Name: the use of chemostats in microbial systems biology
Uploaded: 2013-10-14T20:45:00
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इस काम के फंड न्यूयॉर्क विश्वविद्यालय के फार्म को शुरू द्वारा समर्थित किया गया. हम शुरू में chemostats रूप Sixfors बायोरिएक्टर के उपयोग को विकसित करने वाले मैत्रेय Dunham और मैट Brauer धन्यवाद.

एक chemostat का उपयोग निरंतर संवर्धन के सिद्धांत कार्यान्वयन की एक किस्म में महसूस किया जा सकता है. सभी chemostats में यह सभी घटकों के बाँझपन बनाए रखने के लिए 1) तरीकों के लिए आवश्यक है, 2) एक अच्छी तरह से मिश्रित संस्क?...

<ol>
	<li>Ingraham, J. L., Maaloe, O., Neidhardt, F. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Growth of the Bacterial Cell. , (1983).</li><li>Hall, M. N., Raff, M. C., Thomas, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Cell Growth: Control of Cell Size. , (2004).</li><li>Monod, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=La+technique+de+culture+continue,+theorie+et+applications.">La technique de culture continue, theorie et applications.</a> Ann. Inst. Pasteur. 79, 390-410 (1950).</li><li>Novick, A., Szilard, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Description+of+the+chemostat.">Description of the chemostat.</a> Science. 112, 715-716 (1950).</li><li>Kjeldgaard, N. O., Maaloe, O., Schaechter, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+transition+between+different+physiological+states+during+balanced+growth+of+Salmonella+typhimurium.">The transition between different physiological states during balanced growth of Salmonella typhimurium.</a> J. Gen. Microbiol. 19, 607-616 (1958).</li><li>Maaloe, O., Kjeldgaard, N. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Control+of+macromolecular+synthesis.">Control of macromolecular synthesis.</a> , (1966).</li><li>Saldanha, A. J., Brauer, M. J., Botstein, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nutritional+Homeostasis+in+Batch+and+Steady-State.">Nutritional Homeostasis in Batch and Steady-State.</a> Culture of Yeast. Mol. Biol. Cell. 15, 4089-4104 (2004).</li><li>Boer, V. M., Crutchfield, C. A., Bradley, P. H., Botstein, D., Rabinowitz, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Growth-limiting+intracellular+metabolites+in+yeast+growing+under+diverse+nutrient+limitations.">Growth-limiting intracellular metabolites in yeast growing under diverse nutrient limitations.</a> Mol. Biol. Cell. 21, 198-211 (2010).</li><li>Boer, V. M., de Winde, J. H., Pronk, J. T., Piper, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+genome-wide+transcriptional+responses+of+Saccharomyces+cerevisiae+grown+on+glucose+in+aerobic+chemostat+cultures+limited+for+carbon,+nitrogen,+phosphorus,+or+sulfur.">The genome-wide transcriptional responses of Saccharomyces cerevisiae grown on glucose in aerobic chemostat cultures limited for carbon, nitrogen, phosphorus, or sulfur.</a> J. Biol. Chem. 278, 3265-3274 (2003).</li><li>Brauer, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Coordination+of+growth+rate,+cell+cycle,+stress+response,+and+metabolic+activity+in+yeast.">Coordination of growth rate, cell cycle, stress response, and metabolic activity in yeast.</a> Mol. Biol. Cell. 19, 352-367 (2008).</li><li>Gresham, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Adaptation+to+diverse+nitrogen-limited+environments+by+deletion+or+extrachromosomal+element+formation+of+the+GAP1+locus.">Adaptation to diverse nitrogen-limited environments by deletion or extrachromosomal element formation of the GAP1 locus.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107, 18551-18556 (2010).</li><li>Regenberg, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Growth-rate+regulated+genes+have+profound+impact+on+interpretation+of+transcriptome+profiling+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Growth-rate regulated genes have profound impact on interpretation of transcriptome profiling in Saccharomyces cerevisiae.</a> Genome Biol. 7, R107 (2006).</li><li>Castrillo, J. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Growth+control+of+the+eukaryote+cell:+a+systems+biology+study+in+yeast.">Growth control of the eukaryote cell: a systems biology study in yeast.</a> J. Biol. 6, 4 (2007).</li><li>Cipollina, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Revisiting+the+role+of+yeast+Sfp1+in+ribosome+biogenesis+and+cell+size+control:+a+chemostat+study.">Revisiting the role of yeast Sfp1 in ribosome biogenesis and cell size control: a chemostat study.</a> Microbiology. 154, 337-346 (2008).