Name: assays for studying the role of vitronectin in bacterial adhesion and serum resistance
Uploaded: 2018-10-16T12:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Assays for Studying the Role of Vitronectin in Bacterial Adhesion and Serum Resistance at JoVE.com

Ce travail a été soutenu par des subventions de la Fondation d’Anna et Edwin Berger, Lars Hierta, O.E. et Edla Johansson Foundation, le Swedish Medical Research Council (accorder numéro K2015-57 X-03163-43-4, www.vr.se), la Fondation du Cancer à l’Université Hôpital de Malmö, la société physiographiques (de Forssman Fondation) et du Conseil de comté de Skåne Research and Development Foundation.

1. analyse des Vn comme Ligand protéine bactérienne de Surface
<ol><li>
Détection de Vn-fixation à la surface bactérienne à l’aide de cytométrie en flux Remarque : En cytométrie en flux, nous avons utilisé diffusion latérale et forward scatter pour porte des événements positifs. Pour examiner les interactions avec les Vn, Hif clinique isole (n = 10)7 ont été sélectionnés ainsi qu’e. coli BL21 (DE3) comme témoin négatif (Fig...

<ol>
	<li>Singh, B., Su, Y. C., Riesbeck, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Vitronectin+in+bacterial+pathogenesis:+a+host+protein+used+in+complement+escape+and+cellular+invasion.">Vitronectin in bacterial pathogenesis: a host protein used in complement escape and cellular invasion.</a> Mol. Microbiol. 78 (3), 545-560 (2010).</li><li>Hallstrom, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conserved+Patterns+of+Microbial+Immune+Escape:+Pathogenic+Microbes+of+Diverse+Origin+Target+the+Human+Terminal+Complement+Inhibitor+Vitronectin+via+a+Single+Common+Motif.">Conserved Patterns of Microbial Immune Escape: Pathogenic Microbes of Diverse Origin Target the Human Terminal Complement Inhibitor Vitronectin via a Single Common Motif.</a> PloS one. 11 (1), 0147709 (2016).</li><li>Su, Y. C., Hallstrom, B. M., Bernhard, S., Singh, B., Riesbeck, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Impact+of+sequence+diversity+in+the+Moraxella+catarrhalis.+UspA2/UspA2H+head+domain+on+vitronectin+binding+and+antigenic+variation.">Impact of sequence diversity in the Moraxella catarrhalis. UspA2/UspA2H head domain on vitronectin binding and antigenic variation.</a> Micro. Infect. 15 (5), 375-387 (2013).</li><li>Singh, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+fine-tuned+interaction+between+trimeric+autotransporter+haemophilus+surface+fibrils+and+vitronectin+leads+to+serum+resistance+and+adherence+to+respiratory+epithelial+cells.">A fine-tuned interaction between trimeric autotransporter haemophilus surface fibrils and vitronectin leads to serum resistance and adherence to respiratory epithelial cells.</a> Infect. Immun. 82 (6), 2378-2389 (2014).</li><li>Kohler, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Binding+of+vitronectin+and+Factor+H+to+Hic+contributes+to+immune+evasion+of+Streptococcus+pneumoniae.+serotype+3.">Binding of vitronectin and Factor H to Hic contributes to immune evasion of Streptococcus pneumoniae. serotype 3.</a> Thromb. haemostasis. 113 (1), 125-142 (2015).</li><li>Onelli, E., Citterio, S., O'Connor, J. E., Levi, M., Sgorbati, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flow+cytometry,+sorting+and+immunocharacterization+with+proliferating+cell+nuclear+antigen+of+cycling+and+non-cycling+cells+in+synchronized+pea+root+tips.">Flow cytometry, sorting and immunocharacterization with proliferating cell nuclear antigen of cycling and non-cycling cells in synchronized pea root tips.</a> Planta. 202 (2), 188-195 (1997).</li><li>Al-Jubair, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Haemophilus+influenzae+Type+f+Hijacks+Vitronectin+Using+Protein+H+To+Resist+Host+Innate+Immunity+and+Adhere+to+Pulmonary+Epithelial+Cells.">Haemophilus influenzae Type f Hijacks Vitronectin Using Protein H To Resist Host Innate Immunity and Adhere to Pulmonary Epithelial Cells.</a> J. Immunol. 195 (12), 5688-5695 (2015).</li><li>Martinez-Martin, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Technologies+for+Proteome-Wide+Discovery+of+Extracellular+Host-Pathogen+Interactions.">Technologies for Proteome-Wide Discovery of Extracellular Host-Pathogen Interactions.</a> J. Immunol. Res. 2017, 2197615 (2017).</li><li>Boleij, A., Laarakkers, C. M., Gloerich, J., Swinkels, D. W., Tjalsma, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Surface-affinity+profiling+to+identify+host-pathogen+interactions.">Surface-affinity profiling to identify host-pathogen interactions.</a> Infect. Immun. 79 (12), 4777-4783 (2011).