Name: leaf spray mass spectrometry: a rapid ambient ionization technique to directly assess metabolites from plant tissues
Uploaded: 2018-06-21T15:00:00
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Questo lavoro è stato finanziato dalla sovvenzione NSF Plant Genome Research Program IOS-1238812 e la borsa di studio post-dottorato in biologia IOS-1400818. Il lavoro inoltre è stato finanziato da una borsa di studente laureato di Monsanto di Katherine A. Sammons. Il programma Fulbright africano ricercatore studiosi (2017-2018) è ringraziato per finanziamenti accordati per Nokwanda P. Makunga. Noi apprezziamo molto la donazione di una fonte di nanospray da Jessica Prenni e l'impianto di proteomica e metabolomica presso la Colorado State University.

1. le modifiche all'origine Nanospray per foglia spruzzare MS
<ol><li>Utilizzare un'origine nanospray modificate per spruzzo del foglio MS. Come nessun componenti fluidici sono necessari per spruzzo del foglio MS, è possibile modificare l'origine rimuovendo la sonda LC dall'origine.</li>
	<li>Assemblare il filo MS di spruzzo di foglia si applicherà la tensione al tessuto della pianta con il perno adatto per collegare la sorgente. Saldare il perno a un'estremità di un filo isolato; un morsetto all'estremità opposta ...

