Name: colonization of euprymna scolopes squid by vibrio fischeri
Uploaded: 2012-03-01T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Colonization of Euprymna scolopes Squid by Vibrio fischeri at JoVE.com

Авторы благодарят Маттиаса Gyllborg для поддержки объекта кальмаров и комментариев к этой рукописи, Майкл Хэдфилд и Лаборатории морской Kewalo за помощь в коллекции полей и членов Рубин и Макфолл-Нгай Лаборатория вклад в этот протокол. Работа в лаборатории Мандель поддерживается NSF IOS-0843633.

1. Подготовка бактериальных Инокулят <ol><li> День 0 За два дня до прививки кальмары, плиты соответствующих бактериальных штаммов на LBS 13 агара. </li><li> Инкубируйте бактерий на 25-28 ° С в течение ночи. </li><li> День 1 Инокулировать 3 мл LBS среды в трубке культуры стекл?...

<ol>
	<li>Aas, J. A., Paster, B. J., Stokes, L. N., Olsen, I., Dewhirst, F. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Defining+the+normal+bacterial+flora+of+the+oral+cavity.">Defining the normal bacterial flora of the oral cavity.</a> J. Clin. Microbiol. 43, 5721-5732 (2005).</li><li>Mandel, M. J., Wollenberg, M. S., Stabb, E. V., Visick, K. L., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+single+regulatory+gene+is+sufficient+to+alter+bacterial+host+range.">A single regulatory gene is sufficient to alter bacterial host range.</a> Nature. 458, 215-218 (2009).</li><li>Grice, E. A., Segre, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+skin+microbiome.">The skin microbiome.</a> Nat. Rev. Microbiol. 9, 244-253 (2011).</li><li>Malic, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+and+identification+of+specific+bacteria+in+wound+biofilms+using+peptide+nucleic+acid+fluorescent+in+situ+hybridization+(PNA+FISH).">Detection and identification of specific bacteria in wound biofilms using peptide nucleic acid fluorescent in situ hybridization (PNA FISH).</a> Microbiology. 155, 2603-2611 (2009).</li><li>Turnbaugh, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+human+microbiome+project.">The human microbiome project.</a> Nature. 449, 804-810 (2007).</li><li>Nyholm, S. V., McFall-Ngai, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+winnowing:+establishing+the+squid-Vibrio+symbiosis.">The winnowing: establishing the squid-Vibrio symbiosis.</a> Nat. Rev. Microbiol. 2, 632-642 (2004).</li><li>Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lessons+from+a+cooperative,+bacterial-animal+association:+the+Vibrio+fischeri-Euprymna+scolopes+light+organ+symbiosis.">Lessons from a cooperative, bacterial-animal association: the Vibrio fischeri-Euprymna scolopes light organ symbiosis.</a> Annu. Rev. Microbiol. 50, 591-624 (1996).</li><li>McFall-Ngai, M. J., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Symbiont+recognition+and+subsequent+morphogenesis+as+early+events+in+an+animal-bacterial+mutualism.">Symbiont recognition and subsequent morphogenesis as early events in an animal-bacterial mutualism.</a> Science. 254, 1491-1494 (1991).</li><li>Jones, B., Nishiguchi, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Counterillumination+in+the+Hawaiian+bobtail+squid,+Euprymna+scolopes+Berry+(Mollusca:+Cephalopoda).">Counterillumination in the Hawaiian bobtail squid, Euprymna scolopes Berry (Mollusca: Cephalopoda).</a> Marine Biology. 144, 1151-1155 (2004).</li><li>Graf, J., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Host-derived+amino+acids+support+the+proliferation+of+symbiotic+bacteria.">Host-derived amino acids support the proliferation of symbiotic bacteria.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95, 1818-1822 (1998).</li><li>Ruby, E. G., McFall-Ngai, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+squid+that+glows+in+the+night:+development+of+an+animal-bacterial+mutualism.">A squid that glows in the night: development of an animal-bacterial mutualism.</a> J. Bacteriol. 174, 4865-4870 (1992).</li><li>Lee, P. N., McFall-Ngai, M. J., Callaerts, P., de Couet, H. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Hawaiian+bobtail+squid+(Euprymna+scolopes):+a+model+to+study+the+molecular+basis+of+eukaryote-prokaryote+mutualism+and+the+development+and+evolution+of+morphological+novelties+in+cephalopods.">The Hawaiian bobtail squid (Euprymna scolopes): a model to study the molecular basis of eukaryote-prokaryote mutualism and the development and evolution of morphological novelties in cephalopods.</a> Cold Spring Harbor Protocols. , (2009).</li><li>Stabb, E., Visick, K., Millikan, D., Corcoran, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Vibrio+fischeri-Euprymna+scolopes+symbiosis:+a+model+marine+animal-bacteria+interaction.">The Vibrio fischeri-Euprymna scolopes symbiosis: a model marine animal-bacteria interaction.</a> Recent Advances in Marine Science and Technology. , (2001).</li><li>Boettcher, K. J., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Depressed+light+emission+by+symbiotic+Vibrio+fischeri+of+the+sepiolid+squid+Euprymna+scolopes.">Depressed light emission by symbiotic Vibrio fischeri of the sepiolid squid Euprymna scolopes.</a> J. Bacteriol. 172, 3701-3706 (1990).</li><li>Fidopiastis, P. M., von Boletzky, S., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+niche+for+Vibrio+logei,+the+predominant+light+organ+symbiont+of+squids+in+the+genus+Sepiola.">A new niche for Vibrio logei, the predominant light organ symbiont of squids in the genus Sepiola.</a> J. Bacteriol. 180, 59-64 (1998).</li><li>Bose, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Contribution+of+rapid+evolution+of+the+luxR-luxI+intergenic+region+to+the+diverse+bioluminescence+outputs+of+Vibrio+fischeri+strains+isolated+from+different+environments.">Contribution of rapid evolution of the luxR-luxI intergenic region to the diverse bioluminescence outputs of Vibrio fischeri strains isolated from different environments.</a> Appl. Environ. Microbiol. 77, 2445-2457 (2011).</li></ol>

