Name: examination of host phenotypes in gambusia affinis following antibiotic treatment
Uploaded: 2017-02-22T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment at JoVE.com

This project was partially funded by a FAST (Faculty and Student Team) Award to TPP and JMC from EURECA (Center for Enhancing Undergraduate Research Experiences and Creative Activities) at Sam Houston State University.

Alla djurförsök utfördes under godkännande av IACUC protokoll, numrerade 14-05-05-1018-3-01, 13-04-29-1018-3-01 och 14-04-17-1018-3-01. 1. Animaliska insamling, hantering och etisk Care <ol><li> Samla Gambusia affinis från fält webbplats (identifiering guide på http://www.sms.si.edu/irlspec/Gambusia_affinis.htm) med en liten dip net och plats i 19 L hinkar. Använd visuell inspektion för att identifiera arter. </li><li> Resten fisk för 1-2 d i en hink med damm vatten. Efteråt överföra fisk...

<ol>
	<li>Panda, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Short-Term+Effect+of+Antibiotics+on+Human+Gut+Microbiota.">Short-Term Effect of Antibiotics on Human Gut Microbiota.</a> PloS ONE. 9 (4), 95476 (2014).</li><li>Perez-Cobas, A. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gut+microbiota+disturbance+during+antibiotic+therapy:+a+multi-omic+approach.">Gut microbiota disturbance during antibiotic therapy: a multi-omic approach.</a> Gut. 62 (11), 1591-1601 (2013).</li><li>Theriot, C. M., Young, V. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+and+metabolic+interactions+between+the+gastrointestinal+tract+and+Clostridium+difficile+infection.">Microbial and metabolic interactions between the gastrointestinal tract and Clostridium difficile infection.</a> Gut Microbes. 5 (1), 86-95 (2014).</li><li>Buffie, C. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Precision+microbiome+reconstitution+restores+bile+acid+mediated+resistance+to+Clostridium+difficile.">Precision microbiome reconstitution restores bile acid mediated resistance to Clostridium difficile.</a> Nature. 517, 205-208 (2015).</li><li>Sekirov, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antibiotic-Induced+Perturbations+of+the+Intestinal+Microbiota+Alter+Host+Susceptibility+to+Enteric+Infection.">Antibiotic-Induced Perturbations of the Intestinal Microbiota Alter Host Susceptibility to Enteric Infection.</a> Infect Immun. 76 (10), 4726-4736 (2008).</li><li>Looft, T., Allen, H. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Collateral+effects+of+antibiotics+on+mammalian+gut+microbiomes.">Collateral effects of antibiotics on mammalian gut microbiomes.</a> Gut Microbes. 3 (5), 463-467 (2012).</li><li>Magnadottir, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Innate+immunity+of+fish.">Innate immunity of fish.</a> Fish Shellfish Immunol. 20 (2), 137-151 (2006).</li><li>Gomez, D., Sunyer, J., Salinas, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+mucosal+immune+system+of+fish:+the+evolution+of+tolerating+commensals+while+fighting+pathogens.">The mucosal immune system of fish: the evolution of tolerating commensals while fighting pathogens.</a> Fish Shellfish Immunol. 35 (6), 1729-1739 (2013).</li><li>Nunes, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Acute+Effects+of+Tetracycline+Exposure+in+the+Freshwater+Fish+Gambusia+holbrooki:+Antioxidant+Effects,+Neurotoxicity+and+Histological+Alterations.">Acute Effects of Tetracycline Exposure in the Freshwater Fish Gambusia holbrooki: Antioxidant Effects, Neurotoxicity and Histological Alterations.</a> Arch Environ Contam Toxicol. 68 (2), 331-381 (2014).</li><li>Fryxell, D. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sex+ratio+variation+shapes+the+ecological+effects+of+a+globally+introduced+freshwater+fish.">Sex ratio variation shapes the ecological effects of a globally introduced freshwater fish.</a> Proc Biol Sci. , 22 (2015).</li><li>Nunes, B., Miranda, M. T., Correia, A. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Absence+of+effects+of+different+types+of+detergents+on+the+cholinesterase+activity+and+histological+markers+of+mosquitofish+(Gambusia+holbrooki)+after+a+sub-lethal+chronic+exposure.">Absence of effects of different types of detergents on the cholinesterase activity and histological markers of mosquitofish (Gambusia holbrooki) after a sub-lethal chronic exposure.