Name: colonization of euprymna scolopes squid by vibrio fischeri
Uploaded: 2012-03-01T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Colonization of Euprymna scolopes Squid by Vibrio fischeri at JoVE.com

Yazarlar kalamar tesisleri destek için ve bu elyazması hakkında yorum Michael Hadfield ve saha toplama sırasında yardım için Kewalo Deniz Laboratuarı, bu protokol için katkıları Ruby ve McFall-Ngai Laboratuvar üyeleri için Gyllborg Mattias teşekkür ederim. Mandel Laboratuvarında Çalışma NSF IOS-0843633 tarafından desteklenmektedir.

1. Bakteriyel inokulum hazırlanması <ol><li> Gün 0 Kalamar aşılama, plaka LBS konusunda ilgili bakteri suşlarının 13 agar öncesinde iki gün. </li><li> 25-28 ° C&#39;da bakteri inkübe edin. </li><li> 1. Gün Her biri V. koloni olan bir cam tüp içinde kültür ortamı 3 ml LBS inoküle Enfeksiyon için fischeri suşu. Yedek olarak tüpleri yinelenen hazırlayın. </li><li> 2. Gün (Kalamar adımlar?...

<ol>
	<li>Aas, J. A., Paster, B. J., Stokes, L. N., Olsen, I., Dewhirst, F. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Defining+the+normal+bacterial+flora+of+the+oral+cavity.">Defining the normal bacterial flora of the oral cavity.</a> J. Clin. Microbiol. 43, 5721-5732 (2005).</li><li>Mandel, M. J., Wollenberg, M. S., Stabb, E. V., Visick, K. L., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+single+regulatory+gene+is+sufficient+to+alter+bacterial+host+range.">A single regulatory gene is sufficient to alter bacterial host range.</a> Nature. 458, 215-218 (2009).</li><li>Grice, E. A., Segre, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+skin+microbiome.">The skin microbiome.</a> Nat. Rev. Microbiol. 9, 244-253 (2011).</li><li>Malic, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+and+identification+of+specific+bacteria+in+wound+biofilms+using+peptide+nucleic+acid+fluorescent+in+situ+hybridization+(PNA+FISH).">Detection and identification of specific bacteria in wound biofilms using peptide nucleic acid fluorescent in situ hybridization (PNA FISH).</a> Microbiology. 155, 2603-2611 (2009).</li><li>Turnbaugh, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+human+microbiome+project.">The human microbiome project.</a> Nature. 449, 804-810 (2007).</li><li>Nyholm, S. V., McFall-Ngai, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+winnowing:+establishing+the+squid-Vibrio+symbiosis.">The winnowing: establishing the squid-Vibrio symbiosis.</a> Nat. Rev. Microbiol. 2, 632-642 (2004).</li><li>Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lessons+from+a+cooperative,+bacterial-animal+association:+the+Vibrio+fischeri-Euprymna+scolopes+light+organ+symbiosis.">Lessons from a cooperative, bacterial-animal association: the Vibrio fischeri-Euprymna scolopes light organ symbiosis.</a> Annu. Rev. Microbiol. 50, 591-624 (1996).</li><li>McFall-Ngai, M. J., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Symbiont+recognition+and+subsequent+morphogenesis+as+early+events+in+an+animal-bacterial+mutualism.">Symbiont recognition and subsequent morphogenesis as early events in an animal-bacterial mutualism.