Name: an aquatic microbial metaproteomics workflow: from cells to tryptic peptides suitable for tandem mass spectrometry-based analysis
Uploaded: 2015-09-15T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about An Aquatic Microbial Metaproteomics Workflow: From Cells to Tryptic Peptides Suitable for Tandem Mass Spectrometry-based Analysis at JoVE.com

The authors would like to acknowledge Marcos Di Falco for his expertise and advice with the preparation of the samples for nano-LC MS/MS as well as Dr. Zoran Minic from the University of Regina for the LC MS/MS analysis. This work was supported by NSERC (DG402214-2011) and CRC (950-221184) funding. D.C. was supported by Concordia Institute for Water, Energy, and Sustainable Systems and FQRNT.

1. अभिकर्मकों की तैयारी <ol><li> एसडीएस निकासी समाधान तैयार: 0.1 एम Tris एचसीएल पीएच 7.5, 5% ग्लिसरॉल, 10 मिमी EDTA और 1% एसडीएस। 4 डिग्री सेल्सियस पर 0.22 माइक्रोन फिल्टर और दुकान का उपयोग कर फ़िल्टर बाँझ। </li><li> Polyacrylamide जेल के लिए ...

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	<li>Madsen, E. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microorganisms+and+their+roles+in+fundamental+biogeochemical+cycles.">Microorganisms and their roles in fundamental biogeochemical cycles.</a> Current opinion in biotechnology. 22 (3), 456-464 (2011).</li><li>El-Swais, H., Dunn, K. A., Bielawski, J. P., Li, W. K. W., Walsh, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Seasonal+assemblages+and+short-lived+blooms+in+coastal+northwest+Atlantic+Ocean+bacterioplankton.">Seasonal assemblages and short-lived blooms in coastal northwest Atlantic Ocean bacterioplankton.</a> Environmental microbiology. , (2014).</li><li>Galand, P. E., Potvin, M., Casamayor, E. 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नमूना संरक्षण metaproteomic के अध्ययन के लिए महत्वपूर्ण है और पिछले काम एक शाही सेना स्थिरीकरण समाधान से पहले प्रोटीन निकासी के लिए 28 कोशिकाओं के भंडारण के लिए एक उपयोगी भंडारण बफर है कि प्रदर्शन किया। आदर...