</a> Environ Sci Pollu Res Int. , 1-8 (2016).</li><li>Leonard, A. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Skin+Microbiome+of+Gambusia+affinis+Is+Defined+and+Selective.">The Skin Microbiome of Gambusia affinis Is Defined and Selective.</a> Adv Microbiol. 4, 335-343 (2014).</li><li>Carlson, J. M., Hyde, E. R., Petrosino, J. F., Manage, A. B. W., Primm, T. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+host+effects+of+Gambusia+affinis+with+an+antibiotic-disrupted+microbiome.">The host effects of Gambusia affinis with an antibiotic-disrupted microbiome.</a> Comp Biochem Physiol C Toxicol Pharmacol. 178, 163-168 (2015).</li><li>Karsi, A., Gulsoy, N., Corb, E., Dumpala, P. R., Lawrence, M. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+bioluminescence-based+mutant+screening+strategy+for+identification+of+bacterial+virulence+genes.">High-throughput bioluminescence-based mutant screening strategy for identification of bacterial virulence genes.</a> Appl Environ Microbiol. 75 (7), 2166-2175 (2009).</li><li>Hawke, J. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Edwardsiellosis+caused+by+Edwardsiella+ictaluri+in+Laboratory+Populations+of+Zebrafish+Danio+rerio.">Edwardsiellosis caused by Edwardsiella ictaluri in Laboratory Populations of Zebrafish Danio rerio.</a> J Aquat Anim Health. 25 (3), 171-183 (2013).</li><li>Petrie-Hanson, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+Zebrafish+Danio+rerio+as+a+Model+for+Enteric+Septicemia+of+Catfish+(ESC).">Evaluation of Zebrafish Danio rerio as a Model for Enteric Septicemia of Catfish (ESC).</a> J Aquat Anim Health. 19 (3), 151-158 (2007).</li><li>Fultz, R. S., Primm, T. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Laboratory+Module+for+Host-Pathogen+Interactions:+America's+Next+Top+Model.">A Laboratory Module for Host-Pathogen Interactions: America's Next Top Model.</a> J. Microbiol. Biol. Educ. 11, (2010).</li><li>Uliano, E., Cataldi, M., Carella, F., Migliaccio, O., Iaccarino, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+acute+changes+in+salinity+and+temperature+on+routine+metabolism+and+nitrogen+excretion+in+gambusia+(Gambusia+affinis)+and+zebrafish+(Danio+rerio).">Effects of acute changes in salinity and temperature on routine metabolism and nitrogen excretion in gambusia (Gambusia affinis) and zebrafish (Danio rerio).</a> Comp Biochem Physiol A. 157, 283-290 (2010).</li><li>Shotts, E. B., Waltman, W. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+medium+for+the+selective+isolation+of+Edwardsiella+ictaluri.">A medium for the selective isolation of Edwardsiella ictaluri.</a> J Wildl Dis. 26, 214-218 (1990).</li><li>Under animal toxicity studies, sodium chloride entry. TOXNET - Hazardous Substances Data Bank Available from: <a target="_blank" href="https://toxnet.nlm.nih.gov/">https://toxnet.nlm.nih.gov/</a> (2016)</li><li>Under animal toxicity studies, sodium nitrate entry. TOXNET - Hazardous Substances Data Bank Available from: <a target="_blank" href="https://toxnet.nlm.nih.gov/">https://toxnet.nlm.nih.gov/</a> (2016)</li><li>Under animal toxicity studies, sodium nitrite entry. TOXNET - Hazardous Substances Data Bank Available from: <a target="_blank" href="https://toxnet.nlm.nih.gov/">https://toxnet.nlm.nih.gov/</a> (2016)</li><li>Vilz, T. O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+Assessment+of+Intestinal+Motility+and+Gut+Wall+Inflammation+in+Rodents:+Analyses+in+a+Standardized+Model+of+Intestinal+Manipulation.">Functional Assessment of Intestinal Motility and Gut Wall Inflammation in Rodents: Analyses in a Standardized Model of Intestinal Manipulation.</a> J Vis Exp. (67), e4086 (2012).</li><li>Katoh, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=International+Harmonization+of+Laboratory+Animals.">International Harmonization of Laboratory Animals.</a> National Research Council (US) International Committee of the Institute for Laboratory Animal Research. Microbial Status and Genetic Evaluation of Mice and Rats: Proceedings of the 1999 US/Japan Conference. , (2000).</li></ol>

