Name: rapid colorimetric assays to qualitatively distinguish rna and dna in biomolecular samples
Uploaded: 2013-02-04T09:51:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Rapid Colorimetric Assays to Qualitatively Distinguish RNA and DNA in Biomolecular Samples at JoVE.com

Dette arbeidet ble finansiert av University of Virginia og Jeffress Memorial Trust (J-971). Vi takker L. Columbus, K. Jain, og P. Randolph for personer diskusjoner og kritisk lesing av manuskriptet.

1. Benedicts Assay for reduserende sukker <ol><li> Lag et passende mengde Benedicts reagens - 940 mM vannfritt natriumkarbonat, 588 mM natriumcitrat dehydrate, 68 mM kobber (II) sulfat-pentahydrat. Denne reagensen kan oppbevares ved romtemperatur (RT) i minst seks måneder uten merkbar endring i reaktivitet. </li><li> Listen reagens er 6x. Således, for 600 ul reaksjoner, tilsett 100 ul Benedicts reagens til en ren 1,5 ml mikrosentrifugerør (f.eks Eppendorf merke), per prøve som skal analyseres. </li><li> L...

<ol>
	<li>De Mey, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+DNA+and+RNA+quantification+methods+suitable+for+parameter+estimation+in+metabolic+modeling+of+microorganisms.">Comparison of DNA and RNA quantification methods suitable for parameter estimation in metabolic modeling of microorganisms.</a> Anal. Biochem. 353, 198-203 (2006).</li><li>Desjardins, P., Conklin, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=NanoDrop+Microvolume+Quantitation+of+Nucleic+Acids.">NanoDrop Microvolume Quantitation of Nucleic Acids.</a> J. Vis. Exp. (45), e2565 (2010).</li><li>Ausubel, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Short Protocols in Molecular Biology: A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology. , (1999).</li><li>Voet, D., Voet, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Biochemistry. , (2011).</li><li>Adams, R. L. P., Knowler, J. T., Leader, D. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The Biochemistry of the Nucleic Acids. , (1986).</li><li>Rice, P. A., Correll, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Protein-nucleic acid interactions: Structural biology. , (2008).</li><li>Bowman, J. C., Lenz, T. K., Hud, N. V., Williams, L. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cations+in+charge:+Magnesium+ions+in+RNA+folding+and+catalysis.">Cations in charge: Magnesium ions in RNA folding and catalysis.</a> Curr. Opin. Struct. Biol. , (2012).</li><li>Balandina, A., Kamashev, D., Rouviere-Yaniv, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+bacterial+histone-like+protein+HU+specifically+recognizes+similar+structures+in+all+nucleic+acids.+DNA,+RNA,+and+their+hybrids.">The bacterial histone-like protein HU specifically recognizes similar structures in all nucleic acids. DNA, RNA, and their hybrids.</a> J. Biol. Chem. 277, 27622-27628 (1074).</li><li>Graslund, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+production+and+purification.">Protein production and purification.</a> Nat. Methods. 5, 135-146 (2008).</li><li>Pagano, J. M., Clingman, C. C., Ryder, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+approaches+to+monitor+protein-nucleic+acid+interactions+using+fluorescent+probes.">Quantitative approaches to monitor protein-nucleic acid interactions using fluorescent probes.</a> RNA. 17, 14-20 (2011).</li><li>Benedict, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+reagent+for+the+detection+of+reducing+sugars.">A reagent for the detection of reducing sugars.</a> J. Biol. Chem. 277, e5 (1908).</li><li>Endo, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+simultaneous+estimation+method+of+DNA+and+RNA+by+the+orcinol+reaction+and+a+study+on+the+reaction+mechanism.">A simultaneous estimation method of DNA and RNA by the orcinol reaction and a study on the reaction mechanism.</a> J. Biochem. 67, 629-633 (1970).</li><li>Almog, R., Shirey, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+modified+orcinol+test+for+the+specific+determination+of+RNA.">A modified orcinol test for the specific determination of RNA.</a> Anal. Biochem. 91, 130-137 (1978).</li><li>Dische, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+color+reactions+for+determination+of+sugars+in+polysaccharides.">New color reactions for determination of sugars in polysaccharides.</a> Methods Biochem. Anal. 2, 313-358 (1955).</li><li>Burton, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+study+of+the+conditions+and+mechanism+of+the+diphenylamine+reaction+for+the+colorimetric+estimation+of+deoxyribonucleic+acid.">A study of the conditions and mechanism of the diphenylamine reaction for the colorimetric estimation of deoxyribonucleic acid.</a> Biochemical Journal. 62, 315-323 (1956).</li><li>Vogel, J., Luisi, B. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hfq+and+its+constellation+of+RNA.">Hfq and its constellation of RNA.</a> Nat. Rev. Microbiol. 9, 578-589 (2011).</li><li>Deckert, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+composition+and+electron+microscopy+structure+of+affinity-purified+human+spliceosomal+B+complexes+isolated+under+physiological+conditions.">Protein composition and electron microscopy structure of affinity-purified human spliceosomal B complexes isolated under physiological conditions.</a> Mol. Cell Biol. 26, 5528-5543 (2006).</li><li>Stevens, S. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Composition+and+functional+characterization+of+the+yeast+spliceosomal+penta-snRNP.">Composition and functional characterization of the yeast spliceosomal penta-snRNP.</a> Mol. Cell. 9, 31-44 (2002).</li><li>Sapan, C. V., Lundblad, R. L., Price, N. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Colorimetric+protein+assay+techniques.">Colorimetric protein assay techniques.</a> Biotechnol. Appl. Biochem. 29 (Pt. 2), 99-108 (1999).</li><li>Chomczynski, P., Sacchi, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+single-step+method+of+RNA+isolation+by+acid+guanidinium+thiocyanate-phenol-chloroform+extraction:+twenty-something+years+on.">The single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction: twenty-something years on.</a> Nat. Protoc. 1, 581-585 (2006).</li></ol>

