Name: high-throughput analysis of locomotor behavior in the drosophila island assay
Uploaded: 2017-11-05T08:00:00
Duration: 10 min 30 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay at JoVE.com

Мы признаем ресурсный центр Вены дрозофилы и Блумингтон дрозофилы фондовый центр (низ P40OD018537) для предоставления штаммов дрозофилы . Мы благодарны Klämbt лабораторию для введения нас остров пробирного и Martijn Eidhof для строительства установки пробирного остров. Это исследование было в поддержке совместной транснациональной вызвать E-редкие-3 части Грант «Подготовка терапии для аутосомно-рецессивный атаксии» подготовка (НВО 9003037604), топ Грант (912-12-109) от Нидерландов организации научных исследований (НВО) и два DCN/Radboud университета медицинский центр PhD стипендии. Спонсоры имел никакой роли в дизайн исследования, сбор данных и анализ, решение опубликовать или подготовка рукописи.

<ol>
	<li>Smeets, C. J., Verbeek, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cerebellar+ataxia+and+functional+genomics:+Identifying+the+routes+to+cerebellar+neurodegeneration.">Cerebellar ataxia and functional genomics: Identifying the routes to cerebellar neurodegeneration.</a> Biochim Biophys Acta. 1842, 2030-2038 (2014).</li><li>Liu, Y. T., Lee, Y. C., Soong, B. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=What+we+have+learned+from+the+next-generation+sequencing:+Contributions+to+the+genetic+diagnoses+and+understanding+of+pathomechanisms+of+neurodegenerative+diseases.">What we have learned from the next-generation sequencing: Contributions to the genetic diagnoses and understanding of pathomechanisms of neurodegenerative diseases.</a> J Neurogenet. 29, 103-112 (2015).</li><li>He, J., Mangelsdorf, M., Fan, D., Bartlett, P., Brown, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Amyotrophic+Lateral+Sclerosis+Genetic+Studies:+From+Genome-wide+Association+Mapping+to+Genome+Sequencing.">Amyotrophic Lateral Sclerosis Genetic Studies: From Genome-wide Association Mapping to Genome Sequencing.</a> Neuroscientist. 21, 599-615 (2015).</li><li>Lill, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetics+of+Parkinson's+disease.">Genetics of Parkinson's disease.</a> Mol Cell Probes. 30, 386-396 (2016).</li><li>Bjedov, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanisms+of+life+span+extension+by+rapamycin+in+the+fruit+fly+Drosophila+melanogaster.">Mechanisms of life span extension by rapamycin in the fruit fly Drosophila melanogaster.</a> Cell Metab. 11, 35-46 (2010).</li><li>Hada, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=D-chiro-inositol+and+pinitol+extend+the+life+span+of+Drosophila+melanogaster.">D-chiro-inositol and pinitol extend the life span of Drosophila melanogaster.</a> J Gerontol A Biol Sci Med Sci. 68, 226-234 (2013).</li><li>Schmidt, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kinesin+heavy+chain+function+in+Drosophila+glial+cells+controls+neuronal+activity.">Kinesin heavy chain function in Drosophila glial cells controls neuronal activity.</a> J Neurosci. 32, 7466-7476 (2012).</li><li>Kochinke, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Systematic+Phenomics+Analysis+Deconvolutes+Genes+Mutated+in+Intellectual+Disability+into+Biologically+Coherent+Modules.">Systematic Phenomics Analysis Deconvolutes Genes Mutated in Intellectual Disability into Biologically Coherent Modules.</a> Am J Hum Genet. 98, 149-164 (2016).</li><li>Volkenhoff, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glial+Glycolysis+Is+Essential+for+Neuronal+Survival+in+Drosophila.">Glial Glycolysis Is Essential for Neuronal Survival in Drosophila.</a> Cell Metab. 22, 437-447 (2015).</li><li>Schindelin, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fiji:+an+open-source+platform+for+biological-image+analysis.">Fiji: an open-source platform for biological-image analysis.</a> Nat Methods. 9, 676-682 (2012).</li><li>R Development Core Team. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> R: A language and environment for statistical computing. , (2008).</li><li>Greenspan, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Fly pushing: the theory and practice of Drosophila genetics. , (2004).</li><li>Rothblum-Oviatt, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ataxia+telangiectasia:+a+review.">Ataxia telangiectasia: a review.</a> Orphanet J Rare Dis. 11, 159 (2016).</li><li>Petersen, A. J., Rimkus, S. A., Wassarman, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ATM+kinase+inhibition+in+glial+cells+activates+the+innate+immune+response+and+causes+neurodegeneration+in+Drosophila.">ATM kinase inhibition in glial cells activates the innate immune response and causes neurodegeneration in Drosophila.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 109, E656-E664 (2012).</li><li>Gargano, J. W., Martin, I., Bhandari, P., Grotewiel, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+iterative+negative+geotaxis+(RING):+a+new+method+for+assessing+age-related+locomotor+decline+in+Drosophila.">Rapid iterative negative geotaxis (RING): a new method for assessing age-related locomotor decline in Drosophila.</a> Exp Gerontol. 40, 386-395 (2005).</li><li>. ImageJ User Guide - IJ 1.46 Available from: <a target="_blank" href="https://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/146-30.html">https://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/146-30.html</a> (2012)</li></ol>