</li><li>Abdiche, Y., Malashock, D., Pinkerton, A., Pons, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determining+kinetics+and+affinities+of+protein+interactions+using+a+parallel+real-time+label-free+biosensor,+the+Octet.">Determining kinetics and affinities of protein interactions using a parallel real-time label-free biosensor, the Octet.</a> Anal. Biochem. 377 (2), 209-217 (2008).</li><li>Sultana, A., Lee, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measuring+protein-protein+and+protein-nucleic+Acid+interactions+by+biolayer+interferometry.">Measuring protein-protein and protein-nucleic Acid interactions by biolayer interferometry.</a> Cur. Prot. Prot. Sc. 79, 11-26 (2015).</li><li>Su, Y. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Haemophilus+influenzae+acquires+vitronectin+via+the+ubiquitous+Protein+F+to+subvert+host+innate+immunity.">Haemophilus influenzae acquires vitronectin via the ubiquitous Protein F to subvert host innate immunity.</a> Mol. Microbiol. 87 (6), 1245-1266 (2013).</li><li>Ronander, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nontypeable+Haemophilus+influenzae+adhesin+protein+E:+characterization+and+biological+activity.">Nontypeable Haemophilus influenzae adhesin protein E: characterization and biological activity.</a> J. Infect. Dis. 199 (4), 522-531 (2009).</li><li>Sezonov, G., Joseleau-Petit, D., D'Ari, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Escherichia+coli+physiology+in+Luria-Bertani+broth.">Escherichia coli physiology in Luria-Bertani broth.</a> J. Bact. 189 (23), 8746-8749 (2007).</li><li>Fleury, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+a+Haemophilus+influenzae+factor+H-Binding+lipoprotein+involved+in+serum+resistance.">Identification of a Haemophilus influenzae factor H-Binding lipoprotein involved in serum resistance.</a> J. Imunol. 192 (12), 5913-5923 (2014).</li><li>Abdiche, Y., Malashock, D., Pinkerton, A., Pons, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determining+kinetics+and+affinities+of+protein+interactions+using+a+parallel+real-time+label-free+biosensor,+the+Octet.">Determining kinetics and affinities of protein interactions using a parallel real-time label-free biosensor, the Octet.</a> Anal. Biochem. 377 (2), 209-217 (2008).</li><li>Rich, R. L., Myszka, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Higher-throughput,+label-free,+real-time+molecular+interaction+analysis.">Higher-throughput, label-free, real-time molecular interaction analysis.</a> Anal. Biochem. 361 (1), 1-6 (2007).</li><li>McNamara, G., Difilippantonio, M. J., Ried, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microscopy+and+image+analysis.">Microscopy and image analysis.</a> Current protoc. Hum. Genet. , 4 (2005).</li><li>Lieber, M., Smith, B., Szakal, A., Nelson-Rees, W., Todaro, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+continuous+tumor-cell+line+from+a+human+lung+carcinoma+with+properties+of+type+II+alveolar+epithelial+cells.">A continuous tumor-cell line from a human lung carcinoma with properties of type II alveolar epithelial cells.</a> International J. Canc. 17 (1), 62-70 (1976).</li><li>Foster, K. A., Oster, C. G., Mayer, M. M., Avery, M. L., Audus, K. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+the+A549+cell+line+as+a+type+II+pulmonary+epithelial+cell+model+for+drug+metabolism.">Characterization of the A549 cell line as a type II pulmonary epithelial cell model for drug metabolism.</a> Exp. Cell Res. 243 (2), 359-366 (1998).</li><li>Su, Y. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Haemophilus+influenzae+P4+Interacts+With+Extracellular+Matrix+Proteins+Promoting+Adhesion+and+Serum+Resistance.">Haemophilus influenzae P4 Interacts With Extracellular Matrix Proteins Promoting Adhesion and Serum Resistance.</a> J. Infect. Dis. 213 (2), 314-323 (2016).</li><li>Singh, B., Al-Jubair, T., Morgelin, M., Thunnissen, M. M., Riesbeck, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+unique+structure+of+Haemophilus+influenzae+protein+E+reveals+multiple+binding+sites+for+host+factors.">The unique structure of Haemophilus influenzae protein E reveals multiple binding sites for host factors.</a> Infect. Immun. 81 (3), 801-814 (2013).</li><li>Vellaiswamy, M., Campagna, B., Raoult, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transmission+electron+microscopy+as+a+tool+for+exploring+bacterial+proteins:+model+of+RickA+in+Rickettsia+conorii.">Transmission electron microscopy as a tool for exploring bacterial proteins: model of RickA in Rickettsia conorii.</a> New Microbiolog. 34 (2), 209-218 (2011).</li><li>Pinne, M., Haake, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immuno-fluorescence+assay+of+leptospiral+surface-exposed+proteins.">Immuno-fluorescence assay of leptospiral surface-exposed proteins.</a> J. Vis. Exp. JoVE. (53), (2011).</li></ol>

