Name: a new approach for the comparative analysis of multiprotein complexes based on 15n metabolic labeling and quantitative mass spectrometry
Uploaded: 2014-03-13T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about A New Approach for the Comparative Analysis of Multiprotein Complexes Based on 15N Metabolic Labeling and Quantitative Mass Spectrometry at JoVE.com

MH erkänner stöd från &quot;Deutsche Forschungsgemeinschaft&quot; (DFG). Författare bidrag: MH utformade forskning, KT, JS och MT utfört forskning och analyserade data, KT och MH skrev tidningen.

1. Odling av Chlamydomonas <ol><li> Följande C. reinhardtii stammar användes i föreliggande studie: WT cc124, WT cw15-arg7 (cellvägg bristfällig och argininauxotrof), ett Apsi mutantstam 29 och en pgrl1 knock-out-stam 4. </li><li> Alla stammar odlades i Tris-acetat-fosfat (TAP)-mediet 30, vid 25 ° C med en kontinuerlig ljusintensitet på 20 till 50 μE / m 2 sek och skakning vid 120 rpm. Kulturen i Apsi bör lindas med några silkesp...

Olika kvantitativa proteomik studier med stabila isotopen märkning har publicerats under de senaste åren. I dessa experiment vanligtvis två olika prover jämförs, av vilka ett prov är märkt med en stabil isotop. Därefter proteiner eller peptider från de två proven kombineras i samma förhållande och bearbetas vidare tillsammans 48. Sådana studier tänker ofta att jämföra definierade isolerade cellulära utrymmen (t.ex. kloroplaster, mitokondrier eller thylakoid membran) utsätts för oli...

