Tick Surface Sterilization, DNA Purification, and 16S rRNA Gene Amplification
2:30
16S Amplicon Purification
3:59
Sample Barcoding and Purification
4:58
Library Quantification and Normalization
6:01
Results: Community Ecology of the Ixodes Microbiome
6:43
Conclusion
Transcript
This method can help answer key questions in the field of vector-borne disease ecology such as, what role does the vector microbiome play in pathogen dynamics, and how do vector microbiomes form and vary? The main advantages of this technique are
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Nous présentons ici un protocole de séquençage de nouvelle génération pour le séquençage d’ARNr 16 s qui permet l’identification et la caractérisation des communautés microbiennes dans les vecteurs. Cette méthode implique l’extraction ADN, l’amplification et codes à barres d’échantillons par PCR, séquençage sur une cellule d’écoulement et la bioinformatique pour faire correspondre les données sur les séquences d’information phylogénétique.