</li><li>Gresham, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=System-level+analysis+of+genes+and+functions+affecting+survival+during+nutrient+starvation+in+Saccharomyces+cerevisiae.">System-level analysis of genes and functions affecting survival during nutrient starvation in Saccharomyces cerevisiae.</a> Genetics. 187, 299-317 (2011).</li><li>Levy, S. F., Ziv, N., Siegal, M. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bet+hedging+in+yeast+by+heterogeneous,+age-correlated+expression+of+a+stress+protectant.">Bet hedging in yeast by heterogeneous, age-correlated expression of a stress protectant.</a> PLoS Biol. 10, e1001325 (2012).</li><li>Kao, K. C., Sherlock, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+characterization+of+clonal+interference+during+adaptive+evolution+in+asexual+populations+of+Saccharomyces+cerevisiae.">Molecular characterization of clonal interference during adaptive evolution in asexual populations of Saccharomyces cerevisiae.</a> Nat. Genet. 40, 1499-1504 (2008).</li><li>Gresham, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+repertoire+and+dynamics+of+evolutionary+adaptations+to+controlled+nutrient-limited+environments+in+yeast.">The repertoire and dynamics of evolutionary adaptations to controlled nutrient-limited environments in yeast.</a> PLoS Genet. 4, e1000303 (2008).</li><li>Wenger, J. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hunger+Artists:+Yeast+Adapted+to+Carbon+Limitation+Show+Trade-Offs+under+Carbon+Sufficiency.">Hunger Artists: Yeast Adapted to Carbon Limitation Show Trade-Offs under Carbon Sufficiency.</a> PLoS Genet. 7, e1002202 (2011).</li><li>Dunham, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characteristic+genome+rearrangements+in+experimental+evolution+of+Saccharomyces+cerevisiae.">Characteristic genome rearrangements in experimental evolution of Saccharomyces cerevisiae.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99, 16144-16149 (2002).</li><li>Ronen, M., Botstein, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transcriptional+response+of+steady-state+yeast+cultures+to+transient+perturbations+in+carbon+source.">Transcriptional response of steady-state yeast cultures to transient perturbations in carbon source.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103, 389-394 (2006).</li><li>Kresnowati, M. T. A. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=When+transcriptome+meets+metabolome:+fast+cellular+responses+of+yeast+to+sudden+relief+of+glucose+limitation.">When transcriptome meets metabolome: fast cellular responses of yeast to sudden relief of glucose limitation.</a> Mol. Sys. Biol. 2, 49 (2006).</li><li>Tu, B. P., Kudlicki, A., Rowicka, M., McKnight, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Logic+of+the+yeast+metabolic+cycle:+temporal+compartmentalization+of+cellular+processes.">Logic of the yeast metabolic cycle: temporal compartmentalization of cellular processes.</a> Science. 310, 1152-1158 (2005).</li><li>Tzur, A., Kafri, R., LeBleu, V. S., Lahav, G., Kirschner, M. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+Growth+and+Size+Homeostasis+in+Proliferating+Animal+Cells.">Cell Growth and Size Homeostasis in Proliferating Animal Cells.</a> Science. 325, 167-171 (2009).</li><li>Conlon, I., Raff, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Size+control+in+animal+development.">Size control in animal development.</a> Cell. 96, 235-244 (1999).</li><li>Conlon, I. J., Dunn, G. A., Mudge, A. W., Raff, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extracellular+control+of+cell+size.">Extracellular control of cell size.</a> Nat. Cell Biol. 3, 918-921 (2001).</li><li>Fussmann, G. F., Ellner, S. P., Shertzer, K. W., Hairston, N. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Crossing+the+hopf+bifurcation+in+a+live+predator-prey+system.">Crossing the hopf bifurcation in a live predator-prey system.</a> Science. 290, 1358-1360 (2000).</li><li>Cohen, E. P., Eagle, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+simplified+chemostat+for+the+growth+of+mammalian+cells:+characteristics+of+cell+growth+in+continuous+culture.">A simplified chemostat for the growth of mammalian cells: characteristics of cell growth in continuous culture.</a> J. Exp. Med. 113, 467-474 (1961).</li></ol>

Chemostats वृद्धि नियंत्रित स्थिर राज्य की स्थिति में रोगाणुओं की खेती के लिए सक्षम. कोशिकाओं को एक अपरिवर्तनीय बाहरी वातावरण में जिसके परिणामस्वरूप एक स्थिर दर पर लगातार हो जाना. यह बाहरी वातावरण लगातार ब?...