Fotosyntesen hos Thylakoid membran av växter och alger kan fungera i en linjär och cyklisk läge. Under linjär elektronflöde (LSF) fotosystem I (PSI), fotosystem II (PSII) och cytokrom b. 6 / f slutligen överföra elektroner från vatten till NADP + 1, vilket leder till generering av NADPH och ATP 2. I kontrast, cyklisk elektronflöde (CEF), som är känd för att induceras enligt olika miljöförhållanden som statliga 2 3 och anaeroba betingelser 4, resulterar i re-reduktion av oxiderat PSI genom att injicera elektroner tillbaka in i transportkedjan elektron. Denna process kan ske antingen vid stromal sidan av cytokrom b 6 / f komplex 1 eller på plastoquinone poolen 5 och genererar ATP, men ingen NADPH 2. Syftet med den presenterade protokollet är att demonstrera en masspektrometri (MS) baserat metod för jämförande, kvantitativ analys av multiproteinkomplex i thylakoid membran av Chlamydomonas reinhardtii att få insikt i sammansättningen av dessa komplex under olika förhållanden (som exemplifieras genom att jämföra genetiskt olika stammar). Detta synsätt tillämpades i en publikation av Terashima et al. Under 2012 visar en Ca2 +-beroende reglering av CEF i C. reinhardtii förmedlas av en multiproteinkomplex med proteiner CAS, ANR1 och PGRL1 6. Förfarandet kommer att förklaras genom att jämförelsevis analysera sammansättningen av CEF-supercomplex i två genetiskt olika stammar, och därmed dra fördel av märkning en av de två stammar med tunga kväve (15 N). I korthet innehåller protokollet beredning av thylakoid membran, följt av tvättmedel lösningsgörande och fraktionering av fotosyntetiska komplex i en sackarosdensitetsgradient. Efter fraktionering av lutning, valda fracningar av två stammar blandas baserat på lika stor volym, separerades genom SDS-PAGE följt av in-gel digestion och efterföljande kvantitativ MS-analys. Som nämnts ovan, är CEF induceras under olika miljöförhållanden och en publikation från 2010 visar att isolering av en funktionell CEF-supercomplex från staten 2 låsta celler av C. reinhardtii 7, som utfördes genom att separera solubiliserade Thylakoid membran på en sackarosdensitetsgradient under ultracentrifugering. Olika från al. Iwai et 7, beskriver den presenterade protokollet isoleringen av FSE-supercomplex från anaerob vuxit C. reinhardtii kulturer genom att följa ett alternativt förfarande. Detta omfattar förändringar i thylakoid isoleringsprotokoll samt skillnader beträffande solubiliseringssteget och separation av proteinkomplex genom ultracentrifugering. I det nuvarande protokollet, thylakoid membranisoleras genom tillämpning av den metod som publicerats av Chua och Bennoun 8, medan buffertarna som används för thylakoid framställning av Iwai et al. innehöll 25 mM MES, 0,33 M sackaros, 5 mM MgCl2, 1,5 mM NaCl (pH 6,5) såsom beskrivits 9. Solubiliseringen genomfördes med 0,7 till 0,8% detergent (n-tridecyl-β-D-maltosid) under 30 minuter på is i händelse av Iwai och medarbetare, medan solubiliseringen här beskrivna metoden förlitar sig på användningen av 0,9% detergent (n -dodecyl-β-D-maltosid (β-ts)) och utförs under endast 20 minuter på is. Båda grupperna använde 0.8 mg klorofyll per ml för lösningsgörande med respektive rengöringsmedel. För separation av fotosyntetiska komplex från upplösta thylakoid membran Iwai et al. Tillämpad sackaros koncentrationer 0,1-1,3 M, medan författarna till detta protokoll som används koncentrationer som sträcker sig från 0,4 till 1,3 M. Den sista skillnaden är centrifugeringshastigheten, vilket är lägre än till earlier publicering. Solubilisering av thylakoid membran med nonjoniska tvättmedel följt av sackarosdensitetsgradient fraktione har redan tillämpats i ett flertal studier som sträcker sig från 1980-talet fram till i dag 7, 9-14 och även tillämpningen av metabolisk märkning av proteiner är en utbredd metod inom proteomik området. Den beskrivna tillvägagångssätt tillämpar 15 N metabolisk märkning för en av de två jämförda stammarna genom odling i närvaro av tunga kväve som enda kvävekälla i form av 15 N NH 4 Cl, som är införlivat med alla aminosyror som leder till en massa skifta beroende på aminosyrasekvensen för peptiden. Vid analys av en blandning av 14 N och 15 N inom en MS köra, kan detta massförskjutning användas för att bestämma provets ursprung för varje peptid och den relativa peptid abundances kan beräknas som representerar relativa förekomsten för motsvarandening protein 15. Ett flertal kvantitativa proteomik studier på C. reinhardtii finns tillgängliga, som jämför en definierad mängd protein för att analysera förändringar i proteomet mellan experimentella förhållanden (t.ex. förändringar i proteomet grund av närings 16-19 eller lätta stressen 20,21). Jämfört med dessa studier, i den nu presenterade strategin lika volymer av prover kombineras och analyseras. Denna inställning gör det möjligt att studera vandringsbeteende proteiner i lutning och dessutom att analysera sammansättningen av olika komplex med avseende på de undersökta stammarna. Denna metod kommer att förklaras genom att huvudsakligen koncentrera sig på tre proteiner: Den första kandidaten är kloroplasten-lokaliserad kalciumsensorprotein CAS, som visade sig vara involverade i foto acklimatisering i C. reinhardtii 22. Kalcium anses vara en viktig signalning jon för vägar som aktiveras på grund av olika biotiska och abiotiska påfrestningar slutligen leder till förändringar i genuttryck och cellfysiologi 23 och det föreslogs att kloroplaster kan bidra till cell Ca2 + signalering via CAS proteinet 22,24,25. Det andra proteinet är ANR1 (anaerob svar 1 6), ett protein som visade sig induceras under anoxiska odlingsförhållanden i C. reinhardtii 26. Noterbart var CAS samt ANR1 identifieras som subenheter av FSE-supercomplex och dessutom genom att använda omvänd genetiska metoder, visades att båda proteinerna bidrar funktionellt till CEF in vivo 6, stödja deras roll som funktionella subenheter av denna proteinkomplex. Den tredje proteinet är det thylakoid protein PGR5-Like 1 (PGRL1), som visade sig vara involverad i CEF i Chlamydomonas 4,27 samt i Arabidopsis 5,28 och var också identified i arbetet med Iwai et al. 7 Detta tillvägagångssätt kommer att presenteras genom att visa resultaten från två olika experiment: vildtyp (WT) kontra (vs) en Apsi 29 stam, uppvisar en strykning av PSAB genen kodar för en viktig fotosystem I underenhet, som också är en del av CEF-supercomplex och WT kontra en pgrl1 knock-out stam 4. För var och en av dessa experiment den kvantitativa sammansättningen av CEF-supercomplex mellan en 15 N-och en 14 N-märkta stammen har jämförts.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1135">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:392px;">Chemicals</td>
			<td style="width:427px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:199px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:392px;">Acetic acid</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A0662</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:392px;">Acetone</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A2300</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;">Acetonitrile Optigrade f&#252;r LC-MS</td>
			<td style="width:427px;">Diagonal 
			website: https://www.diagonal.de/</td>
			<td style="width:119px;">9340</td>
			<td style="width:199px;">harmful, work with gloves 
			see protocol text for further precautions</td>
		</tr>
		<tr height="45">
			<td height="45" style="height:45px;">Ammonium chloride 15N</td>
			<td style="width:427px;">Cambridge Isotope Laboratories 
			website: http://www.isotope.com/cil/index.cfm</td>
			<td style="width:119px;">39466-62-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Ammonium chloride 14N</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A0988</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Ammonium hydrogenphosphate&#160;</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A3583</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Ammonium sulfate&#160;</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A3598</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Coomassie brilliant blue R-250</td>
			<td style="width:427px;">Fisher Scientific 
			website: http://www.de.fishersci.com/index.php/deindex</td>
			<td>10041653</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">n-Dodecyl-&#946;-D-maltoside</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A0819</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">EDTA</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A2937</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Formic acid&#160;&#160;</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A3858</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Hepes</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A3724</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Magnesium chloride</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td>A4425</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Methanol</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A2954</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Phosphorous acid</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A0989</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Di-Potassium hydrogenphosphate&#160;</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A1042</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Potassium di-hydrogenphosphate&#160;</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A1043</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Sodium hydroxide</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A1551</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Sucrose</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A1125</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Tricine</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A3954</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:392px;">Tris</td>
			<td style="width:427px;">AppliChem 
			webiste: http://www.applichem.com/home/</td>
			<td style="width:119px;">A2264</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Trypsin (sequencing grade modified) and Trypsin buffer</td>
			<td style="width:427px;">Promega 
			website: http://www.promega.de/</td>
			<td style="width:119px;">V5111</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:392px;"></td>
			<td style="width:427px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:392px;">Equipment&#160;</td>
			<td style="width:427px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Neboulizer (BioNeb cell disruptor)</td>
			<td style="width:427px;">Glas-Col 
			website: http://www.glascol.com/product/subproduct/id/75</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:392px;">Centrifuge tubes (14 x 89 mm)&#160; 
			for preparation of takahashi style gradients</td>
			<td style="width:427px;">Beckman Coulter 
			website: http://www.beckmancoulter.de/</td>
			<td style="width:119px;">331372</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:392px;">Centrifuge tubes 25 x 89 mm 
			for preparation of thylakoid isolation gradients&#160;</td>
			<td style="width:427px;">Beckman Coulter 
			website: http://www.beckmancoulter.de/</td>
			<td style="width:119px;">344058</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:392px;">Coulter Avanti Centrifuge J-20 XP</td>
			<td style="width:427px;">Beckman Coulter 
			website: http://www.beckmancoulter.de/</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Fuchs-Rosenthal cell couting chamber</td>
			<td style="width:427px;">Diagonal 
			website: https://www.diagonal.de/</td>
			<td style="width:119px;">449/72</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;">Homogenizer (Potter) 50 ml&#160;</td>
			<td style="width:427px;">Fisherbrand 
			website: http://www.de.fishersci.com/index.php/defisherbrand</td>
			<td style="width:119px;">10618242</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;">Pistil for homogenizer</td>
			<td style="width:427px;">Fisherbrand 
			website: http://www.de.fishersci.com/index.php/defisherbrand</td>
			<td style="width:119px;">105252220</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:392px;">Ultracentrifuge (Optima XPN-80 Ultracentrifuge)</td>
			<td style="width:427px;">Beckman Coulter 
			website: http://www.beckmancoulter.de/</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:392px;"></td>
			<td style="width:427px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:392px;">Other</td>
			<td style="width:427px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:392px;">Antibodies&#160;</td>
			<td style="width:427px;">Agrisera 
			website: http://www.agrisera.com/en/index.html</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a new approach for the comparative analysis of multiprotein complexes based on 15n metabolic labeling and quantitative mass spectrometry

