Results: The IS Bidirectional Assay Improves Detection Rates and Sequence Quantification Accuracy
1:11
LTR-specific Biotin-primer Extension
2:53
Rsal and CviQI Digestion and Blunt-ending
4:12
Straptavidin Bead Binding
5:31
Linker Ligation
6:39
Pre-amplification of Both Left and Right Junction DNA
8:15
Left- and Right-junction-specific Amplifications
Transcript
The overall goal of this procedure is to identify retroviral vector integration sites in the host genome and quantify the relative frequencies of clonal cell populations each sharing the same integration site. This method can help answer key quest
Sign in or start your free trial to access this content
Dette manuskriptet beskriver eksperimentell prosedyre og programvareanalyse for en toveis integreringsstedanalyse som samtidig kan analysere oppstrøms og nedstrøms vektor-vert-kryss-DNA. Toveis PCR-produkter kan brukes til alle nedstrøms sekvenseringsplattformer. De resulterende dataene er nyttige for en høy gjennomstrømning, kvantitativ sammenligning av integrerte DNA-mål.