Name: colonization of euprymna scolopes squid by vibrio fischeri
Uploaded: 2012-03-01T13:00:00
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저자 오징어 시설 지원이 원고에 대한 의견, 마이클 Hadfield 현장 수령시 도움 Kewalo 해양 연구소,이 프로토콜에 기여를위한 루비와 McFall-Ngai 실험실의 구성원에 대한 Gyllborg Mattias 감사드립니다. Mandel 연구소의 작품은 NSF IOS-0843633에 의해 지원됩니다.

1. 세균성 Inocula의 작성 <ol><li> 데이 0 오징어 접종, 접시 LBS에 관련된 박테리아 변종 13 한천 이전 이틀. </li><li> 25-28 ° C에서 하룻밤 사이에 박테리아를 품어. </li><li> 1 일 각 V. 중 하나를 식민지로 유리 문화 튜브의 중간 세 ML LBS의 예방 감염 fischeri 변형. 백업으로 튜브를 복제 준비합니다. </li><li> 날 2 (오징어 단계 ...

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	<li>Aas, J. A., Paster, B. J., Stokes, L. N., Olsen, I., Dewhirst, F. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Defining+the+normal+bacterial+flora+of+the+oral+cavity.">Defining the normal bacterial flora of the oral cavity.</a> J. Clin. Microbiol. 43, 5721-5732 (2005).</li><li>Mandel, M. J., Wollenberg, M. S., Stabb, E. V., Visick, K. L., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+single+regulatory+gene+is+sufficient+to+alter+bacterial+host+range.">A single regulatory gene is sufficient to alter bacterial host range.</a> Nature. 458, 215-218 (2009).</li><li>Grice, E. A., Segre, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+skin+microbiome.">The skin microbiome.</a> Nat. Rev. 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G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Symbiont+recognition+and+subsequent+morphogenesis+as+early+events+in+an+animal-bacterial+mutualism.">Symbiont recognition and subsequent morphogenesis as early events in an animal-bacterial mutualism.</a> Science. 254, 1491-1494 (1991).</li><li>Jones, B., Nishiguchi, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Counterillumination+in+the+Hawaiian+bobtail+squid,+Euprymna+scolopes+Berry+(Mollusca:+Cephalopoda).">Counterillumination in the Hawaiian bobtail squid, Euprymna scolopes Berry (Mollusca: Cephalopoda).</a> Marine Biology. 144, 1151-1155 (2004).</li><li>Graf, J., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Host-derived+amino+acids+support+the+proliferation+of+symbiotic+bacteria.">Host-derived amino acids support the proliferation of symbiotic bacteria.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95, 1818-1822 (1998).</li><li>Ruby, E. G., McFall-Ngai, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+squid+that+glows+in+the+night:+development+of+an+animal-bacterial+mutualism.">A squid that glows in the night: development of an animal-bacterial mutualism.</a> J. Bacteriol. 174, 4865-4870 (1992).</li><li>Lee, P. N., McFall-Ngai, M. J., Callaerts, P., de Couet, H. 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J., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Depressed+light+emission+by+symbiotic+Vibrio+fischeri+of+the+sepiolid+squid+Euprymna+scolopes.">Depressed light emission by symbiotic Vibrio fischeri of the sepiolid squid Euprymna scolopes.</a> J. Bacteriol. 172, 3701-3706 (1990).</li><li>Fidopiastis, P. M., von Boletzky, S., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+niche+for+Vibrio+logei,+the+predominant+light+organ+symbiont+of+squids+in+the+genus+Sepiola.">A new niche for Vibrio logei, the predominant light organ symbiont of squids in the genus Sepiola.</a> J. Bacteriol. 180, 59-64 (1998).</li><li>Bose, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Contribution+of+rapid+evolution+of+the+luxR-luxI+intergenic+region+to+the+diverse+bioluminescence+outputs+of+Vibrio+fischeri+strains+isolated+from+different+environments.">Contribution of rapid evolution of the luxR-luxI intergenic region to the diverse bioluminescence outputs of Vibrio fischeri strains isolated from different environments.</a> Appl. Environ. Microbiol. 77, 2445-2457 (2011).</li></ol>

설명 식민지 분석은 통제된 실험실 환경에서 자연 공생 프로세스의 분석을 위해 수 있습니다. 따라서, 그것은 서로 다른 자연의 분리에 의한 돌연변이 종자에 의해 서로 다른 화학 정권 아래에서 식민지를 평가하는 데 사용할 수 있습니다. 설명된 실험에서 유사 일반적 공생의 다양한 측면을 평가하는 데 사용됩니다. 식민지의 속도론은 우연 탐지기가 제거된있는 신틸레이션 계수기에서 자동으?...

