Name: chromosomics: detection of numerical and structural alterations in all 24 human chromosomes simultaneously using a novel octochrome fish assay
Uploaded: 2012-02-06T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Chromosomics: Detection of Numerical and Structural Alterations in All 24 Human Chromosomes Simultaneously Using a Novel OctoChrome FISH Assay at JoVE.com

저자들은 비판적으로 읽고 원고를 편집 박사 Cliona M. 맥헤일을 감사드립니다. 이 작품은 환경 보건 과학, 패 장 건강과 기금 R01ES017452 국립 연구소의 국립 연구소에 의해 재정 지원되었다.

1. 샘플 슬라이드 준비 <ul><li> OctoChrome 생선을 포함하여 인간 세포의 확산 metaphase의 염색체 변화를 검토하도록 설계하지만 교양 말초 혈액 세포, 줄기 / 전구 세포 및 세포 라인에 국한되지 않습니다. 샘플은 metaphases에게 3,11-13 수확을위한 표준 절차에 따라 작성하여야한다 : 세포를 팽창하는 metaphase, hypotonic 치료 세포를 체포하고 colcemid 치료를 채용하여, 약 0.5-1 X 10 6 세포에서 정...

<ol>
	<li>Levsky, J. M., Singer, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorescence+in+situ+hybridization:+past,+present+and+future.">Fluorescence in situ hybridization: past, present and future.</a> J. Cell. Sci. 116, 2833-2838 (2003).</li><li>Zhang, L., Eastmond, D. A., Smith, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+nature+of+chromosomal+aberrations+detected+in+humans+exposed+to+benzene.">The nature of chromosomal aberrations detected in humans exposed to benzene.</a> Crit. Rev. Toxicol. 32, 1-42 (2002).</li><li>Zhang, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aberrations+in+chromosomes+associated+with+lymphoma+and+therapy-related+leukemia+in+benzene-exposed+workers.">Aberrations in chromosomes associated with lymphoma and therapy-related leukemia in benzene-exposed workers.</a> Environ. Mol. Mutagen. 48, 467-474 (2007).</li><li>Zhang, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Benzene+increases+aneuploidy+in+the+lymphocytes+of+exposed+workers:+a+comparison+of+data+obtained+by+fluorescence+in+situ+hybridization+in+interphase+and+metaphase.">Benzene increases aneuploidy in the lymphocytes of exposed workers: a comparison of data obtained by fluorescence in situ hybridization in interphase and metaphase.</a> Environ. Mol. Mutagen. 34, 260-268 (1999).</li><li>Zhang, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Increased+aneusomy+and+long+arm+deletion+of+chromosomes+5+and+7+in+the+lymphocytes+of+Chinese+workers+exposed+to+benzene.">Increased aneusomy and long arm deletion of chromosomes 5 and 7 in the lymphocytes of Chinese workers exposed to benzene.</a> Carcinogenesis. 19, 1955-1961 (1998).</li><li>Smith, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Increased+translocations+and+aneusomy+in+chromosomes+8+and+21+among+workers+exposed+to+benzene.">Increased translocations and aneusomy in chromosomes 8 and 21 among workers exposed to benzene.</a> Cancer. Res. 58, 2176-2181 (1998).</li><li>Bayani, J., Squire, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Advances+in+the+detection+of+chromosomal+aberrations+using+spectral+karyotyping.">Advances in the detection of chromosomal aberrations using spectral karyotyping.</a> Clin. Genet. 59, 65-73 (2001).</li><li>Zhang, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chromosome-wide+aneuploidy+study+(CWAS)+in+workers+exposed+to+an+established+leukemogen,+benzene.">Chromosome-wide aneuploidy study (CWAS) in workers exposed to an established leukemogen, benzene.</a> Carcinogenesis. 32, 605-612 (2011).</li><li>Rowley, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+chromosome+translocations+in+leukemogenesis.">The role of chromosome translocations in leukemogenesis.</a> Semin. Hematol. 36, 59-72 (1999).</li><li>Zhang, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+OctoChrome+fluorescence+in+situ+hybridization+to+detect+specific+aneuploidy+among+all+24+chromosomes+in+benzene-exposed+workers.">Use of OctoChrome fluorescence in situ hybridization to detect specific aneuploidy among all 24 chromosomes in benzene-exposed workers.</a> Chem. Biol. Interact. , 153-154 (2005).</li><li>Barch, M. J., Lawce, H. J., Arsham, M. S., Barch, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> In The ACT cytogenetics laboratory. , 17-30 (1991).</li><li>Zhang, L., Yang, W., Hubbard, A. E., Smith, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nonrandom+aneuploidy+of+chromosomes+1,+5,+6,+7,+8,+9,+11,+12,+and+21+induced+by+the+benzene+metabolites+hydroquinone+and+benzenetriol.">Nonrandom aneuploidy of chromosomes 1, 5, 6, 7, 8, 9, 11, 12, and 21 induced by the benzene metabolites hydroquinone and benzenetriol.</a> Environ. Mol. Mutagen. 45, 388-396 (2005).</li><li>Smith, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hydroquinone,+a+benzene+metabolite,+increases+the+level+of+aneusomy+of+chromosomes+7+and+8+in+human+CD34-positive+blood+progenitor+cells.">Hydroquinone, a benzene metabolite, increases the level of aneusomy of chromosomes 7 and 8 in human CD34-positive blood progenitor cells.</a> Carcinogenesis. 21, 1485-1490 (2000).</li><li>Smith, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Advances+in+understanding+benzene+health+effects+and+susceptibility.">Advances in understanding benzene health effects and susceptibility.</a> Annu. Rev. Public. Health. 31, 133-148 (2010).</li></ol>