<html> De kolorimetriske analyser presenteres her tilby en enkel tilnærming for å raskt vurdere den kjemiske natur biomolekylære blandinger, som er oppstått når rensing proteiner, RNA eller komplekser fra hel-cellelysat i forberedelse for videre studier. Som strukturell biologi forfølger flere innfødte som forsamlinger, gradvis større utfordringer, som for eksempel prøve heterogenitet, vil bli stilt av intrikate og multi-komponent komplekser. Supramolecular samlinger er ofte bare marginalt stabil, og deres velly...

Mye av cellebiologi skjer via molekylære interaksjoner som involverer DNA og RNA. 4 Disse naturlig forekommende nukleinsyrer (NAS) interagerer med hverandre, 5 med proteiner, 6 og med en rekke små-molekyl forbindelser og ligander in vivo (f.eks, divalente kationer 7). Interaksjonene kan være kort eller lang levetid (kinetisk), kan variere fra høy til moderat til lav affinitet (termodynamisk styrke), og kan også oppvise betydelig variasjon i kjemiske egenskaper og spesifisitet - noen foreninger er ganske spesifikke (f.eks DNA · · · transkripsjonsfaktorer, RNA · · · skjøting faktorer), mens andre interaksjoner er nødvendigvis langt mer generisk (f.eks DNA · · · bakterielle histone-lignende HU proteiner 8). Uspesifikke interaksjoner med NAs kan ha praktiske konsekvenser for in vitro forsøk med blandinger av biomolecules, som det er mulig, og selv sannsynlig, at noen NAs vil assosiere med biomolekyler av interesse, i det minste under noen delsett av de eksperimentelle betingelser som er brukt (ionestyrke, pH, osv.). Se for eksempel, fremstilling av et protein av interesse (POI) via heterolog over-ekspresjon av det rekombinante protein i Escherichia coli cellekultur; slik prosedyre blir rutinemessig utført i praktisk talt hvilken som helst strukturell biologi lab 9 Ved utarbeidelse for ytterligere eksperimenter, slik. som biokjemiske / biofysisk karakterisering, krystallisering osv.., innledende innsats generelt fokus på å skaffe en tilstrekkelig mengde av POI i så ren form som mulig, helst som en kjemisk homogen og biophysically monodisperse prøven. Etter avbrudd i vertsceller, de tidlige stadiene av en typisk rensing arbeidsflyt som mål å isolere POI fra E. coli proteiner, nukleinsyrer, cellevegg rusk,og andre komponenter av den cellulære lysatet. Imidlertid kan verten NAs samtidig rense med POI for flere fysiokjemiske grunner - en svært grunnleggende POI kan ikke-spesifikt pull-down vert DNA / RNA, POI kan ha en generisk NA-bindende aktivitet (f.eks nevnte HU); POI kan være en ganske bestemt NA-bindende protein, men utstillingen kryssreaktivitet med vert RNA eller DNA&#39;er, vert NAs kan interagere med en kromatografi matrise og derved bare ko-eluer med POI, og så videre. Kritikkløs, høyaffinitetsbinding av vert NAs til en POI kan utgjøre en vexing problem fordi NA urenheter vil trolig påvirke nedstrøms eksperimenter (f.eks fluorescens anisotropi analyser av POI • RNA bindende 10). Alternativt, uforutsette POI · · · Ikke foreninger også kan sees tilfeldig, da slike interaksjoner belyse severdighetene nukleinsyre-bindende kapasitet. Uansett, om NAs er sentrale komponenter