Name: rapid colorimetric assays to qualitatively distinguish rna and dna in biomolecular samples
Uploaded: 2013-02-04T09:51:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Rapid Colorimetric Assays to Qualitatively Distinguish RNA and DNA in Biomolecular Samples at JoVE.com

Dette arbejde blev finansieret af University of Virginia og Jeffress Memorial Trust (J-971). Vi takker L. Columbus, K. Jain, og P. Randolph for personer diskussioner og kritisk læsning af manuskriptet.

1. Benedikts Assay for reducerende sukkerarter <ol><li> Der fremstilles en passende mængde Benedicts prøve - 940 mM vandfrit natriumcarbonat, 588 mM natriumcitrat dehydrat, 68 mM kobber (II) sulfate pentahydrate. Dette reagens kan opbevares ved stuetemperatur (RT) i mindst seks måneder uden synlig ændring i reaktivitet. </li><li> Ovennævnte reagens er 6x. Således for 600 pi reaktioner, tilsættes 100 pi Benedicts prøve til et rent 1,5 ml mikrocentrifugerør (fx Eppendorf mærke), per prøve, der skal a...

<ol>
	<li>De Mey, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+DNA+and+RNA+quantification+methods+suitable+for+parameter+estimation+in+metabolic+modeling+of+microorganisms.">Comparison of DNA and RNA quantification methods suitable for parameter estimation in metabolic modeling of microorganisms.</a> Anal. Biochem. 353, 198-203 (2006).</li><li>Desjardins, P., Conklin, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=NanoDrop+Microvolume+Quantitation+of+Nucleic+Acids.">NanoDrop Microvolume Quantitation of Nucleic Acids.</a> J. Vis. Exp. (45), e2565 (2010).</li><li>Ausubel, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Short Protocols in Molecular Biology: A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology. , (1999).</li><li>Voet, D., Voet, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Biochemistry. , (2011).</li><li>Adams, R. L. P., Knowler, J. T., Leader, D. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The Biochemistry of the Nucleic Acids. , (1986).</li><li>Rice, P. A., Correll, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Protein-nucleic acid interactions: Structural biology. , (2008).</li><li>Bowman, J. C., Lenz, T. K., Hud, N. V., Williams, L. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cations+in+charge:+Magnesium+ions+in+RNA+folding+and+catalysis.">Cations in charge: Magnesium ions in RNA folding and catalysis.</a> Curr. Opin. Struct. Biol. , (2012).</li><li>Balandina, A., Kamashev, D., Rouviere-Yaniv, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+bacterial+histone-like+protein+HU+specifically+recognizes+similar+structures+in+all+nucleic+acids.+DNA,+RNA,+and+their+hybrids.">The bacterial histone-like protein HU specifically recognizes similar structures in all nucleic acids. DNA, RNA, and their hybrids.</a> J. Biol. Chem. 277, 27622-27628 (1074).</li><li>Graslund, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+production+and+purification.">Protein production and purification.</a> Nat. Methods. 5, 135-146 (2008).</li><li>Pagano, J. M., Clingman, C. C., Ryder, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+approaches+to+monitor+protein-nucleic+acid+interactions+using+fluorescent+probes.">Quantitative approaches to monitor protein-nucleic acid interactions using fluorescent probes.</a> RNA. 17, 14-20 (2011).</li><li>Benedict, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+reagent+for+the+detection+of+reducing+sugars.">A reagent for the detection of reducing sugars.</a> J. Biol. Chem. 277, e5 (1908).</li><li>Endo, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+simultaneous+estimation+method+of+DNA+and+RNA+by+the+orcinol+reaction+and+a+study+on+the+reaction+mechanism.">A simultaneous estimation method of DNA and RNA by the orcinol reaction and a study on the reaction mechanism.</a> J. Biochem. 67, 629-633 (1970).</li><li>Almog, R., Shirey, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+modified+orcinol+test+for+the+specific+determination+of+RNA.">A modified orcinol test for the specific determination of RNA.</a> Anal. Biochem. 91, 130-137 (1978).</li><li>Dische, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+color+reactions+for+determination+of+sugars+in+polysaccharides.">New color reactions for determination of sugars in polysaccharides.</a> Methods Biochem. Anal. 2, 313-358 (1955).</li><li>Burton, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+study+of+the+conditions+and+mechanism+of+the+diphenylamine+reaction+for+the+colorimetric+estimation+of+deoxyribonucleic+acid.">A study of the conditions and mechanism of the diphenylamine reaction for the colorimetric estimation of deoxyribonucleic acid.</a> Biochemical Journal. 62, 315-323 (1956).</li><li>Vogel, J., Luisi, B. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hfq+and+its+constellation+of+RNA.">Hfq and its constellation of RNA.</a> Nat. Rev. Microbiol. 9, 578-589 (2011).</li><li>Deckert, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+composition+and+electron+microscopy+structure+of+affinity-purified+human+spliceosomal+B+complexes+isolated+under+physiological+conditions.">Protein composition and electron microscopy structure of affinity-purified human spliceosomal B complexes isolated under physiological conditions.</a> Mol. Cell Biol. 26, 5528-5543 (2006).</li><li>Stevens, S. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Composition+and+functional+characterization+of+the+yeast+spliceosomal+penta-snRNP.">Composition and functional characterization of the yeast spliceosomal penta-snRNP.</a> Mol. Cell. 9, 31-44 (2002).</li><li>Sapan, C. V., Lundblad, R. L., Price, N. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Colorimetric+protein+assay+techniques.">Colorimetric protein assay techniques.</a> Biotechnol. Appl. Biochem. 29 (Pt. 2), 99-108 (1999).</li><li>Chomczynski, P., Sacchi, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+single-step+method+of+RNA+isolation+by+acid+guanidinium+thiocyanate-phenol-chloroform+extraction:+twenty-something+years+on.">The single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction: twenty-something years on.</a> Nat. Protoc. 1, 581-585 (2006).</li></ol>

