Name: colletotrichum fioriniae development in water and chloroform-based blueberry and cranberry floral extracts
Uploaded: 2019-04-12T14:00:00
Duration: 12 min 32 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Colletotrichum fioriniae Development in Water and Chloroform-based Blueberry and Cranberry Floral Extracts at JoVE.com

Мы благодарим Уильям S. Хейнс, наделены Клюква старший научный фонд и Нью-Джерси черники и клюквы исследовательский совет, Inc. за поддержку. Мы также благодарим Дженнифер Vaiciunas (руководство и цветочные препараты), Кристина Constantelos (грибковые культуры и цветочные препараты), Дэвид Джонс (цветочные препараты и извлечений), Оудеманс Лэнгли (цветочные препараты, съемки/фотография), Джесси Линч (цветочные препараты), Роксана Tumnalis (общая поддержка) и многочисленные студенческие/Лето стажеров.

<ol>
	<li>Pszcz&#243;&#322;kowska, A., Okorski, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=First+report+of+anthracnose+disease+caused+by+Colletotrichum+fioriniae+on+blueberry+in+western+Poland.">First report of anthracnose disease caused by Colletotrichum fioriniae on blueberry in western Poland.</a> Plant Disease. 100, 2167 (2016).</li><li>Oudemans, P. V., Caruso, F. L., Stretch, A. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cranberry+fruit+rot+in+the+northeast:+a+complex+disease.">Cranberry fruit rot in the northeast: a complex disease.</a> Plant Disease. 82, 1176-1184 (1998).</li><li>Damm, U., Cannon, P. F., Woudenberg, J. H. C., Crous, P. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Colletotrichum+acutatum+species+complex.">The Colletotrichum acutatum species complex.</a> Studies in Mycology. 73, 37-113 (2012).</li><li>Marcelino, J., Giordano, R., Gouli, S., Gouli, V., Parker, B. L., Skinner, M., TeBeest, D., Cesnik, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Colletotrichum+acutatum+var.+fioriniae+(teleomorph:+Glomerella+acutata+var.+flioriniae+var.+nov.)+infection+of+a+scale+insect.">Colletotrichum acutatum var. fioriniae (teleomorph: Glomerella acutata var. flioriniae var. nov.) infection of a scale insect.</a> Mycologia. 100, 353-374 (2008).</li><li>Pennycook, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Colletotrichum+fioriniae+comb.+&amp;+stat.+nov.,+resolving+a+nomenclatural+muddle.">Colletotrichum fioriniae comb. &amp; stat. nov., resolving a nomenclatural muddle.</a> Mycotaxon. 132, 149-154 (2017).</li><li>Shivas, R. G., Tan, Y. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+taxonomic+re-assessment+of+Colletotrichum+acutatum,+introducing+C.+fioriniae+comb.+et+stat.+nov+and+C.+simmondsii+sp+nov.">A taxonomic re-assessment of Colletotrichum acutatum, introducing C. fioriniae comb. et stat. nov and C. simmondsii sp nov.</a> Fungal Diversity. 39, 111-122 (2009).</li><li>Wharton, P. S., Di&#233;guez-Uribeondo, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+biology+of+Colletotrichum+acutatum.">The biology of Colletotrichum acutatum.</a> Anales del Jard&#237;n Bot&#225;nico de Madrid. 61, 3-22 (2004).</li><li>Prusky, D., Alkan, N., Mengiste, T., Fluhr, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quiescent+and+necrotrophic+lifestyle+choice+during+postharvest+disease+development.">Quiescent and necrotrophic lifestyle choice during postharvest disease development.</a> Annual Review of Phytopathology. 51, 155-176 (2013).</li><li>Milholland, R. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Compendium of Blueberry and Cranberry Diseases. , (1995).