<table border="1"><tbody><tr><td> 시약의 이름 </td><td> 회사 </td><td> 카탈로그 번호 </td><td> 댓글 </td></tr><tr><td> 유리 문화 튜브, 16 밀리미터 직경 </td><td> VWR </td><td> 47729-580 </td><td></td></tr><tr><td> 유리 문화 튜브를위한 모자 </td><td> 어부 </td><td> NC9807998 </td><td></td></tr><tr><td> OD 600 결정에 대한 표시 분광 </td><td> Biowave </td><td> CO8000 </td><td> OD 600을 측정할 수있는 분광 광도계가 작동합니다. 이 기기는 유리 배양 튜브에 직접 액체가 OD 600을 측정할 수 있습니다. inoculum 계산의 일부 조정이 사용되는 장비에 따라 필요할 수 있습니다. </td></tr><tr><td> GloMax 20분의 20 단일 튜브 Luminometer </td><td> Promega </td><td> E5311 </td><td> 터너 BioSystems 20/20n Luminometer에 상응. microcentrifuge 튜브 홀더가 포함되어 있습니다. </td></tr><tr><td> GloMax 20분의 20 라이트 스탠다드 </td><td> Promega </td><td> E5341 </td><td> luminometer 교정하십시오. </td></tr><tr><td> 굴절계, 핸드헬드 </td><td> 포스터와 스미스 수상 </td><td> CD-14035 </td><td> 탈이온수 각각 사용하기 전에 보정. 소금을 빌드 - 업 방지하기 위해 탈이온수있는 모든 사용 후 린스. </td></tr><tr><td> 인스턴트 오션 (인공 해수 농축) </td><td> 포스터 &amp; 스미스 수상 </td><td> CD-16881 </td><td> 0.2 μm의 SFCA 필터를 통해 다음 필터, 굴절계를 이용하여 탈이온수 35 ‰에서 준비합니다. </td></tr><tr><td> 여과 장치 </td><td> Nalgene </td><td> 158-0020 </td><td> 계면 활성제가없는 셀룰로스 아세테이트 (SFCA) 멤브레인 0.2 μm의. 우리는 몇 가지 계면 활성제 함유 PES 필터와 가변 결과를 관찰했습니다. </td></tr><tr><td> 전송 Pipettes </td><td> 어부 </td><td> 13-711 -오전 9시 </td><td> 가위 또는 면도날을 사용하여 깔끔하게 피펫 팁의 직경을 증가시키고 오징어 hatchlings 손을 쓰고 피하기 위해 첫 번째 능선 위의 팁을 했네요. </td></tr><tr><td> 일회용 샘플 그릇 (플라스틱 tumblers) </td><td> 혜성 </td><td> T9S (9온스) </td><td> 상부 직경 3 접종을위한 그릇, ¼ &quot;더 낮은 직경이 ¼&quot;, 높이 3 &quot;. 그들이 오징어는 낮은 산소의 틈새에 갇혀받을 수있는 더 아래쪽 가장자리를, 없다로 갔었는 동질적인 환경을 만듭니다. 크기가 최적화됩니다 40-ML inoculum. webstaurantstore.com에서 가능 # 619PI9. </td></tr><tr><td> Drosophila 튜브 </td><td> VWR </td><td> 89092-720 </td><td> 유리병 직경은 luminometer의 PMT에 오프닝과 일치합니다. </td></tr><tr><td> 1.5 ML의 Microcentrifuge 튜브 </td><td> ISC Bioexpress </td><td> C-3217-1CS </td><td> 튜브 pestles의 모양에 맞게해야합니다. </td></tr><tr><td> 에탄올, 200 입증 </td><td> 어부 </td><td> BP2818-100 </td><td></td></tr><tr><td> Pestles </td><td> 킴블의 체이스 / Kontes </td><td> 749521-1500 </td><td></td></tr><tr><td> 도금 비즈, 5 밀리미터 직경 </td><td> 킴블의 체이스 </td><td> 13,500 오 </td><td> 튜브 및 압력솥 당 5 준비합니다. </td></tr></tbody></table>

