Name: high-throughput analysis of locomotor behavior in the drosophila island assay
Uploaded: 2017-11-05T08:00:00
Duration: 10 min 30 s
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हम P40OD018537 उपभेदों प्रदान करने के लिए वियना Drosophila संसाधन केंद्र और ब्लूमिंगटन Drosophila स्टॉक सेंटर (NIH Drosophila) स्वीकार करते हैं । हम द्वीप परख करने के लिए हमें शुरू करने और द्वीप परख सेटअप के निर्माण के लिए Martijn Eidhof के लिए Klämbt प्रयोगशाला के लिए आभारी हैं । इस अध्ययन में ई दुर्लभ-3 संयुक्त अंतरराष्ट्रीय कॉल अनुदान "ऑटोसोमल अवकाश ataxias के लिए तैयारी" (NWO ९००३०३७६०४), एक शीर्ष अनुदान (912-12-109) से नीदरलैंड संगठन के लिए वैज्ञानिक अनुसंधान (NWO), और द्वारा समर्थित भाग में था two DCN/Radboud यूनिवर्सिटी मेडिकल सेंटर पीएचडी फैलोशिप. funders अध्ययन डिजाइन, डेटा संग्रह और विश्लेषण, प्रकाशित करने का निर्णय, या पांडुलिपि की तैयारी में कोई भूमिका नहीं थी ।

<ol>
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लेखकों के हित का खुलासा करने का कोई टकराव नहीं है.