कोशिकाओं के विकास को आनुवांशिक और पर्यावरणीय कारकों 1,2 बातचीत के जटिल नेटवर्क के द्वारा नियंत्रित किया जाता है. सेल के विकास के multifactorial विनियमन अपने अध्ययन करने के लिए एक प्रणाली स्तर के दृष्टिकोण जरूरी है. हालांकि, विनियमित सेल के विकास के कठोर अध्ययन प्रयोगात्मक कोशिकाओं के विकास दर है जिस पर नियंत्रित करने की कठिनाई से चुनौती दी है. इसके अलावा, यहां तक ​​कि सरल प्रयोगों में कोशिकी शर्तों वे पैदा के रूप में कोशिकाओं को लगातार अपने वातावरण को बदल के रूप में अक्सर गतिशील और जटिल हैं. , परिभाषित अपरिवर्तनीय और नियंत्रित वातावरण में सेल विकास दर की प्रयोगात्मक नियंत्रण सक्षम बनाता है कि कोशिकाओं के संवर्धन की एक विधि: इन समस्याओं का समाधान chemostat द्वारा प्रदान की जाती है. एक chemostat का उपयोग निरंतर संवर्धन की विधि स्वतंत्र रूप से 1950 में मोनोड 3 और Novick और Szilárd 4 द्वारा वर्णित किया गया था. मूल रूप से कल्पना की है, कोशिकाओं चोर है कि मीडिया का एक निश्चित मात्रा में बड़े हो रहे हैंtinually नई मीडिया और पुराने मीडिया और कोशिकाओं के एक साथ हटाने (चित्रा 1) के अलावा द्वारा पतला. युग्मित साधारण समीकरण अंतर (चित्रा 2) सेल घनत्व (एक्स) और chemostat पोत में वृद्धि को सीमित पोषक तत्व (ओं) की एकाग्रता में परिवर्तन की दर का वर्णन. महत्वपूर्ण बात है, समीकरणों की इस प्रणाली स्थिर राज्य में, कोशिकाओं (यानी घातीय वृद्धि दर स्थिर) के विशिष्ट विकास दर के बराबर है कि उल्लेखनीय निहितार्थ के साथ एक एकल (अशून्य) स्थिर स्थिर राज्य (चित्रा 3) की भविष्यवाणी जिस पर संस्कृति (डी) पतला है. कमजोर पड़ने की दर अलग करके इसे विभिन्न विकास दर में और पोषक तत्व सीमा के विभिन्न परिस्थितियों में कोशिकाओं की स्थिर राज्य की आबादी की स्थापना संभव है. chemostats का उपयोग कर विकास दर की प्रयोगात्मक नियंत्रण कैसे सेल फिजियोलॉजी परिवर्तन की समझ के विकास के लिए महत्वपूर्ण थाविकास 5,6 की दरों के साथ. हालांकि, सूक्ष्मजीवविज्ञानी तरीकों के इस पूर्व मुख्य आधार बीसवीं सदी के दौरान आणविक जीव विज्ञान अनुसंधान में विस्फोट के दौरान तेजी से अस्पष्ट हो गया. आज, रोगाणुओं और बहुकोशिकीय जीव और प्रणालियों स्तर के विश्लेषण के लिए जीनोम पैमाने तरीकों के आगमन दोनों में वृद्धि पर नियंत्रण में नए सिरे से रुचि chemostats के उपयोग के लिए प्रेरणा का नवीकरण किया है. यहाँ, हम सेल विकास दर का सटीक नियंत्रण और chemostats का उपयोग अनोखे संभव है कि बाहरी वातावरण को भुनाने कि तीन आवेदनों का वर्णन. इस तरह के टेप और मेटाबोलाइट्स - जैसे - coordinately विकास दर के साथ विनियमित रहे हैं सबसे पहले, हम biomolecules के हजारों की बहुतायत जांच के लिए कैसे chemostats के उपयोग का वर्णन. दूसरा, हम chemostats प्रतियोगिता प्रयोगों का उपयोग पोषक तत्व सीमित वातावरण में अलग जीनोटाइप के बीच विकास दर मतभेद का सटीक अनुमान प्राप्त करने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है वर्णन कैसे. तीसरा, हम वर्णन कैसे chemostats कर सकते हैंलगातार पोषक तत्व गरीब वातावरण में बढ़ कोशिकाओं की अनुकूली विकास का अध्ययन करने के लिए इस्तेमाल किया जाएगा. ये उदाहरण chemostats पर्यावरण बातचीत और अनुकूली विकास सेल के विकास विनियमन, जीन का सिस्टम स्तर की जांच सक्षम कर रहे हैं रास्ते में जो उदाहरण देना.