</a> Science. 254, 1491-1494 (1991).</li><li>Jones, B., Nishiguchi, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Counterillumination+in+the+Hawaiian+bobtail+squid,+Euprymna+scolopes+Berry+(Mollusca:+Cephalopoda).">Counterillumination in the Hawaiian bobtail squid, Euprymna scolopes Berry (Mollusca: Cephalopoda).</a> Marine Biology. 144, 1151-1155 (2004).</li><li>Graf, J., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Host-derived+amino+acids+support+the+proliferation+of+symbiotic+bacteria.">Host-derived amino acids support the proliferation of symbiotic bacteria.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95, 1818-1822 (1998).</li><li>Ruby, E. G., McFall-Ngai, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+squid+that+glows+in+the+night:+development+of+an+animal-bacterial+mutualism.">A squid that glows in the night: development of an animal-bacterial mutualism.</a> J. Bacteriol. 174, 4865-4870 (1992).</li><li>Lee, P. N., McFall-Ngai, M. J., Callaerts, P., de Couet, H. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Hawaiian+bobtail+squid+(Euprymna+scolopes):+a+model+to+study+the+molecular+basis+of+eukaryote-prokaryote+mutualism+and+the+development+and+evolution+of+morphological+novelties+in+cephalopods.">The Hawaiian bobtail squid (Euprymna scolopes): a model to study the molecular basis of eukaryote-prokaryote mutualism and the development and evolution of morphological novelties in cephalopods.</a> Cold Spring Harbor Protocols. , (2009).</li><li>Stabb, E., Visick, K., Millikan, D., Corcoran, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Vibrio+fischeri-Euprymna+scolopes+symbiosis:+a+model+marine+animal-bacteria+interaction.">The Vibrio fischeri-Euprymna scolopes symbiosis: a model marine animal-bacteria interaction.</a> Recent Advances in Marine Science and Technology. , (2001).</li><li>Boettcher, K. J., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Depressed+light+emission+by+symbiotic+Vibrio+fischeri+of+the+sepiolid+squid+Euprymna+scolopes.">Depressed light emission by symbiotic Vibrio fischeri of the sepiolid squid Euprymna scolopes.</a> J. Bacteriol. 172, 3701-3706 (1990).</li><li>Fidopiastis, P. M., von Boletzky, S., Ruby, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+niche+for+Vibrio+logei,+the+predominant+light+organ+symbiont+of+squids+in+the+genus+Sepiola.">A new niche for Vibrio logei, the predominant light organ symbiont of squids in the genus Sepiola.</a> J. Bacteriol. 180, 59-64 (1998).</li><li>Bose, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Contribution+of+rapid+evolution+of+the+luxR-luxI+intergenic+region+to+the+diverse+bioluminescence+outputs+of+Vibrio+fischeri+strains+isolated+from+different+environments.">Contribution of rapid evolution of the luxR-luxI intergenic region to the diverse bioluminescence outputs of Vibrio fischeri strains isolated from different environments.</a> Appl. Environ. Microbiol. 77, 2445-2457 (2011).</li></ol>