eller forurensninger, må man først kvantifisere ogidentifisere hvilken type (DNA, RNA) av co-rensing NAs i forberedelse til nedstrøms eksperimenter. Flere analytiske metoder finnes for påvisning og kvantifisering av NAs i en prøve. De fleste av de tilgjengelige metodene er fundamentalt enten spektrofotometrisk (f.eks en 260 absorbansverdier og en 260 / A 280 forholdstall), fluorometrisk (f.eks binding av tiazolring oransje eller andre fluorescerende fargestoffer til NA), eller kolorimetrisk (følsomhet nukleosider til kjemiske reaksjoner at avkastning kromoforer absorberende i UV-vis område av det elektromagnetiske spektrum), som nylig er beskrevet av De Mey et al. 1 er imidlertid avgjørende skritt å identifisere hvilken type polynukleotid som RNA eller DNA utenfor rammen av mange av disse kvantifisering tilnærminger. Her har vi gi et sett av kolorimetriske assays for å raskt identifisere hvilke typer NA komponenter i et proteinholdig prøve. Protokollene er beskrevet her cen effektivt utført uten ytterligere trinn for å isolere de potensielle NA urenheter, og stole på Benedicts analysen for reduserende sukker 11, den orcinol analysen for pentoser 12,13, og difenylamin reaksjoner 14,15 av 2&#39;-deoxypentoses (figur 1 og 2) . Benedikt test (Figur 2a) utnytter evnen av den lineære, åpen-kjede (aldehyd) form av en aldose sukker å redusere Cu 2 +, med samtidig oksydasjon av sukkeret er karbonyl til et karboksylat gruppe og produksjon av Cu 2 O som en uløselig rød bunnfall. Denne reaksjonen vil teste positivt med frie reduserende sukker som aldoses og ketoses (som omdanner de tilsvarende aldoses via enediol mellomprodukter), men ikke med pentose sukker som er låst inn i syklisk form som en del av det kovalente ryggraden av et DNA-eller RNA-polynukleotidet. På grunn av den minimalistiske kravet av en fri hemiacetal funksjonalitet, andre compounds som kunne tester positiv i denne analysen - og derfor fungere som potensielle interferents - inkluderer α-hydroksy-ketoner og korte oligosakkarider (f.eks disakkaridet maltose). Både Bial største orcinol (Figur 2b) og Dische største difenylamin (figur 2c) reaksjoner er basert på innledende ødeleggelse av polynukleotidet ryggraden, via depurination av nukleosid og ytterligere syre-eller base-katalysert hydrolyse av de overordnede nukleotider, for å gi furan-2 -karbaldehyd (furfural) derivater, og disse derivater reagerer med enten en polyhydroksy fenol eksempel orcinol (Bial største) eller difenylamin (Dische tallet) reagenser for å danne fargede kondensasjonsprodukter av meste ukjent kjemisk struktur. DNA versus RNA Spesifisiteten til Dische s analysen stammer fra det faktum at den pentose sukker må være 2&#39;-deoxygenated for å være utsatt for oksidasjon til ω-hydroxylevulinyl aldehyd, som videre reagerer med difenylaminunder sure betingelser for å gi en lys blå kondensat (Figur 2c). Bruke strømlinjeformede protokollen beskrevet her, har vi funnet at disse sukker-spesifikke kolorimetriske reaksjoner kan skille mellom RNA og DNA, og vil også indikere tilstedeværelse av frie reduserende sukker som glukose, fruktose, eller ribose i biomolekylære prøve.