सूक्ष्मजीवों सर्वव्यापी हैं और पृथ्वी की biogeochemical चक्र 1 में आवश्यक भूमिका निभाते हैं। वर्तमान में, माइक्रोबियल समुदाय संरचना और समारोह निस्र्पक के लिए उपलब्ध कई आणविक दृष्टिकोण हैं। 4 - सबसे आम -16 rRNA जीन का विश्लेषण पर्यावरण डीएनए 2 से पीसीआर प्रवर्धित दृश्यों है। -16 RRNA जीन विश्लेषण का एक नुकसान यह है कि यह केवल चयापचय समारोह पर कम जानकारी के साथ, वंशावली पहचान और समुदाय की संरचना के बारे में जानकारी प्रदान करता है। Metagenomics, metatranscriptomics और metaproteomics समुदाय संरचना और चयापचय के बारे में जानकारी उपलब्ध कराने के रूप में इसके विपरीत, इस तरह के दृष्टिकोण। 8 - metagenomics, या जीवों का एक संयोजन के जीन की सामग्री का विश्लेषण, समुदाय 5 की संरचना और कार्यात्मक क्षमता के बारे में जानकारी प्रदान करता है। शक्तिशाली है, यह कार्यात्मक संभावित चयापचय के अनुरूप नहीं हो सकता हैजीवों की गतिविधियों। एक जीव के जीनोटाइप आरएनए को लिखित और आगे एक phenotype में जिसके परिणामस्वरूप, प्रोटीन के लिए अनुवाद किया जा सकता है जिनमें से प्रत्येक की अपनी जीन, का प्रतिनिधित्व करती है। इस प्रकार, एक वातावरण में माइक्रोबियल कार्यात्मक गतिविधि की समझ में सहायता करने के लिए, बाद जीनोमिक विश्लेषण 9 प्रदर्शन किया जाना चाहिए। यह किसी भी वातावरण में लिखित रहे हैं जो जीन का पता चलता है, क्योंकि Metatranscriptomics, या शाही सेना टेप का विश्लेषण उपयोगी है। हालांकि, mRNA स्तर हमेशा की वजह से translational विनियमन, आरएनए आधा जीवन है, और कई प्रोटीन प्रतियां हर mRNA 10 के लिए उत्पन्न किया जा सकता है कि इस तथ्य को उनके इसी प्रोटीन के स्तर से मेल नहीं खाते। इन कारणों metaproteomics के लिए अब पर्यावरण माइक्रोबायोलॉजी के लिए एक महत्वपूर्ण उपकरण के रूप में मान्यता प्राप्त है। आम metaproteomic एक जटिल नमूने में प्रोटीन के पास पूर्ण पूरक आमतौर पर एन के माध्यम से, शुद्ध और एक साथ विश्लेषण कर रहे हैं, जहां एक बन्दूक प्रोटिओमिक दृष्टिकोण का उपयोग का विश्लेषण करती हैएक मास स्पेक्ट्रोमीटर पर पेप्टाइड्स और विश्लेषण में zymatic पाचन। इसके बाद मिलकर मास स्पेक्ट्रोमेट्री (एमएस / एमएस) &quot;पेप्टाइड फिंगरप्रिंटिंग&quot; खोज प्रोटीन डेटाबेस से पेप्टाइड अनुक्रम और मूल के संभावित प्रोटीन (एक समीक्षा के लिए 11 देखें) निर्धारित करने के लिए प्रयोग किया जाता है। प्रोटियोमिक काम जीनोमिक डेटा की उपलब्धता में वृद्धि हुई है और संवेदनशीलता और उच्च throughput प्रोटीन की पहचान और मात्रा का ठहराव 11,12 के लिए अनुमति मास स्पेक्ट्रोमीटर की सटीकता में वृद्धि करने के लिए पिछले 25 वर्षों के लिए धन्यवाद में एक लंबा सफर तय किया है। प्रोटीन जीन अभिव्यक्ति की अंतिम उत्पाद हैं, metaproteomic डेटा किसी भी पर्यावरण और क्या प्रोटीन वे व्यक्त कर रहे हैं में सक्रिय हैं, जो जीवों निर्धारित करने में मदद कर सकते हैं। पर्यावरण चर के एक विशेष सेट एक जीव या समुदाय के phenotype को कैसे प्रभावित करेगा निर्धारित करने की कोशिश करते हैं तो यह फायदेमंद है। शुरू में, सागर में एमएस / एमएस आधारित metaproteomic अध्ययनों लक्षित में विशिष्ट प्रोटीन की पहचान करने के लिए इस्तेमाल किया गयाSAR11 समुद्री बैक्टीरिया 13 में प्रकाश संचालित प्रोटॉन पंप proteorhodopsin पर ध्यान केंद्रित पहला अध्ययन के साथ माइक्रोबियल प्रजातियों। हाल ही में, तुलनात्मक metaproteomic विश्लेषण जटिल समुदायों के बीच अंतर प्रोटीन अभिव्यक्ति पैटर्न स्पष्ट कर दिया है। उदाहरण तटीय उत्तर पश्चिमी अटलांटिक महासागर में 14 या अंटार्कटिक प्रायद्वीप 5 में चयापचय में अस्थायी पारियों की पहचान शामिल है। अन्य अध्ययनों से एक उच्च उत्पादक तटीय उमड़ने सिस्टम 15 के लिए एक कम पोषक तत्व सागर चक्र से एक भौगोलिक आड़ा काट-साथ, उदाहरण के लिए, स्थानिक तराजू भर में प्रोटीन अभिव्यक्ति पैटर्न में बदलाव का वर्णन किया है। Metaproteomics के आगे समीक्षा के लिए हम श्नाइडर एट अल। (2010) 9 और विलियम्स एट अल। (2014) 16 सलाह देते हैं। लक्षित प्रोटिओमिक्स भी पर्यावरण 17,18 में विशिष्ट चयापचय मार्ग की अभिव्यक्ति यों के लिए हाल के वर्षों में नियोजित किया गया है। वहाँmetaproteomic विश्लेषण में तीन मुख्य चरणों कर रहे हैं ए। पहले चरण नमूना संग्रह, सेल और प्रोटीन की एकाग्रता भी शामिल