Vi beskriver en levende hel dyr kvantitativ måling for permeabilitet i embryonale sebrafisk hjernen. Teknikken analyserer evnen til å beholde cerebrospinalvæsken og molekyler av forskjellige molekylvekter innenfor nevralrøret lumen og kvantifiserer deres bevegelse ut av ventriklene. Denne metoden er nyttig for å bestemme forskjeller i epithelial permeabilitet og modning under utvikling og sykdom.