Bactéries pathogènes recrutent Vn à la surface des cellules et d’utilisent ce régulateur de complément pour éviter les dépôts de facteurs du complément et l’achèvement du complexe membranaire attaque2. VN fonctionne aussi comme une molécule de pont entre les protéines de surface bactériennes et de récepteurs de surface cellulaire hôte, permettant ainsi des agents pathogènes d’adhérer à la surface des cellules épithéliales et par la suite servir de médiateur internalisati...

La vitronectine (Vn) est une glycoprotéine humaine importante impliqués dans le maintien de l’homéostasie par l’intermédiaire de la régularisation du système fibrinolytique. VN fonctionne aussi comme un régulateur de complément en inhibant la voie du complément terminal au cours de la formation d’un complexe C5b6-7 et la polymérisation de C9. Plusieurs bactéries pathogènes ont démontré que recruter Vn à la surface cellulaire comme moyen de résistance complément dépôt1,2,3. En outre, Vn fonctionne comme une molécule « sandwich » entre bactéries et récepteurs des cellules épithéliales hôte, favorisant ainsi l’adhérence et l’internalisation des pathogènes2,4,5. Liaison du Vn à la surface de la cellule bactérienne est véhiculée par d’autres protéines actuellement non identifiés. Élucider pleinement le rôle fonctionnel de Vn-liaison à l’évasion de la réponse immunitaire de tuyau exigera donc identification de protéines Vn-recrutement.
La première étape dans l’identification des protéines liant Vn est pour tester si un agent pathogène d’intérêt peut lier purifiée Vn. cytométrie en flux est une méthode pratique et simple pour déterminer si Vn est lié aux cellules de l’agent pathogène. Dans cette étude, nous avons évalué la liaison du Vn à divers Haemophilus influenzae type f (Hif) isolats cliniques6. La méthode décrite ici est quantitative et peut être utilisée pour distinguer la capacité de liaison d’une grande variété de souches bactériennes. Dans une étude précédente, nous avons caractérisé protéine H (PH) de Hif comme un liant Vn protéine7. Par conséquent, dans la présente étude, le potentiel de liaison Vn de mutants de type sauvage (WT) Hif et Hif M10Δ del/h ont été comparées en utilisant les protocoles décrits.
Lorsqu’il est déterminé qu’un pathogène lie Vn, la deuxième étape est de caractériser la surface proteome afin d’identifier des protéines liant le Vn potentiels. Une variété d’approches peut être utilisée pour ce but8,9, mais ces méthodes ne sont pas décrits dans le présent rapport. La méthode plus appropriée pour l’examen des interactions protéine-protéine est d’inoculation exprimer certaines protéines de surface bactériennes chez e. coli et purification par chromatographie d’affinité. Ici, nous utilisons des PH et ses interactions moléculaires Vn pour illustrer la méthode. Interactions entre recombinant PH et Vn furent caractérisées par une enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA)7 et une technique récemment développée d’exempte d’étiquette appelée bio-couche interférométrie (BLI)10,11. Alors que les tests ELISA peuvent servir à confirmer les interactions protéine-protéine, BLI fournit des données détaillées sur les paramètres cinétiques des interactions.
Afin d’étudier le rôle fonctionnel de Vn en adhérence bactérienne, deux dosages différents peuvent être utilisés. Le premier test décrit ici est une mesure directe de l’adhérence des bactéries sur des surfaces de verre enduit de Vn, tandis que le deuxième test examine l’adhérence à la surface des cellules épithéliales. Pour le premier test, lames de verre ont été revêtus de Vn, et la liaison du WT ou souches mutantes de Hif a été évaluée par microscopie et coloration de Gram. Cette technique permet de distinguer facilement bactéries basés sur la capacité de lier Vn12. Adhérence bactérienne aux cellules de mammifères a été analysée puis en ajoutant des bactéries cultivées sur une monocouche de cellules épithéliales alvéolaires de la type II ; attachement des bactéries a été évaluée en comptant le nombre de formatrices unités (UFC). Collés et intériorisées de bactéries peuvent être distinguées en présence ou en absence de Vn4,13.
Le rôle de l’acquisition de Vn en résistance au sérum bactérienne a été évalué par dosage sérique meurtre (c'est-à-dire, l’activité bactéricide de sérum). Afin d’évaluer l’importance de l’acquisition de Vn dans la résistance au sérum, l’activité bactéricide du sérum appauvris en Vn (VDS) a été comparée à celle du sérum humain normal (NHS). La méthode utilisée facilement distingue liant Vn contre bactéries non contraignant basés sur la résistance au sérum. Nous avons utilisé cette méthode pour étudier le rôle de Vn dans la résistance au sérum de plusieurs bactéries pathogènes4,12.
De nombreuses méthodes ont été rapportés pour l’étude des interactions hôte-pathogène. Nous décrivons ici un ensemble de protocoles qui peuvent être facilement adaptés à l’étude de tout agent pathogène afin d’évaluer le rôle de Vn dans la pathogenèse. Nous avons testé ces protocoles à l’aide de différents agents pathogènes, et Hif a été choisi comme exemple pour ce rapport.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:1013px;" width="1014">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">1.5 mL thermomixter</td>
			<td style="width:288px;">Eppendorf</td>
			<td style="width:119px;">5355</td>
			<td style="width:272px;">dry block heating and cooling shaker</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">5 mL polystyrene round-bottom tube&#160;</td>
			<td>BD Falcon</td>
			<td>60819-138</td>
			<td>12 &#215; 75 mm style</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:335px;">5% CO2 supplied incubator&#160;</td>
			<td style="width:288px;">Thermo Scientific&#160;</td>
			<td style="width:119px;">BBD6220</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;">6 mL polystyrene round-bottom tube&#160;</td>
			<td style="width:288px;">VWR</td>
			<td>89000-478</td>
			<td>12 &#215; 75 mm style with cap</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">24-well plates</td>
			<td style="width:288px;">BD Falcon</td>
			<td>08-772-1H</td>
			<td style="width:272px;">Cell culture grade</td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;width:335px;">30% Hydrogen peroxide (H2O2) solution</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">H1009-100ML</td>
			<td>Laboratory analysis grade</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:335px;">75 cm2 tissue culture flask</td>
			<td style="width:288px;">BD Falcon</td>
			<td>BD353136</td>
			<td>Vented</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">96 well black flat bottom plate</td>
			<td style="width:288px;">Greiner Bio-One</td>
			<td>655090</td>
			<td>Tissue culture treated &#181;Clear black plates</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">A549 Cell Line human</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">86012804-1VL</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Cell detachment enzyme (Accutase)&#160;</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>A6964-500ML</td>
			<td style="width:272px;">Cell Culture Grade</td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:335px;">AR2G sensors</td>
			<td style="width:288px;">Pall Life Science</td>
			<td>18-5095</td>
			<td style="width:272px;">Sensor to immobilized protein by amino coupling&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">Acetone</td>