इस प्रोटोकॉल का वर्णन "Drosophila द्वीप परख" स्थूल कि मात्रात्मक द्वीप परख के दौरान Drosophila मोटर व्यवहार का आकलन है । स्थूल सही समय के साथ मंच पर मक्खियों गिना जाता है, द्वीप परख अत्यधिक संवेदनशील और मात्रात्मक उच्च हरकत दोषों का प्रवाह मूल्यांकन के लिए उपयुक्त बना । इस पद्धति की अनुमति देता है किसी भी हालत की तुलना के लिए, मक्खियों के साथ विभिंन आनुवंशिक और/ यह readout खोज उपकरण के रूप में विशेष रूप से उपयोगी है जब बड़े आनुवंशिक या दवा स्क्रीन प्रदर्शन, जब आंदोलन विकारों और अंय स्नायविक रोगों के Drosophila मॉडल का अध्ययन, या जब गतिवान या उड़ान की जांच व्यवहार.
द्वीप परख इस पांडुलिपि में प्रस्तुत प्रोटोकॉल मौजूदा पर लाभ प्रदान करता है/ उदाहरण के लिए, वीडियो ट्रैकिंग गतिवान अधिक समय लेने वाली और बड़े नमूना आकार के परीक्षण के लिए कम उपयुक्त है । द्वीप परख एक उच्च प्रवाह जांच उपकरण है, और, इस अर्थ में, तेजी से इंटरैक्टिव नकारात्मक geotaxis (अंगूठी) परख16के बराबर है । दोनों के बीच अंतर यह है कि द्वीप परख हरकत समस्याओं की एक व्यापक रेंज का पता लगाने के लिए अनुमति देता है; मक्खियों की अक्षमता के लिए मंच छोड़ने के लिए उड़ान में दोषों के कारण हो सकता है, कूद, या चलने की वजह से व्यवहार विंग (मांसपेशी/न्यूरॉन्स) और/या पैर (मांसपेशी/ दूसरी ओर, अंगूठी परख चढ़ाई में दोषों का आकलन/पैदल व्यवहार पैर की वजह से (मांसपेशी/ मामले में उपयोगकर्ताओं को कई व्यवहार readouts में रुचि रखते हैं, द्वीप परख भी आसानी से ऐसे अंगूठी परख के रूप में अंय परख, के साथ संयुक्त किया जा सकता है । इसके अलावा, optogenetics के लिए आवश्यक पराबैंगनीकिरण आसानी से द्वीप परख बॉक्स में स्थापित किया जा सकता है, और सेटअप इतना आसान है कि यह आसानी से एक कमरे में ले जाया जा सकता है, जहां तापमान और प्रकाश नियंत्रित किया जा सकता है ।
को सफलता और द्वीप परख यहां वर्णित की reproducibility सुनिश्चित करने के लिए, कई सिफारिशों का पालन किया जाना चाहिए । Aliquot और प्रायोगिक परीक्षण शीशियों के लिए मक्खियों हस्तांतरण करने के लिए प्रयोग करने से पहले एक दिन में सह के प्रभाव से बचने के लिए2 या ठंडा संज्ञाहरण । भीड़ न करें प्रयोगात्मक शीशियों (उपयोग 10-15 मक्खियों प्रति शीशी; यह हमेशा के लिए मक्खियों की एक ही संख्या प्रति शीशी जगह सबसे अच्छा है) । हर समय ताजे खाने पर मक्खियों को रखें । अगर परख के संचालन के साथ अभी तक परिचित नहीं है, अभ्यास मंच पर मक्खियों फेंकने के लिए उपज को अधिकतम । इसके अलावा जल्दी से हाथ वापस लेने का अभ्यास सही बाद में, के रूप में यह डेटा विश्लेषण (छवि विश्लेषण के साथ हस्तक्षेप और उड़ान शुरू गिनती के बाद ही हाथ चित्र से बाहर है) । की तुलना की जरूरत है कि प्रयोगों में पर्यावरणीय और प्रयोगात्मक शर्तों समान रखें (जैसे, नियंत्रण बनाम म्यूटेंट या एक जीनोटाइप विभिन्न उम्र में परीक्षण). हमेशा दिन के एक ही समय में प्रयोगों का प्रदर्शन और नियंत्रित तापमान और आर्द्रता की स्थिति के तहत शीशियों को बनाए रखने. सांख्यिकीय शक्ति के लिए, परीक्षण जैविक नकल के प्रति कम से कम तीन तकनीकी प्रतिकृतियां ।
यहां वर्णित मैक्रो के सफल प्रदर्शन को सुनिश्चित करने के लिए, वेब कैमरा और छवि सेटिंग्स को अधिक से अधिक विपरीत प्राप्त करने के लिए समायोजित किया जाना चाहिए: एक सफेद मंच पर काले वस्तुओं के रूप में प्रदर्शित मक्खियों । जब मक्खियों की संख्या ठीक से मैक्रो द्वारा गिना नहीं है, कंट्रास्ट सेटिंग्स समायोजित करें, जांचें कि क्या रॉय ठीक से चयनित है, और यह सुनिश्चित करें कि मंच पर मक्खियों के आकार निर्दिष्ट ंयूनतम मक्खी आकार सेटिंग से ऊपर है (इस प्रोटोकॉल का चरण ८.३ देखें) । सेटिंग्स केवल एक बार परिभाषित करने की आवश्यकता है । वे सभी प्रयोगों के लिए लागू कर रहे हैं, जब तक वेब कैमरा और मंच के बीच की दूरी बदल नहीं है । Circularity_min और अधिकतम सेटिंग्स कणों के प्रचलन को परिभाषित (कण = गिना मक्खियों) कि विश्लेषण के लिए खाते में ले जाया जाएगा (मक्खियों = वस्तुओं गिना). 1 एक परिपूर्ण वृत्त का प्रतिनिधित्व करता है, और 0 एक पंक्ति17का प्रतिनिधित्व करता है । मक्खियों हमेशा परिपत्र की एक निश्चित डिग्री मौजूद (एक मक्खी एक सीधी रेखा के रूप में प्रकट नहीं कर सकते हैं) के बाद से, "Circularity_max" सेटिंग 1 पर सेट है और "Circularity_min" सेटिंग ०.४ पर सेट किया गया है । यह संभावना नहीं है कि उपयोगकर्ता को इन सेटिंग्स को समायोजित करने की आवश्यकता है ।
