커 Inc의 </td><td> 9002-93-1 </td><td></td></tr><tr><td> 십대 초반 20 </td><td> Acros </td><td> 9005-64-5 </td><td></td></tr><tr><td> 0.25 % 트립신 - EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산) </td><td> Cellgro </td><td> 25-053 - CI </td><td></td></tr><tr><td> 2XBBS </td><td></td><td></td><td> 구성 : 50mM BES [P H 6.95], 280 MM NaCl 및 1.5 MM 나 2 HPO 4. 6.95로 산도를 조정상온에서. 소독 및 -20 ° C.에 aliquots에 저장을 필터 </td></tr><tr><td> 코팅 항체 : p24에 단클론 항체 (183 - H12 - 5C) </td><td> NIH AIDS 연구 및 참조 시약 프로그램 </td><td> 3537 </td><td></td></tr><tr><td> 차 항체 : HIV - IG (hyperimmune 인간 환자의 혈청) </td><td> NIH AIDS 연구 및 참조 시약 프로그램 </td><td> 3957 </td><td></td></tr><tr><td> 차 항체 : 염소 안티 인간 IgG, 복합 퍼옥시데이즈 </td><td> 찌르다 </td><td> 31,130 </td><td></td></tr><tr><td> HRP 기판 </td><td> KPL Inc의 </td><td> 50-76-11 </td><td></td></tr><tr><td> Immulon 2HB 96 잘 접시 </td><td> 써모 과학 </td><td> 3455 </td><td></td></tr><tr><td> SW32Ti 및 SW32.1 티의 로터와 호환 초원 심 분리기 </td> &lt;TD&gt; 베크 만 보습 바로 앞에 달린 풀베는 날 </td><td></td><td></td></tr><tr><td> TLA - 55 로터와 탁상 초원 심 분리기 </td><td> 베크 만 보습 바로 앞에 달린 풀베는 날 </td><td></td><td></td></tr><tr><td> 고속 microfuge 튜브 </td><td> 베크 만 보습 바로 앞에 달린 풀베는 날 </td><td> 326823, 358123, 357448 </td><td></td></tr><tr><td> 자동 Densi 흐름 밀도 구배 fractionator </td><td> Labconco 주식 회사 </td><td> 4,517,000 </td><td></td></tr><tr><td> 그라데이션 구 </td><td> CBS 과학 주식 회사 주식 회사 </td><td> GM - 20 </td><td></td></tr></tbody></table>

in vitro uncoating of hiv-1 cores

retroviruses의 게놈은 지질 봉투에 둘러싸인 capsid으로 쌌다는 것입니다. 이러한 HIV - 1과 같은 lentiviruses, 들어, 원뿔 capsid의 껍질은 육각의 격자로 배열 CA 단백질로 구성되어 있습니다. capsid는 원추 1, 2의 좁은 끝에 7 광범 끝에 pentamers와 5 닫힙니다. 이 capsid의 쉘으로 쌌다는 바이러스 ribonucleoprotein 복합이며, 함께 그들은 코어를 구성. 대상 세포막과 바이러스 세포막의 융합에 따라, HIV - 1은 세포질에 발표됩니다. capsid 다음 uncoating이라고도 과정에서 용해 형태로 3 무료 CA를 방출 disassembles. HIV - 1 uncoating의 세포내 위치와 타이밍을 제대로 이해하고 있습니다. capsid의 안정성을 변경 CA에서 단일 아미노 산 대체는 또한 세포 4 감염 HIV - 1의 능력을 손상. 이것은 capsid의 안정성은 HIV - 1 감염에 대해 중요한 것을 나타냅니다. </p&gt; HIV - 1 uncoating이 프로세스에 대한 민감하고 안정적​​인 assays의 가용성의 부족으로 인해 공부를 어렵게되었습니다. 여기 감염 HIV - 1 입자로부터 분리된 코어를 사용하여 체외에서 uncoating 공부를위한 양적 방법을 설명합니다. 접근 방식은 추위에 세제의 계층 통해 선형 자당 기울기에 집중 virions의 침강에 의해 코어의 고립을 포함한다. uncoating 계량하려면, 분리된 코어는 37 incubated 아르 ° C 각종 초과 간격 및 ultracentrifugation에 의해 연속적으로 pelleted하십시오. uncoating의 범위가 뜨는에서 CA의 분율을 quantifying 의해 분석됩니다. 이 접근은 HIV - 1 capsid 안정성 4, 5, 6에서 바이러스 변이의 효과를 분석하기 위해 고용되었습니다. 또한 HIV - 1 uncoating의 세포 요소의 역할을 공부하는 데 유용합니다.