Колонизация анализа, описанного позволяет для анализа природных симбиотических процессов в контролируемых лабораторных условиях. Как таковой, он может быть использован для оценки колонизации мутантных штаммов, различных природных изолятов и при различных режимах химических вещест?...

<table border="1"><tbody><tr><td> Название реагента </td><td> Компания </td><td> Номер по каталогу </td><td> Комментарии </td></tr><tr><td> Стекло Культура трубы, диаметром 16 мм </td><td> VWR </td><td> 47729-580 </td><td></td></tr><tr><td> Крышки для стеклянных трубок культуры </td><td> Рыбак </td><td> NC9807998 </td><td></td></tr><tr><td> Видимый спектрофотометр для определения OD 600 </td><td> Biowave </td><td> CO8000 </td><td> Любой спектрофотометр, способный измерять OD 600 будет работать. Это устройство может измерять OD 600 жидкость непосредственно в стеклянные трубки культуры. Некоторые корректировки посевной расчета могут быть необходимы в зависимости от инструмента используются. </td></tr><tr><td> GloMax 20/20 однотрубные люминометр </td><td> Promega </td><td> E5311 </td><td> Эквивалент Тернер BioSystems 20/20n люминометр. Включает в себя держатель микроцентрифужных трубку. </td></tr><tr><td> GloMax 20/20 Свет Стандартный </td><td> Promega </td><td> E5341 </td><td> Для люминометра калибровки. </td></tr><tr><td> Рефрактометр, Handheld </td><td> Фостер и Смит водных видов спорта </td><td> CD-14035 </td><td> Калибровку перед каждым использованием деионизированной водой. Промыть после каждого использования деионизированной водой, чтобы предотвратить накоплению солей. </td></tr><tr><td> Мгновенный океана (искусственного концентрата морской воды) </td><td> Foster &amp; Smith водных видов спорта </td><td> CD-16881 </td><td> Подготовить на 35 ‰ в деионизованной воде, с использованием рефрактометра, а затем процеживают через 0,2 мкм SFCA фильтр. </td></tr><tr><td> Фильтрации </td><td> Nalgene </td><td> 158-0020 </td><td> Поверхностно-ацетата целлюлозы (SFCA) мембрана, 0,2 мкм. Мы наблюдали разные результаты с некоторыми поверхностно-содержащих PES фильтры. </td></tr><tr><td> Передача Пипетки </td><td> Рыбак </td><td> 13-711 -9 утра </td><td> Используя ножницы или лезвие бритвы, вырезать кончиком чистого над первым хребтом увеличить диаметр кончика пипетки и избегать сжимая кальмар птенцов. </td></tr><tr><td> Одноразовые миски образца (пластиковые стаканы) </td><td> Комета </td><td> T9s (9 гр.) </td><td> Чаши для прививки, с верхним диаметром 3 ¼ &quot;, нижний диаметр 2 ¼&quot;, высота 3 &quot;. Миски создать однородную среду, поскольку они не имеют нижний край, в котором кальмар может попасть в ловушку в с низким содержанием кислорода нишу. Размер оптимизирован 40 мл посевной. Доступные в webstaurantstore.com, # 619PI9. </td></tr><tr><td> Флаконы Drosophila </td><td> VWR </td><td> 89092-720 </td><td> Флакон диаметр соответствует отверстию на люминометра ФЭУ. </td></tr><tr><td> Пробирки на 1,5 мл Микроцентрифуга </td><td> ISC Bioexpress </td><td> C-3217-1CS </td><td> Трубы должны соответствовать форме пестики. </td></tr><tr><td> Этанол, 200 Доказательство </td><td> Рыбак </td><td> BP2818-100 </td><td></td></tr><tr><td> Пестики </td><td> Кимбл Chase / Kontes </td><td> 749521-1500 </td><td></td></tr><tr><td> Покрытие бисера, диаметром 5 мм </td><td> Кимбл Chase </td><td> 13500 5 </td><td> Подготовить 5 процентов труб и автоклав. </td></tr></tbody></table>