<table border="1">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Name of the reagent</td>
			<td>Company</td>
			<td>Catalogue number</td>
			<td>Comments (optional)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Infors-HT Sixfors Chemostat</td>
			<td>Appropriate Technical Resources, Inc.</td>
			<td>&nbsp;</td>
			<td>&nbsp;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass Bottle 9.5 L</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>02-887-1</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pinchcock</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>05-867</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stopper, Size 12, Green Neoprene</td>
			<td>Cole-Palmer</td>
			<td>EW-62991-42</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Straight Connector</td>
			<td>Cole-Palmer</td>
			<td>EW-30703-02</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>General purpose ties 4 in</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>NC9557052</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tubing, Silicone Rubber</td>
			<td>Small Parts</td>
			<td>B000FMWTDE</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tubing, Silicone, 3/8 in OD</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>02-587-1Q</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tubing, Silicone, 7/32 in OD</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>02-587-1E</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tubing, Stainless Steel, 3/16 in OD</td>
			<td>McMaster-Carr</td>
			<td>6100K164</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tubing, Stainless Steel, 3/8 in OD</td>
			<td>McMaster-Carr</td>
			<td>6100K161</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hook Connectors</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>14-66-18Q</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ratchet Clamp</td>
			<td>Cole-Palmer</td>
			<td>EW-06403-11</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Luer, Female</td>
			<td>Cole-Palmer</td>
			<td>EW-45512-34</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Luer, Male</td>
			<td>Cole-Palmer</td>
			<td>EW-45513-04</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Millipore Aervent MTGR05010 62 mm Filter, 0.2 &mu;m</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>MTGR05010</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PTFE Acrodisc CR 13 mm filters, 0.2 &mu;m</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>NC9131037</td>
			<td>For Media Vessel and Hosing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Direct-Reading Flowtube for Air</td>
			<td>Cole-Palmer</td>
			<td>EW-32047-77</td>
			<td>For Nitrogen Gas Setup</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Direct-Reading Flowtube for Nitrogen</td>
			<td>Cole-Palmer</td>
			<td>EW-32048-63</td>
			<td>For Nitrogen Gas Setup</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gas Proportioner Multitube Frames</td>
			<td>Cole-Palmer</td>
			<td>EW-03218-50</td>
			<td>For Nitrogen Gas Setup</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Regulator, Two-Stage Analytical</td>
			<td>Airgas</td>
			<td>Y12-N145D580</td>
			<td>For Nitrogen Gas Setup</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hose Adaptor, Stainless Steel</td>
			<td>Airgas</td>
			<td>Y99-26450</td>
			<td>For Nitrogen Gas Setup</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hose Male Adaptor</td>
			<td>Airgas</td>
			<td>WES544</td>
			<td>For Nitrogen Gas Setup</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Norprene Tubing</td>
			<td>US Plastics</td>
			<td>57280</td>
			<td>For Nitrogen Gas Setup</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tripod Base</td>
			<td>Cole-Palmer</td>
			<td>EW-03218-58</td>
			<td>For Nitrogen Gas Setup</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Valve Cartridges</td>
			<td>Cole-Palmer</td>
			<td>EW-03217-92</td>
			<td>For Nitrogen Gas Setup</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Carboy 10 L</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>02-963-2A</td>
			<td>For Media Preperation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Steritop Sterile Vacuum Bottle-Top Filters, 1,000 ml, PES membrane; for 45 mm neck size</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>SCGP-T10-RE</td>
			<td>For Media Preperation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Media Bottle 100 ml, 45 mm neck size</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>FB-800-100</td>
			<td>For Media Preperation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>calcium chloride&middot;2H2O</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>C79-500</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sodium chloride</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP358-1</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>magnesium sulfate&middot;7H2O</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>230391</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>potassium phosphate monobasic</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>AC424205000</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ammonium sulfate</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>AC423400010</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>potassium chloride</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>P9541</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>boric acid</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>B6768</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>copper sulfate&middot;5H2O</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>209198</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>potassium iodide</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>60400</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ferric chloride&middot;6H2O</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>I88-100</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>manganese sulfate&middot;H2O</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>230391</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sodium molybdate&middot;2H2O</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>M7634</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>zinc sulfate&middot;7H2O</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>Z68-500</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>biotin</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP232-1</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>calcium pantothenate</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>AC24330-1000</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>folic acid</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>F7876</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>inositol (aka myo-inositol)</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>AC12226-1000</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>niacin (aka nicotinic acid)</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>N4126</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>p-aminobenzoic acid</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>AC14621-2500</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pyridoxine HCl</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>P9755</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>riboflavin</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>R4500-25G</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>thiamine HCl</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP892-100</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Leucine</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>L8000-100G</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Uracil</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>U0750</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dextrose</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>DF0155-08-5</td>
			<td>Media Reagents</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