			<td style="width:288px;">VWR</td>
			<td>97064-786</td>
			<td>Analysis grade</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Bovine Serum Albumins (BSA)</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>A2058</td>
			<td style="width:272px;">Suitable for cell culture</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">Bibulous paper&#160;</td>
			<td style="width:288px;">VWR</td>
			<td>28511-007</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:335px;">Bio-layer interferometer</td>
			<td style="width:288px;">Pall Life Science</td>
			<td style="width:119px;">FB-50258</td>
			<td style="width:272px;">Bilayer interferometry measuring equipment</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;">Crystal violet solution</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>HT90132-1L</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">C4BP (C4b binding protein)</td>
			<td style="width:288px;">Complement Technology, Inc.</td>
			<td style="width:119px;">A109</td>
			<td>Bought as Frozen liquid form</td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;width:335px;">Calcium chloride (CaCl2)</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>C5670-500G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Carbol-fuchsin solution</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>HT8018-250ML</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Citric acid</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>251275-500G</td>
			<td>American Chemical Society (ACS) grade</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Decolorizing solution</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>75482-250ML-F</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">E. coli host (E. Coli BL21)</td>
			<td style="width:288px;">Novagen</td>
			<td>69450-3</td>
			<td>Protein expression host</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">F12 medium</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>D6421</td>
			<td style="width:272px;">Cell Culture Grade</td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:335px;">Flow cytometer&#160;</td>
			<td style="width:288px;">BD Biosciences</td>
			<td style="width:119px;">651154</td>
			<td style="width:272px;">Cell analysis grade for research applications&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Fetal Calf Serum (FCS)</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>12003C</td>
			<td style="width:272px;">Suitable for cell culture</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Normal human serum (NHS)</td>
			<td style="width:288px;">Complement Technology, Inc.</td>
			<td>NHS</td>
			<td style="width:272px;">Pooled human serum</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">FITC-conjugated donkey anti-sheep antibodies&#160;</td>
			<td style="width:288px;">AbD Serotec</td>
			<td>STAR88F</td>
			<td style="width:272px;">Polyclonal</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Gentamicin</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>G1397</td>
			<td style="width:272px;">Cell culture grade</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;">Glucose</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">G8270-1KG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Gelatin</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>G9391</td>
			<td>Suitable for cell culture</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Hemocytometer</td>
			<td style="width:288px;">Marienfeld</td>
			<td>640210</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">HRP-conjugated anti-His tag antibodies</td>
			<td style="width:288px;">Abcam</td>
			<td style="width:119px;">ab1269</td>
			<td style="width:272px;">Polyclonal</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">Human factor H</td>
			<td style="width:288px;">Complement Technology, Inc.</td>
			<td style="width:119px;">A137</td>
			<td>Bought as Frozen liquid form</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">C4BP</td>
			<td style="width:288px;">Complement Technology, Inc.</td>
			<td style="width:119px;">A109</td>
			<td>Frozen solution</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Human serum albumin</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">A1653-10G</td>
			<td>lyophilized powder</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Histidine affinity resin column (HisTrap HP)</td>
			<td style="width:288px;">GE Health Care Life Science</td>
			<td style="width:119px;">17-5247-01</td>
			<td>Columns prepacked with Ni Sepharose</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">His-tagged PH</td>
			<td style="width:288px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>Recombinantly expressed and purified in our lab</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Iodine solution</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>HT902-8FOZ</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">Methanol</td>
			<td style="width:288px;">VWR</td>
			<td>BDH1135-1LP</td>
			<td>Analysis grade</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">&#160;Microscope</td>
			<td style="width:288px;">Olympus</td>
			<td style="width:119px;">IX73</td>
			<td style="width:272px;">Inverted microscope</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Microscope slides</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>S8902</td>
			<td style="width:272px;">plain, size 25 mm &#215; 75 mm&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;width:335px;">Magnesium chloride (MgCl2)</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>M8266-1KG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Plasmid containg C terminal 6x His-tag on the backbone (pET26(b))</td>
			<td style="width:288px;">Novagen</td>
			<td>69862-3</td>
			<td>DNA vector</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Polysorb microtitre plates&#160;</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>M9410</td>
			<td style="width:272px;">For ELISA</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Potassium hydroxide (KOH)</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">6009</td>
			<td>American Chemical Society (ACS) grade</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Sheep anti-human Vn antibodies</td>
			<td style="width:288px;">AbD Serotec</td>
			<td>AHP396</td>
			<td style="width:272px;">Polyclonal</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">Shaker&#160;</td>
			<td style="width:288px;">Stuart Scientific</td>
			<td style="width:119px;">STR6</td>
			<td>Platform shaker</td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;width:335px;">Tissue culture flask</td>
			<td style="width:288px;">BD Falcon</td>
			<td style="width:119px;">3175167</td>
			<td style="width:272px;">75 cm2</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">&#160;Thermomixer&#160;</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>T3317</td>
			<td>Dry block heating and cooling shaker</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:335px;">Tetramethylbenzidine</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>860336-100MG</td>
			<td>ELISA grade</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:335px;">Vitronectin (Vn) from human plasma</td>
			<td style="width:288px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>V8379-50UG</td>
			<td>cell culture grade</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