Авторы не имеют никаких конфликтов интересов раскрыть.

Этот протокол описывает «Дрозофилы остров Assay» макрос, который количественно оценивает дрозофилы моторное поведение во время остров assay. Макрос точно рассчитывает мух на платформе со временем, делая пробирного острова весьма деликатного и подходит для количественной оценки высок объём опорно дефектов. Методология позволяет для сравнения каких-либо условий, с мухами, выращенных в условиях различных генетических и/или окружающей среды, включая воздействие наркотиков. Эта индикация таким образом особенно полезным инструментом обнаружения при выполнении больших генетических или фармацевтических экранов, при изучении дрозофилы модели двигательных расстройств и других неврологических заболеваний, или при изучении передвижения или рейса поведение.
Протокол assay остров, представленные в этой рукописи обеспечивает преимущества перед существующими/альтернативные методы. Например видео слежения локомоции гораздо более трудоемкой и менее пригодны для тестирования больших выборок. Остров представляет собой высокопроизводительного скрининга инструмент и, в этом смысле сопоставимо с Пробирной быстрого интерактивного негативные geotaxis (кольцо)16. Разница между ними является, что остров анализов позволяет для обнаружения более широкий спектр проблем опорно-двигательного аппарата; мух невозможности покинуть платформы могут быть вызваны дефектами в полете, прыжки, или ходить поведение вызвано крыла (мышцы/нейронов) и/или ног (мышцы/нейронов) дефектов. С другой стороны кольцо assay оценивает дефекты в восхождение/ходьба поведения, вызванные дефектами ноги (мышцы/нейронов). В случае, если пользователи заинтересованы в нескольких поведенческих отсчетов, остров assay также легко может сочетаться с другие анализы, например кольцо assay. Кроме того лазеры, необходимых для Оптогенетика может быть легко установлен в поле пробирного остров, и установки настолько прост, его можно легко перенести в помещение, где температура и свет может контролироваться.
Для обеспечения успеха и воспроизводимость пробирного остров, описанные здесь, должны следовать несколько рекомендаций. Алиготе и передачи мух на экспериментальные испытания ампул по крайней мере за один день до эксперимента, чтобы избежать последствий CO2 или холодной анестезии. Не загромождать экспериментальной флаконы (использовать 10-15 мух на флакон; это лучше всегда разместить такое же количество мух на флакон). Мух на свежие продукты питания на все времена. Если не еще не знакомы с проведением анализа, практика бросать летит на платформу для максимизации доходности. Также практика быстро втягивания руки право впоследствии, как это мешает с анализа данных (анализ изображений и летать, считая начать только после того, как рука находится вне изображения). Держите экологических и экспериментальных условий идентичны в экспериментах, которые нужно сравнить (например, элементов управления и мутанты или генотипа проверял на разных возрастов). Всегда выполнять эксперименты в то же время суток и поддерживать флаконы под контролем температуры и влажности. Для статистической мощности испытания по меньшей мере три технических реплицирует на биологических репликации.
Для обеспечения успешного выполнения макроса, описанные здесь, параметры веб-камера и изображения должна корректироваться для достижения максимальной контрастности: мухи, появляясь как черные объекты на белом платформе. Когда количество мух не учитываются должным образом макроса, настройки контраста, проверьте, выбран ли должным образом ROI и убедитесь, что размер мух на платформе выше указанного минимума летать размер установки (см. шаг 8.3 настоящего Протокола). Параметры нужно только быть определен только один раз. Они применимы для всех экспериментов, при условии, что расстояние между веб-камерой и платформы не изменяется. Circularity_min и Макс параметры определяют цикличность частиц (частицы = подсчет мух), будут приниматься во внимание для анализа (летает = подсчитываемые объекты). 1 представляет собой идеальный круг, а 0 линия17. Так как мух всегда присутствует определенная степень округлости (летать не может появиться как прямая линия), в 1 устанавливается параметр «Circularity_max» и параметр «Circularity_min» устанавливается на 0,4. Маловероятно, что пользователь должен настроить эти параметры.
