בין שיטות שונות להערכת ביטוי גנים, רצף תפוקה גבוהה של RNA, או RNA-seq. הוא אטרקטיבי במיוחד, כפי שניתן לבצע ולנתח מבלי להסתמך על מידע גנומי זמין מראש. במהלך RNA-seq, RNA מבודד מדגימות עניין משמש ליצירת ספריית DNA, אשר לאחר מכן מוגברת ורצף. בסופו של דבר, RNA-seq יכול לקבוע אילו גנים באים לידי ביטוי, את רמות הביטוי שלהם ואת נוכחותם של כל תמלילים שלא היו ידועים קודם לכן.

כאן, JoVE מציג את העקרונות הבסיסיים מאחורי RNA-seq. לאחר מכן אנו דנים בצעדים הניסיוניים והאנליטיים של פרוטוקול RNA-seq כללי. לבסוף, אנו בוחנים כיצד חוקרים משתמשים כיום ב-RNA-seq, למשל, כדי להשוות ביטוי גנים בין דגימות ביולוגיות שונות, או כדי לאפיין אינטראקציות בין חלבון לרנ"א.