colonization of euprymna scolopes squid by vibrio fischeri

Специальные бактерии обнаружены в связи с тканей животных 1-5. Такой хост-бактериальных ассоциаций (симбиоз) может иметь пагубные последствия (патогенные), не фитнес-следствие (комменсалы), либо быть полезным (взаимопомощи). В то время много внимания уделялось патогенные взаимодействия, мало известно о процессах, которые определяют воспроизводимых приобретение полезных / комменсальных бактерии из окружающей среды. Световых орган взаимности между морскими грамотрицательные бактерии V. fischeri и Гавайских бобтейл кальмары, Е. scolopes, представляет собой весьма специфическое взаимодействие, в котором один хозяин (Э. scolopes) устанавливает симбиотические отношения с только одного вида бактерий (В. fischeri) на протяжении всей своей жизни 6,7. Биолюминесценция производства V. fischeri во время этого взаимодействия дает анти-хищный пользу E. scolopes во время ночных мероприятий 8,9, в то времяБогатые питательными веществами тканей хозяина обеспечивает V. fischeri с защитой ниша 10. В каждом хосте поколения, эти отношения воспроизводятся, тем самым обеспечивая предсказуемый процесс, который может быть оценен подробно на различных этапах развития симбиотических. В лаборатории несовершеннолетних кальмар люк aposymbiotically (неколонизированных), и, если они собираются в течение первых 30-60 минут и переданы симбионта без воды не может быть колонизирована за исключением экспериментальных посевной 6. Это взаимодействие обеспечивает, таким образом полезную модель, в которой для оценки отдельных шагов, которые приводят к конкретным приобретение симбиотических микробов из окружающей среды 11,12. Здесь мы опишем метод оценки степени колонизации, что происходит, когда только что вылупившихся aposymbiotic E. scolopes подвергаются (искусственного) морская вода, содержащая V. fischeri. Этот простой анализ описывает прививки, естественной инфекции и восстановлениебактериальных симбионтов от зарождающегося органа свете E. scolopes. Особое внимание уделяется тому, чтобы обеспечить согласованную среду для животных во время симбиотической развития, особенно в отношении качества воды и света сигналы. Методы характеризуют симбиотических населения описано включают: (1) измерение бактериально-производные биолюминесценции, и (2) прямой подсчет колоний восстановленных симбионтов.

Watch this Scientific Journal Video about Colonization of Euprymna scolopes Squid by Vibrio fischeri at JoVE.com

Colonization of Euprymna scolopes Squid by Vibrio fischeri

Метод описывается процедура, посредством которой Гавайских кальмар бобтейл,<em&gt; Euprymna scolopes</em&gt; И бактериальных симбионтов,<em&gt; Vibrio fischeri</em&gt;, Поднимаются отдельно, а затем ввели, чтобы обеспечить определенный колонизации органа свет кальмаров бактериями. Колонизация обнаружения бактериально-производные люминесценции и прямым подсчетом колонии описаны.

Колонизация Euprymna scolopes Squid по Vibrio fischeri</em

Specific bacteria are found in association with animal tissue1-5. Such host-bacterial associations (symbioses) can be detrimental (pathogenic), have no ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Colonization of Euprymna scolopes Squid by Vibrio fischeri

Assessing Hepatic Metabolic Changes During Progressive Colonization of Germ-free Mouse by 1H NMR Spectroscopy

Assessing Hepatic Metabolic Changes During Progressive Colonization of Germ-free Mouse by 1H NMR Spectroscopy

Оценка изменения Печеночная Метаболический Во Прогрессивная Колонизация зародыш без мыши по 1 Н-ЯМР-спектроскопии

It is well known that gut bacteria contribute significantly to the host homeostasis, providing a range of benefits such as immune protection and vitamin ...