<html> De kolorimetriske assays præsenteret her tilbyde en simpel metode til hurtigt at vurdere den kemiske natur af biomolekylære blandinger, såsom støder ved rensning af proteiner, RNA&#39;er eller komplekser fra helcelle-lysat som forberedelse til yderligere undersøgelser. Som strukturel biologi forfølger flere native-lignende forsamlinger, gradvist større udfordringer, såsom prøve heterogenitet, vil blive stillet af de indviklede og multi-komponent-komplekser. Supramolekylære samlinger er ofte kun marginalt...

Meget af cellebiologi sker via molekylære interaktioner, der involverer DNA og RNA. Fire Disse naturligt forekommende nukleinsyrer (NK) interagerer med hinanden, 5 med proteiner, 6 og med en række små molekyler og ligander in vivo (f.eks divalente kationer 7). Samspillet kan være kort eller lang levetid (kinetisk), kan variere fra høj til moderat til lav affinitet (termodynamisk styrke), og kan også udvise betydelig variation i kemiske egenskaber og specificitet - nogle foreninger er meget specifikke (f.eks DNA · · · transkriptionsfaktorer, RNA · · · splejsningsfaktorer), mens andre interaktioner er nødvendigvis langt mere generisk (f.eks DNA · · · bakterielle histon-lignende HU-proteiner 8). Ikke-specifikke interaktioner med NAS kan få praktiske konsekvenser for in vitro forsøg med blandinger af biomolecules, da det er muligt, og endda sandsynligt, at nogle kontorer vil associere med de biomolekyler af interesse, i det mindste under en vis delmængde af de eksperimentelle betingelser, som anvendes (ionstyrke, pH, osv.). Overvej for eksempel produktion af et protein af interesse (POI) via heterolog overekspression af det rekombinante protein i Escherichia coli-cellekultur; sådan procedure udføres rutinemæssigt i stort set alle strukturel biologi lab 9 I forberedelse til yderligere eksperimenter, f.eks. som biokemisk / biofysisk karakterisering, krystallisering osv., indledende bestræbelser normalt fokusere på at opnå en tilstrækkelig mængde af POI i så ren en form som muligt, helst som en kemisk homogen og biofysisk monodispers prøve. Efter afbrydelse af værtsceller, sigter de tidlige stadier af en typisk oprensning workflow at isolere POI fra E. coli-proteiner, nukleinsyrer, cell wall debris,og andre komponenter i det cellulære lysat. Imidlertid kan host kontorer co-oprenses med POI flere fysisk-kemiske grunde - et stærkt basisk POI kan ikke-specifikt pull-down host DNA / RNA, POI kan have en generisk NA-bindende aktivitet (f.eks ovennævnte HU); POI kan være temmelig specifikke NA-bindende protein, men udviser krydsreaktivitet med værts-RNA&#39;er eller DNA&#39;er, host NA&#39;er kan reagere med en kromatografi-matrix og derved simpelthen co-elueres med POI, og så videre. Vilkårlig, højaffinitetsbinding af vært NA til et IP kan udgøre et irriterende problem, fordi NA urenheder sandsynligvis vil forstyrre efterfølgende eksperimenter (for eksempel fluorescens-anisotropi assays af POI • RNA-binding 10). Alternativt uventet POI · · · NA foreninger også kan ses tilfældigt, da sådanne interaktioner belyse POI nukleinsyre-bindende kapacitet. Uanset hvad, uanset om kontorer er centrale elementer eller