एक मक्खी मंच की सीमा के करीब स्थित है जब मैक्रो कभी-कभार गिनती गलतियां करता है. यह हो सकता है अगर मक्खियों मक्खी लेकिन में और बाहर उपयोगकर्ता परिभाषित रॉय के चलने नहीं कर सकते । ज्यादातर मामलों में, रॉय का चयन (यह फिटिंग के रूप में ज्यादा के रूप में मंच के लिए संभव) आसानी से इस मुद्दे को हल कर सकते हैं । हालांकि, "द्वीप परख विश्लेषण" स्क्रिप्ट का पता लगाने और सही अनुचित डेटा में और रॉय अपेक्षाकृत अच्छी तरह से बाहर चलने मक्खियों की वजह से गिनती करने में सक्षम है । हालांकि वेब कैमरा के संकल्प यहां प्रस्तुत काफी उच्च है भेदभाव के करीब निकटता में मक्खियों काफी अच्छी तरह से, हम इस तरह के रूप में "Drosophila द्वीप परख" स्थूल, की छवि प्रसंस्करण प्रक्रिया में अतिरिक्त एल्गोरिदम लागू किया है वाटरशेड और घिस समारोह17. इन मक्खियों कि मंच पर करीब निकटता में है की उचित विरेखा की सुविधा । इसके अतिरिक्त, मैक्रो उस प्लेटफ़ॉर्म से जंप करने वाले मक्खियों के बीच अंतर करने में असमर्थ है या इससे दूर उड़ गया था । बहरहाल, यह आम तौर पर मनाया जाता है कि स्वस्थ युवा मक्खी उपभेदों तुरंत उड़ जब मंच पर गिरा दिया, जबकि पुराने मक्खियों और हरकत घाटे के साथ मक्खियों मंच पर लंबे समय तक रहने के लिए और अंत में कूद या मंच गिर जाएगा । इन सीमाओं के बावजूद, परख और विश्लेषण हरकत व्यवहार का एक बहुत ही सटीक उपाय प्रदान करते हैं ।
"द्वीप परख विश्लेषण" स्क्रिप्ट के सफल प्रदर्शन को सुनिश्चित करने के लिए, उपयोगकर्ता के लिए इनपुट और आउटपुट स्क्रिप्ट पंक्तियों में फ़ाइलें प्रोटोकॉल में संकेत के लिए सही रास्ते में प्रवेश करने के लिए और सही फ़ोल्डर प्रारूप में डेटा प्रदान करने के लिए सुनिश्चित करने के लिए है (संकेत के रूप में चित्रा 2में) । उपयोगकर्ता भी कड़े (पंक्ति ६८: अविश्वसनीय प्रयोगात्मक डेटा बाहर फिल्टर करने के लिए इस्तेमाल किया मानदंड पाता है "count" स्तंभ में पहला मान 5 से कम या बराबर है; पंक्ति ७१: "गणना" स्तंभ में पहला मान platfo पर फेंकी गई मक्खियों की कुल संख्या से अधिक है rm + 3), ६८ और ७१ "द्वीप परख विश्लेषण" स्क्रिप्ट में पंक्तियों में पाठ के सामने एक # जोड़कर इन फ़िल्टर सेटिंग्स बंद कर दें । इस स्थिति में, विश्लेषण में सभी डेटासेट को शामिल किया जाएगा. वैकल्पिक रूप से, फ़िल्टर सेटिंग्स पंक्तियाँ ६८ और ७१ उपयोगकर्ता आवश्यकताओं के अनुसार में मानों को समायोजित करके परिवर्तित किया जा सकता है । "परिणाम. txt" "Drosophila द्वीप परख" मैक्रो द्वारा उत्पंन में गिनती मूल्यों में संभव कलाकृतियों को भी मैंयुअल रूप से समायोजित किया जा सकता है, और स्क्रिप्ट को समायोजित डेटा पर फिर से चला जा सकता है । जब उपयोगकर्ता प्रसंस्करण में रुचि है 10 से अधिक एफपीएस, या डेटा के 10 से अधिक एस, "द्वीप परख विश्लेषण द्वारा संसाधित फ्रेम की संख्या स्क्रिप्ट" चाहिएसमायोजित किया जाएगा । सांख्यिकीय विश्लेषण भी यूज़र-डिफ़ाइंड विकल्प द्वारा प्रतिस्थापित किया जा सकता है ।
एक फ़ोल्डर बुलाया "उदाहरण द्वीप परख," छवि समय के साथ उदाहरण युक्त-श्रृंखला द्वीप परख का उपयोग कर प्राप्त की, निंनलिखित वेबसाइट पर पाया जा सकता है: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.4309652.v1 । डाउनलोड "उदाहरण द्वीप परख" फ़ोल्डर और इस प्रोटोकॉल में वर्णित चरणों का पालन करने के लिए जल्दी से फ़ाइल भंडारण की संरचना के साथ परिचित हो, "Drosophila द्वीप परख मैक्रो" के साथ छवियों के प्रसंस्करण, और "द्वीप परख विश्लेषण" स्क्रिप्ट.
द्वीप परख, विकसित स्थूल और विश्लेषण स्क्रिप्ट के साथ संयोजन में, का मूल्यांकन करने के लिए और गतिभंग-Telangiectasia के एक Drosophila मॉडल के ंयायपालिका आंदोलन व्यवहार को बढ़ाता है इस्तेमाल किया जा सकता है । के बाद से परख कुशलतापूर्वक विभिंन उंर के लिए लागू किया जा सकता है, यह अच्छी तरह से phenotypes के संभावित प्रगतिशील प्रकृति का विश्लेषण करने के लिए अनुकूल है ।
सारांश में, द्वीप परख, "Drosophila द्वीप परख" स्थूल और "द्वीप परख विश्लेषण" स्क्रिप्ट के साथ संयोजन में, एक लागत प्रभावी, विश्वसनीय है, और अत्यधिक कुशल परख के लिए होना चाहए विश्लेषण और हरकत दोष यों की मात्रा एक उच्च प्रवाह तरीके में आंदोलन विकारों के Drosophila मॉडल ।