assays for studying the role of vitronectin in bacterial adhesion and serum resistance

Bactéries utilisent le complément régulateurs comme un moyen d’échapper à la réponse immunitaire hôte. Nous décrivons ici les protocoles d’évaluation de l’acquisition de vitronectine de rôle aux fois surface de cellule bactérienne dans la résistance pour le système immunitaire. Expériences de cytométrie de flux identifié la vitronectine plasma humain comme ligand pour la protéine de membrane externe du récepteur bactérien H d’Haemophilus influenzae type f. Un dosage immuno-enzymatique a été utilisé pour caractériser les interactions protéine-protéine purifiée de la protéine recombinante H mettant aux prises la vitronectine et affinité a été évaluée en utilisant l’interférométrie bio-couche. L’importance biologique de la liaison de la vitronectine à H la protéine à la surface des cellules bactériennes à l’évasion de la réponse immunitaire hôte a été confirmée à l’aide d’un test de résistance de sérum avec sérum humain normal et appauvri la vitronectine. L’importance de la vitronectine dans l’adhérence bactérienne a été analysée à l’aide de lames de verre, avec ou sans revêtement de vitronectine, suivie par la coloration de Gram. Enfin, l’adhérence bactérienne aux monocouches de cellules épithéliales alvéolaires humains a été étudiée. Les protocoles décrits ici peuvent être facilement adaptés à l’étude de toutes les espèces bactériennes d’intérêt.