Tarif kolonizasyonu tahlil, bir laboratuvar ortamında, doğal bir proses simbiyotik analizi için olanak sağlar. Bunun gibi, farklı doğal izole tarafından mutant soylar, ve farklı kimyasal rejimlerinde kolonizasyonu değerlendirmek için kullanılabilir. Açıklanan varyasyonlar ile ilgili deneyler yaygın sembiyoz farklı yönleriyle değerlendirmek için kullanılmıştır. Kolonizasyonu kinetikleri tesadüf detektörü çıkartılmış olduğu bir sintilasyon sayacı otomatik olarak tespit edilebilir ilk 24 saa...

<table border="1"><tbody><tr><td> Reaktifi Adı </td><td> Şirket </td><td> Katalog Numarası </td><td> Yorumlar </td></tr><tr><td> Cam Kültür Tüpler, 16 mm Çap </td><td> VWR </td><td> 47729-580 </td><td></td></tr><tr><td> Cam Kültür Tüpler için kapaklar </td><td> Balıkçı </td><td> NC9807998 </td><td></td></tr><tr><td> OD 600 Belirlenmesi görebilir Spektrofotometre </td><td> Biowave </td><td> CO8000 </td><td> OD 600 ölçebilen herhangi bir spektrofotometre çalışacaktır. Bu birim cam kültürü tüplerinin doğrudan sıvı OD 600 ölçebilirsiniz. Inokulum hesaplama bazı ayarlamalar kullanılan alet bağlı olarak gerekli olabilir. </td></tr><tr><td> GloMax 20/20 Tek-Tüp Luminometre </td><td> Promega </td><td> E5311 </td><td> Turner Biyosistem 20/20n Luminometre Eşdeğer. Mikrosantrifüj tüpü tutucusu içerir. </td></tr><tr><td> GloMax 20/20 Işık Standart </td><td> Promega </td><td> E5341 </td><td> Luminometre kalibrasyonu için. </td></tr><tr><td> Refraktometre, El </td><td> Foster ve Smith Aquatics </td><td> CD-14035 </td><td> Deiyonize su ile her kullanımdan önce kalibre. Tuz birikmesini önlemek için deiyonize su ile her kullanımdan sonra durulayın. </td></tr><tr><td> Instant Ocean (yapay deniz suyu konsantresi) </td><td> Foster &amp; Smith Aquatics </td><td> CD-16881 </td><td> Ardından 0.2 um bir filtreden SFCA, sonra süzme, refraktometre kullanılarak, deiyonize su içinde 35 ‰ azından hazırlayın. </td></tr><tr><td> Filtrasyon Ünitesi </td><td> Nalgene </td><td> 158-0020 </td><td> Sürfaktan içermeyen selüloz asetat (SFCA) membranı, 0.2 um. Bazı yüzey içeren PES filtreleri ile değişken sonuçlar gözlemledik. </td></tr><tr><td> Transferi Pipetler </td><td> Balıkçı </td><td> 13-711 -09:00 </td><td> Makas veya jilet kullanarak, temiz pipet ucu çapını artırmak ve kalamar yavru sıkma önlemek için ilk sırt üstü ucu kesilir. </td></tr><tr><td> Tek Örnek Kaseler (plastik tumbler) </td><td> Kuyrukluyıldız </td><td> T9S (9 oz.) </td><td> Üst çapı 3 ile aşılama için Kaseler, ¼ &quot;, alt çapı 2 ¼&quot;, yüksekliği 3 &quot;. Onlar kalamar düşük oksijenli niş içinde sıkışıp olsun hangi bir alt kenarı var gibi Kaseler homojen bir ortam oluşturmak. Boyutu optimize edilmiştir için 40 ml inokulum. webstaurantstore.com Boş, # 619PI9. </td></tr><tr><td> Drosophila Flakon </td><td> VWR </td><td> 89092-720 </td><td> Flakon çapı luminometre PMT açılış eşleşir. </td></tr><tr><td> 1.5 ml Microcentrifuge Tüpler </td><td> ISC Bioexpress </td><td> C-3217-1CS </td><td> Tüpler havan şekline uygun olmalıdır. </td></tr><tr><td> Etanol, 200 Proof </td><td> Balıkçı </td><td> BP2818-100 </td><td></td></tr><tr><td> Havan </td><td> Kimble Chase / Kontes </td><td> 749521-1500 </td><td></td></tr><tr><td> Kaplama Boncuklar, 5 mm çaplı </td><td> Kimble Chase </td><td> 13500 5 </td><td> Tüp ve otoklav başına 5 hazırlayın. </td></tr></tbody></table>

