Tick Surface Sterilization, DNA Purification, and 16S rRNA Gene Amplification
2:30
16S Amplicon Purification
3:59
Sample Barcoding and Purification
4:58
Library Quantification and Normalization
6:01
Results: Community Ecology of the Ixodes Microbiome
6:43
Conclusion
Transcript
This method can help answer key questions in the field of vector-borne disease ecology such as, what role does the vector microbiome play in pathogen dynamics, and how do vector microbiomes form and vary? The main advantages of this technique are
Sign in or start your free trial to access this content
Hier presenteren we een volgende-generatie sequencing-protocol voor het 16S rRNA rangschikken waarmee identificatie en karakterisering van microbiële gemeenschappen binnen de vectoren. Deze methode houdt het DNA-extractie, versterking en barcoding van monsters door middel van PCR, rangschikking op een stroom-cel, en bio-informatica aan sequencedata tot fylogenetische informatie.