<ol>
	<li>Pitt, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Principles+and+applications+of+liquid+chromatography+-+mass+spectrometry+in+clinical+biochemistry.">Principles and applications of liquid chromatography - mass spectrometry in clinical biochemistry.</a> The Clinical Biochemist Reviews. 30 (1), 19-34 (2009).</li><li>Cooks, R. G., Ouyang, Z., Takats, Z., Wiseman, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+technologies.+Ambient+mass+spectrometry.">Detection technologies. Ambient mass spectrometry.</a> Science. 311 (5767), 1566-1570 (2006).</li><li>Kim, H. 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G., Ouyang, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Leaf+spray:+direct+chemical+analysis+of+plant+material+and+living+plants+by+mass+spectrometry.">Leaf spray: direct chemical analysis of plant material and living plants by mass spectrometry.</a> Analytical Chemistry. 83 (20), 7608-7613 (2011).</li><li>Chan, S. L. -. F., Wong, M. Y. -. M., Tang, H. -. W., Che, C. -. M., Ng, K. -. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tissue-spray+ionization+mass+spectrometry+for+raw+herb+analysis.">Tissue-spray ionization mass spectrometry for raw herb analysis.</a> Rapid Communications in Mass Spectrometry. 25 (19), 2837-2843 (2011).</li><li>Wang, H., Liu, J., Cooks, R. G., Ouyang, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Paper+spray+for+direct+analysis+of+complex+mixtures+using+mass+spectrometry.">Paper spray for direct analysis of complex mixtures using mass spectrometry.</a> Angewandte Chemie International Edition. 49 (5), 877-880 (2010).</li><li>Liu, J., Wang, H., Cooks, R. G., Ouyang, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Leaf+spray:+Direct+chemical+analysis+of+plant+material+and+living+plants+by+mass+spectrometry.">Leaf spray: Direct chemical analysis of plant material and living plants by mass spectrometry.</a> Analytical Chemistry. 83 (20), 7608-7613 (2011).</li><li>Malaj, N., Ouyang, Z., Sindona, G., Cooks, R. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+pesticide+residues+by+leaf+spray+mass+spectrometry.">Analysis of pesticide residues by leaf spray mass spectrometry.</a> Analytical Methods. 4 (7), 1913-1919 (2012).</li><li>Snyder, D. T., Schilling, M. C., Hochwender, G., Kaufman, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analytical+methods+profiling+phenolic+glycosides+in+Populus+deltoides+and+Populus+grandidentata+by+leaf+spray+ionization+tandem+mass+spectrometry.">Analytical methods profiling phenolic glycosides in Populus deltoides and Populus grandidentata by leaf spray ionization tandem mass spectrometry.</a> Analytical Methods. 7 (3), 870-876 (2015).</li><li>Falcone, C. E., Cooks, R. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+recognition+of+emerald+ash+borer+infestation+using+leaf+spray+mass+spectrometry.">Molecular recognition of emerald ash borer infestation using leaf spray mass spectrometry.</a> Rapid Communications in Mass Spectrometry. 30 (11), 1304-1312 (2016).</li><li>Liu, J., Gu, Z., Yao, S., Zhang, Z., Chen, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+analysis+of+Callicarpa+L.+using+direct+spray+ionization+mass+spectrometry.">Rapid analysis of Callicarpa L. using direct spray ionization mass spectrometry.</a> Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 124, 93-103 (2016).</li><li>Freund, D. M., Martin, A. C., Cohen, J. D., Hegeman, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Direct+detection+of+surface+localized+specialized+metabolites+from+Glycyrrhiza+lepidota+(American+licorice)+by+leaf+spray+mass+spectrometry.">Direct detection of surface localized specialized metabolites from Glycyrrhiza lepidota (American licorice) by leaf spray mass spectrometry.</a> Planta. 247 (1), 267-275 (2018).</li><li>Smith, M. T., Crouch, N. R., Gericke, N., Hirst, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Psychoactive+constituents+of+the+genus+Sceletium+N.E.Br.