हाल के वर्षों में, अगली पीढ़ी के अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों में अग्रिम बहुत मस्तिष्क की अपक्षयी आंदोलन विकारों अंतर्निहित जीन की पहचान के लिए योगदान दिया है (जैसे, अनुमस्तिष्क गतिभंग और पार्किंसंस), परिधीय न्यूरॉन्स की मूल (जैसे, पेशीशोषी पार्श्व स्केलेरोसिस और वंशानुगत स्पास्टिक paraplegia), और पेशी मूल के (जैसे, Duchenne पेशी dystrophy और myotonic dystrophy)1,2,3,4 . इस के बावजूद, थोड़ा आणविक तंत्र है कि इन विकारों के सबसे आबाद के बारे में जाना जाता है । इन तंत्रों की बेहतर समझ के लिए उपचारों का विकास आवश्यक है.
मनुष्य के रूप में, मॉडल जीवों में आंदोलन, जैसे उड़ान और गतिवान Drosophilaमें, केंद्रीय मस्तिष्क द्वारा नियंत्रित किया जाता है, परिधीय तंत्रिका तंत्र, और मांसपेशियों. इसके अलावा, तेज पीढ़ी के समय और Drosophila के आनुवंशिक toolbox इस मॉडल जीव आंदोलन विकारों में शामिल जीन के उच्च प्रवाह स्क्रीनिंग के लिए विशेष रूप से उपयुक्त बनाने के लिए और दवा परीक्षण के लिए5,6 . कारण शर्तों की पर्याप्त संख्या है कि इस तरह की स्क्रीन, विश्वसनीय, लागत प्रभावी, और रिश्तेदार सरल परख, साथ ही उपकरण में परीक्षण किया जा करने के लिए एक स्वचालित तरीके से उत्पादन परिणामों को बढ़ाता है, अत्यधिक वांछनीय है की जरूरत है ।
श्मिट एट अल । (२०१२) 7 वर्णित एक कम लागत परीक्षण "द्वीप परख" के लिए Drosophila हरकत व्यवहार का मूल्यांकन कहा जाता है । द्वीप परख सफलतापूर्वक बड़े पैमाने पर इस्तेमाल किया गया है glia के साथ जीन की पहचान विशेष कार्य7, बौद्धिक विकलांगता के Drosophila मॉडल के मूल्यांकन में8, और के सामांय मूल्यांकन के लिए मक्खी मोटर व्यवहार9. द्वीप परख के सिद्धांत डिजाइन एक ऊंचा मंच है जिस पर कई मक्खियों फेंक रहे है के होते हैं । यह एक सहज मोटर व्यवहार है कि स्वस्थ मक्खियों सेकंड के भीतर मंच से बचने के लिए सक्षम बनाता है लाती है । परख समय7,8,9पर मंच पर शेष मक्खियों की संख्या के उपाय । इन सभी सुविधाओं का संकेत है कि द्वीप परख आंदोलन विकारों में शामिल जीन के लिए एक शक्तिशाली स्क्रीनिंग उपकरण हो सकता है ।
वर्तमान में, फिल्माया द्वीप परख डेटा का मात्रात्मक विश्लेषण मैंयुअल रूप से किया जाता है7,8,9। परख की दक्षता में सुधार करने के लिए, एक कम लागत विधि अर्द्ध करने के लिए विकसित किया गया था स्वचालित रूप से मंच से मक्खियों के भागने यों तो । सेटअप एक साधारण एक लैपटॉप के लिए मंच की छवि समय श्रृंखला इकट्ठा करने के लिए, फ्रेम के साथ हर ०.१ एस फ्रेम हासिल की है वेब कैमरा का उपयोग करता है तो "Drosophila द्वीप परख" स्थूल के साथ कार्रवाई कर रहे है कि मंच पर मक्खियों की संख्या quantifies समय. "Drosophila द्वीप परख" मैक्रो तीन स्वतंत्र उप-मैक्रोज़ में विभाजित है: (I) "स्टैक और प्रोजेक्शन बनाएं", उप-मैक्रो अलग अलग सबफ़ोल्डर में संग्रहीत विभिंन द्वीप प्रयोगों की पहचान करता है और एक स्टैक बनाता है और प्रत्येक के एक प्रक्षेपण समय श्रृंखला । (II) "प्लेटफ़ॉर्म परिभाषित करें" उप-मैक्रो लगातार सभी "Projection_image_name. tif" फ़ाइलें व्यक्तिगत प्रयोगात्मक सबफ़ोल्डर्स, पर जो बिंदु पर उपयोगकर्ता मैन्युअल रूप से ब्याज के क्षेत्र (ROI) के रूप में द्वीप प्लेटफ़ॉर्म को परिभाषित करने के लिए अनुरोध किया गया है में स्थित खोल देगा । (III) "विश्लेषण" स्वचालित रूप से समय श्रृंखला के दौरान मंच पर शेष मक्खियों की संख्या quantifies । उप-मैक्रोज़ लगातार (एक रन में) या स्वतंत्र रूप से चलाया जा सकता है । सांख्यिकीय डेटा विश्लेषण के लिए, एक स्क्रिप्ट के लिए स्वचालित रूप से प्राप्त डेटा प्रक्रिया और एक सांख्यिकीय परीक्षण लागू करने के लिए निर्धारित है कि उपचार/पादी एक दूसरे से काफी अलग व्यवहार विकसित किया गया था (चित्र 1) । अंत में, यह प्रदर्शित किया जाता है कि इस सेटअप का मूल्यांकन और गतिभंग-telangiectasia (पर) के लिए एक Drosophila मॉडल की ंयायपालिका हरकत क्षमता को बढ़ाता है ।

