Name: multiplexed immunofluorescence analysis and quantification of intratumoral pd-1+ tim-3+ cd8+ t cells
Uploaded: 2018-02-08T12:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Multiplexed Immunofluorescence Analysis and Quantification of Intratumoral PD-1+ Tim-3+ CD8+ T Cells at JoVE.com

Ce travail a été soutenu par des subventions de l’Institut National du Cancer (INCA) (HE), Ligue contre le Cancer (HE), Université Sorbonne Paris Cité (HE), ANR (Selectimmunco) (HE), Labex Immuno-oncologie (HE), SIRIC CARPEM (CG, ET). GDE a été financée par une bourse de la Fondation ARC. EV et CD ont été financées par une bourse de l’APHP (recherche de bourse d’année). ChB est financé par une bourse de recherche de l’Université Sorbonne Paris Cité (contrat doctoral). Les auteurs remercient Bristol Myers Squibb pour leur financement dans ce projet. Les auteurs remercient le département de pathologie de l’Hôpital Européen Georges Pompidou et Necker (Laurianne Chambolle, Elodie Michel et Gisèle Legall). Les auteurs remercient la plate-forme de l’histologie des rendez-vous, Hôpital Européen Georges Pompidou (Corinne Lesaffre).

Cette étude a été réalisée conformément à la déclaration d’Helsinki et a été approuvée par le Comité d’éthique local (CPP Ile de France nr. 2012-05-04). Consentement éclairé a été obtenu par le participant dans les cohortes.
1. tissu matériel
<ol><li>Recueillir des échantillons de tissus RCC le jour de la chirurgie. Gérer le spécimen chirurgical à température ambiante (département de pathologie).</li>
	<li>Prélever un échantillon de la tumeur d’environ 0,5 cm ...

