Name: clinicopathological analysis of mirna expression in breast cancer tissues by using mirna in situ hybridization
Uploaded: 2016-06-07T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization at JoVE.com

This work was supported by the NIH grant (5R01 CA178386-03) and the USC ASPIRE-1 grant to HC. We would like to thank Vrushab Gowda for his assistance with manuscript.

Данное исследование было одобрено Институциональным наблюдательным советом из Чоннам больницы Университета Хвасун и Университета Южной Каролины. Образцы TMA, состоящие из рака молочной железы и совпавших соседних нормальных тканей молочной железы были предоставлены Биобанка из унив...

<ol>
	<li>Shah, N. R., Chen, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MicroRNAs+in+pathogenesis+of+breast+cancer:+Implications+in+diagnosis+and+treatment.">MicroRNAs in pathogenesis of breast cancer: Implications in diagnosis and treatment.</a> World J Clin Oncol. 5, 48-60 (2014).</li><li>Tang, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=miR-185+suppresses+tumor+proliferation+by+directly+targeting+E2F6+and+DNMT1+and+indirectly+upregulating+BRCA1+in+triple-negative+breast+cancer.">miR-185 suppresses tumor proliferation by directly targeting E2F6 and DNMT1 and indirectly upregulating BRCA1 in triple-negative breast cancer.</a> Mol Cancer Ther. 13, 3185-3197 (2014).</li><li>Ye, X. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Epigenetic+silencing+of+miR-375+induces+trastuzumab+resistance+in+HER2-positive+breast+cancer+by+targeting+IGF1R.">Epigenetic silencing of miR-375 induces trastuzumab resistance in HER2-positive breast cancer by targeting IGF1R.</a> BMC Cancer. 14, 134 (2014).</li><li>Oneyama, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MicroRNA-mediated+downregulation+of+mTOR/FGFR3+controls+tumor+growth+induced+by+Src-related+oncogenic+pathways.">MicroRNA-mediated downregulation of mTOR/FGFR3 controls tumor growth induced by Src-related oncogenic pathways.</a> Oncogene. 30, 3489-3501 (2011).</li><li>McGuire, A., Brown, J. A., Kerin, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Metastatic+breast+cancer:+the+potential+of+miRNA+for+diagnosis+and+treatment+monitoring.">Metastatic breast cancer: the potential of miRNA for diagnosis and treatment monitoring.</a> Cancer Metastasis Rev. 34, 145-155 (2015).</li><li>Quesne, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biological+and+prognostic+associations+of+miR-205+and+let-7b+in+breast+cancer+revealed+by+in+situ+hybridization+analysis+of+micro-RNA+expression+in+arrays+of+archival+tumour+tissue.">Biological and prognostic associations of miR-205 and let-7b in breast cancer revealed by in situ hybridization analysis of micro-RNA expression in arrays of archival tumour tissue.</a> J Pathol. 227, 306-314 (2012).</li><li>Fernandez, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=miR-340+inhibits+tumor+cell+proliferation+and+induces+apoptosis+by+targeting+multiple+negative+regulators+of+p27+in+non-small+cell+lung+cancer.">miR-340 inhibits tumor cell proliferation and induces apoptosis by targeting multiple negative regulators of p27 in non-small cell lung cancer.</a> Oncogene. 34, 3240-3250 (2015).</li><li>Yu, L., Zhang, J., Guo, X., Li, Z., Zhang, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MicroRNA-224+upregulation+and+AKT+activation+synergistically+predict+poor+prognosis+in+patients+with+hepatocellular+carcinoma.">MicroRNA-224 upregulation and AKT activation synergistically predict poor prognosis in patients with hepatocellular carcinoma.</a> Cancer Epidemiol. 38, 408-413 (2014).</li><li>Li, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=microRNA-146+up-regulation+predicts+the+prognosis+of+non-small+cell+lung+cancer+by+miRNA+in+situ+hybridization.">microRNA-146 up-regulation predicts the prognosis of non-small cell lung cancer by miRNA in situ hybridization.</a> Exp Mol Pathol. 96, 195-199 (2014).</li><li>Kriegel, A. J., Liang, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MicroRNA+in+situ+hybridization+for+formalin+fixed+kidney+tissues.">MicroRNA in situ hybridization for formalin fixed kidney tissues.</a> J Vis Exp. , e50785 (2013).</li><li>Ucar, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=miR-212+and+miR-132+are+required+for+epithelial+stromal+interactions+necessary+for+mouse+mammary+gland+development.">miR-212 and miR-132 are required for epithelial stromal interactions necessary for mouse mammary gland development.</a> Nat Genet. 42, 1101-1108 (2010).</li><li>Nuovo, G. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+situ+detection+of+microRNAs+in+paraffin+embedded,+formalin+fixed+tissues+and+the+co-localization+of+their+putative+targets.">In situ detection of microRNAs in paraffin embedded, formalin fixed tissues and the co-localization of their putative targets.</a> Methods. 52, 307-315 (2010).</li><li>Kierzek, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+influence+of+locked+nucleic+acid+residues+on+the+thermodynamic+properties+of+2'-O-methyl+RNA/RNA+heteroduplexes.">The influence of locked nucleic acid residues on the thermodynamic properties of 2'-O-methyl RNA/RNA heteroduplexes.</a> Nucleic Acids Res. 33, 5082-5093 (2005).</li><li>Fischer, A. H., Jacobson, K. A., Rose, J., Zeller, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Paraffin+embedding+tissue+samples+for+sectioning.">Paraffin embedding tissue samples for sectioning.</a> CSH Protoc. 2008, (2008).</li><li>Li, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sequential+expression+of+miR-182+and+miR-503+cooperatively+targets+FBXW7,+contributing+to+the+malignant+transformation+of+colon+adenoma+to+adenocarcinoma.">Sequential expression of miR-182 and miR-503 cooperatively targets FBXW7, contributing to the malignant transformation of colon adenoma to adenocarcinoma.</a> J Pathol. 234, 488-501 (2014).</li></ol>