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td class="xl19">25 x 95 mm Drosophila vials</td>
			<td class="xl19">Flystuff</td>
			<td class="xl20">32-116SB</td>
			<td class="xl19">-</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl21">Logitech C525 HD Webcam</td>
			<td class="xl19">Logitech</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Any webcam with USB connection is suitable.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Stand to hold webcam</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Lamp</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">12 V LED lights are appropriate</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Pounding pad</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Any mouse pad works</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Island Assay box</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Dimensions 40x35x2.5 cm. Hole 20x30 cm. Transparent.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Island Assay bath</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Dimensions 42x38x25 cm. Non white.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Island/platform</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Dimensions 42x38x25 cm. Uniform white.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Soap</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Standard dishwashing detergent is suitable.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Computer</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Scripts run both on Windows and Mac</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl22">Image-recording software: HandiAvi&#174;</td>
			<td class="xl23">AZcendant&#174;</td>
			<td class="xl23">-</td>
			<td class="xl19">HandyAvi is only compatible with Windows and has been described throughout the manuscript. It can be downloaded from: http://www.azcendant.com/DownloadHandyAvi.html (version 5.0)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl22">Image-recording software: WebcamCapture</td>
			<td class="xl25">-</td>
			<td class="xl25">-</td>
			<td class="xl25">Fiji/ImageJ plugin that can be used on Mac alternative to HandyAvi for image-recordings and can be downloaded from: https://imagej.nih.gov/ij/plugins/webcam-capture/ When using this method, the user has to use the same folder setup and image-recording settings indicated in this manuscript, with the exception that for each experimental replicate, the captured image stack should be exported as Stack.tiff to the corresponding experimental replicate folder. Upon running the &#34;Drosophila Island Assay&#34; macro on this data, no text should be present in the &#34;First frame identifier&#34; setting.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Fiji</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Version 1.4 or higher, can be downloaded from: https://figshare.com/s/def4197ee0010b21a76f</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">R studio</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl24">Can be downloaded from: https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">R</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl24">Version 3.3.2, can be downloaded from: https://cran.rstudio.com</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