<ol>
	<li>Borghaei, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nivolumab+versus+Docetaxel+in+Advanced+Nonsquamous+Non-Small-Cell+Lung+Cancer.">Nivolumab versus Docetaxel in Advanced Nonsquamous Non-Small-Cell Lung Cancer.</a> N Engl J Med. 373 (17), 1627-1639 (2015).</li><li>Granier, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cancer+immunotherapy:+Rational+and+recent+breakthroughs.">Cancer immunotherapy: Rational and recent breakthroughs.</a> Rev Med Interne. 37 (10), 694-700 (2016).</li><li>Motzer, R. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nivolumab+for+Metastatic+Renal+Cell+Carcinoma:+Results+of+a+Randomized+Phase+II+Trial.">Nivolumab for Metastatic Renal Cell Carcinoma: Results of a Randomized Phase II Trial.</a> J Clin Oncol. 33 (13), 1430-1437 (2015).</li><li>Robert, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nivolumab+in+previously+untreated+melanoma+without+BRAF+mutation.">Nivolumab in previously untreated melanoma without BRAF mutation.</a> N Engl J Med. 372 (4), 320-330 (2015).</li><li>Robert, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ipilimumab+plus+dacarbazine+for+previously+untreated+metastatic+melanoma.">Ipilimumab plus dacarbazine for previously untreated metastatic melanoma.</a> N Engl J Med. 364 (26), 2517-2526 (2011).</li><li>Rosenberg, J. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Atezolizumab+in+patients+with+locally+advanced+and+metastatic+urothelial+carcinoma+who+have+progressed+following+treatment+with+platinum-based+chemotherapy:+a+single-arm,+multicentre,+phase+2+trial.">Atezolizumab in patients with locally advanced and metastatic urothelial carcinoma who have progressed following treatment with platinum-based chemotherapy: a single-arm, multicentre, phase 2 trial.</a> Lancet. 387 (10031), 1909-1920 (2016).</li><li>Schadendorf, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pooled+Analysis+of+Long-Term+Survival+Data+From+Phase+II+and+Phase+III+Trials+of+Ipilimumab+in+Unresectable+or+Metastatic+Melanoma.">Pooled Analysis of Long-Term Survival Data From Phase II and Phase III Trials of Ipilimumab in Unresectable or Metastatic Melanoma.</a> J Clin Oncol. 33 (17), 1889-1894 (2015).</li><li>Ribas, A., Hu-Lieskovan, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=What+does+PD-L1+positive+or+negative+mean?.">What does PD-L1 positive or negative mean?.</a> J Exp Med. 213 (13), 2835-2840 (2016).</li><li>Rizvi, N. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cancer+immunology.+Mutational+landscape+determines+sensitivity+to+PD-1+blockade+in+non-small+cell+lung+cancer.">Cancer immunology. Mutational landscape determines sensitivity to PD-1 blockade in non-small cell lung cancer.</a> Science. 348 (6230), 124-128 (2015).</li><li>Roussel, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Composite+biomarkers+defined+by+multiparametric+immunofluorescence+analysis+identify+ALK-positive+adenocarcinoma+as+a+potential+target+for+immunotherapy.">Composite biomarkers defined by multiparametric immunofluorescence analysis identify ALK-positive adenocarcinoma as a potential target for immunotherapy.</a> OncoImmunology. 6 (4), e1286437 (2017).</li><li>Pages, F., Granier, C., Kirilovsky, A., Elsissy, C., Tartour, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biomarqueurs+pr&#233;dictifs+de+r&#233;ponse+aux+traitements+bloquant+les+voies+de+costimulation+inhibitrices.">Biomarqueurs pr&#233;dictifs de r&#233;ponse aux traitements bloquant les voies de costimulation inhibitrices.</a> Bull Cancer. 103, S151-S159 (2016).</li><li>Tumeh, P. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PD-1+blockade+induces+responses+by+inhibiting+adaptive+immune+resistance.">PD-1 blockade induces responses by inhibiting adaptive immune resistance.</a> Nature. 515 (7528), 568-571 (2014).</li><li>Fourcade, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Upregulation+of+Tim-3+and+PD-1+expression+is+associated+with+tumor+antigen-specific+CD8++T+cell+dysfunction+in+melanoma+patients.">Upregulation of Tim-3 and PD-1 expression is associated with tumor antigen-specific CD8+ T cell dysfunction in melanoma patients.</a> J Exp Med. 207 (10), 2175-2186 (2010).</li><li>Koyama, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Adaptive+resistance+to+therapeutic+PD-1+blockade+is+associated+with+upregulation+of+alternative+immune+checkpoints.">Adaptive resistance to therapeutic PD-1 blockade is associated with upregulation of alternative immune checkpoints.</a> Nat Commun. 7, 10501 (2016).</li><li>Wherry, E. J., Kurachi, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+and+cellular+insights+into+T+cell+exhaustion.">Molecular and cellular insights into T cell exhaustion.</a> Nat Rev Immunol. 15 (8), 486-499 (2015).</li><li>Cai, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tim-3+expression+represents+dysfunctional+tumor+infiltrating+T+cells+in+renal+cell+carcinoma.">Tim-3 expression represents dysfunctional tumor infiltrating T cells in renal cell carcinoma.