Vissa utmaningar kräver en viloperiod i ren APW efter antibiotikabehandling för det läkemedel som skall utarmas på fiskvävnad. Om viloperiod hoppas då antibiotika närvaro kan förbrylla resultaten, särskilt när analysen innebär exponering för bakterier. För att undersöka effekterna av en förändrad microbiome komposition utan stora förändringar i det totala antalet mikrober på värden, preliminära experiment övervakning microbiome sammansättning (16S profilering eller hela genomet sekvensering) och b...

Det har fastställts att antibiotika kan störa den mänskliga microbiome leder till dysbios, vilket betyder ett mikrobiella obalans. Mikrobiota s sammansättning förändring efter antibiotikabehandlingar har visat sig sänka samhällets mångfald, minska nyckelpersoner, och ändra gemenskap metabolism, särskilt i tarmen 1, 2. Antibiotikum störning av tarmen microbiome kan minska kolonisering resistens mot Clostridium difficile 3, 4 och Salmonella 5. Dessutom har störningar i mikrobiota kopplats till utvecklingen av många syndrom och sjukdomar hos människor (t.ex. antibiotikaassocierad enterokolit, inflammatorisk tarmsjukdom, metabola sjukdomar, osv.). Antibiotika är också allmänt tillämpas inom jordbruket som tillväxtbefrämjande medel iboskap och fjäderfäproduktion 6. Användningen av dessa kraftfulla verktyg är inte utan bieffekter, vilket är tydligt i den snabba ökningen av antibiotikaresistens, samt effekterna av en störd microbiome har med sin bebodda värd. Många studier har visat att bredspektrumantibiotikaanvändning har långvariga konsekvenser för struktur och funktion hos mikrobiota, ännu biverkningar från en antibiotika störs microbiome påverkar värd fysiologi är bara spekulationer som ännu inte stöds. Samspelet mellan värd, mikrobiota, och antibiotika är långt ifrån förstås på ett kortfattat sätt. Därför är en enkel och mer lätthanterlig modell fördelaktigt att belysa den mycket komplexa däggdjurssystem. Slemhinneytor hos människor, inklusive tarmen, hamnen den högsta tätheten och mångfalden av mikrober, och även de mest intima mikrob-värd interaktioner. Mucosal hud microbiome fisk erbjuder several fördelar som ett modellsystem. Den Teleostei (benfiskar) är en av de tidigaste linjerna divergerar i Vertebrata mening att teleosts har både medfödda och förvärvade immunsystem som har samar utvecklat en relation med kommenbakteriesamhällen 7. Fisk hud delar många egenskaper med typ 1 slemhinneytor hos däggdjur, såsom fysiologiska funktioner, immunitets komponenter och arrangemang av slemproducerande celler 8. Den externa placeringen av fiskskinn slemhinneyta erbjuder en microbiome lätt att experimentellt manipulera och prov. Den västra moskitfisk, Gambusia affinis (G. affinis), är en modell fisk som har använts i det förflutna för att studera parning och toxikologi 9, 10, 11. Med tanke på den lilla storleken, befolknings överflöd i naturen som en invasiv art, m<html> inimal vård kostnad och härdiga natur, har vi utvecklat G. affinis som en slemhinna microbiome modell. Vidare, Gambusia delar fysiologi föder levande ungar med viviparous däggdjur, vilket är ovanligt i fiskarter. Vi avslutade den mest omfattande studien vid tidpunkten för fiskskinn normal mikrobiota använder 16S profilering med Gambusia 12. Ytterligare arbete visade tre negativa effekter på värd efter avbrott i huden och tarmfloran med hjälp av ett brett spektrum antibiotikum 13. Fem olika effekter undersöktes i fisken efter antibiotika exponering. Den mest väletablerade värd förmån för microbiome är konkurrenskraftig uteslutning av patogener. Fisken patogen Edwardsiella ictaluri är känd för att orsaka utbrott av enter septikemi i kommersiella havskatt gårdarna 14. E. Siella ictaluri har också visat sig dödligt infektera zebrafiskclass = &quot;xref&quot;&gt; 15, 16 och Gambusia 17. En utmaning med denna patogen från vattnet kan fungera som ett mått på utslagning. Som en jämförelse med mottaglighet för en enskild patogen, var överlevnad under exponering för en hög täthet av blandade organismer också utföras. Avföring och organiskt-rik jord användes som gemensamt stött källor mikrobiella samhällen. En annan etablerad roll bakterietarm samhället utför är närings bearbetning och energi skörd, vilket påverkar den totala näringsupptaget för värden. Som en grov mätning av näring, var fisk kroppsvikt jämfört före och efter en månad av matas en standarddiet. Antibiotikabehandlade fisk som ett genomsnitt gått ner i vikt medan kontrollfisk i genomsnitt gått upp i vikt under månaden. Mekanismen för denna brist på viktökning är oklar. En möjlig bidragande orsak är transittiden av mat i tarmen. En GI motitets metod anpassades från zebrafisk (Adam Rich, SUNY Brockport, personlig kommunikation) för att bestämma överföringstiden. Det har ännu inte fastställts om antibiotikabehandlade fisk har en förändrad transittiden. En gemensam utmaning med erfarenhet i den naturliga miljön av alla organismer, särskilt fisk, är osmotisk stress. Gambusia har visat att snabbt anpassa sig när akut betonade i höga koncentrationer av salthalt 18. Överraskande, fisk med en antibiotika förändrad microbiome uppvisade sänkt överlevnad till en hög saltstress. Mekanismen för denna nya fenotyp är under utredning. En annan vanlig stress på vattenlevande djur, särskilt i akvarier, är giftiga former av kväve (ammoniak, nitrat och nitrit). Överlevnad mot nitrat var inte signifikant olika mellan antibiotika-behandlade och kontrollfisk. De metoder som presenteras i detta manuskript kan användas med Gambusia eller liknande fisk modellorganismer, såsom zebrafisk och medaka, att mäta fenotyper i fisken efter experimentell manipulation.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="568">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:184px;">Rifampicin</td>
			<td style="width:104px;">Calbiochem</td>
			<td style="width:127px;">557303-1GM</td>
			<td style="width:153px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Sodium Nitrate</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S5506</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:184px;">Fluorescein-labeled 70 kDa anionic dextran</td>
			<td style="width:104px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td>D1823</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">PBS tablets</td>
			<td>Calbiochem</td>
			<td>6500-OP</td>
			<td>tablets dissolve in water to make phosphate-buffered saline</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