+and+other+Mesembryanthemaceae:+a+review.">Psychoactive constituents of the genus Sceletium N.E.Br. and other Mesembryanthemaceae: a review.</a> Journal of Ethnopharmacology. 50 (3), 119-130 (1996).</li><li>Gerickea, N., Viljoen, A. 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J., Bain, R. M., Wiley, J. S., Ouyang, Z., Cooks, R. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mass+spectrometry+in+the+home+and+garden.">Mass spectrometry in the home and garden.</a> Journal of The American Society for Mass Spectrometry. 26 (2), 224-230 (2015).</li><li>Lawton, Z. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analytical+validation+of+a+portable+mass+spectrometer+featuring+interchangeable,+ambient+ionization+sources.">Analytical validation of a portable mass spectrometer featuring interchangeable, ambient ionization sources.</a> Journal of the American Society for Mass Spectrometry. 28 (6), 1048-1059 (2017).</li><li>. GNPS Available from: <a target="_blank" href="https://gnps.ucsd.edu/">https://gnps.ucsd.edu/</a> (2018)</li><li>Chambers, M. 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H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=GC-MS,+LC-MS(n),+LC-high+resolution-MS(n),+and+NMR+studies+on+the+metabolism+and+toxicological+detection+of+mesembrine+and+mesembrenone,+the+main+alkaloids+of+the+legal+high+&amp;#34;Kanna&amp;#34;+isolated+from+Sceletium+tortuosum.">GC-MS, LC-MS(n), LC-high resolution-MS(n), and NMR studies on the metabolism and toxicological detection of mesembrine and mesembrenone, the main alkaloids of the legal high &amp;#34;Kanna&amp;#34; isolated from Sceletium tortuosum.</a> Analytical and Bioanalytical Chemistry. 407 (3), 761-778 (2015).</li><li>Zhang, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+detection+of+polyhydroxylated+alkaloids+in+mulberry+using+leaf+spray+mass+spectrometry.">Rapid detection of polyhydroxylated alkaloids in mulberry using leaf spray mass spectrometry.</a> Analytical Methods. 5 (10), 2455-2460 (2013).</li><li>Pereira, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+screening+of+agrochemicals+by+paper+spray+ionization+and+leaf+spray+mass+spectrometry:+which+technique+is+more+appropriate?.">Rapid screening of agrochemicals by paper spray ionization and leaf spray mass spectrometry: which technique is more appropriate?.</a> Analytical Methods. 8, 6023-6029 (2016).</li><li>Zhang, J. I., Li, X., Cooks, R. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Direct+analysis+of+steviol+glycosides+from+Stevia+leaves+by+ambient+ionization+mass+spectrometry+performed+on+whole+leaves.">Direct analysis of steviol glycosides from Stevia leaves by ambient ionization mass spectrometry performed on whole leaves.</a> The Analyst. 137 (13), 3091-3098 (2012).</li><li>Freund, D. M., Hegeman, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Recent+advances+in+stable+isotope-enabled+mass+spectrometry-based+plant+metabolomics.">Recent advances in stable isotope-enabled mass spectrometry-based plant metabolomics.</a> Current Opinion in Biotechnology. 43, 41-48 (2017).</li><li>Wurtzel, E. T., Kutchan, T. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plant+metabolism,+the+diverse+chemistry+set+of+the+future.">Plant metabolism, the diverse chemistry set of the future.</a> Science. 353 (6305), 1232-1236 (2016).</li></ol>

Il riuscito uso di questo protocollo si basa sull'ottimizzazione dei vari passaggi per la specie di piante, tipo di tessuto e presenti di destinazione di interesse. I parametri descritti nel protocollo forniscono un buon punto di partenza. Le seguenti decisioni sperimentali devono essere realizzati e testati: o meno all'uso (1) taglio o tessuto uncut e (2) solvente o nessun solvente, (3) quali solvente da utilizzare e in quale volume, (4) che cosa la distanza del tessuto dall'ingresso di ioni deve essere e (5) l'ampiezza...