</a> World J Urol. 34 (4), 561-567 (2016).</li><li>Sakuishi, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Targeting+Tim-3+and+PD-1+pathways+to+reverse+T+cell+exhaustion+and+restore+anti-tumor+immunity.">Targeting Tim-3 and PD-1 pathways to reverse T cell exhaustion and restore anti-tumor immunity.</a> J Exp Med. 207 (10), 2187-2194 (2010).</li><li>Stack, E. C., Wang, C., Roman, K. A., Hoyt, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiplexed+immunohistochemistry,+imaging,+and+quantitation:+a+review,+with+an+assessment+of+Tyramide+signal+amplification,+multispectral+imaging+and+multiplex+analysis.">Multiplexed immunohistochemistry, imaging, and quantitation: a review, with an assessment of Tyramide signal amplification, multispectral imaging and multiplex analysis.</a> Methods. 70 (1), 46-58 (2014).</li><li>Bethmann, D., Feng, Z., Fox, B. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immunoprofiling+as+a+predictor+of+patient's+response+to+cancer+therapy-promises+and+challenges.">Immunoprofiling as a predictor of patient's response to cancer therapy-promises and challenges.</a> Curr Opin Immunol. 45, 60-72 (2017).</li><li>Badoual, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PD-1-expressing+tumor-infiltrating+T+cells+are+a+favorable+prognostic+biomarker+in+HPV-associated+head+and+neck+cancer.">PD-1-expressing tumor-infiltrating T cells are a favorable prognostic biomarker in HPV-associated head and neck cancer.</a> Cancer Res. 73 (1), 128-138 (2013).</li><li>Nizard, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Induction+of+resident+memory+T+cells+enhances+the+efficacy+of+cancer+vaccine.">Induction of resident memory T cells enhances the efficacy of cancer vaccine.</a> Nat Commun. 8, 15221 (2017).</li><li>Nghiem, P. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PD-1+Blockade+with+Pembrolizumab+in+Advanced+Merkel-Cell+Carcinoma.">PD-1 Blockade with Pembrolizumab in Advanced Merkel-Cell Carcinoma.</a> N Engl J Med. 374 (26), 2542-2552 (2016).</li><li>Roussel, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Composite+biomarkers+defined+by+multiparametric+immunofluorescence+analysis+identify+ALK-positive+adenocarcinoma+as+a+potential+target+for+immunotherapy.">Composite biomarkers defined by multiparametric immunofluorescence analysis identify ALK-positive adenocarcinoma as a potential target for immunotherapy.</a> Oncoimmunology. (4), (2017).</li><li>Woods, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mismatch+in+epitope+specificities+between+IFNgamma+inflamed+and+uninflamed+conditions+leads+to+escape+from+T+lymphocyte+killing+in+melanoma.">Mismatch in epitope specificities between IFNgamma inflamed and uninflamed conditions leads to escape from T lymphocyte killing in melanoma.</a> J Immunother Cancer. 4, 10 (2016).</li><li>Granier, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tim-3+Expression+on+Tumor-Infiltrating+PD-1+CD8++T+Cells+Correlates+with+Poor+Clinical+Outcome+in+Renal+Cell+Carcinoma.">Tim-3 Expression on Tumor-Infiltrating PD-1+CD8+ T Cells Correlates with Poor Clinical Outcome in Renal Cell Carcinoma.</a> Cancer Res. 77 (5), 1075-1082 (2017).</li><li>Feng, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multispectral+Imaging+of+T+and+B+Cells+in+Murine+Spleen+and+Tumor.">Multispectral Imaging of T and B Cells in Murine Spleen and Tumor.</a> J Immunol. 196 (9), 3943-3950 (2016).</li><li>Feng, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multispectral+imaging+of+formalin-fixed+tissue+predicts+ability+to+generate+tumor-infiltrating+lymphocytes+from+melanoma.">Multispectral imaging of formalin-fixed tissue predicts ability to generate tumor-infiltrating lymphocytes from melanoma.</a> J Immunother Cancer. 3, 47 (2015).</li><li>Fridman, W. H., Pages, F., Sautes-Fridman, C., Galon, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+immune+contexture+in+human+tumours:+impact+on+clinical+outcome.">The immune contexture in human tumours: impact on clinical outcome.</a> Nat Rev Cancer. 12 (4), 298-306 (2012).</li><li>Nizard, M., Roussel, H., Tartour, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Resident+Memory+T+Cells+as+Surrogate+Markers+of+the+Efficacy+of+Cancer+Vaccines.">Resident Memory T Cells as Surrogate Markers of the Efficacy of Cancer Vaccines.</a> Clin Cancer Res. 22 (3), 530-532 (2016).</li><li>Sandoval, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mucosal+imprinting+of+vaccine-induced+CD8(+)+T+cells+is+crucial+to+inhibit+the+growth+of+mucosal+tumors.">Mucosal imprinting of vaccine-induced CD8(+) T cells is crucial to inhibit the growth of mucosal tumors.</a> Sci Transl Med. 5 (172), 172ra120 (2013).</li><li>Carstens, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatial+computation+of+intratumoral+T+cells+correlates+with+survival+of+patients+with+pancreatic+cancer.">Spatial computation of intratumoral T cells correlates with survival of patients with pancreatic cancer.</a> Nat Commun. 8, 15095 (2017).</li></ol>