<table border="1"><tbody><tr><td> Reagens eller utstyr </td><td> Leverandør / firma </td><td> Katalognummer </td><td> Kommentarer, notater </td></tr><tr><td> Vannfritt natriumkarbonat </td><td> Fisher Scientific </td><td> S263 </td><td></td></tr><tr><td> Natriumsitrat dihydrat </td><td> Sigma </td><td> S-4641 </td><td></td></tr><tr><td> Kobber (II) sulfat-pentahydrat </td><td> VWR </td><td> VW3312-2 </td><td></td></tr><tr><td> Orcinol monohydrat </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> O1875 </td><td></td></tr><tr><td> Konsentrert HCl </td><td> VWR </td><td> BDH3030 </td><td></td></tr><tr><td> Jernklorid hexahydrate </td><td> Sigma </td><td> F-2877 </td><td></td></tr><tr><td> Difenylamin </td><td> Aldrich </td><td> 112763 </td><td></td></tr><tr><td> Iseddik </td><td> Fisher Scientific </td><td> A28 </td><td></td></tr><tr><td> Svovelsyre </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 258105 </td><td></td></tr><tr><td> Etanol </td><td> Koptec </td><td> V1101 </td><td></td></tr><tr><td> Ribose </td><td> Sigma </td><td> R-7500 </td><td> prep ved 1% w / v i H 2 O </td></tr><tr><td> Ribonukleinsyre fra bakegjær (S. cerevisiae) </td><td> Sigma </td><td> R6750 </td><td> prep ved 10 mg / ml i H 2 O, store ved -20 ° C </td></tr><tr><td> Deoksyribonukleinsyre (natriumsalt), fra kalvethymus </td><td> Sigma </td><td> D1501 </td><td> prep ved 10 mg / ml i H 2 O, store ved 4 ° C </td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td> Reagenser, utstyr og sikkerhet Materialer er oppført i following bord i den rekkefølgen de vises i protokollen delen. Ikke annet er angitt (ovenfor), kan alle reagenser lagres ved romtemperatur og belysning. For noen produkter som ikke er nevnt nedenfor (f.eks mikrosentrifugerør), kan den vanlige modellen / / utvalg funnet i en standard biokjemisk laboratorium brukes (f.eks Eppendorf merkevare 1,5 ml mikrofugerør). Standard plast mikrofugerør bør brukes for trinnene involverer sentrifugering (f.eks til sediment partikkelformig materiale nær slutten av hver protokoll). Ingen bestemt materiale er å foretrekke, så lenge rørene kan være forseglet, de typiske polypropylenrør funnet i biokjemi laboratorier fungere godt. I form av sikkerhetsmessige bekymringer og avfallshåndtering skal standard laboratorieforholdsregler (vernebriller, avtrekksskap) utøves i pre-paring, som arbeider med, og avhending av løsninger som inneholder konsentrert eddiksyre, saltsyre, eller svovelsyre. For organiske reagenser som orcinol eller diphenylamin, nitrilhansker er å foretrekke fremfor den vanlige latex (naturgummi) variasjon. </td></tr></tbody></table>

rapid colorimetric assays to qualitatively distinguish rna and dna in biomolecular samples