है जो नमूना तैयार है। समुद्री सूक्ष्म जीव विज्ञान में नमूना संग्रह अक्सर सामान्यतः एक 0.22 माइक्रोन कारतूस के उपयोग के साथ, मुक्त रहने माइक्रोबियल कोशिकाओं के कब्जा करने के लिए निस्पंदन द्वारा पीछा बड़ा कोशिकाओं, कणों और कण-जुड़े बैक्टीरिया को दूर करने के लिए एक पूर्व फिल्टर के माध्यम से समुद्री जल का निस्पंदन जरूरत पर जोर देता फिल्टर यूनिट 19,20। ये फिल्टर एक प्लास्टिक सिलेंडर में incased कर रहे हैं और फिल्टर यूनिट के भीतर किया जा सकता है कि एक सेल और प्रोटीन निकासी प्रोटोकॉल एक महत्वपूर्ण उपकरण होगा। बायोमास प्राप्त हो जाने के बाद, कोशिकाओं में प्रोटीन निकासी के लिए अनुमति देने के लिए lysed किया जाना चाहिए। कई तरीकों guanidine एचसीएल सेल 21 और सोडियम dodecyl सल्फेट (एसडीएस) आधारित सेल तरीकों सहित, नियोजित किया जा सकता है। एसडीएस जैसे डिटर्जेंट, concentrati कई प्रोटीन प्रकार झिल्ली में खलल न डालें और solubilizing में बहुत कुशल हैं, यद्यपि0.1% नीचे की ओर प्रोटीन के पाचन और एमएस विश्लेषण 22 के साथ हस्तक्षेप कर सकते हैं के रूप में के रूप में कम ons। प्रमुख चिंता का विषय आयन स्रोत 23 के अंदर रिवर्स चरण तरल क्रोमैटोग्राफी और आयन दमन या संचय की शक्ति को हल करने, trypsin पाचन क्षमता पर एसडीएस के नकारात्मक प्रभाव है। दूसरे चरण में प्रोटीन प्रारंभिक tryptic पेप्टाइड के प्राथमिक अमीनो एसिड अनुक्रम का पता लगाने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है कि AM / Z विखंडन पैटर्न में जिसके परिणामस्वरूप, नियंत्रण रेखा एमएस / एमएस विश्लेषण के बाद enzymatic पाचन के अधीन हैं, जहां विभाजन और विश्लेषण है। विभिन्न पाचन तरीकों का इस्तेमाल किया डिटर्जेंट के प्रकार, साथ ही नीचे की ओर मास स्पेक्ट्रोमेट्री कार्यप्रवाह पर निर्भर किया जा सकता है। हमारे प्रोटोकॉल में, जेल से एसडीएस को हटाने के बाद 1-डी पृष्ठ वैद्युतकणसंचलन किसी भी डिटर्जेंट संक्रमण को दूर करने के लिए उपयोग किया जाता है। ऐसी झिल्ली प्रोटीन के रूप में, solubilize के लिए मुश्किल हो जाता है कि प्रोटीन का विश्लेषण, उच्च ध्यान केंद्रित के उपयोग की आवश्यकताएसडीएस या अन्य डिटर्जेंट की trations। इस एसडीएस जेल वैद्युतकणसंचलन साथ संगतता के मुद्दों की ओर जाता है। एक अध्ययन का उद्देश्य प्रोटीन solubilize करने के लिए इन मुश्किल के solubilization की आवश्यकता है, ट्यूब-जेल प्रणाली 22,24 इस्तेमाल किया जा सकता है। ट्यूब-जेल विधि वैद्युतकणसंचलन के उपयोग के बिना जेल मैट्रिक्स के भीतर प्रोटीन को शामिल किया गया। इसके बाद solubilization के लिए प्रयोग किया जाता है किसी भी डिटर्जेंट प्रोटीन के पाचन से पहले हटा रहे हैं। तीसरे चरण bioinformatic विश्लेषण है। इस चरण में एमएस / एमएस पेप्टाइड डेटा पेप्टाइड्स और प्रोटीन के नमूने में मौजूद हैं, जो निर्धारित करने के लिए अनुवाद न्यूक्लियोटाइड दृश्यों का एक डाटाबेस के खिलाफ की खोज कर रहे हैं। पेप्टाइड्स की पहचान इसके खिलाफ खोज की है डेटाबेस पर निर्भर है। समुद्री metaproteomic डेटा सामान्यतः संदर्भ जीनोम, जैसे ग्लोबल महासागर सैम्पलिंग डाटासेट के रूप में 25 metagenomic डेटा, साथ ही असभ्य ली से एकल कक्ष परिलक्षित जीनोम के शामिल डेटाबेस के खिलाफ की खोज कर रहे हैं26,27 neages। Metaproteomic डेटा 5 निकाली थी के रूप में प्रोटीन की पहचान भी एक ही नमूना से metagenomic दृश्यों का समावेश करके बढ़ाया जा सकता है। यहाँ हम माइक्रोबियल बायोमास से एमएस / एमएस आधारित विश्लेषण के लिए उपयुक्त पेप्टाइड्स निस्पंदन द्वारा एकत्र की है और एक शाही सेना स्थिरीकरण समाधान में संग्रहीत की पीढ़ी के लिए एक प्रोटोकॉल प्रदान करते हैं। यहाँ वर्णित प्रोटोकॉल डीएनए और प्रोटीन सभी कदम प्रोटीन करने के लिए अग्रणी और डीएनए बारिश के समान हैं, इसलिए है कि एक ही नमूना से अलग होने के लिए अनुमति देता है। केवल एक फिल्टर प्रोटीन और डीएनए निष्कर्षण दोनों के लिए आवश्यक है के बाद से एक व्यावहारिक दृष्टिकोण से, कम निस्पंदन की आवश्यकता है। हम भी इस प्रोटोकॉल दो पहले प्रकाशित प्रोटोकॉल का संयोजन, अनुकूलन और संशोधन के माध्यम से बनाया गया था कि स्वीकार करना चाहते हैं। सेल कदम (2011) 28। उल्लेख किया गया था एट अल से अनुकूलित कर रहे हैं और घटक को पचाने में जेल ट्रिप्सिन Shevche से अनुकूलित हैNKO एट अल। (2007) 29।