Modifications et dépannage :
La qualité du tissu est un paramètre important ; Il peut être facilement vérifiée par coloration hématoxyline et éosine.
Un des avantages de la technique est la possibilité de salissures multiplexé, mais pour éviter tout débordement de fluorophore, il est recommandé de choisir des longueurs d’onde d’émission avec delta de 10 minimum nm. Ici, parce que nous avons eu 4 salissures y compris DAPI, nous av...

Dans quelques années, l’immunothérapie est devenue un traitement très prometteur pour de nombreux types de cancers, dont le RCC. En particulier, immunothérapie, basée sur l’inhibition des points de contrôle inhibiteurs comme PD-1 et CTLA-4 a été signalé à être cliniquement efficace1,2,3,4,5, 6. anticorps monoclonaux contre CTLA-4, PD-1, ou programme mort Ligand 1 (PD-L1) ont déjà été approuvés dans plusieurs types de cancers et conduire à des réponses cliniques durables dans plus de 20 % des patients7. Néanmoins, pas tous les patients sont les intervenants, le coût du traitement est élevé, et ces traitements sont toxiques, conduisant à des potentiels graves effets secondaires de type auto-immune. Par conséquent, le défi actuel est d’identifier des marqueurs prédictifs de ces nouvelles immunothérapies. Le taux de mutations dans la tumeur, l’expression de PD-L1 ou les niveaux d’intratumorale CD8+ infiltration de lymphocytes T ont été signalés en corrélation avec la réponse clinique. Cependant, cette association est encore trop faible pour recommander l’utilisation de ces biomarqueurs cliniques en pratique clinique, à l’exception de l’essai de compagnon pour PD-L1 avant l’administration de la Pembrolizumab en non-small cell lung cancer (NSCLC) patients8 ,9,1011,12. Il a été démontré que la co-expression de nombreux récepteurs inhibiteurs comme PD-1, Tim-3, 3-Lag, et CTLA-4, induit un phénotype épuisement cellulaire et la résistance à la thérapie13,14,15. Puisque le sang périphérique n’est pas représentatif du microenvironnement tumoral, c’est d’un grand intérêt à analyser les caractéristiques phénotypiques de la cellules in situ. PD-1 et Tim-3 cellules T exprimant conjointement sont connus pour être des cellules fonctionnellement altérées dans plusieurs contextes13,16,17. Dans cette étude, l’impact pronostique de la co-expression des deux récepteurs inhibiteurs PD-1 et Tim-3 sur CD8+ T des cellules a été évaluée.
Jusqu'à présent, étudier la co-expression de multiples marqueurs sur tumeur infiltrant les lymphocytes (TILs) a principalement été réalisée par analyse en cytométrie en flux, rend nécessaire de travailler sur les tumeurs fraîches et donc excluant des analyses rétrospectives. Traditionnels in situ de coloration, coloration seule à la fois peut être effectuée, et la caractérisation du type qui a exprime les marqueurs n’est pas possible. Par exemple, PD-L1 est exprimée par de nombreux types de cellules du microenvironnement tumoral, rendant difficile de définir par immunohistochimie conventionnelle analyse quelles cellules exprimant PD-L1 sont les plus pertinents pour les études de corrélation. Dans ce travail, nous avons développé une méthode d’immunofluorescence multiparamétriques innovatrice in situ avec comptage informatique pour mettre en corrélation la co-expression de PD-1 et Tim-3 par tumeur infiltrant CD8+ T-cellules, avec des résultats cliniques dans la RCC. Cette technique présente plusieurs avantages, y compris la possibilité d’analyser au niveau unicellulaire et marqueurs multiples en même temps à l’aide d’une caméra multispectrale qui peut capturer des intervalles limités > 10 nm à travers des cristaux liquides filtres18. En outre, la procédure est automatique ce qui permet une reproductibilité entre opérateurs et une analyse raccourcie par rapport aux techniques manuelles19. Dans le domaine du cancer, plusieurs études ont rapporté convaincre plusieurs salissures des molécules immunitaires comme PD-1, PD-L1 et CD8 dans la cellule de Merkel carcinome, cancer du poumon et tête et du cou du cancer20,21,22, 23. le nombre d’éléments automatisés est possible avec une formation par l’utilisateur (étape de la détermination du phénotype). La fluorescence est mesurée dans les compartiments cellulaires (membrane, cytoplasme et noyaux).