Le piante contengono una vasta gamma di piccole molecole con proprietà chimiche diverse. MS è una tecnica potente per l'analisi dei composti vegetali perché può fornire composizioni elementale con un'alta sensibilità e specificità per la rilevazione e l'identificazione di metaboliti1. Più comunemente, MS viene eseguita su campioni estratti con solvente, che sono separati mediante cromatografia a prima analisi MS1. Tuttavia, l'uso della cromatografia liquida (LC) richiede tempi di analisi lunga e spesso è associato con un vasto campione preparazione1. Al contrario, analisi chimica diretta dei tessuti intatti che elude la cromatografia è una tecnica molto rapida, che necessitano di preparazione minima del campione2. Così, in casi dove possono essere rinunciati passaggi cromatografici, un'analisi chimica diretta può essere molto vantaggiosa.
Tipico di LC-MS per la ricerca di prodotti e metabolomica naturale si basa su estrazioni lunga massa di materiali secchi o surgelati vegetali contenenti più tessuti e delle cellule tipi3. In alternativa, analisi chimica diretta, ad esempio il rilevamento di MS di metaboliti da tessuto vegetale, possono isolare tipi cellulari ed evitare artefatti di preparazione4. Spruzzo del foglio MS, noto anche come tessuto-spray5,6, è una tecnica di ionizzazione ambiente diretto MS, che richiede essenzialmente, nessuna preparazione del campione5,7. Spruzzo del foglio che MS è collegato strettamente a spruzzo di carta MS, una tecnica di ionizzazione ambiente con caratteristiche di ionizzazione electrospray che consente il rilevamento degli analiti che si depositano sulla carta7. A dispetto del nome, spruzzo del foglio MS è applicabile ai vari tipi di tessuti vegetali, lascia non solo è stato dimostrato su frutta, semi, radici, tessuti floreali e tuberi, tra gli altri6,8,9, 10,11,12. La tecnica facilita l'ionizzazione di sostanze fitochimiche endogena direttamente da materiali vegetali nello spettrometro di massa per rilevamento8. Spruzzo del foglio MS può anche fornire informazioni sulla distribuzione spaziale delle sostanze chimiche nei tipi differenti del tessuto in piante13. Quando spruzzo del foglio MS viene confrontato con l'estrazione con solvente e LC-MS, i risultati indicano spruzzo del foglio che MS consente il rilevamento rapido dei metaboliti superficie da tipi di cella univoci come tricomi13. La figura 1 illustra la struttura sperimentale di foglia spray MS. Ionizzazione electrospray diretto si verifica solo le modifiche di origine secondaria. Un'alta tensione viene applicata al tessuto della pianta tramite una fascetta metallica, producendo uno spray di goccioline molto caricate formando un cono di Taylor che trasporta gli ioni e la presa dello ione della sig. ra Electrospray ionizzazione avviene dal liquido naturale della pianta o dal solvente appl IED a superficie della pianta. A punta sul tessuto facilita l'electrospray e possa essere naturalmente presenti in natura o creati dal taglio.
Spruzzo del foglio MS è un metodo veloce per l'analisi qualitativa e semiquantitativa di tessuti vegetali intatto che hanno trovato il programma di utilità per una vasta gamma di applicazioni. Ad esempio, la tecnica è stata utilizzata per rilevare composti endogeni per distinguere specie affini e anche per valutare i cambiamenti nella stessa specie coltivate in condizioni diverse. Studi precedenti hanno dimostrato questo approccio misurando metaboliti in beautyberry (Callicarpa L.) 12 e ginseng americano (Panax quinquefolium L.) 6. in quest'ultimo esempio, ginsenosidi, gli aminoacidi e gli oligosaccaridi potrebbero essere rilevati dopo aver bagnato del tessuto ginseng crudo. Ginseng americano coltivate e selvatiche sono stati differenziati da tubero fette6. Spruzzo del foglio successivo MS, che ha permesso per una successiva ispezione morfologica e microscopica6era preservare l'integrità di tubero di ginseng. Inoltre, possono essere individuati anche composti esogeni su campioni di piante. Un numero di pesticidi (acetamiprid, difenilammina, imazalil, linuron e tiabendazolo) è stato rilevato sulla buccia o polpa di frutta e verdura9. Mentre questi studi e molti altri hanno dimostrato l'utilità di spruzzo del foglio MS per vari scopi specifici, un protocollo dettagliato precedentemente non è stato segnalato.
Qui, la descrizione di protocollo non si concentrerà sull'ottimizzazione del metodo per un tessuto specifico o composti. Piuttosto, la rilevazione di mesembrine alcaloidi di Sceletium tortuosum (L.) N.E.Br. (Aizoaceae) viene utilizzata come esempio per discutere le misure di ottimizzazione necessarie che dovrebbero essere prese durante l'impostazione di un esperimento di MS foglia spray per una specie, tessuto, o presenti per la prima volta. S. tortuosum è una succulenta endemica nella regione di Karroo semi-aride del Sud Africa. Una medicina tradizionale del San e Khoi Khoi i popoli, è stato usato per la soppressione dell'appetito e della sete, anche per quanto riguarda i suoi effetti psicotropi e analgesici14,15. Attualmente, gli estratti standardizzati sono utilizzati per il trattamento di patologie neuropsichiatriche e neuropsicologiche16,17. I composti primari di interesse includono il mesembrine dell'alcaloide e suoi derivati, molti dei quali si trovano anche correlate Sceletium specie15. Popolazioni coltivate e selvatiche di S. tortuosum hanno concentrazioni variabili di alcaloidi mesembrine, presentando così un controllo di qualità sfida18. Un metodo per la determinazione rapida di alcaloidi mesembrine, come spruzzo del foglio MS, può essere utile nel monitoraggio Sceletium prodotti. Perché in precedenza, c' non era stato nessun protocollo sperimentale visual dettagliato per lo spray foglia tecnica MS, ci illustrerà il metodo utilizzando l'esempio di S. tortuosume viene descritto quanto segue: la modifica di un'origine nanospray, il selezione e preparazione dei tessuti vegetali, l'acquisizione dei dati, l'interpretazione dei risultati e l'ottimizzazione dei parametri MS.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="880">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:237px;">Conn Pin</td>
			<td style="width:139px;">Digi-Key elctronics&#160;</td>
			<td style="width:119px;">WM2563CT-ND</td>
			<td style="width:385px;">pin will insert into Thermo Scientific&#160; source to provide voltage&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:237px;">small clamp</td>
			<td style="width:139px;">Digi-Key elctronics&#160;</td>
			<td>314-1018-ND</td>
			<td>CLIP MICRO ALLIGATOR COPPER 5A</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:237px;">large clamp</td>
			<td style="width:139px;">Digi-Key elctronics&#160;</td>
			<td>290-1951-ND</td>
			<td>ALLIGATOR CLIP NARROW NICKLE 5A</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Heat shrink</td>
			<td style="width:139px;">Digi-Key elctronics&#160;</td>
			<td style="width:119px;">Q2Z1-KIT-ND</td>
			<td>to cover soldering joints&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:237px;">NSI source Nanospray Ion Source</td>
			<td style="width:139px;">Thermo scientific</td>
			<td style="width:119px;">NA</td>
			<td>Another brand will work if you are not using a Thermo instrument</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:237px;">Q Exactive- hybrid quadrupole Orbitrap</td>
			<td style="width:139px;">Thermo scientific</td>
			<td style="width:119px;">NA</td>
			<td>Another brand will work if you are not using a Thermo instrument</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:237px;">Tune Software</td>
			<td style="width:139px;">Thermo scientific</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>Another brand will work if you are not using a Thermo instrument</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:237px;">Xcalibur Software</td>
			<td style="width:139px;">Thermo scientific</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:237px;">Plant of interest - S. tortousum</td>
			<td style="width:139px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