Den introducerade protokoll tillhandahåller ett verktyg för analys av multiproteinkomplex i thylakoid membranet, genom att avslöja insikter i komplexa sammansättning under olika förhållanden. I detta protokoll den metod demonstreras genom att jämföra sammansättningen av proteinkomplex som ansvarar för cyklisk elektronflöde (CEF) i Chlamydomonas reinhardtii, isolerad från genetiskt olika stammar. Förfarandet innefattar isolering av Thylakoid membran åtföljt av deras separation i multiproteinkomplex genom sackarosdensitetsgradientcentrifugering, SDS-PAGE, immunodetektion och jämförande, kvantitativ masspektrometri (MS) baserat på differentiell metabolisk märkning (14 N / 15 N) av analyserade stammar. Tvättmedel upplösta thylakoid membran lastas på sackaros densitetsgradienter på lika klorofyllkoncentration. Efter ultracentrifugering, är gradienter separeras i fraktioner, som analyseras av mass spectrometry baserad på samma volym. Detta tillvägagångssätt gör utredningen av sammansättningen inom gradientfraktionerna och dessutom att analysera vandringsbeteende olika proteiner, speciellt med fokus på ANR1, CAS, och PGRL1. Dessutom är denna metod demonstreras genom att bekräfta resultaten med immunoblotting och dessutom genom att stödja resultaten från tidigare studier (identifiering och PSI beroende migrering av proteiner som tidigare beskrivits som en del av FSE-supercomplex såsom PGRL1, FNR, och cyt f). Noterbart är detta tillvägagångssätt tillämpas för att hantera ett brett spektrum av frågor, för vilka detta protokoll kan antas och exempel som används för jämförande analyser av multiproteinkomplex komposition isolerad från olika miljöförhållanden.