이 소설 OctoChrome - 물고기 분석은 하나가 동시에 슬라이드에 하나의 하이브리드화 모두 24 인간의 염색체를 검사 할 수 있습니다. 8 사각형의 염색체 조합의 배치는 가장 일반적인 leukemias과 lymphomas의 비 임의 염색체 rearrangements의 식별을 용이하게하도록 설계되었습니다. 따라서 분석이 동시에 숫자 (aneuploidy)뿐만 아니라 구조적인 (translocations) 염색체 변경 감지할 수 있습니다. ...

<table border="1"><tbody><tr><td> 시약의 이름 </td><td> 회사 </td><td> 카탈로그 번호 </td><td> 댓글 (옵션) </td><tr><tr><td> OctoChrome 키트 </td><td> Cytocell (주), 캠브리지, 영국 </td><td> PMP 803 </td><td></td></tr><tr><td> phytohaemagglutinin (PHA) </td><td> Invitrogen 주식 회사 </td><td> 10576-015 </td><td></td></tr><tr><td> Colcemid </td><td> Invitrogen 주식 회사 </td><td> 15212-012 </td><td></td></tr><tr><td> Carnoy의 정착액 </td><td></td><td></td><td> 메탄올 : 빙초산 = 3 : 1 </td></tr><tr><td> 형광 마일croscope </td><td></td><td></td><td> 동시에 서로 다른 색상을 볼 수 DAPI, 텍사스 빨강, FITC와 Coumarin의 스펙트럼 개별적 및 DAPI / FITC / 텍사스 레드 삼중 필터를 볼 수있는 필터가 장착된 </td></tr><tr><td> Metafer 소프트웨어 </td><td> MetaSystems, Altlussheim, 독일 </td><td></td><td> 모든 metaphases를 찾습니다 촉진하고 이상에게 재평가 </td></tr></tbody></table>

chromosomics: detection of numerical and structural alterations in all 24 human chromosomes simultaneously using a novel octochrome fish assay