colonization of euprymna scolopes squid by vibrio fischeri

Spesifik bakteri hayvan dokusu 1-5 ile birlikte bulunur. Böyle ana-bakteriyel dernekler (symbioses) (patojen) zararlı olabilir, hiçbir spor sonucu (ortakçı), ya da (mutualist) faydalı olabilir. Çok dikkat patojen etkileşimleri verilmiş olsa da, biraz ortamdan ortakçı / yararlı bakterilerin tekrarlanabilir satın dikte süreçleri hakkında bilinmektedir. Deniz Gram-negatif bakteri arasında ışık organı karşılıkçılık V. fischeri ve Hawai Bobteyli kalamar, E. scolopes, bir ana (E. scolopes) ömrü 6,7 boyunca yalnızca bir bakteri türü (V. fischeri) ile simbiyotik bir ilişki kurar ki bir çok spesifik bir etkileşim gösterir. V. tarafından üretilen Biyolüminesens Bu etkileşim sırasında fischeri E. bir anti-yırtıcı yarar sağlar nokturnal faaliyetleri sırasında scolopes 8,9 ikenbesin açısından zengin konak doku sağlar V. Korumalı bir niş 10 fischeri. Her ana üretimi sırasında, bu ilişki dolayısıyla simbiyotik gelişiminin çeşitli aşamalarında ayrıntılı bir biçimde tespit edilebilir, öngörülebilir bir süreci temsil değinmeyecek edilir. İlk 30-60 dakika içinde toplanan ve symbiont-serbest su transfer edilirse laboratuarda, yavru kalamar ambar aposymbiotically (uncolonized), ve, deneysel inokulum 6 dışında kolonize olamaz. Bu etkileşim, böylece çevreye 11,12 bir simbiyotik mikrop spesifik kazanım yol tek tek adımların değerlendirmek için yararlı olan bir model sistemi sağlar. Burada yeni aposymbiotic E. yumurtadan oluşur kolonizasyon derecesini değerlendirmek için bir yöntem tarif scolopes (yapay) deniz suyu içeren maruz V. fischeri. Bu basit test aşılama, doğal enfeksiyon ve kurtarma açıklarE. doğmakta olan ışık organ bakteriyel symbiont arasında scolopes. Bakım özellikle su kalitesi ve ışık işaretleri ile ilgili, simbiyotik gelişim sırasında hayvanlar için tutarlı bir ortam sağlamak için alınır. Açıklanan simbiyotik nüfus karakterize etmek Yöntemleri bakteriyel kaynaklı biyolüminesensin (1) ölçümü ve geri symbionts sayımı (2) doğrudan koloni bulunmaktadır.

Watch this Scientific Journal Video about Colonization of Euprymna scolopes Squid by Vibrio fischeri at JoVE.com

Colonization of Euprymna scolopes Squid by Vibrio fischeri

Yöntemine göre Hawaiian Bobteylleri squid prosedür özetlenmektedir<em&gt; Euprymna scolopes</em&gt; Ve bakteriyel symbiont,<em&gt; Vibrio fischeri</em&gt;, Bakteriler tarafından kalamar ışık organın belirli kolonizasyon için izin tanıtıldı ayrı ayrı, sonra yükseliyor. Bakteriyel kaynaklı lüminesans ve doğrudan koloni sayımı ile kolonizasyon tespit açıklanmıştır.

Kolonizasyon Euprymna scolopes Squid tarafından Vibrio fischeri</em

Specific bacteria are found in association with animal tissue1-5. Such host-bacterial associations (symbioses) can be detrimental (pathogenic), have no ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Colonization of Euprymna scolopes Squid by Vibrio fischeri

Assessing Hepatic Metabolic Changes During Progressive Colonization of Germ-free Mouse by 1H NMR Spectroscopy

Assessing Hepatic Metabolic Changes During Progressive Colonization of Germ-free Mouse by 1H NMR Spectroscopy

Germ-free Mouse Aşamalı Kolonizasyon sırasında Karaciğer metabolik değişiklikler Değerlendirilmesi 1 H-NMR Spektroskopi

It is well known that gut bacteria contribute significantly to the host homeostasis, providing a range of benefits such as immune protection and vitamin ...

İmmünoloji ve Enfeksiyon

Quantification of Fungal Colonization, Sporogenesis, and Production of Mycotoxins Using Kernel Bioassays

Çekirdek biyoanalizlerin kullanarak Fungal Kolonizasyon, Sporogenesis ve Mikotoksin Üretimi Kantitasyonu

The rotting of grains by seed-infecting fungi poses one of the greatest economic challenges to cereal production worldwide, not to mention serious risks ...

TransFLP &#x2014; A Method to Genetically Modify Vibrio cholerae Based on Natural Transformation and FLP-recombination

TransFLP - Genetiği değiştirmek için bir yöntem<em&gt; Vibrio cholerae</em&gt; Doğal Dönüşüm ve FLP-rekombinasyon sonucu

Several methods are available to manipulate bacterial chromosomes1-3. Most of these protocols rely on the insertion of conditionally replicative plasmids ...