Цель данного исследования состояла в том, чтобы определить уровень экспрессии микроРНК в тканях молочной железы с использованием микроРНК гибридизация. Следует отметить, что в этом эксперименте все условия были оптимизированы для ткани рака молочной железы. Дальнейшая оптимиза?...

Рак молочной железы является одним из наиболее распространенных злокачественных заболеваний, влияющих на женское население по всему земному шару. Более 1,3 миллиона случаев рака молочной железы сообщают каждый год по всему миру 1,2. Хотя опухолевые клетки традиционно считаются биологически гомогенным и высоко пролиферативные, стало очевидным, что рак молочной железы является генетически и клинически неоднородна. Устойчивость к распространенных противоопухолевых препаратов является отличительной чертой на поздних стадиях рака молочной железы, что приводит к смерти в большинстве пациентов через ее облегчения прогрессирования рака и метастазирования расстояния 3. MicroRNAs (миРНК) представляют собой класс небольших молекул РНК примерно длиной 22 нуклеотидов , которые регулируют экспрессию генов путем блокирования трансляции мРНК или опосредовать деградацию мРНК 4. Более 2000 различных микроРНК до сих пор были идентифицированы у людей, которые связаны с заболеваниями человека 5. Увеличивается массив исследований ВГАе показали , что микроРНК может функционировать в качестве онкогенов и опухолевых супрессоров и часто дизрегуляции в опухолях 6. микроРНК сильно влияет на все первичные онкогенеза, контролируя основные регуляторы клеточного цикла, старении, апоптоза и аутофагии, наряду с таковыми из опухолевых клеток моторики, инвазию и метастазирование 7. Выражение Аберрантная микроРНК было также связано с клиническими проявлениями , такими как стадия, дифференцировка, прогноза и ответа на адъювантной терапии 8. В частности, повышенная экспрессия микроРНК-146 коррелирует с плохим прогнозом при раке легкого пациентов 9. Другое исследование показало , что потеряли выражение микроРНК-let7b связана с злокачественными фенотипами и, как следствие, плохой выживаемости 6. Понимание типов клеток и структур, которые выражают микроРНК является важной частью понимания механики, через которые изменения в микроРНК выражение влияния клетки иткани фенотипы 10. Некоторые микроРНК найдены секретируется в стромальных клетках попадала в эпителиальных клетках и специфически воздействуют на их цели. В том же ключе, микроРНК-212 и микроРНК-132 секретируется стромы и регулировать эпителиальные-стромальных взаимодействий , необходимых для протоковой выроста в процессе развития молочной железы 11. Основная цель данной работы состоит в объяснении подробный протокол для выявления экспрессии микроРНК в тканях молочной железы с помощью микроРНК гибридизация. Мы оптимизировали все условия для анализа уровней экспрессии микроРНК-489 в образцах рака молочной железы пациента. С этой целью мы использовали DIG маркированы заперта кислоты (LNA) зонд нуклеиновой в нашем эксперименте. Некоторые из нуклеотидов имели модификацию МШУ, то есть, метиленовый мостик, соединяющий 2 &#39;атом кислорода и 4&#39; атом углерода рибозы основной цепи, которая фиксирует нуклеотид таким образом, что он остается &quot;запертой на месте&quot; после того, как гибридизации. В результате, это гораздо сложнеедля гибридизированных комплекс для денатурации 12,13.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="661">
	<tbody>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:216px;">ELF-97</td>