VN-fixation à la surface des bactéries a été déterminée par cytométrie en flux. Hif tous les isolats cliniques testés dans cette étude a recruté Vn à la surface des cellules. Aucune interaction de Vn avec la surface cellulaire a été observée pour la souche de contrôle négatif d’e. coli (Figure 1A). Comme illustré à la Figure 1B, le PH est une protéine liant Vn majeur...

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Assays for Studying the Role of Vitronectin in Bacterial Adhesion and Serum Resistance

Ce rapport décrit les protocoles pour caractériser les interactions entre les protéines de membrane externe bactérienne et la vitronectine régulateur de complément humain. Les protocoles peuvent être utilisés pour étudier les réactions de la liaison et la fonction biologique de la vitronectine dans n’importe quelle espèce bactérienne.

Dosages pour étudier le rôle de la vitronectine dans adhésion bactérienne et la résistance au sérum

Bacteria utilize complement regulators as a means of evading the host immune response. Here, we describe protocols for evaluating the role vitronectin ...

Cette méthode peut aider à répondre à des questions clés dans le domaine de l’interaction hôte-pathogène, comme la façon dont les pathogènes bactériens causent la maladie chez l’homme en utilisant des protéines humaines. Le principal avantage de cette technique est qu’elle peut répondre si un agent pathogène peut utiliser vitronectin pour établir l’infection de l’hôte. Nous nous concentrerons sur vitronectin, une protéine hôte qui prend part à la matrice extracellulaire, mais fonctionne également comme un inhibiteur de complément dans la voie déterminante de l’activation de complément.Ces faits sont très importants et très attrayants pour les agents pathogènes causant des maladies chez l’homme. Pour se préparer à la cytométrie d’écoulement, résuspendez les granulés bactériens avec 50 microlitres de tampon bloquant contenant 250 nanomolaire vitronectin. Ensuite, incuber les échantillons pendant une heure à température ambiante sans trembler.Après l’incubation, pelleter les bactéries par centrifugation à 3500 g pendant cinq minutes. Ensuite, lavez les granulés trois fois à l’aide de PBS et d’étapes de centrifugation similaires. Après le lavage, ajouter 50 microlitres d’anticorps polyclonals vitronectin antihumains de moutons primaires à la pastille bactérienne à une à 100 dilution dans PBS BSA.Incuber la suspension pendant une heure à température ambiante. Ensuite, lavez les bactéries trois fois avec PBS pour éliminer les anticorps non liés. Ensuite, ajouter 50 microlitres de PBS BSA contenant de la fluorescéine isothiocyanate conjugué âne anticorps polyclonal à la pastille.Incuber à température ambiante pendant une heure dans l’obscurité. Enfin, après trois étapes de lavage, réutiliser la pastille bactérienne avec 300 microlitres de PBS et analyser par cytométrie d’écoulement. Pour se préparer à l’ELISA, distribuez 100 microlitres de solution protéique dans chaque puits d’une plaque de microtiter PolySorp.Fermez la plaque avec le couvercle et conservez-la à quatre degrés Celsius pendant la nuit pour faciliter l’immobilisation des protéines sur les puits de plaques de microtiter. Jetez la solution de la plaque de microtiter en s’inclinant à l’envers sur l’évier. Ensuite, lavez les puits trois fois avec 300 microlitres de PBS par puits.Bloquer les puits enduits pendant une heure à température ambiante avec PBS contenant 2,5 pour cent de volume de poids BSA. Après avoir enlevé la solution de blocage, lavez les puits trois fois avec 300 microlitres de PBST par puits. Maintenant, ajoutez 100 microlitres de 50 nanomolaires recombinant son-marqué PH à chaque échantillon.Dans les puits de contrôle, ajouter seulement 100 microlitres de PBS BSA. Incuber la plaque pendant une heure à température ambiante. Après l’incubation, jetez la solution protéique et éliminez les protéines non liées en lavant les puits trois fois avec 300 microlitres de PBST par puits.Ensuite, ajoutez 100 microlitres de PBS BSA contenant du peroxydidase de radis de cheval conjugué anti-ses anticorps polyclonals. Après avoir couvé pendant une heure à température ambiante, lavez les puits trois fois avec 300 microlitres de PBST par puits. Détecter les complexes antigènes-anticorps en ajoutant 100 microlitres de réagen de détection ELISA à chaque puits.Ensuite, ajouter 50 microlitres d’un acide sulfurique molaire par puits pour arrêter la réaction. Mesurez la densité optique des puits à 450 nanomètres à l’aide d’un lecteur de microplaque. Immobiliser la vitronectine humaine sur des capteurs réactifs à l’amine en utilisant la méthode de couplage de l’amine selon les directives du fabricant.