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Sterivex -GP 0.22 &#956;m filter unit</td>
			<td>Millipore</td>
			<td>SVGP01050</td>
			<td>Sampling</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAlater Stabilization Solution</td>
			<td>Ambion</td>
			<td>AM7021</td>
			<td>Sampling</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tris&#160;</td>
			<td>Bio Basic</td>
			<td>77-86-1 or TB0196-500G</td>
			<td>Protein Extraction/ SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DTT</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>D0632-1G</td>
			<td>Protein Extraction</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SDS</td>
			<td>Bio Basic</td>
			<td>15-21-3</td>
			<td>Protein Extraction/ SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>EDTA</td>
			<td>Bio Basic</td>
			<td>6381-92-6</td>
			<td>Protein Extraction</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycerol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>56-81-5</td>
			<td>Protein Extraction</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>10K Amicon Filter</td>
			<td>Millipore</td>
			<td>UFC801024</td>
			<td>Protein Extraction</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>179337-4L</td>
			<td>Protein Precipitation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetone</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>67-64-1</td>
			<td>Protein Precipitation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MPC Protein Precipitation reagent</td>
			<td>Epicenter</td>
			<td>mmP03750</td>
			<td>DNA Precipitation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>2-Propanol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>67-63-0</td>
			<td>DNA Precipitation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Qubit dsDNA BR Assay kit</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>Q32850</td>
			<td>DNA Quantification</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Qubit Protein Assay kit</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>Q33211</td>
			<td>Protein Quantification</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sucrose</td>
			<td>Bio Basic</td>
			<td>57-50-1</td>
			<td>SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TEMED</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>161-0800</td>
			<td>SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>APS</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>161-0700</td>
			<td>SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>30% Acrylamide</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>161-0158</td>
			<td>SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SimplyBlue SafeStain</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>LC6060</td>
			<td>SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycine</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>161-0718</td>
			<td>SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>B-mercaptoethanol</td>
			<td>Bio Basic</td>
			<td>60-24-2</td>
			<td>SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Laemmli Sample Buffer</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>161-0737</td>
			<td>SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Precision Plus Protein Kaleidoscope Ladder</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>161-0375EDU</td>
			<td>SDS PAGE gel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetonitrile</td>
			<td>VWR</td>
			<td>CABDH6044-4</td>
			<td>In-gel Trypsin digest</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NH4HCO3</td>
			<td>Bio Basic</td>
			<td>1066-33-7</td>
			<td>In-gel Trypsin digest</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DTT</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>D0632-1G</td>
			<td>In-gel Trypsin digest</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Formic Acid</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>F0507-500ML</td>
			<td>In-gel Trypsin digest</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HPLC grade H2O</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>270733-4L</td>
			<td>In-gel Trypsin digest</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Iodoacetamide</td>
			<td>Bio Basic</td>
			<td>144-48-9</td>
			<td>In-gel Trypsin digest</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trypsin</td>
			<td>Promega</td>
			<td>V5111</td>
			<td>In-gel Trypsin digest</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Protein LoBind Tube 1.5ml</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>22431081</td>
			<td>In-gel Trypsin digest</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>2mL ROBO vial 9mm</td>
			<td>Candian Life Science</td>
			<td>VT009/C395SB</td>
			<td>In-gel Trypsin digest</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PP BM insert, No spring</td>
			<td>Candian Life Science</td>
			<td>4025P-631</td>
			<td>In-gel Trypsin digest</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