forurenende stoffer, må man først kvantificere ogidentificere typen (DNA, RNA) af co-oprensning NA&#39;er som forberedelse til efterfølgende eksperimenter. Adskillige analytiske metoder eksisterer til detektion og kvantificering NA i en prøve. De fleste af de tilgængelige fremgangsmåder er grundlæggende enten spektrofotometrisk (fx en 260 absorbansværdier og A 260 / A 280-forhold), fluorometriske (fx binding af thiazol orange eller andre fluorescerende farvestoffer til NA) eller kolorimetriske (følsomhed af nucleosider til kemiske reaktioner at udbyttet kromoforer absorberer i UV-VIS område af det elektromagnetiske spektrum), som for nylig beskrevet af De Mey et al. 1. Men det afgørende trin for at identificere, hvilken type polynukleotid som RNA eller DNA er uden for mange af disse kvantificering fremgangsmåder. Her giver vi et sæt kolorimetriske assays til hurtigt at identificere de typer af NA-komponenter i en proteinholdig prøve. Protokollerne beskrevet her cen være effektivt udføres uden yderligere trin med isolering af de potentielle NA urenheder, og stole på Benedikts assay til reducerende sukker 11, den orcinol assay for pentoser 12,13, og diphenylamin reaktioner 14,15 af 2&#39;-deoxypentoses (figur 1 og 2) . The Benedict test (figur 2a) udnytter evnen af den lineære, åbenkædede (aldehyd) form af en aldose sukker for at reducere Cu 2 +, med ledsagende oxidation af sukkeret er carbonyl en carboxylat-del og produktion af Cu2 O som en uopløseligt rødt bundfald. Denne reaktion vil teste positive med frie reducerende sukkerarter, såsom aldoser og ketoser (som omdanner til de tilsvarende aldoser via enediol mellemprodukter), men ikke med pentosesukkerstoffer der er låst til cyklisk form som en del af den kovalente rygraden i et DNA-eller RNA-polynukleotid. På grund af den minimalistiske krav om en fri hemiacetal funktionalitet, andre compounds der kunne testes positive i dette assay - og derfor fungere som potentielle interfererende - omfatter α-hydroxy-ketoner og korte oligosaccharider (f.eks disaccharidet maltose). Både Bial s orcinol (figur 2b), Dische s diphenylamin (fig. 2c) reaktioner er baseret på indledende ødelæggelse af polynukleotidet backbone, via depurinering af nucleosidet og yderligere syre-eller basekatalyseret hydrolyse af forældrene nukleotider, til opnåelse af furan-2 -carbaldehyd (furfural) derivater, disse derivater derefter omsættes med enten en polyhydroxy-phenol, såsom orcinol (Bial s) eller diphenylamin (Dische s) reagenser til dannelse af farvede kondensationsprodukter af stort set ukendt kemisk struktur. DNA&#39;et versus RNA specificitet Dische s assayet skyldes, at den pentose sukker skal 2&#39;-deoxygeneret for at være modtagelige for oxidation til ω-hydroxylevulinyl aldehyd, som yderligere reagerer med diphenylaminunder sure betingelser til opnåelse af en lys blå kondensat (figur 2c). Anvendelse af de strømlinede protokollerne der er beskrevet her, har vi fundet, at disse sukker-specifikke kolorimetriske reaktioner kan skelne mellem RNA og DNA og kan også indikere tilstedeværelsen af ​​frie reducerende sukkerarter, såsom glucose, fructose, ribose eller i en biomolekylær prøve.