À l’aide de PBS, diluer en série le ligand PH recombinant de zéro à quatre micromolaires et transférer les solutions qui en résultent à une plaque de microtiter noir à fond plat de 96 puits. Exécutez l’expérience à 30 degrés Celsius à l’aide d’un instrument d’interférométrie de biocque. Pipette 10 microlitres d’une solution de deux microgrammes par millilitre de Vitronectin dans PBS sur une lame de microscope en verre comme une seule goutte.Laisser sécher la goutte sur la lame pendant 30 minutes à température ambiante. Lavez les glissières en verre enduites de protéines trois fois en les trempant dans un bécher contenant du PBS pendant deux secondes pour éliminer l’excès de protéines non enrobées. Maintenant, ajoutez 10 millilitres d’une culture Hif fraîche dans une boîte de Pétri en plastique stérile et submergez les glissières en verre enduit dans le milieu culturel.Incuber les plats à 37 degrés Celsius pendant une heure avec des secousses à 20 RPM. Après l’incubation, éliminez les bactéries non liées en plongeant les glissières trois fois dans un bécher rempli de PBS avant de visualiser les bactéries liées par gram tacher tel que décrit dans le protocole de texte. Culture A549 cellules épithéliales telles que décrites dans le protocole de texte.Après un lavage et une trypsinisation des cellules à 37 degrés Celsius, diluer la suspension cellulaire à 5000 cellules par millilitre à l’aide d’un milieu complet contenant cinq microgrammes par millilitre de génycine. Avant l’infection bactérienne, remplacer le milieu dans les puits par F12 moyen et incuber pendant la nuit à 37 degrés Celsius. Lavez la monocouche cellulaire trois fois avec un millilitre de PBS à température ambiante.Ensuite, placez la plaque sur la glace et 200 microlitres de milieu F12 pré-réfrigéré contenant 10 microgrammes par millilitre de Vitronectin. Après avoir couvé la plaque à quatre degrés Celsius pendant une heure, jetez la solution par pipetting et lavez la couche cellulaire deux fois avec un millilitre de PBS à température ambiante. Ajouter 100 microlitres de type sauvage Hif fraîchement cultivé dans le milieu F12 à chaque puits.Incuber la plaque pendant deux heures à 37 degrés Celsius. Ensuite, aspirez le milieu avec une pipette et lavez les cellules épithéliales A549 trois fois avec PBS. Ajouter 50 microlitres par puits de solution de détachement cellulaire et suivre avec une incubation de cinq minutes à 37 degrés Celsius.Ensuite, ajouter 50 microlitres de F12 milieu complet par puits pour arrêter la réaction enzymatique. Transférer les cellules épithéliales de chaque puits dans un tube de verre de six millilitres contenant quatre perles de verre. Lyse les cellules à température ambiante en tourbillonnant pendant deux minutes.Après diluer la cellule lysate 100 fois, plaque 10 microlitres de l’échantillon dilué sur une plaque d’agar au chocolat. Comptez les colonies après une incubation nocturne à 37 degrés Celsius. Effectuer l’analyse de la résistance dépendante de vitronectin à l’activité bactérienne du sérum humain, la première culture et pelleter les bactéries comme décrit dans le protocole de texte.Après centrifugation, resuspendez la pastille bactérienne avec un volume de tampon Dextrose-Gélatine-Veronal. Maintenant, ajoutez 1500 CFU de bactéries à 100 microlitres de DGVB plus plus contenant 5% de sérum. Incuber l’échantillon à 37 degrés Celsius pendant 15 minutes en secouant à 300 RPM.Retirer un aliquot de 10 microlitres du mélange de réaction à zéro minute et 15 minutes. Déposer l’aliquot sur une agar au chocolat et incuber l’assiette à 37 degrés Celsius pendant la nuit. Après l’incubation des plaques d’agar au chocolat, comptez les colonies apparaissant dans les assiettes et calculez le pourcentage de bactéries tuées tel que décrit dans le protocole textuel.Tous les isolats cliniques Hif testés dans cette étude ont recruté vitronectin à la surface de la cellule tel que déterminé par la cytométrie de flux. La liaison de Vitronectin par la souche de type sauvage Hif a provoqué un changement dans la population alors que le mutant n’a pas lié Vitronectin. Les interactions protéine-protéine entre la protéine ph et la vitronectin, protéine liant la vitro majeure, ont été estimées par ELISA.Les résultats indiquent une interaction significative entre PH et vitronectin et le contrôle positif par rapport au contrôle négatif. L’interaction entre PH et Vitronectin a été estimée en temps réel à l’aide de l’interférométrie de biocque pour avoir une affinité de 2,2 micromolaires. En outre, l’expression bactérienne manquante de PH sur la surface de cellules a montré l’adhérence réduite aux surfaces en verre vitronectin-enduites par rapport aux cellules sauvages de type.En outre, la présence de Vitronectin à la surface des cellules épithéliales a considérablement amélioré l’adhérence de Hif. Pour estimer l’activité inhibitrice complète de Vitronectin, le meurtre sérique- médiatisé a été examiné. Les cellules Hif de type sauvage présentaient une résistance au sérum plus élevée que les cellules mutantes.Aucune bactérie n’a été tuée en présence de sérum inactivé par la chaleur. Fait intéressant, le type sauvage Hif a montré la survie réduite dans le sérum vitronectin-épuisé et le réapprovisionnement de Vitronectin a augmenté la survie bactérienne. Cependant, la souche mutante n’a pas répondu à l’épuisement de Vitronectin parce qu’elle ne pouvait pas recruter vitronectin à la surface de cellules.Une fois maîtrisée, cette technique peut être faite en trois à quatre jours pour n’importe quel agent pathogène et n’oubliez pas d’utiliser la culture fraîche des pathogènes bactériens. Après avoir regardé cette vidéo, vous devriez avoir une bonne compréhension sur la façon d’analyser la liaison Vitronectin à un agent pathogène. En plus de cette technique, les protéines de surface liant la vitronectine des bactéries peuvent être identifiées en utilisant la protéomique et le ballonnement occidental.Cette technique est importante pour les chercheurs dans le domaine de l’interaction hôte-pathogène et aussi pour explorer le mécanisme de virulence chez les bactéries.