Макрос иногда делает Счетной ошибки, когда Муха расположен недалеко от границы с платформы. Это может произойти, если мухи не могут летать но ходить и из пользовательских ROI. В большинстве случаев изменив ROI (монтаж его как можно больше платформы) может легко решить эту проблему. Однако сценарий «Остров пробирного анализа» способен обнаружить и правильно неправильная данных счетчиков, вызванные мух, ходьба и уменьшать ROI относительно хорошо. Хотя резолюции webcam, представленные здесь достаточно высоки, чтобы дискриминация мух в непосредственной близости от довольно хорошо, мы осуществили дополнительные алгоритмы в процедуре обработки изображений «Дрозофилы остров Assay» макроса, такие как водораздел и подрывают функции17. Это облегчает надлежащее разграничение мух, которые находятся в непосредственной близости на платформе. Кроме того, макрос не может отличить мух, которые прыгали от платформы или летели от него. Тем не менее обычно отмечается, что здоровые молодые летать штаммов улетать сразу при перетаскивании платформы, тогда как старые мух и мух с двигательного дефицита остаться дольше на платформе и будет в конечном итоге перейти или упасть платформа. Несмотря на эти ограничения и пробирного анализа обеспечивают очень точная мера двигательного поведения.
Для обеспечения успешного выполнения сценария «Остров пробирного анализа», пользователь должен убедиться в том, чтобы ввести правильный путь для ввода и вывода файлов в строках сценария, указывается в протоколе и предоставлять данные в формате правильную папку (как указано на рис. 2). Если пользователь считает критерии, используемые для фильтрации ненадежной экспериментальных данных слишком строгими (строка 68: первое значение в столбце «Подсчитать» является меньше или равно 5; строки 71: первое значение в столбце «Количество» выше, чем общее количество мух, бросили на пла RM + 3), отключить эти параметры фильтра, добавив # перед текст в строках 68 и 71 в сценарии «Остров пробирного анализа». В этом случае все наборы данных будут включены в анализ. Кроме того параметры фильтра можно изменить путем изменения значения в строках, 68 и 71 в зависимости от потребностей пользователя. Можно также вручную отрегулировать возможные артефакты в подсчет значений в «results.txt», созданный макросом «Дрозофилы остров Assay», и сценарий можно запускать повторно, скорректированных данных. Когда пользователь заинтересован в обработке более чем 10 fps, или более чем 10 s данных, количество кадров, обработаны сценарием «Остров пробирного анализа» следуеткорректироваться. Статистический анализ также могут быть заменены пользователем альтернатив.
Папка с названием «Примеры остров Assay, «содержащие примеры с изображения ряды, полученные с помощью остров assay, можно найти на следующем вебсайте: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.4309652.v1. Скачать папку «Примеры остров Assay» и выполните действия, описанные в настоящем Протоколе, чтобы быстро ознакомиться с структуру файлов хранения, обработки изображения с макросом «Остров дрозофилы пробирного» и «Остров пробирного анализа» сценарий.
Assay остров, в сочетании с развитыми макро и анализ сценария, может использоваться для оценки и количественного определения ненормальное движение поведение модели дрозофилы атаксия-телеангиэктазии. Так как assay может быть эффективно применен для различных возрастов, он хорошо подходит для анализа потенциально прогрессивный характер фенотипов.
В целом остров assay, в комбинации с макросом «Дрозофилы остров Assay» и «Остров пробирного анализа» сценарий, является экономически эффективных, надежных и высокоэффективных пробирного объективно проанализировать и определить дефекты опорно- Дрозофила модели двигательных расстройств в духе высокой пропускной способности.