Den introducerade kvantitativa proteomik strategi syftar till att karakterisera sammansättningen av multiproteinkomplex i thylakoid membran visas av den jämförande analys av CEF-supercomplex komponenter i genetiskt olika C. reinhardtii stammar. Den beskrivna metoden har med framgång tillämpats av al. Terashima et 6 och består isoleringen av thylakoid membran från anaeroba odlade kulturer, följt av tvättmedel görande. Därefter proverna laddas på ett sackarosdensitetsgradi...

Watch this Scientific Journal Video about A New Approach for the Comparative Analysis of Multiprotein Complexes Based on 15N Metabolic Labeling and Quantitative Mass Spectrometry at JoVE.com

A New Approach for the Comparative Analysis of Multiprotein Complexes Based on 15N Metabolic Labeling and Quantitative Mass Spectrometry

Den beskrivna jämförande, kvantitativ proteomik strategi syftar till att få insikt i sammansättningen av multiproteinkomplex under olika förhållanden och demonstreras genom att jämföra genetiskt olika stammar. För kvantitativ analys av lika volymer av olika fraktioner från en sackarosdensitetsgradient blandas och analyseras med masspektrometri.

En ny metod för jämförande analys av multiproteinkomplex baserat på<sup&gt; 15</sup&gt; N Metabolic Märkning och kvantitativ masspektrometri

The introduced protocol provides a tool for the analysis of multiprotein complexes in the thylakoid membrane, by revealing insights into complex ...

Research

JoVE Journal

Biology

A New Approach for the Comparative Analysis of Multiprotein Complexes Based on 15N Metabolic Labeling and Quantitative Mass Spectrometry

MALDI Sample Preparation: the Ultra Thin Layer Method

MALDI Provberedning: Ultra tunt lager Metod

This video demonstrates the preparation of an ultra-thin matrix/analyte layer for analyzing peptides and proteins by Matrix-Assisted Laser Desorption ...