</li><li>DeMarsay, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Anthracnose fruit rot of highbush blueberry: biology and epidemiology. , (2005).</li><li>Madden, L. V., Yang, X. S., Wilson, L. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+rain+intensity+on+splash+dispersal+of+Colletotrichum+acutatum.">Effects of rain intensity on splash dispersal of Colletotrichum acutatum.</a> Phytopathology. 86, 864-874 (1996).</li><li>Yang, X., Madden, L. V., Wilson, L. L., Ellis, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+surface-topography+and+rain+intensity+on+splash+dispersal+of+Colletotrichum+acutatum.">Effects of surface-topography and rain intensity on splash dispersal of Colletotrichum acutatum.</a> Phytopathology. 80, 1115-1120 (1990).</li><li>Wharton, P. S., Dickman, J. S., Schilder, A. M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Timing+of+spore+release+by+Colletotrichum+acutatum+in+Michigan+blueberry+fields.">Timing of spore release by Colletotrichum acutatum in Michigan blueberry fields.</a> Phytopathology. 92, 86 (2002).</li><li>MacKenzie, S. J., Peres, N. A., Timmer, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Colonization+of+citrus+leaves+and+secondary+conidiation+response+to+citrus+flower+extracts+by+non-postbloom+fruit+drop+strains+of+Colletotrichum+acutatum.">Colonization of citrus leaves and secondary conidiation response to citrus flower extracts by non-postbloom fruit drop strains of Colletotrichum acutatum.</a> Tropical Plant Pathology. 35, 333-342 (2010).</li><li>Leandro, L. F. S., Gleason, M. L., Nutter, F. W., Wegulo, S. N., Dixon, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Strawberry+plant+extracts+stimulate+secondary+conidiation+by+Colletotrichum+acutatum+on+symptomless+leaves.">Strawberry plant extracts stimulate secondary conidiation by Colletotrichum acutatum on symptomless leaves.</a> Phytopathology. 93, 1285-1291 (2003).</li><li>Waller, T. J., Vaiciunas, J., Constantelos, C., Oudemans, P. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evidence+the+blueberry+floral+extracts+influence+secondary+conidiation+and+appressorial+formation+of+Colletotrichum+fioriniae.">Evidence the blueberry floral extracts influence secondary conidiation and appressorial formation of Colletotrichum fioriniae.</a> Phytopathology. 108, 561-567 (2017).</li><li>Gager, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The influence of cranberry floral wax on appressorium formation in Colletotrichum fioriniae. , (2015).</li><li>Podila, G. K., Rogers, L. M., Kolattukudy, P. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+signals+from+avocado+surface+wax+trigger+germination+and+appressorium+formation+in+Colletotrichum+gloeosporioides.">Chemical signals from avocado surface wax trigger germination and appressorium formation in Colletotrichum gloeosporioides.</a> Plant Physiology. 103, 267-272 (1993).</li><li>Polashock, J. J., Caruso, F. L., Oudemans, P. V., McManus, P. S., Crouch, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+North+American+cranberry+fruit+rot+fungal+community:+a+systematic+overview+using+morphological+and+phylogenetic+affinities.">The North American cranberry fruit rot fungal community: a systematic overview using morphological and phylogenetic affinities.</a> Plant Pathology. 58, 1116-1127 (2009).</li><li>Miller, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=V-8+juice+agar+as+a+general+purpose+medium+for+fungi+and+bacteria.">V-8 juice agar as a general purpose medium for fungi and bacteria.</a> Phytopathology. 45, 461-462 (1955).</li></ol>