Ici, les différents sous-ensembles d’infiltration tumorale de CD8+ T des cellules exprimant PD-1 et/ou Tim-3 dans une grande cohorte de RCC étaient comptés et les résultats ont été corrélés avec des scores de gravité clinique et les paramètres de survie. Il était également possible d’analyser l’intensité de fluorescence membranaire à la résolution cellulaire avec des données de Fluorescence de moyenne intensité (MFI) comme en cytométrie en flux. Pour autant que nous le savons, cela représente les première déclaration pronostique résultats de l’étude à l’aide de cette technique de comptage des fonction d’imagerie multispectrale.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Vectra 3 Automated Quantitative Pathology Imaging&#160;</td>
			<td>Perkin Elmer</td>
			<td>CLS142338</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>inForm cell analysis 2.1.</td>
			<td>Perkin Elmer</td>
			<td>CLS135781</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>R software</td>
			<td>https://www.r-project.org</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dakopen delimiting pen</td>
			<td>Dako</td>
			<td>S2002</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tris Buffer Salin TBS Tablets</td>
			<td>Takara, Bio Inc.</td>
			<td>TAKT9141Z</td>
			<td>pH7.6 100 tablet</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tris Buffer Salin Tween 20 TBS(+Tween20)</td>
			<td>Takara, Bio Inc.</td>
			<td>TAKT9142Z</td>
			<td>pH 7.6 100 tablets</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Biotin blocking system</td>
			<td>Dako</td>
			<td>X0590</td>
			<td>Avidin 0.1% and Biotin 0.01%</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>normal donkey serum</td>
			<td>Jackson Immunoresearch</td>
			<td>017-000-001</td>
			<td>5% vol./vol. concentration</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fluoroshield with DAPI</td>
			<td>Sigma-aldrich</td>
			<td>F6057</td>
			<td>1.5 &#181;g/mL concentration&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Knittel glass coverslip</td>
			<td>Knittel&#160;Gl&#228;ser,</td>
			<td>100039</td>
			<td>24x60 mm 100 cover slips</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Rabbit anti-CD8 Clone P17-V</td>
			<td>novus</td>
			<td>NBP1-79055</td>
			<td>use at 4&#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mouse anti-PD-1 Clone NAT</td>
			<td>abcam</td>
			<td>ab52587</td>
			<td>use at 2 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Goat anti-Tim-3</td>
			<td>R&#38;D</td>
			<td>AF2365</td>
			<td>use at 3 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Rabbit anti-PD-L1 Clone SP142</td>
			<td>Roche</td>
			<td>7309457001</td>
			<td>use at 1 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mouse AF647 labeled pan- Keratin Clone C11&#160;</td>
			<td>Cell Signalling</td>
			<td>4528</td>
			<td>use at 0.5 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Goat anti-human gal9&#160;</td>
			<td>R&#38;D</td>
			<td>AF2045</td>
			<td>use at 0.3 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cyan 5 conjugated donkey anti-rabbit&#160;</td>
			<td>Jackson Immunoresearch</td>
			<td>711-175-152</td>
			<td>use at 5 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Biotinylated F(ab&#8217;2) donkey anti-mouse IgG</td>
			<td>Jackson Immunoresearch</td>
			<td>715-066-150</td>
			<td>use at 3 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Alexa Fluor488 conjugated donkey anti-goat IgG</td>
			<td>abcam</td>
			<td>ab150133</td>
			<td>use at 5 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cy3 labeled streptavidin&#160;</td>
			<td>Amersham</td>
			<td>PA43001</td>
			<td>use at 3 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>negative control mouse IgG1</td>
			<td>Dako</td>
			<td>X0931</td>
			<td>use at 2 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IgG from goat serum</td>
			<td>Sigma-aldrich</td>
			<td>I5256</td>
			<td>use at 3 &#181;g/mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IgG from rabbit serum</td>
			<td>Sigma-aldrich</td>
			<td>I5006</td>
			<td>use at 4&#181;g/mL</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