<table border="1"><tbody><tr><td> Reagens eller udstyr </td><td> Leverandør / firma </td><td> Katalog nummer </td><td> Kommentarer, noter </td></tr><tr><td> Vandfrit natriumcarbonat </td><td> Fisher Scientific </td><td> S263 </td><td></td></tr><tr><td> Natriumcitratdihydrat </td><td> Sigma </td><td> S-4641 </td><td></td></tr><tr><td> Kobber (II) sulfate pentahydrate </td><td> VWR </td><td> VW3312-2 </td><td></td></tr><tr><td> Orcinol monohydrat </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> O1875 </td><td></td></tr><tr><td> Koncentreret HCI </td><td> VWR </td><td> BDH3030 </td><td></td></tr><tr><td> Ferrichlorid-hexahydrat </td><td> Sigma </td><td> F-2877 </td><td></td></tr><tr><td> Diphenylamin </td><td> Aldrich </td><td> 112.763 </td><td></td></tr><tr><td> Iseddike </td><td> Fisher Scientific </td><td> A28 </td><td></td></tr><tr><td> Svovlsyre </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 258.105 </td><td></td></tr><tr><td> Ethanol </td><td> Koptec </td><td> V1101 </td><td></td></tr><tr><td> Ribose </td><td> Sigma </td><td> R-7500 </td><td> prep ved 1% vægt / volumen i H2O </td></tr><tr><td> Ribonukleinsyre fra bagegær (S. cerevisiae) </td><td> Sigma </td><td> R6750 </td><td> prep ved 10 mg / ml i H2O, opbevares ved -20 ° C </td></tr><tr><td> Deoxyribonukleinsyre (natriumsalt) fra kalvethymus </td><td> Sigma </td><td> D1501 </td><td> prep ved 10 mg / ml i H2O, opbevar ved 4 ° C </td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td> Reagenser, Udstyr &amp; Safety Materialer er anført i following tabel i den rækkefølge, som de optræder i protokollen afsnit. Medmindre andet er angivet (ovenfor), kan alle reagenserne opbevares ved stuetemperatur og belysning. For nogen produkter ikke er nævnt nedenfor (f.eks mikrocentrifugerør), kan den sædvanlige mærke / model / sort fundet i en standard biokemisk laboratorium skal benyttes (f.eks, Eppendorf mærke 1,5 ml mikrocentrifugerør). Standard plast mikrocentrifugerør bør anvendes ved trin, der involverer centrifugering (f.eks, at sedimentere partikelformet materiale nær enden af hver protokol). Ingen særlige materiale er at foretrække, så længe rørene kan forsegles, de typiske polypropylenrør fundet i biokemiske laboratorier fungerer godt. Med hensyn til sikkerhedsmæssige betænkeligheder og bortskaffelse af affald, bør standardlaboratoriemetoder forholdsregler (sikkerhedsbriller, stinkskabe) udøves i pre-spån, der arbejder med, og bortskaffelse af opløsninger indeholdende koncentreret eddikesyre, saltsyre eller svovlsyre. For organiske reagenser, såsom orcinol eller diphenylamin, nitrilhandsker er at foretrække frem for den fælles latex (naturgummi) sort. </td></tr></tbody></table>

rapid colorimetric assays to qualitatively distinguish rna and dna in biomolecular samples