			<td style="width:159px;">Life technology&#160;</td>
			<td style="width:119px;">E6604</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">50X Denhard&#39;t&#160;</td>
			<td style="width:159px;">Life technology&#160;</td>
			<td align="right" style="width:119px;">750018</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">t-RNA</td>
			<td style="width:159px;">Roche</td>
			<td align="right" style="width:119px;">109541</td>
			<td>Reconstitute in DEPC water</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Herring Sperm DNA</td>
			<td style="width:159px;">Promega&#160;</td>
			<td style="width:119px;">D1815</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Roche Blocking&#160;</td>
			<td style="width:159px;">Roche</td>
			<td align="right" style="width:119px;">11096176001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">RVC</td>
			<td style="width:159px;">Fisher</td>
			<td style="width:119px;">50-812-650</td>
			<td>Before use spin down it at 16.1 RCF and take supernatant&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">miR-489 probe&#160;</td>
			<td style="width:159px;">Exiqon</td>
			<td style="width:119px;">38599-01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Nuclease free BSA</td>
			<td style="width:159px;">Roche&#160;</td>
			<td align="right" style="width:119px;">711454</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Primary antibody-anti DIG</td>
			<td style="width:159px;">Roche&#160;</td>
			<td align="right" style="width:119px;">11093274910</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Diethyl Pyrocarbonate&#160;</td>
			<td style="width:159px;">Sigma</td>
			<td align="right" style="width:119px;">1609478</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

clinicopathological analysis of mirna expression in breast cancer tissues by using mirna in situ hybridization

In this article, we describe a detailed protocol for miRNA detection in breast cancer tissue using in situ hybridization with a digoxigenin-labelled LNA (Locked Nucleic Acid) probe. The probe was recognized by anti-DIG alkaline phosphatase antibodies and later developed using alkaline phosphatase substrate producing fluorescence signals. Here we utilized miRNA in situ hybridization (MISH) technique to analyze expression of miR-489 in tissues from breast cancer patients. This technique can detect the localization of miRNA of interest in individual tissue samples. This technique can be used to compare the expression of desired miRNA in tumor tissue with that in adjacent normal tissue and to identify the specific structures responsible for expressing this miRNA. This technique can be very useful in answering certain clinical questions, such as role of specific miRNA in the development of cancer. Our results indicate that mammary epithelial cells express significantly higher levels of miR-489 than adjacent tumor cells.

ткани молочной железы человек был использован для определения экспрессии микроРНК-489. Были обнаружены молочной железы проток и эпителиальные клетки , чтобы выразить значительно более высокие микроРНК-489 уровней , чем соседние ткани опухоли у двух пациентов (рис 1А...

Watch this Scientific Journal Video about Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization at JoVE.com

Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization

Here we present a protocol to detect miRNA expression in breast cancer patient samples using miRNA in situ hybridization.