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In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

Uncoating는 HIV - 1 수명주기의 초기 단계에 필수적인 단계이며 capsid 쉘의 해체와 바이러스 ribonucleoprotein 복합 (vRNP)의 출시로 정의됩니다. 여기, 우리는 HIV - 1 virions에서 그대로 코어를 분리 및 그들의 uncoating을 quantifying 기술을 입증<em&gt; 체외에서</em&gt;.

HIV - 1 코어의 시험 관내 Uncoating에서

The genome of the retroviruses is encased in a capsid surrounded by a lipid envelope. For lentiviruses, such as HIV-1, the conical capsid shell is ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3

V3의 HIV - 1 Tropism의 Genotypic 추론 사용 인구를 기반 시퀀싱

Background: Prior to receiving a drug from CCR5-antagonist class in HIV therapy, a patient must undergo an HIV tropism test to confirm that his or her ...

연구

면역학 및 감염병학

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage (Tropism) by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage Tropism by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

Genotypic 접근 방법을 사용하여 시퀀스 분석에 의한 HIV-1 Coreceptor 사용 (Tropism)의 예측

Maraviroc (MVC) is the first licensed antiretroviral drug from the class of coreceptor antagonists. It binds to the host coreceptor CCR5, which is used by ...

Imaging of HIV-1 Envelope-induced Virological Synapse and Signaling on Synthetic Lipid Bilayers

의 이미징 HIV-1 봉투 유발 Virological 시냅스와 합성 지질 Bilayers에 신호

Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection occurs most efficiently via cell to cell transmission2,10,11. This cell to cell transfer between ...

An In vitro Co-infection Model to Study Plasmodium falciparum-HIV-1 Interactions in Human Primary Monocyte-derived Immune Cells

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<em&gt; 체외에서</em공부하기&gt; 공동 감염 모델<em&gt; Plasmodium falciparum</em인간의 기본 단핵구 파생 면역 세포에서&gt; - HIV-1 상호 작용

Plasmodium falciparum, the causative agent  of the deadliest form of malaria, and human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) are among the most important ...

New Tools to Expand Regulatory T Cells from HIV-1-infected Individuals

새로운 도구는 HIV-1에 감염된 개인으로부터 규제 T 세포를 확장하려면

CD4+ Regulatory T cells (Tregs) are potent immune modulators and serve an important function in human immune homeostasis. Depletion of Tregs has led to ...

A Restriction Enzyme Based Cloning Method to Assess the In vitro Replication Capacity of HIV-1 Subtype C Gag-MJ4 Chimeric Viruses

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제한 효소 기반의 복제 방법을 평가하기 위해<em&gt; 시험관</em&gt; HIV-1 서브 타입 C 개그 - MJ4 키메라 바이러스의 복제 능력

The protective effect of many HLA class I alleles on HIV-1 pathogenesis and disease progression is, in part, attributed to their ability to target ...

Conformational Evaluation of HIV-1 Trimeric Envelope Glycoproteins Using a Cell-based ELISA Assay

셀 기반의 ELISA 분석을 사용하여 HIV-1 삼량 봉투 당 단백질의 구조적 평가

HIV-1 envelope glycoproteins (Env) mediate viral entry into target cells and are essential to the infectious cycle. Understanding how those glycoproteins ...

Isolation of Exosomes from the Plasma of HIV-1 Positive Individuals

HIV-1 양성 개인의 플라즈마에서 엑소 좀의 분리

Exosomes are small vesicles ranging in size from 30 nm to 100 nm that are released both constitutively and upon stimulation from a variety of cell types. ...

Visualization of HIV-1 Gag Binding to Giant Unilamellar Vesicle (GUV) Membranes

Visualization of HIV-1 Gag Binding to Giant Unilamellar Vesicle GUV Membranes

거대한 단일 층 소포 (GUV) 막 바인딩 HIV-1 개그의 시각화

The structural protein of HIV-1, Pr55Gag (or Gag), binds to the plasma membrane in cells during the virus assembly process. Membrane binding of Gag is an ...

Evaluation of the Efficacy And Toxicity of RNAs Targeting HIV-1 Production for Use in Gene or Drug Therapy

유전자 또는 약물 치료에 사용하기 위해 HIV-1 생산을 표적 RNA를의 효능 및 독성 평가

Small RNA therapies targeting post-integration steps in the HIV-1 replication cycle are among the top candidates for gene therapy and have the potential ...