Biochemical eksperimenter kræver sædvanligvis præcis viden, på et tidligt stadium, af nukleinsyre, protein og andre biomolekylære komponenter i potentielt heterogene prøver. Nukleinsyrer kan detekteres via adskillige etablerede metoder, herunder analytiske metoder, som er spektrofotometrisk (f.eks A 260), fluorometriske (fx binding af fluorescerende farvestoffer) eller kolorimetriske (nukleosid-specifikke chromogene kemiske reaktioner). En Selv om det ikke kan let at skelne RNA fra DNA, A 260 / A280-forhold er almindeligt anvendt, da det giver en enkel og hurtig to vurdering af den relative indhold af nukleinsyre, der absorberer overvejende i nærheden af 260 nm og protein, der absorberer hovedsagelig nær 280 nm. Forhold &lt;0,8 tages som indikation af &quot;rene&quot; protein prøver, medens ren nukleinsyre (NA) er kendetegnet ved forhold&gt; 1,5 3. However, der situationer, hvor protein / NA indhold kan ikke så klart eller pålideligt udledes simple UV-vis spektrofotometriske målinger. For eksempel prøver (i) kan indeholde et eller flere proteiner, som er relativt fri for de aromatiske aminosyrer er ansvarlige for absorption ved ≈ 280 nm (Trp, Tyr, Phe), som det er tilfældet med nogle små RNA-bindende proteiner, og (ii) prøver kan udvise mellemliggende A 260 / A280-forhold (~ 0,8 &lt;~ 1.5), hvor protein / NA indhold er langt mindre klar og kan endog afspejle en høj affinitet associering mellem proteinet og NA komponenter. Til sådanne scenarier, beskriver vi heri en suite af kolorimetriske analyser til hurtigt at skelne RNA, DNA og reducerende sukkerarter i en potentielt blandede prøve af biomolekyler. Metoderne er afhængige af forskellig sensitivitet af pentoser og andre kulhydrater til Benedikts, Bial s (orcinol), og Dische s (diphenylamin) reagenser, de strømlinede protokoller kan være comafsluttet i løbet af få minutter, uden nogen yderligere trin der til isolering af bestanddelene. Assayene kan udføres parallelt for at skelne mellem RNA og DNA, samt angive tilstedeværelsen af frie reducerende sukkerarter, såsom glucose, fructose og ribose (Figur 1).

Resultaterne er vist i figur 3 for anvendelse af disse kolorimetriske assays til kendte referenceforbindelser. Repræsentative kvalitative data er vist for Benedikts (a), BIAL s orcinol (b), og Dische s diphenylamin (c) assays, og standardkurver for disse tre assays er vist i figur 4.. I paneler 3 (ac), viser de venstre paneler positive / negative kontrolforsøg med passende reaktive / ikke-reaktive analytter, disse visuelle resultater er vist in situ, i kuvetterne, der er besk...

Watch this Scientific Journal Video about Rapid Colorimetric Assays to Qualitatively Distinguish RNA and DNA in Biomolecular Samples at JoVE.com

Rapid Colorimetric Assays to Qualitatively Distinguish RNA and DNA in Biomolecular Samples

En suite af kolorimetriske assays er beskrevet for hurtigt skelne protein, RNA, DNA, og re-duktion sukker i potentielt heterogene biomolekylære prøver.