high-throughput analysis of locomotor behavior in the drosophila island assay

अगली पीढ़ी के sequencing प्रौद्योगिकियों में अग्रिमों एक बढ़ती हुई गति में आंदोलन विकारों और अन्य स्नायविक रोगों के लिए (उंमीदवार) रोग जीन की पहचान करने के लिए योगदान करते हैं । हालांकि, थोड़ा आणविक तंत्र है कि इन विकारों आबाद के बारे में जाना जाता है । आनुवंशिक, आणविक, और Drosophila melanogaster के व्यवहार toolbox इस मॉडल विशेष रूप से एक उच्च प्रवाह तरीके से नए रोग जीन और तंत्र की विशेषताएं उपयोगी जीव बनाता है । फिर भी, उच्च प्रवाह स्क्रीन कुशल और विश्वसनीय परख कि, आदर्श रूप में, लागत प्रभावी है और इन विकारों के लिए प्रासंगिक लक्षण की स्वचालित ठहराव के लिए अनुमति की आवश्यकता है । द्वीप परख एक लागत प्रभावी और आसानी से स्थापित करने के लिए Drosophila हरकत व्यवहार का मूल्यांकन विधि है । इस परख में, मक्खियों एक निश्चित ऊंचाई से एक मंच पर फेंक दिया जाता है । यह सेकंड के भीतर मंच से बचने के लिए मक्खियों को सक्षम बनाता है कि एक सहज मोटर प्रतिक्रिया लाती है । वर्तमान में, फिल्माया द्वीप परख के मात्रात्मक विश्लेषण मैंयुअल रूप से किया है, जो एक श्रमसाध्य उपक्रम है, खासकर जब बड़ी स्क्रीन प्रदर्शन कर रहे हैं ।
इस पांडुलिपि का वर्णन "Drosophila द्वीप परख" और "द्वीप परख विश्लेषण" उच्च प्रवाह, स्वचालित डेटा प्रसंस्करण और द्वीप परख डेटा के ठहराव के लिए एल्गोरिदम । सेटअप में, एक साधारण webcam एक लैपटॉप से जुड़ा मंच के एक छवि श्रृंखला इकट्ठा जबकि परख की जाती है । "Drosophila द्वीप परख" मुक्त स्रोत सॉफ्टवेयर फिजी के लिए विकसित एल्गोरिथ्म इन छवि श्रृंखला और quantifies प्रक्रियाओं, प्रत्येक प्रयोगात्मक स्थिति के लिए, समय के साथ मंच पर मक्खियों की संख्या । "द्वीप परख विश्लेषण" स्क्रिप्ट, नि: शुल्क सॉफ्टवेयर आर के साथ संगत, स्वचालित रूप से प्राप्त डेटा प्रक्रिया और गणना करने के लिए विकसित किया गया था कि उपचार/पादी सांख्यिकीय रूप से अलग हैं । यह बहुत द्वीप परख की क्षमता में सुधार और यह बुनियादी गतिवान और उड़ान व्यवहार के लिए एक शक्तिशाली readout बनाता है । यह इस प्रकार बड़ी मक्खी हरकत क्षमता, आंदोलन विकारों के Drosophila मॉडल, और नशीली दवाओं की प्रभावकारिता की जांच स्क्रीन पर लागू किया जा सकता है ।