the use of chemostats in microbial systems biology

कोशिकाओं बाहरी दुनिया से संकेतों के जवाब में वृद्धि की दर को विनियमित. सेल बढ़ती है, विविध सेलुलर प्रक्रियाओं macromolecular संश्लेषण, चयापचय और कोशिका विभाजन चक्र को अंततः, प्रतिबद्धता सहित समन्वय होना चाहिए. chemostat, प्रयोगात्मक सेल के विकास दर को नियंत्रित करने की एक विधि, व्यवस्थित अध्ययन का एक शक्तिशाली साधन प्रदान करता है कि कैसे विकास दर प्रभावों सेलुलर प्रक्रियाओं - और सेल के विकास की दर को नियंत्रित कि विनियामक नेटवर्क - जीन अभिव्यक्ति और चयापचय सहित. पीढ़ियों chemostats के सैकड़ों के लिए बनाए रखा जब सेल के विकास को सीमित कि पर्यावरण की स्थिति में रोगाणुओं के अनुकूली विकास का अध्ययन करने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है. हम chemostat संस्कृतियों के सिद्धांत का वर्णन उनके संचालन का प्रदर्शन और उनके विभिन्न अनुप्रयोगों के उदाहरण देते हैं. बीसवीं सदी के मध्य में अपनी शुरुआत के बाद अप्रचार की अवधि के बाद, साथ जीनोम पैमाने के तरीके के अभिसरण एक में नए सिरे सेब्याज सेल के विकास और अनुकूली विकास के आणविक आधार के नियमन में जैविक अनुसंधान में chemostats के उपयोग में एक पुनर्जागरण उत्तेजक है.

Chemostats का एक बड़ा फायदा यह कमजोर पड़ने की दर अलग से प्रयोगात्मक कोशिकाओं के विकास की दर को नियंत्रित करने की क्षमता है. नवोदित खमीर में, Saccharomyces cerevisiae, एक सेल की आकृति विज्ञान कोशिका विभाजन चक्र में अपने पहले च?...

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The Use of Chemostats in Microbial Systems Biology

सेल के विकास दर एक विनियमित प्रक्रिया और सेल शरीर क्रिया विज्ञान के एक प्राथमिक निर्धारक है. Chemostats का उपयोग सतत संवर्धन सेल के विकास और कैसे उन नेटवर्क सेल के विकास का अनुकूलन के लिए तैयार है कि नियंत्रण आणविक नेटवर्क के अध्ययन की सुविधा पोषक तत्व सीमा से सेल के विकास दर के बाह्य नियंत्रण सक्षम बनाता है.

माइक्रोबियल सिस्टम्स बायोलॉजी में Chemostats का प्रयोग करें

Cells regulate their rate of growth in response to signals from the external world. As the cell grows, diverse cellular processes must be coordinated ...

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