an aquatic microbial metaproteomics workflow: from cells to tryptic peptides suitable for tandem mass spectrometry-based analysis

Meta-omic technologies such as metagenomics, metatranscriptomics and metaproteomics can aid in the understanding of microbial community structure and metabolism. Although powerful, metagenomics alone can only elucidate functional potential. On the other hand, metaproteomics enables the description of the expressed in situ metabolism and function of a community. Here we describe a protocol for cell lysis, protein and DNA isolation, as well as peptide digestion and extraction from marine microbial cells collected on a cartridge filter unit (such as the Sterivex filter unit) and preserved in an RNA stabilization solution (like RNAlater). In mass spectrometry-based proteomics studies, the identification of peptides and proteins is performed by comparing peptide tandem mass spectra to a database of translated nucleotide sequences. Including the metagenome of a sample in the search database increases the number of peptides and proteins that can be identified from the mass spectra. Hence, in this protocol DNA is isolated from the same filter, which can be used subsequently for metagenomic analysis.

एक प्रदर्शन के रूप में, हम सतह और उत्तरी कनाडा में तटीय समुद्र की क्लोरोफिल अधिकतम से एकत्र दो समुद्री जल के नमूने पर प्रोटोकॉल का प्रदर्शन किया। समुद्र में समुद्री जल के 6-7 एल 3 माइक्रोन GF / डी prefilter के माध्?...

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An Aquatic Microbial Metaproteomics Workflow: From Cells to Tryptic Peptides Suitable for Tandem Mass Spectrometry-based Analysis

This protocol is for the extraction and concentration of protein and DNA from microbial biomass collected from seawater, followed by the generation of tryptic peptides suitable for tandem mass spectrometry-based proteomic analysis.