В последние годы прогресс в области технологий виртуализации нового поколения значительно способствовали идентификации генов, лежащие в основе дегенеративный двигательных расстройств головного мозга (например, мозжечковая атаксия и Паркинсона), периферической нейронов происхождения (например, боковой амиотрофический склероз и Наследственные спастические параплегии) и мышечного происхождения (например, мышечной дистрофии Дюшенна и Миотоническая Дистрофия)1,2,3,4 . Несмотря на это мало что известно о молекулярные механизмы, которые лежат в основе большинства этих расстройств. Более глубокое понимание этих механизмов имеет важное значение для разработки методов лечения.
Как и люди движение в модели организмов, таких как полет и передвижения у дрозофилы, находится под контролем центрального мозга, периферической нервной системы и мышц. Кроме того, Быстрая генерация время и генетических элементов дрозофилы делают эту модель организма особенно подходит для высокопроизводительного скрининга генов участвующих в двигательных расстройств и для наркотиков испытания5,6 . Из-за значительное количество условий, которые должны быть проверены в таких экранов, надежным, экономически эффективным и относительно простых анализов, а также инструменты для количественной оценки результаты вывода в автоматическом режиме являются весьма желательно.
Шмидт и др. (2012) 7 описал лоу кост тест называется «остров assay» для оценки дрозофилы двигательного поведения. Assay остров успешно используется в крупномасштабных показы для идентификации генов с глии конкретных функций7, в оценке моделей дрозофилы интеллектуальной инвалидности8, а для общей оценки покупать моторное поведение9. Принцип дизайн остров assay состоит из повышенных платформа, на которой создаются несколько мух. Это вызывает врожденные мотор поведение, что позволяет здоровой мух убежать от платформы в течение нескольких секунд. Assay измеряет количество мух, оставаясь на платформе за время7,8,9. Все эти особенности указывают, что остров assay может быть мощным скрининга для генов, вовлеченных в движение расстройств.
В настоящее время количественный анализ данных снят остров пробирного делается вручную7,8,9. Для повышения эффективности анализа, был разработан метод лоу кост поддается полуавтоматически побег мухи от платформы. Программа установки использует простой веб-камеры, подключен к ноутбуку для сбора время изображения, серия платформы, с кадрами приобрел каждые 0.1 s. кадров затем обрабатываются с макросом «Дрозофилы остров Assay», который измеряет количество мух на платформе над время. Макрос «Дрозофилы остров Assay» разделен на три независимых вложенные макросы: (I) «Создание стека и проекции,» вложенный макрос определяет различные острова эксперименты, хранящихся в различных подпапках и создает стек и проекции каждого временных рядов. (II) подпункта макрос «Определение платформы» будет последовательно открыть все файлы «Projection_image_name.tif», расположенный в отдельных экспериментальных подпапках, в какой момент пользователя запрашивается вручную определить остров платформы как региона интерес (ROI). (III) «анализ» автоматически измеряет количество мух, оставаясь на платформе во временных рядов. Вложенные макросы могут выполняться последовательно (за один проход) или самостоятельно. Для анализа статистических данных сценарий был разработан для автоматической обработки полученных данных и применять статистический тест, чтобы определить, является ли лечение/генотипов ведут себя значительно отличаются друг от друга (рис. 1). Наконец он продемонстрировал, что эта настройка может использоваться для оценки и количественного определения аберрантных опорно-двигательной способности дрозофилы модели для атаксия телеангиэктазии (AT).