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

In Vitro Assay of Bacterial Adhesion onto Mammalian Epithelial Cells

In Vitro Assay of Bacterial Adhesion onto Mammalian Epithelial Cells

Test in vitro de l&#39;adhésion bactérienne sur des mammifères cellules épithéliales

To cause infections, bacteria must colonize their host. Bacterial pathogens express various molecules or structures able to promote attachment to host ...

Recherche

Immunologie et infection

Amplifying and Quantifying HIV-1 RNA in HIV Infected Individuals with Viral Loads Below the Limit of Detection by Standard Clinical Assays

Amplifier et quantifier l&#39;ARN VIH-1 chez les individus infectés par le VIH ayant une charge virale sous le seuil de détection par Standard tests cliniques

Amplifying viral genes and quantifying HIV-1 RNA in HIV-1 infected individuals with viral loads below the limit of detection by standard assays (below ...

Introducing Shear Stress in the Study of Bacterial Adhesion

Présentation de contrainte de cisaillement dans l&#39;étude de l&#39;adhésion bactérienne

During bacterial infections a sequence of interactions occur between the pathogen and its host. Bacterial adhesion to the host cell surface is often the ...

One-day Workflow Scheme for Bacterial Pathogen Detection and Antimicrobial Resistance Testing from Blood Cultures

Schéma de flux de travail d&#39;une journée pour la détection de pathogènes et des bactéries tests de résistance antimicrobienne à partir d&#39;hémocultures

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	Nonhost disease resistance of plants against bacterial pathogens is controlled by complex defense pathways. Understanding this mechanism is important ...

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Statique Essai d&#39;adhésion pour l&#39;étude de l&#39;intégrine activation dans les lymphocytes T

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In Vitro and In Vivo Model to Study Bacterial Adhesion to the Vessel Wall Under Flow Conditions

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In vitro et in vivo modèle pour étudier l&#39;adhésion bactérienne au navire muraux dans des conditions de débit

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Assay of Adhesion Under Shear Stress for the Study of T Lymphocyte-Adhesion Molecule Interactions

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