एक जलीय माइक्रोबियल Metaproteomics कार्यप्रवाह: अग्रानुक्रम मास स्पेक्ट्रोमेट्री आधारित विश्लेषण के लिए उपयुक्त tryptic पेप्टाइड्स के लिए कोशिकाओं से

Meta-omic technologies such as metagenomics, metatranscriptomics and metaproteomics can aid in the understanding of microbial community structure and ...

Research

JoVE Journal

Environment

Characterization and Application of Passive Samplers for Monitoring of Pesticides in Water

विशेषता और निष्क्रिय Samplers के अनुप्रयोग पानी में कीटनाशकों की निगरानी के लिए

Five different water passive samplers were calibrated under laboratory conditions for measurement of 124 legacy and current used pesticides. This study ...

Alternative Method of Removing Otoliths from Sturgeon

स्टर्जन से Otoliths हटाने की वैकल्पिक विधि

Extracting the otoliths (ear bones) from fish that have very thick skulls can be difficult and very time consuming. The common practice of making a ...

Extraction and Analysis of Microbial Phospholipid Fatty Acids in Soils

निष्कर्षण और मिट्टी में माइक्रोबियल Phospholipid फैटी एसिड का विश्लेषण

Phospholipid fatty acids (PLFAs) are key components of microbial cell membranes. The analysis of PLFAs extracted from soils can provide information about ...

A Flow-through Exposure System for Evaluating Suspended Sediments Effects on Aquatic Life

जलीय जीवन पर निलंबित कर दिया मूल्यांकन के निक्षेपों प्रभाव के लिए एक प्रवाह के माध्यम से एक्सपोजर सिस्टम

This paper describes the Fish Larvae and Egg Exposure System (FLEES). The flow-through exposure system is used to investigate the effects of suspended ...

Basic Research in Plasma Medicine - A Throughput Approach from Liquids to Cells

प्लाज्मा चिकित्सा में बुनियादी अनुसंधान-तरल पदार्थ से कोशिकाओं को एक प्रवाह दृष्टिकोण

In plasma medicine, ionized gases with temperatures close to that of vertebrate systems are applied to cells and tissues. Cold plasmas generate reactive ...

Characterization of Aquatic Biofilms with Flow Cytometry

प्रवाह Cytometry के साथ जलीय फिल्म के लक्षण वर्णन

Biofilms are dynamic consortia of microorganism that play a key role in freshwater ecosystems. By changing their community structure, biofilms respond ...

Isolation and Analysis of Microbial Communities in Soil, Rhizosphere, and Roots in Perennial Grass Experiments

अलगाव और मिट्टी, Rhizosphere, और जड़ों में बारहमासी घास प्रयोगों में माइक्रोबियल समुदायों के विश्लेषण

Plant and soil microbiome studies are becoming increasingly important for understanding the roles microorganisms play in agricultural productivity. The ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

लार्वा मछली में व्यवहार प्रतिक्रिया प्रोफाइल की जांच के लिए प्रयोगात्मक प्रोटोकॉल: न्यूरो उत्तेजक कैफीन के लिए आवेदन

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Composition and Distribution Analysis of Bioaerosols Under Different Environmental Conditions

संरचना और विभिंन पर्यावरणीय स्थितियों के तहत, एयरोसोल्स के वितरण विश्लेषण

Variable microorganisms in particulate matter (PM) under different environmental conditions may have significant impacts on human health. In this study, ...

Identifying Per- and Polyfluorinated Chemical Species with a Combined Targeted and Non-Targeted-Screening High-Resolution Mass Spectrometry Workflow

एक संयुक्त लक्षित और गैर-लक्षित स्क्रीनिंग उच्च संकल्प मास स्पेक्ट्रोमेट्री कार्यप्रवाह के साथ प्रति और पॉलीफ्लोरीनेटेड रासायनिक प्रजातियों की पहचान

Historical and emerging per- and polyfluoroalkyl substances (PFASs) have garnered significant interest from the public and government agencies from the ...