Characterization of Inflammatory Responses During Intranasal Colonization with Streptococcus pneumoniae

Characterization of Inflammatory Responses During Intranasal Colonization with Streptococcus pneumoniae

Streptococcus pneumoniae ile İntranazal Kolonizasyon Sırasında İnflamatuar Yanıtların Karakterizasyonu

Nasopharyngeal colonization by Streptococcus pneumoniae is a prerequisite to invasion to the lungs or bloodstream1. This organism is capable of colonizing ...

Investigating the Effects of Probiotics on Pneumococcal Colonization Using an In Vitro Adherence Assay

Investigating the Effects of Probiotics on Pneumococcal Colonization Using an In Vitro Adherence Assay

Bir kullanma Pnömokok Kolonizasyon üzerinde Probiyotiklerin Etkileri incelenmesi<em&gt; In Vitro</em&gt; Yapışma Deneyi

Adherence of Streptococcus pneumoniae (the pneumococcus) to the epithelial lining of the nasopharynx can result in colonization and is considered a ...

Development of a More Sensitive and Specific Chromogenic Agar Medium for the Detection of Vibrio parahaemolyticus and Other Vibrio Species

Development of a More Sensitive and Specific Chromogenic Agar Medium for the Detection of Vibrio parahaemolyticus and Other Vibrio Species

Tespiti için daha duyarlı ve özgül Chromogenic Agar Orta Gelişimi<em&gt; Vibrio parahaemolyticus</em&gt; Ve Diğer<em&gt; Vibrio</em&gt; Türler

Foodborne infections in the US caused by Vibrio species have shown an upward trend. In the genus Vibrio, V. parahaemolyticus is responsible for the ...

A Murine Model of Group B Streptococcus Vaginal Colonization

A Murine Model of Group B Streptococcus Vaginal Colonization

B Grubu bir murin modelinde<em&gt; Streptococcus</em&gt; Vajinal Kolonizasyon

Streptococcus agalactiae (group B Streptococcus, GBS), is a Gram-positive, asymptomatic colonizer of the human gastrointestinal tract and vaginal tract of ...

Laboratory Techniques Used to Maintain and Differentiate Biotypes of Vibrio cholerae Clinical and Environmental Isolates

Laboratory Techniques Used to Maintain and Differentiate Biotypes of Vibrio cholerae Clinical and Environmental Isolates

Biyotiplerin Bakımında ve Türevinde Kullanılan Laboratuvar Teknikleri<emVibrio cholerae</em&gt; Klinik ve Çevresel İzolatlar

The aquatic Gram-negative bacterium Vibrio cholerae is the etiological agent of the infectious gastrointestinal disease cholera. Due to the global ...

Induction of Cellular Differentiation and Single Cell Imaging of Vibrio parahaemolyticus Swimmer and Swarmer Cells

Induction of Cellular Differentiation and Single Cell Imaging of Vibrio parahaemolyticus Swimmer and Swarmer Cells

Hücresel Farklılaşma ve Tek Hücreli Görüntüleme İndüksiyonu<emVibrio parahaemolyticus</em&gt; Yüzücü ve Swarmer Hücreleri

The ability to study the intracellular localization of proteins is essential for the understanding of many cellular processes. In turn, this requires the ...

Detection of Enterohemorrhagic Escherichia Coli Colonization in Murine Host by Non-invasive In Vivo Bioluminescence System

Detection of Enterohemorrhagic Escherichia Coli Colonization in Murine Host by Non-invasive In Vivo Bioluminescence System

Non-invaziv Vivo içinde Bioluminescence sistemi tarafından fare konak Enterohemorrhagic Escherichia Coli kolonizasyon algılama

Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) O157:H7, which is a foodborne pathogen that causesdiarrhea, hemorrhagic colitis (HS), and hemolytic uremic syndrome ...