examination of host phenotypes in gambusia affinis following antibiotic treatment

The commonality of antibiotic usage in medicine means that understanding the resulting consequences to the host is vital. Antibiotics often decrease host microbiome community diversity and alter the microbial community composition. Many diseases such as antibiotic-associated enterocolitis, inflammatory bowel disease, and metabolic disorders have been linked to a disrupted microbiota. The complex interplay between host, microbiome, and antibiotics needs a tractable model for studying host-microbiome interactions. Our freshwater vertebrate fish serves as a useful model for investigating the universal aspects of mucosal microbiome structure and function as well as analyzing consequential host effects from altering the microbial community. Methods include host challenges such as infection by a known fish pathogen, exposure to fecal or soil microbes, osmotic stress, nitrate toxicity, growth analysis, and measurement of gut motility. These techniques demonstrate a flexible and useful model system for rapid determination of host phenotypes.

En övergripande schematiskt diagram över den experimentella system som används för att studera fisk värdeffekter från antibiotikum exponering 13 representeras i figur 1A och innefattar den teknik för att extrahera huden (Figur 1B) och tarm (Figur 1C) microbiomes från fisken. Tre dagar valdes som antibiotika exponeringstiden, eftersom tidigare data visar att medan den totala huden odlingsbara antal droppar ...