leaf spray mass spectrometry: a rapid ambient ionization technique to directly assess metabolites from plant tissues

Le piante producono migliaia di piccole molecole che sono diversi nelle loro proprietà chimiche. Spettrometria di massa (MS) è una tecnica potente per l'analisi dei metaboliti vegetali perché fornisce pesi molecolari con alta sensibilità e specificità. Spruzzo del foglio MS è una tecnica di ionizzazione ambientale cui tessuto vegetale è utilizzato per l'analisi chimica diretta tramite electrospray, eliminando cromatografia dal processo. Questo approccio alla degustazione di metaboliti permette di essere rilevati simultaneamente dai tessuti vegetali intatto, riducendo al minimo la quantità di preparazione dei campioni necessari per una vasta gamma di classi chimiche. Quando viene utilizzato con una MS di massa ad alta risoluzione, accurata, spruzzo del foglio MS facilita il rilevamento rapido di metaboliti di interesse. È anche possibile raccogliere dati di frammentazione tandem massa con questa tecnica per facilitare un'identificazione di composta. La combinazione di misure accurate di massa e la frammentazione è utile nel confermare identità composta. Lo spray di foglia tecnica MS richiede solo piccole modifiche a una sorgente di ionizzazione nanospray ed è uno strumento utile per espandere ulteriormente le funzionalità di uno spettrometro di massa. Qui, il tessuto fresco foglia da Sceletium tortuosum (Aizoaceae), una pianta medicinale tradizionale dal Sud Africa, è analizzato; numerosi mesembrine alcaloidi vengono rilevati con spruzzo del foglio MS.

A 10 settimane che post-germinazione, appena raccolti coltivati in serra, S. tortuosum foglie sono stati analizzati da spruzzo del foglio MS. Il flusso di lavoro sperimentale per la rilevazione di metaboliti da S. tortuosum lascia utilizzando spruzzo del foglio che MS è illustrata nella Figura 2. Una foglia è stata selezionata, tagliata in una striscia sottile con un'estremità appuntita per formare un punto e serrata con lo spray di fogli...

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Leaf Spray Mass Spectrometry: A Rapid Ambient Ionization Technique to Directly Assess Metabolites from Plant Tissues

Spettrometria di massa di foglia spray è una tecnica di analisi chimica diretta che riduce al minimo la preparazione del campione ed Elimina cromatografia, consentendo per la rilevazione rapida di piccole molecole da tessuti vegetali.

Spettrometria di massa di foglia Spray: Una tecnica di ionizzazione ambiente rapido per valutare direttamente metaboliti dai tessuti vegetali

Plants produce thousands of small molecules that are diverse in their chemical properties. Mass spectrometry (MS) is a powerful technique for analyzing ...

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Understanding of complex biological systems requires the measurement, analysis and integration of multiple compound classes of the living cell, usually ...

Optimal Preparation of Formalin Fixed Samples for Peptide Based Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry Imaging Workflows

Preparazione ottimale di formalina riparata campioni per Peptide basati su matrice assistita spettrometria totale di desorbimento/ionizzazione Laser i flussi di lavoro di Imaging

The use of matrix-assisted laser desorption/ionization, mass spectrometry imaging (MALDI MSI) has rapidly expanded, since this technique analyzes a host ...

Detection of Protein Ubiquitination Sites by Peptide Enrichment and Mass Spectrometry

Rilevamento di siti di Ubiquitinazione proteica mediante arricchimento dei peptidi e spettrometria di massa

The posttranslational modification of proteins by the small protein ubiquitin is involved in many cellular events. After tryptic digestion of ...

Sample Preparation for Probe Electrospray Ionization Mass Spectrometry

Preparazione del campione per la spettrometria di massa di ionizzazione elettrospray sonda

Mass spectrometry (MS) is a powerful tool in analytical chemistry because it provides very accurate information about molecules, such as mass-to-charge ...

Isolation of Histone from Sorghum Leaf Tissue for Top Down Mass Spectrometry Profiling of Potential Epigenetic Markers

Isolamento dell'istono dal tessuto fogliare di sorgo per la profilazione della spettrometria di massa dall'alto verso il basso dei potenziali marcatori epigenetici

Histones belong to a family of highly conserved proteins in eukaryotes. They pack DNA into nucleosomes as functional units of chromatin. ...

Semi-Quantitative Analysis of Peptidoglycan by Liquid Chromatography Mass Spectrometry and Bioinformatics

Analisi semi-quantitativa del peptidoglicano mediante cromatografia liquida spettrometria di massa e bioinformatica

Peptidoglycan is an important component of bacterial cell walls and a common cellular target for antimicrobials. Although aspects of peptidoglycan ...

Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Metabolomica quantitativa di Saccharomyces Cerevisiae mediante cromatografia liquida accoppiata con spettrometria di massa tandem

Metabolomics is a methodology used for the identification and quantification of many low-molecular-weight intermediates and products of metabolism within ...