Hurtige kolorimetriske analyser til kvalitativ Skelne RNA og DNA i Biomolekylær Samples

Biochemical experimentation generally requires accurate knowledge, at an early stage, of the nucleic acid, protein, and other biomolecular components in ...

Research

JoVE Journal

Chemistry

Rapid High Throughput Amylose Determination in Freeze Dried Potato Tuber Samples

Rapid High Throughput Amylose Bestemmelse i frysetørret kartoffelknolden Prøver

This protocol describes a high through put colorimetric method that relies on the formation of a complex between iodine and chains of glucose molecules in ...

Formation of Ordered Biomolecular Structures by the Self-assembly of Short Peptides

Dannelse af Bestilte Biomolekylær Strukturer af Self-samling af korte peptider

In nature, complex functional structures are formed by the self-assembly of biomolecules under mild conditions. Understanding the forces that control ...

Confocal Imaging of Confined Quiescent and Flowing Colloid-polymer Mixtures

Konfokal Imaging for lukkede hvilestrøm og flagrende kolloid-polymer Blandinger

The behavior of confined colloidal suspensions with attractive interparticle interactions is critical to the rational design of materials for directed ...

Preparation of Mica and Silicon Substrates for DNA Origami Analysis and Experimentation

Udarbejdelse af Mica og Silicon Substrater for DNA Origami Analyse og eksperimenter

The designed nature and controlled, one-pot synthesis of DNA origami provides exciting opportunities in many fields, particularly nanoelectronics. Many of ...

Deacetylation Assays to Unravel the Interplay between Sirtuins (SIRT2) and Specific Protein-substrates

Deacetylation Assays to Unravel the Interplay between Sirtuins SIRT2 and Specific Protein-substrates

Deacetylering Analyser til Løs Samspil mellem sirtuins (SIRT2) og specifikt protein-substrater

Acetylation has emerged as an important post-translational modification (PTM) regulating a plethora of cellular processes and functions. This is further ...

A Method to Manipulate Surface Tension of a Liquid Metal via Surface Oxidation and Reduction

En metode til at manipulere overfladespænding en Liquid Metal via Surface oxidation og reduktion

Controlling interfacial tension is an effective method for manipulating the shape, position, and flow of fluids at sub-millimeter length scales, where ...

Coulomb Explosion Imaging as a Tool to Distinguish Between Stereoisomers

Coulomb eksplosion billeddannelse som et redskab til at skelne mellem stereoisomere

This article shows how the COLTRIMS (Cold Target Recoil Ion Momentum Spectroscopy) or the "reaction microscope" technique can be used to distinguish ...

DNA-magnetic Particle Binding Analysis by Dynamic and Electrophoretic Light Scattering

DNA-magnetiske partikel bindende analyse af dynamiske og elektroforese lysspredning

Isolation of DNA using magnetic particles is a field of high importance in biotechnology and molecular biology research. This protocol describes the ...

Rapid Nanoprobe Signal Enhancement by In Situ Gold Nanoparticle Synthesis

Rapid Nanoprobe Signal Enhancement by In Situ Gold Nanoparticle Synthesis

Hurtig Nanoprobe Signal forstærkning af In Situ guld nanopartikel syntese

The use of nanoprobes such as gold, silver, silica or iron-oxide nanoparticles as detection reagents in bioanalytical assays can enable high sensitivity ...

NMR-Based Activity Assays for Determining Compound Inhibition, IC50 Values, Artifactual Activity, and Whole-Cell Activity of Nucleoside Ribohydrolases

NMR-Based Activity Assays for Determining Compound Inhibition, IC50 Values, Artifactual Activity, and Whole-Cell Activity of Nucleoside Ribohydrolases

NMR-baserede Aktivitetsassays til bestemmelse af sammensatte hæmning, IC50 -værdier, artifaktuel aktivitet og helcelle aktivitet af Nukleosid-Ribohydrolaser

NMR spectroscopy is often used for the identification and characterization of enzyme inhibitors in drug discovery, particularly in the context of fragment ...