A Quantitative Assessment of The Yeast Lipidome using Electrospray Ionization Mass Spectrometry

En kvantitativ bedömning av jästen Lipidome med elektrospray Spektrometri jonisation

Lipids are one of the major classes of biomolecules and play important roles membrane dynamics, energy storage, and signalling1-4. The budding yeast ...

Analyzing Large Protein Complexes by Structural Mass Spectrometry

Analysera stora proteinkomplex från struktur-masspektrometri

Living cells control and regulate their biological processes through the coordinated action of a large number of proteins that assemble themselves into an ...

Blue Native Polyacrylamide Gel Electrophoresis (BN-PAGE) for Analysis of Multiprotein Complexes from Cellular Lysates

Blue Native Polyacrylamide Gel Electrophoresis BN-PAGE for Analysis of Multiprotein Complexes from Cellular Lysates

Blå Native polyakrylamidgelelektrofores (BN-PAGE) för analys av Multiproteinkomplex från Cellular Lysates

Multiprotein complexes (MPCs) play a crucial role in cell signalling, since most proteins can be found in functional or regulatory complexes with other ...

Amide Hydrogen/Deuterium Exchange &amp; MALDI-TOF Mass Spectrometry Analysis of Pak2 Activation

Amide Hydrogen/Deuterium Exchange & MALDI-TOF Mass Spectrometry Analysis of Pak2 Activation

Amid Hydrogen / Deuterium Exchange och MALDI-TOF-masspektometri Analys av Pak2 Aktivering

Amide hydrogen/deuterium exchange (H/D exchange) coupled with mass spectrometry has been widely used to analyze the interface of protein-protein ...

A Protocol for the Identification of Protein-protein Interactions Based on 15N Metabolic Labeling, Immunoprecipitation, Quantitative Mass Spectrometry and Affinity Modulation

A Protocol for the Identification of Protein-protein Interactions Based on 15N Metabolic Labeling, Immunoprecipitation, Quantitative Mass Spectrometry and Affinity Modulation

Ett protokoll för identifiering av protein-proteininteraktioner Baserat på<sup&gt; 15</sup&gt; N metabolisk märkning, immunoutfällning, kvantitativa masspektrometri och Affinity modulering

Protein-protein interactions are fundamental for many biological processes in the cell. Therefore, their characterization plays an important role in ...

Metabolic Labeling and Membrane Fractionation for Comparative Proteomic Analysis of Arabidopsis thaliana Suspension Cell Cultures

Metabolic Labeling and Membrane Fractionation for Comparative Proteomic Analysis of Arabidopsis thaliana Suspension Cell Cultures

Metabola Märkning och Membrane Fraktione för jämförande proteomik analys av<em&gt; Arabidopsis thaliana</em&gt; Fjädring cellkulturer

Plasma membrane microdomains are features based on the physical properties of the lipid and sterol environment and have particular roles in signaling ...

The ChroP Approach Combines ChIP and Mass Spectrometry to Dissect Locus-specific Proteomic Landscapes of Chromatin

Den ChroP Approach Kombinerar Chip och masspektrometri att dissekera Locus-specifika Proteomic Landscapes of Chromatin

Chromatin is a highly dynamic nucleoprotein complex made of DNA and proteins that controls various DNA-dependent processes. Chromatin structure and ...

A New Technique for Quantitative Analysis of Hair Loss in Mice Using Grayscale Analysis

En ny teknik för kvantitativ analys av håravfall hos möss Använda gråskala Analys

Alopecia is a common form of hair loss which can occur in many different conditions, including male-pattern hair loss, polycystic ovarian syndrome, and ...

Quantification of Site-specific Protein Lysine Acetylation and Succinylation Stoichiometry Using Data-independent Acquisition Mass Spectrometry

Kvantifiering av platsspecifika Protein lysin acetylering och Succinylation stökiometri använder Data-oberoende förvärv masspektrometri

Post-translational modification (PTM) of protein lysine residues by N&#400;-acylation induces structural changes that can dynamically regulate protein ...