Watch this Scientific Journal Video about Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment at JoVE.com

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Denna studie involverar metoder för att avslöja effekterna på en modell fisk värd följande förändring av huden och tarmen microbiome samhällen komposition genom ett antibiotikum.

Undersökning av värd Fenotyper i<em&gt; Gambusia affinis</em&gt; Efter antibiotikabehandling

The commonality of antibiotic usage in medicine means that understanding the resulting consequences to the host is vital. Antibiotics often decrease host ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

Undersökning av Telomer G-överhäng Struktur i Trypanosoma brucei</em

The telomere G-overhang structure has been identified in many eukaryotes including yeast, vertebrates, and Trypanosoma brucei. It serves as the substrate ...

Use of Artificial Sputum Medium to Test Antibiotic Efficacy Against Pseudomonas aeruginosa in Conditions More Relevant to the Cystic Fibrosis Lung

Use of Artificial Sputum Medium to Test Antibiotic Efficacy Against Pseudomonas aeruginosa in Conditions More Relevant to the Cystic Fibrosis Lung

Användning av artificiell Sputum Medium för att testa antibiotika effekt mot<em&gt; Pseudomonas aeruginosa</em&gt; I villkor som är mer relevanta för cystisk fibros Lung

There  is growing concern about the relevance of in vitro antimicrobial  susceptibility tests when applied to isolates of P. aeruginosa from  cystic ...

Systemic Bacterial Infection and Immune Defense Phenotypes in Drosophila Melanogaster

Systemic Bacterial Infection and Immune Defense Phenotypes in Drosophila Melanogaster

Systemisk bakterieinfektion och immunförsvar fenotyper i<em&gt; Drosophila melanogaster</em

The fruit fly Drosophila melanogaster is one of the premier model organisms for studying the function and evolution of immune defense. Many aspects of ...

A Protocol to Characterize the Morphological Changes of Clostridium difficile in Response to Antibiotic Treatment

A Protocol to Characterize the Morphological Changes of Clostridium difficile in Response to Antibiotic Treatment

Ett protokoll för att karaktärisera de morfologiska förändringarna av<em&gt; Clostridium difficile</em&gt; Som svar på antibiotisk behandling

Assessment of antibiotic action with new drug development directed towards anaerobic bacteria is difficult and technically demanding. To gain insight into ...

Quantitative Polymerase Chain Reaction-based Analyses of Murine Intestinal Microbiota After Oral Antibiotic Treatment

Kvantitativa Polymerase Chain Reaction-baserade analyser av murina tarmens bakterieflora efter Oral antibiotikabehandling

The gut microbiota has a central influence on human health. Microbial dysbiosis is associated with many common immunopathologies such as inflammatory ...

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Kvantitativ undersökning av antibiotikakänsligheten hos Neisseria gonorrhoeae aggregat använder ATP-utnyttjande kommersiella analyser och Live/Dead färgning

The emergence of antibiotic resistant Neisseria gonorrhoeae (GC) is a worldwide health threat and highlights the need to identify individuals who fail ...

Human Colonoid Monolayers to Study Interactions Between Pathogens, Commensals, and Host Intestinal Epithelium

Mänskliga Colonoid enskiktslager att studera interaktioner mellan patogener, förknippas och värd Intestinal epitel

Human 3-dimensional (3D) enteroid or colonoid cultures derived from crypt base stem cells are currently the most advanced ex vivo model of the intestinal ...

Antibiotic Dereplication Using the Antibiotic Resistance Platform

Antibiotikum Dereplication med hjälp av antibiotikaresistens plattform

One of the main challenges in the search for new antibiotics from natural product extracts is the re-discovery of common compounds. To address this ...

Visualization of Bacterial Resistance using Fluorescent Antibiotic Probes

Visualisering av bakteriell resistens med fluorescerande antibiotikasonder

Fluorescent antibiotics are multipurpose research tools that are readily used for the study of antimicrobial resistance, due to their significant ...

Analysis of SAMHD1 Restriction by Flow Cytometry in Human Myeloid U937 Cells

Analys av SAMHD1-begränsning genom flödescytometri i humana myeloida U937-celler

Sterile &#945;-motif/histidine-aspartate domain-containing protein 1 (SAMHD1) inhibits replication of HIV-1 in quiescent myeloid cells. U937 cells are ...