원위치 하이브리드화 (물고기)의 형광은 특정 DNA 시퀀스는 세포 핵 1 metaphase이나 계면 염색체를 감지할 수 있도록하는 기법이다. 기술은 전체 염색체 또는 특정 염색체 지역에 잡종을 고유한 시퀀스와 DNA 프로브를 사용하며 고전 cytogenetics에 대한 강력한 보조 역할을합니다. 예를 들어, 많은 이전의 연구는 고전 cytogenetic 분석 2를 사용하여 벤젠 노출, 벤젠 - 중독 환자 및 벤젠에 노출된 건강한 노동자와 관련된 백혈병 환자의 증가 염색체 aberrations의 자주 감지했다. 물고기를 사용하여, 백혈병 특정 염색체 변경은 벤젠 유발 leukemogenesis의 cytogentic 변화의 중요한 역할을 나타내는 벤젠 3-6에 노출 분명히 건강한 노동자로 상승하는 관찰되었습니다. 일반적으로, 하나의 생선 분석은 조사 하나 또는 몇 전체 염색체또는 슬라이드마다 특정 loci, 그래서 여러 hybridizations는 인간의 염색체를 모두 충당하기 위해 여러 슬라이드에 실시해야합니다. 분광 karyotyping (SKY)는 동시에 전체 게놈의 시각화 있지만, 특별한 소프트웨어 및 장비 제한 그 응용 7에 대한 요구 사항을 허용합니다. 여기서는 소설 생선 분석, 우리는 그러한 염색체 전체 aneuploidy 연구와 같은 인간의 연구에서 한 슬라이드에있는 모든 24 인간의 염색체의 동시 분석 (CWAS)로 여기에 정의 Chromosomics에 대해 적용할 수있는 OctoChrome - 물고기, 설명 8. Chromoprobe의 Multiprobe 시스템으로 Cytocell하여 판매 방법의 기초는 세 가지 모든 염색체 페인팅 프로브 (그림 1) 운반 각각 8 사각형으로 나뉘어져 있습니다 OctoChrome 장치입니다. 세 프로브 각각 직접 가지 다른 색의 형광단, 녹색 (FITC), 빨간색 (텍사스 빨강), 파랑 (Coumarin)로 표시됩니다. OctoChrom의 염색체 조합의 정리, T (15, 17), T (8, 21, 전자 장치 인스턴스 t (22 9)에 대해 가장 일반적인 leukemias과 lymphomas에서 발견되지 않은 임의의 구조적 염색체 변경 (translocations)의 식별을 용이하게하도록 설계되었습니다 ), T (14, 18) 9. 또, 염색체의 숫자 변화 (aneuploidy)가 동시에 감지가 가능하다. 해당 템플릿 슬라이드도 metaphase의 확산은 (그림 2) 구속되며, OctoChrome 장치로 배치되는 방향 8 사각형으로 나뉘어져 있습니다. 프로브 및 대상 DNA는 높은 온도와 습기 챔버에 hybridized에 변성이며, 다음 모든 24 인간의 염색체는 동시에 시각이 될 수 있습니다. OctoChrome 물고기는 백혈병과 림프종의 임상 진단 및 모든 염색체의 aneuploidies의 검출을위한 유망 기술입니다. 우리는 벤젠 노출 중국어 노동자 8,10의 CWAS 연구에서이 새로운 Chromosomic 접근 방식을 적용했습니다.

Watch this Scientific Journal Video about Chromosomics: Detection of Numerical and Structural Alterations in All 24 Human Chromosomes Simultaneously Using a Novel OctoChrome FISH Assay at JoVE.com

Chromosomics: Detection of Numerical and Structural Alterations in All 24 Human Chromosomes Simultaneously Using a Novel OctoChrome FISH Assay

소설의 형광<em&gt; 현장에서</em&gt; 하이브리드화 (물고기) 동시에 특히 숫자 및 구조 모두 염색체 변경 한 하이브리드화에서 하나의 디바이스에있는 모든 24 인간의 염색체의 백혈병 및 림프종과 관련된 특정 염색체 translocations를 검사 방법은 설명되어 있습니다.

Chromosomics : 수치과 구조 변경의 탐지는 모두 24 인간의 염색체로 동시에 소설 OctoChrome 생선 분석을 사용

Fluorescence in situ hybridization (FISH) is a technique that allows specific DNA sequences to be detected on metaphase or interphase chromosomes in cell ...