multiplexed immunofluorescence analysis and quantification of intratumoral pd-1+ tim-3+ cd8+ t cells

Les cellules immunitaires sont des composantes importantes du microenvironnement tumoral et influer sur la croissance tumorale et l’évolution à toutes les étapes de la cancérogenèse. Notamment, il est maintenant bien établi que le système immunitaire infiltrent dans les tumeurs humaines peut corréler avec le pronostic et la réponse au traitement. L’analyse de l’infiltrat immunitaire dans le microenvironnement tumoral est devenu un enjeu majeur pour la classification des patients et la réponse au traitement.
La co-expression de récepteurs inhibiteurs tels que le programme Cell Death Protein 1 (PD1 ; également connu sous le nom CD279), Lymphocyte T cytotoxique associé protéines 4 (CTLA-4), lymphocytes immunoglobuline et mucine contenant des protéines-3 (Tim-3 ; également connu sous le nom CD366) lymphocytaire Activation de gènes 3 (gal-3, aussi connu sous le nom CD223), est une caractéristique de l’épuisement de lymphocytes T. Nous avons développé une immunofluorescence multiparamétriques in situ afin d’identifier et de quantifier au niveau cellulaire la co-expression de ces récepteurs inhibiteurs de coloration. Sur une série rétrospective de tissus congelés de carcinomes des cellules rénales (CCR), à l’aide d’une technologie d’imagerie multispectrale fluorescence couplée avec une analyse d’images, il a été constaté que la co-expression de PD-1 et Tim-3 sur tumeur infiltrant CD8+ T des cellules est corrélée à un mauvais pronostic dans la RCC. À notre connaissance, cela représente la première étude démontrant que cela automatisé technologie multiplex in situ peut avoir une certaine pertinence clinique.

En utilisant le protocole général décrit ci-dessus, l’étude visait à quantifier intratumorale CD8+ T cells co exprimant les récepteurs inhibiteurs PD-1 et Tim-3 dans les tissus de patients atteints d’hypernéphrome et de corréler les résultats avec les résultats cliniques25congelés.
Optimisation de la coloration de CD8/PD-1/Tim-3 :
<p class="jove_content" fo:...

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Multiplexed Immunofluorescence Analysis and Quantification of Intratumoral PD-1+ Tim-3+ CD8+ T Cells

Multiplexés Immunofluorescence analyse et Quantification d’intratumorale PD-1+ + Tim-3 CD8+ T Cells

Étudier le microenvironnement tumoral peut identifier des biomarqueurs pronostiques ou prédictifs de la réponse clinique à l’immunothérapie. Présentée ici, une méthode innovatrice repose sur in situ par fluorescence multispectrale d’imagerie permettant d’analyser et de compter automatiquement différentes sous-populations de CD8+ T des cellules. Cette technique fiable et reproductible est adaptée pour les analyses de cohorte importante.

Immune cells are important components of the tumor microenvironment and influence tumor growth and evolution at all stages of carcinogenesis. Notably, it ...

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Multiplexed Immunofluorescence Analysis and Quantification of Intratumoral PD-1+ Tim-3+ CD8+ T Cells

Ex Vivo Imaging of Resident CD8 T Lymphocytes in Human Lung Tumor Slices Using Confocal Microscopy

Ex Vivo Imaging of Resident CD8 T Lymphocytes in Human Lung Tumor Slices Using Confocal Microscopy

Ex Vivo Imagerie des Lymphocytes T CD8 résident dans des tumeurs du poumon humain tranches à l’aide de la microscopie confocale

CD8 T cell are key players in the fight against cancer. In order for CD8 T cells to kill tumor cells they need to enter into the tumor, migrate within the ...

Recherche

Recherche en cancérologie

Real Time Detection of In Vitro Tumor Cell Apoptosis Induced by CD8+ T Cells to Study Immune Suppressive Functions of Tumor-infiltrating Myeloid Cells

Real Time Detection of In Vitro Tumor Cell Apoptosis Induced by CD8+ T Cells to Study Immune Suppressive Functions of Tumor-infiltrating Myeloid Cells

Détection en temps réel de dans l’apoptose des cellules tumorales in Vitro induite par CD8+ T Cells pour étudier les fonctions immunitaires de suppresseurs de tumeur-infiltration de cellules myéloïdes

Potentiation of the tumor-killing ability of CD8+ T cells in tumors, along with their efficient tumor infiltration, is a key element of successful ...

