Entre los diferentes métodos para evaluar la expresión génica, la secuenciación de alto rendimiento del ARN o RNA-SEQ es particularmente atractiva, como puede ser realizado y analizado sin depender de la información genómica disponible previa. Durante RNA-seq, el ARN aislado de muestras de interés se utiliza para generar una biblioteca de ADN, que luego es amplificada y secuenciada. En última instancia, RNA-seq puede determinar qué genes se expresan, los niveles de su expresión y la presencia de cualquier transcritos anteriormente desconocidos.

Aquí, Zeus presenta los principios básicos detrás de RNA-seq. Luego discutimos los pasos experimentales y análisis de un protocolo general de RNA-seq. Por último, veremos cómo los investigadores actualmente están utilizando RNA-seq, por ejemplo, para comparar la expresión génica entre diferentes muestras biológicas, o para caracterizar las interacciones proteína-RNA.