Research

JoVE Journal

Biology

Fluorescence in situ hybridization (FISH) Protocol in Human Sperm

Fluorescence in situ hybridization FISH Protocol in Human Sperm

형광 현장에서</em인간의 정자에서> 하이브리드화 (물고기) 프로토콜

Aneuploidies are the most frequent chromosomal abnormalities in humans. Most of these abnormalities result from meiotic errors during the gametogenic ...

연구

생물학

High-throughput Saccharification Assay for Lignocellulosic Materials

리그노셀룰로오스성 자료에 대한 높은 처리량 당화 분석

Polysaccharides that make up plant lignocellulosic biomass can be broken down to produce a range of sugars that subsequently can be 
used in establishing ...

Detection of Viral RNA by Fluorescence in situ Hybridization (FISH)

Detection of Viral RNA by Fluorescence in situ Hybridization FISH

형광에 의한 바이러스성 RNA의 탐지<em&gt; 현장에서</em&gt; 하이브리드화 (물고기)

Viruses  that infect cells elicit specific changes to normal cell functions which serve  to divert energy and resources for viral replication. Many ...

Detecting Somatic Genetic Alterations in Tumor Specimens by Exon Capture and Massively Parallel Sequencing

엑손 캡처 및 대규모 병렬 염기 서열 종양 검체에서 체세포 유전 변경을 검출

Efforts  to detect and investigate key oncogenic mutations have proven valuable to  facilitate the appropriate treatment for cancer patients. The ...

Efficient Production and Purification of Recombinant Murine Kindlin-3 from Insect Cells for Biophysical Studies

의 효율적인 생산 및 정제 재조합 쥐과 Kindlin-3 생물 물리학 연구 곤충 세포에서

Kindlins are essential coactivators, with talin, of the cell surface receptors&#160;integrins and also participate in integrin outside-in signalling, and ...

Assessing Species-specific Contributions To Craniofacial Development Using Quail-duck Chimeras

메추라기 오리 키메라를 사용하여 두개 안면 개발에 종 - 특정 포스트 평가

The generation of chimeric embryos is a widespread and powerful approach to study cell fates, tissue interactions, and species-specific contributions to ...

Recombinant Protein Expression for Structural Biology in HEK 293F Suspension Cells: A Novel and Accessible Approach

소설 및 액세스 접근 : 구조 HEK 293F 서스펜션 세포의 생물학에 대한 재조합 단백질 발현

The expression and purification of large amounts of recombinant protein complexes is an essential requirement for structural biology studies. For over two ...

Targeted RNA Sequencing Assay to Characterize Gene Expression and Genomic Alterations

RNA 시퀀싱 분석은 유전자 발현 및 게놈 변경을 특성화를 대상으로

RNA sequencing (RNAseq) is a versatile method that can be utilized to detect and characterize gene expression, mutations, gene fusions, and noncoding ...

Studying Ribonucleotide Incorporation: Strand-specific Detection of Ribonucleotides in the Yeast Genome and Measuring Ribonucleotide-induced Mutagenesis

Ribonucleotides 효 모 게놈에 Ribonucleotide 유도 된 Mutagenesis 측정의 공부 Ribonucleotide 법인: 물가 관련 검색

The presence of ribonucleotides in nuclear DNA has been shown to be a source of genomic instability. The extent of ribonucleotide incorporation can be ...

Improved Fecundity and Fertility Assay for Aedes aegypti using 24 Well Tissue Culture Plates (EAgaL Plates)

Improved Fecundity and Fertility Assay for Aedes aegypti using 24 Well Tissue Culture Plates EAgaL Plates

24 잘 조직 배양 플레이트를 사용하여 Aedes aegypti에 대한 개선 된 Fecundity 및 불임 분석 (EAgaL 플레이트)

Mosquitoes represent a significant public health problem as vectors of various pathogens. For those studies that require an assessment of mosquito fitness ...