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td class="xl19">25 x 95 mm Drosophila vials</td>
			<td class="xl19">Flystuff</td>
			<td class="xl20">32-116SB</td>
			<td class="xl19">-</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl21">Logitech C525 HD Webcam</td>
			<td class="xl19">Logitech</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Any webcam with USB connection is suitable.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Stand to hold webcam</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Lamp</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">12 V LED lights are appropriate</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Pounding pad</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Any mouse pad works</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Island Assay box</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Dimensions 40x35x2.5 cm. Hole 20x30 cm. Transparent.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Island Assay bath</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Dimensions 42x38x25 cm. Non white.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Island/platform</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Dimensions 42x38x25 cm. Uniform white.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Soap</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Standard dishwashing detergent is suitable.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Computer</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Scripts run both on Windows and Mac</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl22">Image-recording software: HandiAvi&#174;</td>
			<td class="xl23">AZcendant&#174;</td>
			<td class="xl23">-</td>
			<td class="xl19">HandyAvi is only compatible with Windows and has been described throughout the manuscript. It can be downloaded from: http://www.azcendant.com/DownloadHandyAvi.html (version 5.0)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl22">Image-recording software: WebcamCapture</td>
			<td class="xl25">-</td>
			<td class="xl25">-</td>
			<td class="xl25">Fiji/ImageJ plugin that can be used on Mac alternative to HandyAvi for image-recordings and can be downloaded from: https://imagej.nih.gov/ij/plugins/webcam-capture/ When using this method, the user has to use the same folder setup and image-recording settings indicated in this manuscript, with the exception that for each experimental replicate, the captured image stack should be exported as Stack.tiff to the corresponding experimental replicate folder. Upon running the &#34;Drosophila Island Assay&#34; macro on this data, no text should be present in the &#34;First frame identifier&#34; setting.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">Fiji</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">Version 1.4 or higher, can be downloaded from: https://figshare.com/s/def4197ee0010b21a76f</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">R studio</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl24">Can be downloaded from: https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/</td>
		</tr>
		<tr>
			<td class="xl19">R</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl19">-</td>
			<td class="xl24">Version 3.3.2, can be downloaded from: https://cran.rstudio.com</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

high-throughput analysis of locomotor behavior in the drosophila island assay

Достижения в области технологий виртуализации нового поколения способствовать идентификации генов (кандидат) болезни двигательных расстройств и других неврологических заболеваний на увеличение скорости. Однако мало что известно о молекулярные механизмы, которые лежат в основе этих расстройств. Генетические, молекулярной и поведенческих инструментов Drosophila melanogaster делает эту модель организма особенно полезным квалифицировать новые заболевания генов и механизмы в духе высокой пропускной способности. Тем не менее высок объём экраны требуют эффективной и надежной анализов, которые, в идеале, являются экономически эффективными и позволяют для автоматизированного количественного определения черты соответствующих для этих расстройств. Assay остров является экономически эффективным и легко set-up метод для оценки дрозофилы двигательного поведения. В этот assay мух брошены на платформу с фиксированной высоты. Это вызывает врожденные мотор ответ, который позволяет мух убежать от платформы в течение нескольких секунд. В настоящее время количественный анализ снят остров анализов делается вручную, что является трудоемким мероприятием, особенно при выполнении больших экранов.
Эта рукопись описывает «Дрозофилы остров Assay» и «Остров пробирного анализа» алгоритмы для высокой пропускной способности, автоматизированной обработки данных и количественной оценки остров анализа данных. В программе установки простой веб-камеры, подключен к ноутбуку собирает изображения серии платформы, в то время как генотипирования. «Дрозофилы остров Assay» алгоритм, разработанный для программное обеспечение open-source Фиджи обрабатывает эти изображения серии и количественно, для каждого экспериментальные условия, количество мух на платформе с течением времени. «Остров пробирного анализа» сценарий, совместимый с свободного программного обеспечения R, был разработан для автоматической обработки полученных данных и вычисления ли лечение/генотипов статистически отличаются. Это значительно повышает эффективность анализа остров и делает его мощный индикация для основных локомоции и поведение рейса. Таким образом, он может применяться для больших экранов расследование летать опорно-двигательной способности, дрозофила модели двигательных расстройств, и эффективность препарата.