Pathological Analysis of Lung Metastasis Following Lateral Tail-Vein Injection of Tumor Cells

Analyse pathologique des métastases pulmonaires après injection latérale de cellules tumorales dans la veine caudale

Metastasis, the primary cause of morbidity and mortality for most cancer patients, can be challenging to model preclinically in mice. Few spontaneous ...

Evaluating Cell Death Using Cell-Free Supernatant of Probiotics in Three-Dimensional Spheroid Cultures of Colorectal Cancer Cells

Évaluation de la mort cellulaire à l’aide d’un surnageant sans cellules de probiotiques dans des cultures sphéroïdes tridimensionnelles de cellules cancéreuses colorectales

This manuscript describes a protocol to evaluate cancer cell deaths in three dimensional (3D) spheroids of multicellular types of cancer cells using ...

Immunofluorescence Imaging of DNA Damage and Repair Foci in Human Colon Cancer Cells

Imagerie d’immunofluorescence des dommages d’ADN et des foyers de réparation dans les cellules cancéreuses du côlon humain

The purpose of the manuscript is to provide a step-by-step protocol for performing immunofluorescence microscopy to study the radiation-induced DNA damage ...

Tumor Transplantation for Assessing the Dynamics of Tumor-Infiltrating CD8+ T Cells in Mice

Tumor Transplantation for Assessing the Dynamics of Tumor-Infiltrating CD8+ T Cells in Mice

Transplantation tumorale pour évaluer la dynamique des lymphocytes T CD8+ infiltrant la tumeur chez la souris

T cell-mediated immunity plays a crucial role in immune responses against tumors, with cytotoxic T lymphocytes (CTLs) playing the leading role in ...

Expansion and Enrichment of Gamma-Delta (&#947;&#948;) T Cells from Apheresed Human Product

Expansion and Enrichment of Gamma-Delta ÃƒÅ½Ã‚Â³ÃƒÅ½Ã‚Â´ T Cells from Apheresed Human Product

Expansion et enrichissement des lymphocytes T gamma-delta (γδ) à partir d’un produit humain aphéré

Although V&#947;9V&#948;2 T cells are a minor subset of T lymphocytes, this population is sought after for its ability to recognize antigens in a major ...

Multiplexed Barcoding Image Analysis for Immunoprofiling and Spatial Mapping Characterization in the Single-Cell Analysis of Paraffin Tissue Samples

Analyse d’images de codes à barres multiplexés pour l’immunoprofilage et la caractérisation de la cartographie spatiale dans l’analyse unicellulaire d’échantillons de tissus de paraffine

Multiplexed imaging technology using antibody barcoding with oligonucleotides, which sequentially detects multiple epitopes in the same tissue section, is ...

Multiplex Immunofluorescence and Spatial Image Analysis of the Tumor Microenvironment

Multiplex Immunofluorescence Combined with Spatial Image Analysis for the Clinical and Biological Assessment of the Tumor Microenvironment

Multiplex Immunofluorescence Combined with Spatial Image Analysis for the Clinical and Biological Assessment of the Tumor Microenvironment (Video) | JoVE 

Immunofluorescence multiplex combinée à l’analyse d’images spatiales pour l’évaluation clinique et biologique du microenvironnement tumoral

The tumor microenvironment (TME) is composed of a plethora of different cell types, such as cytotoxic immune cells and immunomodulatory cells. Depending ...

Flow Analysis of PDL1-Vaxx Antibody Blockade Using Magnetic Fluorescent Beads

Magnetic Fluorescent Bead-Based Dual-Reporter Flow Analysis of PDL1-Vaxx Peptide Vaccine-Induced Antibody Blockade of the PD-1/PD-L1 Interaction

Magnetic Fluorescent Bead-Based Dual-Reporter Flow Analysis of PDL1-Vaxx Peptide Vaccine-Induced Antibody Blockade of the PD-1/PD-L1 Interaction (Video) | JoVE

Analyse de flux à double rapporteur à base de billes fluorescentes magnétiques du blocage de l’interaction-1/-L1 par les anticorps induits par le vaccin PDL1-VAXX

The inhibition of checkpoint receptors (PD-1, PD-L1, and CTLA-4) with monoclonal antibodies has shown great benefit in clinical trials for treating cancer ...