Vi beskriver en levende hele dyr kvantitativ måling for permeabiliteten af den embryoniske zebrafisk hjernen. Teknikken analyserer evnen til at fastholde cerebrospinalvæske og molekyler med forskellige molekylvægte i de neurale rør lumen og kvantificerer deres bevægelse ud af ventriklerne. Denne metode er nyttig til bestemmelse af forskelle i epitel permeabilitet og modning under udvikling og sygdom.