Watch this Scientific Journal Video about High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay at JoVE.com

High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay

Assay остров является относительно новой, экономически assay, который может использоваться для оценки основных двигательного поведения Drosophila melanogaster. Эта рукопись описаны алгоритмы для автоматической обработки данных и объективной количественной оценки остров анализа данных, что делает этот assay чувствительных, высок объём индикация для больших экранов генетических или фармакологических.

Высок объём анализ двигательного поведения в Assay остров дрозофилы

Advances in next-generation sequencing technologies contribute to the identification of (candidate) disease genes for movement disorders and other ...

Research

JoVE Journal

Neuroscience

High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay

Single Sensillum Recordings in the Insects Drosophila melanogaster and Anopheles gambiae

Single Sensillum Recordings in the Insects Drosophila melanogaster and Anopheles gambiae

Одноместный Recordings сенсиллы в Насекомые Дрозофилы И Anopheles gambiae</em

The sense of smell is essential for insects to find foods, mates, predators, and oviposition sites3. Insect olfactory sensory neurons (OSNs) are enclosed ...

Assaying Locomotor, Learning, and Memory Deficits in Drosophila Models of Neurodegeneration

Assaying Locomotor, Learning, and Memory Deficits in Drosophila Models of Neurodegeneration

Опорно-двигательного опробование, обучение и память Дефицит Drosophila Модели нейродегенерации

Advances in genetic methods have enabled the study of genes involved in human neurodegenerative diseases using Drosophila as a model system1. Most of ...

Studying the Neural Basis of Adaptive Locomotor Behavior in Insects

Изучение нейронных основе адаптивной функции опорно-двигательного у насекомых

Studying the neural basis of walking behavior, one often faces the problem that it is hard to separate the neuronally produced stepping output from those ...

In vivo Electroporation of Developing Mouse Retina

In vivo Electroporation of Developing Mouse Retina

В естественных условиях Электропорация развивающихся Мышь Retina

The functional characterization of genes expressed during mammalian retinal development remains a significant challenge.  Gene targeting to generate ...

Methods to Assay Drosophila Behavior

Methods to Assay Drosophila Behavior

Методы Анализ Drosophila Поведение

Drosophila melanogaster, the fruit fly, has been used to study molecular mechanisms of a wide range of human diseases such as cancer, cardiovascular ...

A Single-fly Assay for Foraging Behavior in Drosophila

A Single-fly Assay for Foraging Behavior in Drosophila

Одно-муха Анализ на нагула поведения в<em&gt; Дрозофилы</em

For many animals, hunger promotes changes in the olfactory system in a manner that facilitates the search for appropriate food sources. In this video ...

Determination of the Spontaneous Locomotor Activity in Drosophila melanogaster

Determination of the Spontaneous Locomotor Activity in Drosophila melanogaster

Определение спонтанную двигательную активность в<em&gt; Дрозофилы</em

Drosophila melanogaster has been used as an excellent model organism to study environmental and genetic manipulations that affect behavior. One such ...

High Throughput Assay to Examine Egg-Laying Preferences of Individual Drosophila melanogaster

High Throughput Assay to Examine Egg-Laying Preferences of Individual Drosophila melanogaster

Высокая пропускная способность анализа, чтобы изучить яйцекладка предпочтений отдельных<em&gt; Дрозофилы</em

Recently, egg-laying preference of Drosophila has emerged as a genetically tractable model to study the neural basis of simple decision-making processes. ...

A Simple Way to Measure Alterations in Reward-seeking Behavior Using Drosophila melanogaster

A Simple Way to Measure Alterations in Reward-seeking Behavior Using Drosophila melanogaster

Простой способ измерить изменения в Reward обращаемость за помощью<em&gt; Дрозофилы</em

We describe a protocol for measuring ethanol self-administration in fruit flies (Drosophila melanogaster) as a proxy for changes in reward states. We ...

Quantification of Drosophila Grooming Behavior

Количественное определение поведения дрозофилы

Drosophila grooming behavior is a complex multi-step locomotor program that requires coordinated movement of both forelegs and hindlegs. Here we present a ...