Quantification of Fungal Colonization, Sporogenesis, and Production of Mycotoxins Using Kernel Bioassays

Количественная грибковой колонизации, спорогенеза, и производство микотоксинов Использование ядра Биопробы

The rotting of grains by seed-infecting fungi poses one of the greatest economic challenges to cereal production worldwide, not to mention serious risks ...

TransFLP &#x2014; A Method to Genetically Modify Vibrio cholerae Based on Natural Transformation and FLP-recombination

TransFLP - метод генетической модификации<em&gt; Холерный вибрион</em&gt; На основе природных преобразований и FLP-рекомбинации

Several methods are available to manipulate bacterial chromosomes1-3. Most of these protocols rely on the insertion of conditionally replicative plasmids ...

Characterization of Inflammatory Responses During Intranasal Colonization with Streptococcus pneumoniae

Characterization of Inflammatory Responses During Intranasal Colonization with Streptococcus pneumoniae

Характеристика воспалительных реакций во время интраназальной колонизации стрептококковой пневмонией

Nasopharyngeal colonization by Streptococcus pneumoniae is a prerequisite to invasion to the lungs or bloodstream1. This organism is capable of colonizing ...

Investigating the Effects of Probiotics on Pneumococcal Colonization Using an In Vitro Adherence Assay

Investigating the Effects of Probiotics on Pneumococcal Colonization Using an In Vitro Adherence Assay

Исследование действия пробиотиков на пневмококковой колонизации Использование<em&gt; Экстракорпоральное</em&gt; Соблюдение Анализ

Adherence of Streptococcus pneumoniae (the pneumococcus) to the epithelial lining of the nasopharynx can result in colonization and is considered a ...

Development of a More Sensitive and Specific Chromogenic Agar Medium for the Detection of Vibrio parahaemolyticus and Other Vibrio Species

Development of a More Sensitive and Specific Chromogenic Agar Medium for the Detection of Vibrio parahaemolyticus and Other Vibrio Species

Развитие более чувствительным и специфичным хромогенного агаровой среде для обнаружения<em&gt; Vibrio parahaemolyticus</em&gt; И другие<em&gt; Vibrio</em&gt; Виды

Foodborne infections in the US caused by Vibrio species have shown an upward trend. In the genus Vibrio, V. parahaemolyticus is responsible for the ...

A Murine Model of Group B Streptococcus Vaginal Colonization

A Murine Model of Group B Streptococcus Vaginal Colonization

Мышиной модели группы B<em&gt; Streptococcus</em&gt; Вагинальный Колонизация

Streptococcus agalactiae (group B Streptococcus, GBS), is a Gram-positive, asymptomatic colonizer of the human gastrointestinal tract and vaginal tract of ...

Laboratory Techniques Used to Maintain and Differentiate Biotypes of Vibrio cholerae Clinical and Environmental Isolates

Laboratory Techniques Used to Maintain and Differentiate Biotypes of Vibrio cholerae Clinical and Environmental Isolates

Лабораторные методы, используемые для поддержания и дифференциации биотипов<em&gt; Vibrio cholerae</em&gt; Клинические и экологические изоляты

The aquatic Gram-negative bacterium Vibrio cholerae is the etiological agent of the infectious gastrointestinal disease cholera. Due to the global ...

Induction of Cellular Differentiation and Single Cell Imaging of Vibrio parahaemolyticus Swimmer and Swarmer Cells

Induction of Cellular Differentiation and Single Cell Imaging of Vibrio parahaemolyticus Swimmer and Swarmer Cells

Индукция клеточной дифференцировки и визуализации отдельных клеток<em&gt; Vibrio parahaemolyticus</em&gt; Плоттеры и богомольцы

The ability to study the intracellular localization of proteins is essential for the understanding of many cellular processes. In turn, this requires the ...

Detection of Enterohemorrhagic Escherichia Coli Colonization in Murine Host by Non-invasive In Vivo Bioluminescence System

Detection of Enterohemorrhagic Escherichia Coli Colonization in Murine Host by Non-invasive In Vivo Bioluminescence System

Обнаружение энтерогеморрагические Escherichia Coli колонизации в мышиных принимающей системой неинвазивные в Vivo биолюминесценции

Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) O157:H7, which is a foodborne pathogen that causesdiarrhea, hemorrhagic colitis (HS), and hemolytic uremic syndrome ...