RNA-Seq

Overview

Unter den verschiedenen Methoden zur Genexpression ist Hochdurchsatz-Sequenzierung von RNA und RNA-FF besonders attraktiv, da es durchgeführt und ohne auf vorherige genomische Informationen analysiert werden kann. Während RNA-Seq wird RNA isoliert von Proben von Interesse verwendet, um eine DNA-Bibliothek zu generieren, die dann verstärkt und sequenziert. Letztlich, RNA-Seq bestimmen kann, welche Gene exprimiert werden, das Maß an ihren Ausdruck und das Vorhandensein von bisher unbekannte Protokolle.

Jupiter stellt die grundlegenden Prinzipien hinter RNA-seq. Wir besprechen dann die experimentelle und analytische Schritte eines allgemeinen RNA-Seq-Protokolls. Schließlich untersuchen wir, wie Forscher derzeit RNA-Seq, z. B. Genexpression zwischen verschiedenen biologischen Proben zu vergleichen oder um Protein-RNA-Interaktionen zu charakterisieren verwenden.

Procedure

RNA-Sequenzierung oder RNA-Seq, ist eine Technik, die Informationen über die Abfolge und Menge jeder RNA ausgedrückte, bekannte als das "Transkriptom," kann in einer Zellpopulation. Im Gegensatz zu anderen Expressions-profiling-Methoden wie Microarrays, die Sondierung für bekannte RNA-Sequenzen beinhalten, kann RNA-Seq Genexpression von Organismen mit UN-sequenzierten Genome Profil erstellen. Darüber hinaus kann RNA-Seq eine größere Reichweite der Niederschrift Ausdruck Ebenen als Microarrays, vor allem be...