colonization of euprymna scolopes squid by vibrio fischeri

특정 박테리아는 동물 조직을 1-5으로 협회에서 발견된다. 이러한 호스트 세균성 협회는 (symbioses) (병원성) 해로운가 될 수없고 피트니스 결과 (공생)가없는, 또는 (mutualistic) 유익합니다. 많은 관심은 병원성 상호 작용 부여되어 있지만, 거의가 환경에서 공생 / 유익한 박테리아의 재현성 인수를 지시하는 프로세스에 대해 알려져 있습니다. 해양 그람 음성 세균 사이의 가벼운 장기 mutualism V. fischeri와 하와이 꼬리 자른 오징어, E. scolopes는 하나의 호스트 (E. scolopes)는 자사의 일생 6,7의 과정 전반에 걸쳐 하나의 세균 종 (V. fischeri)와 공생 관계를 수립하는 매우 구체적인 상호 작용을 나타냅니다. V. 제작한 Bioluminescence 이 상호 작용하는 동안 fischeri는 엑스타시의 안티 육식 혜택을 제공합니다 야행성 활동 8,9 중 scolopes 반면영양이 풍부한 호스트 조직을 제공 V. 보호 틈새 10과 fischeri. 각 호스트 생성하는 동안,이 관계는 따라서 공생 발전의 다양한 단계에서 세부 평가 수있는 예측 가능한 프로세스를 대표 recapitulated있다. 첫 번째 30~60분 내에 수집 symbiont없는 물로 전송하는 경우 실험실에서 청소년 오징어 해치 aposymbiotically (uncolonized), 그리고는, 실험 inoculum 6에 의한 경우를 제외하고 식민지하실 수 없습니다. 이 상호 작용함으로써 환경 11,12의 공생 미생물의 특정 취득으로 이어질 개별 단계를 평가하는하는 유용한 모델 시스템을 제공합니다. 여기 새로 aposymbiotic E.을 꾸몄다고 때 발생하는 식민지의 정도를 평가하는 방법을 설명 scolopes는 (인공)이 포함된 해수에 노출되는 V. fischeri 있습니다.이 간단한 분석은 접종, 자연 감염 및 복구에 대해 설명E.의 초기 조명 장기에서 세균성 symbiont의 scolopes. 케어는 특히 수질과 라이트 단서와 관련하여, 공생 개발하는 동안 동물을위한 일관된 환경을 제공하기 위해 가져옵니다. 설명 공생 인구를 특성화하기위한 방법은 bacterially-파생 bioluminescence (1) 측정 및 회복 symbionts의 계산 (2) 직접 식민지를 포함합니다.

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Colonization of Euprymna scolopes Squid by Vibrio fischeri

방법에 의한 하와이의 꼬리 자른 오징어 절차를 간략하게 설명<em&gt; Euprymna scolopes</em&gt;와 세균성 symbiont,<em&gt; 장염 fischeri</em&gt;, 박테리아에 의한 오징어 표시등 기관의 특정 식민지 수 있도록 도입 별도로하고 사육하고 있습니다. bacterially-파생된 발광에 의한 직접적인 식민지의 계산에 의한 식민지 감지 기능이 설명되어 있습니다.

의 식민지 Euprymna scolopes 오징어에 의한 장염 fischeri</em

Specific bacteria are found in association with animal tissue1-5. Such host-bacterial associations (symbioses) can be detrimental (pathogenic), have no ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Colonization of Euprymna scolopes Squid by Vibrio fischeri

Assessing Hepatic Metabolic Changes During Progressive Colonization of Germ-free Mouse by 1H NMR Spectroscopy

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하여 세균없는 마우스 프로 그레시브 콜로니 동안 간장 신진 대사 변경 사항 평가 1 H NMR 분광학

It is well known that gut bacteria contribute significantly to the host homeostasis, providing a range of benefits such as immune protection and vitamin ...

연구

면역학 및 감염병학

Quantification of Fungal Colonization, Sporogenesis, and Production of Mycotoxins Using Kernel Bioassays

커널 Bioassays를 사용하여 곰팡이 콜로니, Sporogenesis 및 Mycotoxins 생산의 부량

The rotting of grains by seed-infecting fungi poses one of the greatest economic challenges to cereal production worldwide, not to mention serious risks ...

TransFLP &#x2014; A Method to Genetically Modify Vibrio cholerae Based on Natural Transformation and FLP-recombination

TransFLP - 유 전적으로 수정하는 방법<em&gt; 장염 cholerae</em&gt; 자연 변화와 FLP-재조합에 근거

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연쇄상 구균 폐렴으로 비강 내 식민지 화 중 염증 반응의 특성화

Nasopharyngeal colonization by Streptococcus pneumoniae is a prerequisite to invasion to the lungs or bloodstream1. This organism is capable of colonizing ...

Investigating the Effects of Probiotics on Pneumococcal Colonization Using an In Vitro Adherence Assay

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의 검출을위한 더 민감하고 특정 원체 한천 배지의 개발<em&gt; 장염 비브리오 균</em&gt; 및 기타<em&gt; 비브리오</em&gt; 종

Foodborne infections in the US caused by Vibrio species have shown an upward trend. In the genus Vibrio, V. parahaemolyticus is responsible for the ...

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Laboratory Techniques Used to Maintain and Differentiate Biotypes of Vibrio cholerae Clinical and Environmental Isolates

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The aquatic Gram-negative bacterium Vibrio cholerae is the etiological agent of the infectious gastrointestinal disease cholera. Due to the global ...

Induction of Cellular Differentiation and Single Cell Imaging of Vibrio parahaemolyticus Swimmer and Swarmer Cells

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세포 분화 및 단일 세포 이미징의 유도<em&gt; 비브리오 균 (Vibrio parahaemolyticus)</em&gt; Swimmer and Swarmer Cells

The ability to study the intracellular localization of proteins is essential for the understanding of many cellular processes. In turn, this requires the ...

Detection of Enterohemorrhagic Escherichia Coli Colonization in Murine Host by Non-invasive In Vivo Bioluminescence System

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생물 발광 시스템 비-침략 적 비보에 의해 Murine 호스트에서 Enterohemorrhagic 대장균 식민지의 검출

Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) O157:H7, which is a foodborne pathogen that causesdiarrhea, hemorrhagic colitis (HS), and hemolytic uremic syndrome ...