Biokjemiske eksperimentering krever generelt nøyaktig kunnskap, på et tidlig stadium, av nukleinsyre, protein, og andre komponenter i potensielt biomolekylære heterogene prøver. Nukleinsyrer kan påvises via flere etablerte tilnærminger, inkludert analytiske metoder som er spektrofotometriske (f.eks, en 260), fluorometrisk (f.eks, binding av fluorescerende fargestoffer), eller kolorimetriske (nukleosid-spesifikke kromogene kjemiske reaksjoner). 1 Selv om det ikke kan lett skille RNA fra DNA, A 260 / A 280 forholdet er vanligvis blir anvendt, som det tilbyr en enkel og rask 2 vurdering av den relative innholdet av nukleinsyre, som absorberer hovedsakelig nær 260 nm og protein, som absorberer hovedsakelig nær 280 nm. Prosenter &lt;0,8 tas som en indikasjon på et &#39;rent&#39; protein prøver, mens ren nukleinsyre (NA) er karakterisert ved forholdstall&gt; 1,5 3. HoWever, er det scenarier der protein / NA innholdet ikke kan være så tydelig eller pålitelig utledes fra enkle uv-vis spektrofotometriske målinger. For eksempel, (i) prøver kan inneholde ett eller flere proteiner som er relativt blottet for de aromatiske aminosyrer som er ansvarlige for absorpsjon ved 280 nm (≈ Trp, Tyr, Phe), som er tilfellet med noen små RNA-bindende proteiner, og (ii) prøver kan fremvise mellomprodukt A 260 / A 280 forholdstall (~ 0,8 &lt;~ 1,5), hvor proteinet / NA innhold er langt mindre klart og kan selv gjenspeile noen høy affinitet assosiasjon mellom proteinet og NA komponenter. For slike scenarier, beskriver vi her en pakke med kolorimetriske analyser for å raskt skille RNA, DNA, og reduserende sukker i en potensielt blandet utvalg av biomolekyler. Metodene stole på differensial følsomheten pentoses og andre karbohydrater til Benedict, Bial tallet (orcinol), og Dische er (difenylamin) reagenser, de strømlinjeformede protokoller kan være comgjennomført i løpet av minutter, uten noen ytterligere trinn for å måtte isolere komponentene. Assayene kan utføres i parallell for å differensiere mellom RNA og DNA, samt indikere tilstedeværelse av frie reduserende sukker som glukose, fruktose, og ribose (Figur 1).

Resultatene er vist i Figur 3 for påføring av disse kolorimetriske assays til kjente referanseforbindelser. Representative kvalitative data er vist for Benedict (A), Bial største orcinol (b), og Dische største difenylamin (c) analyser, og standardkurver for disse tre analysene er vist i figur 4.. I paneler 3 (AC), venstre paneler viser positive / negative kontroll forsøk med videooverføring reaktive / reaktivt analytter, disse visuelle resultater er vist i situ, i kyvette...

Watch this Scientific Journal Video about Rapid Colorimetric Assays to Qualitatively Distinguish RNA and DNA in Biomolecular Samples at JoVE.com

Rapid Colorimetric Assays to Qualitatively Distinguish RNA and DNA in Biomolecular Samples

En pakke med kolorimetriske analyser er beskrevet for raskt skille protein, RNA, DNA, og re-ducing sukker i potensielt heterogene biomolekylære prøver.