Анализ клинико-патологическими микроРНК выражения при раке молочной железы ТКАНЕЙ с помощью микроРНК<em&gt; В Ситу</em&gt; Гибридизация

In this article, we describe a detailed protocol for miRNA detection in breast cancer tissue using in situ hybridization with a digoxigenin-labelled LNA ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization

Oral Biofilm Analysis of Palatal Expanders by Fluorescence In-Situ Hybridization and Confocal Laser Scanning Microscopy

Устные Анализ биопленки небных расширителей по флуоресценции in-situ гибридизация и конфокальной лазерной сканирующей микроскопии

Confocal laser scanning microscopy (CLSM) of natural heterogeneous biofilm is today facilitated by a comprehensive range of staining techniques, one of ...

Multi-modal Imaging of Angiogenesis in a Nude Rat Model of Breast Cancer Bone Metastasis Using Magnetic Resonance Imaging, Volumetric Computed Tomography and Ultrasound

Мульти-модальных изображений ангиогенеза в обнаженной модели крысы из груди метастазы рака костей с помощью магнитного резонанса, компьютерной томографии Объемные и ультразвуковые

Angiogenesis is an essential feature of cancer growth and metastasis formation. In bone metastasis, angiogenic factors are pivotal for tumor cell ...

Profiling of Estrogen-regulated MicroRNAs in Breast Cancer Cells

Профилирование Эстроген-регулируемых микроРНК в клетках рака молочной железы

Estrogen plays vital roles in mammary gland development and breast cancer progression. It mediates its function by binding to and activating the estrogen ...

Quantification of Breast Cancer Cell Invasiveness Using a Three-dimensional (3D) Model

Quantification of Breast Cancer Cell Invasiveness Using a Three-dimensional 3D Model

Количественное определение клеток рака молочной железы инвазивности Использование трехмерной (3D) модель

It is now well known that the cellular and tissue microenvironment are critical regulators influencing tumor initiation and progression. Moreover, the ...

Carotid Artery Infusions for Pharmacokinetic and Pharmacodynamic Analysis of Taxanes in Mice

Сонной артерии Настои для Фармакокинетические и фармакодинамические анализ Таксаны в мышах

When proposing the use of a drug, drug combination, or drug delivery into a novel system, one must assess the pharmacokinetics of the drug in the study ...

Mammosphere Formation Assay from Human Breast Cancer Tissues and Cell Lines

Mammosphere Формирование анализа из рака молочной железы человека тканях и клеточных линий

Similar to healthy tissues, many blood and solid malignancies are now thought to be organised hierarchically, with a subset of stem-like cancer cells that ...

In Vivo and Ex Vivo Approaches to Study Ovarian Cancer Metastatic Colonization of Milky Spot Structures in Peritoneal Adipose

In Vivo and Ex Vivo Approaches to Study Ovarian Cancer Metastatic Colonization of Milky Spot Structures in Peritoneal Adipose

В Vivo и экс Vivo подходы к изучению рака яичников метастатического колонизации Млечного Местная структур в брюшной жировой

High-grade serous ovarian cancer (HGSC), the cause of widespread peritoneal metastases, continues to have an extremely poor prognosis; fewer than 30% of ...

Studying Pancreatic Cancer Stem Cell Characteristics for Developing New Treatment Strategies

Изучение рака поджелудочной железы стволовых клеток Характеристики для разработки новых стратегий лечения

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) contains a subset of exclusively tumorigenic cancer stem cells (CSCs) which have been shown to drive tumor ...

miRNA Expression Analyses in Prostate Cancer Clinical Tissues

микроРНК экспрессии анализ рака предстательной железы Клинические тканей

A critical challenge in prostate cancer (PCa) clinical management is posed by the inadequacy of currently used biomarkers for disease screening, ...

Systems Biology of Metabolic Regulation by Estrogen Receptor Signaling in Breast Cancer

Системная биология регулирования метаболическим путем эстрогеновых рецепторов Signaling при раке молочной железы

With the advent of the -omics approaches our understanding of the chronic diseases like cancer and metabolic syndrome has improved. However, effective ...