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High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay

द्वीप परख एक अपेक्षाकृत नए, लागत प्रभावी परख कि Drosophila melanogasterके बुनियादी हरकत व्यवहार का मूल्यांकन किया जा सकता है । इस पांडुलिपि स्वचालित डेटा प्रसंस्करण और द्वीप परख डेटा के उद्देश्य ठहराव के लिए एल्गोरिदम का वर्णन, इस परख एक संवेदनशील, उच्च बड़े आनुवंशिक या औषधीय स्क्रीन के लिए readout का प्रवाह बना ।

Drosophila द्वीप परख में हरकत व्यवहार के उच्च प्रवाह विश्लेषण

Advances in next-generation sequencing technologies contribute to the identification of (candidate) disease genes for movement disorders and other ...

Research

JoVE Journal

Neuroscience

High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay

Single Sensillum Recordings in the Insects Drosophila melanogaster and Anopheles gambiae

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कीड़े में एकल Sensillum रिकॉर्डिंग ड्रोसोफिला मेलानोगास्टर और एनोफ़ेलीज़ gambiae</em

The sense of smell is essential for insects to find foods, mates, predators, and oviposition sites3. Insect olfactory sensory neurons (OSNs) are enclosed ...

Assaying Locomotor, Learning, and Memory Deficits in Drosophila Models of Neurodegeneration

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में परख लोकोमोटर, सीखना, और स्मृति घाटे ड्रोसोफिला Neurodegeneration के मॉडल

Advances in genetic methods have enabled the study of genes involved in human neurodegenerative diseases using Drosophila as a model system1. Most of ...

Studying the Neural Basis of Adaptive Locomotor Behavior in Insects

कीड़े में अनुकूली लोकोमोटर व्यवहार के तंत्रिका आधार अध्ययन

Studying the neural basis of walking behavior, one often faces the problem that it is hard to separate the neuronally produced stepping output from those ...

In vivo Electroporation of Developing Mouse Retina

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विकास माउस रेटिना के vivo electroporation में

The functional characterization of genes expressed during mammalian retinal development remains a significant challenge.  Gene targeting to generate ...

Methods to Assay Drosophila Behavior

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परख के लिए तरीके ड्रोसोफिला व्यवहार

Drosophila melanogaster, the fruit fly, has been used to study molecular mechanisms of a wide range of human diseases such as cancer, cardiovascular ...

A Single-fly Assay for Foraging Behavior in Drosophila

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Foraging व्यवहार के लिए एक एकल मक्खी परख में<em&gt; ड्रोसोफिला</em

For many animals, hunger promotes changes in the olfactory system in a manner that facilitates the search for appropriate food sources. In this video ...

Determination of the Spontaneous Locomotor Activity in Drosophila melanogaster

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में सहज हरकत गतिविधि का निर्धारण<em&gt; ड्रोसोफिला मेलानोगास्टर</em

Drosophila melanogaster has been used as an excellent model organism to study environmental and genetic manipulations that affect behavior. One such ...

High Throughput Assay to Examine Egg-Laying Preferences of Individual Drosophila melanogaster

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उच्च throughput परख की जांच करने के लिए व्यक्ति की अंडे बिछाने प्राथमिकताएं<em&gt; ड्रोसोफिला मेलानोगास्टर</em

Recently, egg-laying preference of Drosophila has emerged as a genetically tractable model to study the neural basis of simple decision-making processes. ...

A Simple Way to Measure Alterations in Reward-seeking Behavior Using Drosophila melanogaster

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इनाम व्यवहार की मांग में बदलाव को मापने के लिए उपयोग कर एक सरल तरीका<em&gt; ड्रोसोफिला मेलानोगास्टर</em

We describe a protocol for measuring ethanol self-administration in fruit flies (Drosophila melanogaster) as a proxy for changes in reward states. We ...

Quantification of Drosophila Grooming Behavior

ड्रोसोफिला ग्रूमिंग व्यवहार की मात्रा

Drosophila grooming behavior is a complex multi-step locomotor program that requires coordinated movement of both forelegs and hindlegs. Here we present a ...