Rapid Kolorimetriske Analyser til kvalitativt Skille RNA og DNA i biomolekylære Prøver

Biochemical experimentation generally requires accurate knowledge, at an early stage, of the nucleic acid, protein, and other biomolecular components in ...

Research

JoVE Journal

Chemistry

Rapid High Throughput Amylose Determination in Freeze Dried Potato Tuber Samples

Rapid høy gjennomstrømning Amylose Bestemmelse i Freeze Tørket potet Tuber Samples

This protocol describes a high through put colorimetric method that relies on the formation of a complex between iodine and chains of glucose molecules in ...

Formation of Ordered Biomolecular Structures by the Self-assembly of Short Peptides

Dannelse av Bestilte biomolekylære strukturer ved selvbygging av Short Peptider

In nature, complex functional structures are formed by the self-assembly of biomolecules under mild conditions. Understanding the forces that control ...

Confocal Imaging of Confined Quiescent and Flowing Colloid-polymer Mixtures

Confocal Imaging av Confined Hvile og Flowing Kolloid-polymer blandinger

The behavior of confined colloidal suspensions with attractive interparticle interactions is critical to the rational design of materials for directed ...

Preparation of Mica and Silicon Substrates for DNA Origami Analysis and Experimentation

Utarbeidelse av Mica og Silicon Underlag for DNA Origami analyse og eksperimentering

The designed nature and controlled, one-pot synthesis of DNA origami provides exciting opportunities in many fields, particularly nanoelectronics. Many of ...

Deacetylation Assays to Unravel the Interplay between Sirtuins (SIRT2) and Specific Protein-substrates

Deacetylation Assays to Unravel the Interplay between Sirtuins SIRT2 and Specific Protein-substrates

Deacetylering Analyser å greie samspillet mellom sirtuins (SIRT2) og spesifikt protein-substrater

Acetylation has emerged as an important post-translational modification (PTM) regulating a plethora of cellular processes and functions. This is further ...

A Method to Manipulate Surface Tension of a Liquid Metal via Surface Oxidation and Reduction

En metode for å manipulere overflatespenningen i en Liquid Metal via Surface Oksidasjon og reduksjon

Controlling interfacial tension is an effective method for manipulating the shape, position, and flow of fluids at sub-millimeter length scales, where ...

Coulomb Explosion Imaging as a Tool to Distinguish Between Stereoisomers

Coulomb eksplosjon Imaging som et verktøy til å skille mellom Stereoisomers

This article shows how the COLTRIMS (Cold Target Recoil Ion Momentum Spectroscopy) or the "reaction microscope" technique can be used to distinguish ...

DNA-magnetic Particle Binding Analysis by Dynamic and Electrophoretic Light Scattering

DNA-magnetiske partikler bindende analyse av dynamisk og Electrophoretic lysspredning

Isolation of DNA using magnetic particles is a field of high importance in biotechnology and molecular biology research. This protocol describes the ...

Rapid Nanoprobe Signal Enhancement by In Situ Gold Nanoparticle Synthesis

Rapid Nanoprobe Signal Enhancement by In Situ Gold Nanoparticle Synthesis

Rask Nanoprobe Signal forsterkning av i Situ gull hydrogenion syntese

The use of nanoprobes such as gold, silver, silica or iron-oxide nanoparticles as detection reagents in bioanalytical assays can enable high sensitivity ...

NMR-Based Activity Assays for Determining Compound Inhibition, IC50 Values, Artifactual Activity, and Whole-Cell Activity of Nucleoside Ribohydrolases

NMR-Based Activity Assays for Determining Compound Inhibition, IC50 Values, Artifactual Activity, and Whole-Cell Activity of Nucleoside Ribohydrolases

NMR-baserte aktivitet analyser for å bestemme sammensatte hemming, IC50 verdier, Artifactual aktivitet, og hele cellen aktivitet av nukleosid Ribohydrolases

NMR spectroscopy is often used for the identification and characterization of enzyme inhibitors in drug discovery, particularly in the context of fragment ...