Авторы не имеют ничего сообщать.

Bioassays, обнаружения C. fioriniae ответ на цветочных экстрактов (FEs) были разработаны для плодов черники и клюквы гниль pathosystems, но может быть легко адаптирована для других садовых культур. Протокол, подробно изложенных выше был ценным в приобретении многие важные наборы данных включая, но не ограничиваясь: FE эффекты на нескольких изолятов многочисленных патогенных микроорганизмов, время курс информацию, касающуюся микоз этапов в присутствии различных Фес, Сравнение методов извлечения, проверки отдельных химических веществ на C. fioriniae роста и дифференцировки, оценки отдельных цветок органа экстрактов, влияние температуры на C. fioriniae присутствии FE, эффекты Фенология зависимых воск экстракции, и цветочные дождевой воды эффектов. Используя эти методы полученные данные предоставила также более четкое представление о жизни C. fioriniae стадий и частично разъясняет, почему Блум период столь важное значение для контроля за много фруктов, гниение патогенов.
Первоначально, все цветы были обработаны одинаково активно-FE, но процесс извлечения перешла к использованию всего цветы. Цветочные вскрытие было много времени и имел очень мало влияет на биологическую результате FEs. Однако, отдельные цветочные органы могут и должны были оцененные используя этот протокол, но большую осторожность должны быть приняты для вымачивать не полностью цветочные ткани (Дополнительные фильм 1, с техникой, подробно описанные в шаге 2.3), это может привести к выпустила грибы токсичных/статических соединений в FE, которые могут исказить микроскопических оценок. Менее инвазивные извлечений например перевал -FE (Дополнительные фильм 2) и rw-FE теперь являются более благоприятными, из-за их легкости приобретения. Кроме того эти методы извлечения требуется только вакуумной фильтрации для получения биологически активных цветочные химические сигналы.
Цветы, использованы в всех зубов обычно были в холодильнике 0-3 дня до приготовления экстракта. Задача настоящего Протокола является управление временем FE оборота (коллекцию полей путем хранения экстрактов). Это усугублялось многочисленные образцы из многочисленных источников и дат. Замороженные цветы не были оценены в любой реальной степени, как талой цветки появляются ухудшилось и бесцветные. Однако после того, как были подготовлены Феса на водной основе, повторил замораживания и оттаивания показал не влияет на биологическую FE, так до тех пор, как FE быстро размораживают после подготовки биопроб (жизнеспособные 3-летний FE).
На основе хлороформ извлечения позволяет расследование возбудителя ответы на поверхности воски трехмерные цветные/фрукты в двумерной плоскости через испарение ch-FE на стекло coverslips. Однако маловероятно, что фактические кристаллических структур воски на хранение от ch-FE идентичны к поверхности, из которого они были собраны. Смысл, дополнительные методы должны быть реализованы, если грибковых ответ на конкретные воск структур в vivo являются основным направлением следствия. Хлороформ-на основе экстрактов нужно больше хранения обслуживания чем экстракции на водной основе. Помимо поддержания ch-FE экстрактов в темноте, PTFE выстроились клеточной культуры труба шапки и парафина, герметизации необходимо обернуть регулярно проверяться для испарения утечек и заменить при необходимости.
Концепция контроля цветочные дождевой сток коренится в идею продвижения инструменты мониторинга конкретных заболеваний. Устройства для сбора дождевой воды может быть адаптирована к много других архитектур завод, до тех пор, пока коллекция устройство захватывает дождевой воды, запускаемый офф цветы. Этот подход предоставляет информацию о ли или не цветочные стимуляции в поле присутствует в любой момент времени и может контролироваться на протяжении всего сезона. Кроме того коллекция устройств могут быть развернуты в нескольких местах навесом, чтобы определить, насколько цветочный подсказки были вымыты в любой заданной смачивания событие. В будущем эксперименты, rw-FE будет диктовать, когда следует начинать фунгицид приложений и когда они могут безопасно конец. Кроме того осуществляя мониторинг фенологии зависимых воск экстракции (протокол раздел 9), значение периода цветения биологии патогена стало еще более очевидным. Этот раздел также включены продемонстрировать гибкость этих bioassays, предоставляя методы, которые позволяют бок о бок сравнения принимающей поверхности воска, которые временно разделены. Данные, полученные с использованием методов цветочные добычи и bioassays представляют ощутимых показателей возбудителя стимуляции, конкретных химических классов биологии патогена, и цели для будущих стратегий.

Colletotrichum fioriniae вызывает гнили плодов голубики (Vaccinium corymbosum L.) и большой американской клюквы (V. macrocarpon Айтон)1,2. Этот возбудитель был недавно разделенное от C. acutatum видов комплекс3,4,5,6 и возбудителя голубики антракноз и членом гнили плодов клюквы комплекс, помимо многочисленных других растений заболеваний во всем мире7. C. fioriniae имеет скрытые, hemibiotrophic образ жизни8, с инфекций во время цветения и симптом развития, не становится очевидным, пока плоды находятся в заключительной стадии созревания9. В черники и клюквы плоды гниют только адекватно управляется с фунгицидом заявлений в период цветения. Возбудитель Перезимовывает в спящие голубики цветочные почки весы10 и sporulates во время цветения. Конидий перемещаются во всем купола через дождь всплеск разгон11,12 и нарастание посевным материалом был сильно коррелирует с Блум периода13. Ответ Colletotrichum видов цветов хост не уникален для Vaccinium, как цветы являются важными компонентами плодов цитрусовых пост Блум падение (ПФО)14 , а также15клубники антракноз, в обоих случаях причиной патогена на sporulate. Все эти случаи свидетельствуют о необходимости эффективных методов для оценки временнóй динамики цветочные химические сигналы на C. fioriniae и других патогенов, которые заражают во время цветения. Идеи, предоставляемые описанные здесь методы становятся все более ценным.
Этот протокол детали методов закупок, цветочные экстракт (FE) и проведет оценку ответов C. fioriniae FE через стекла coverslip bioassays15,16. Цветочные добыча методы делятся на два основных типа; на водной основе экстракции (активных-FE, пассивный (перевал -FE) и поля на основе дождевой воды (rw-FE)) и на основе хлороформ (ch-FE)17 экстракции. На водной основе экстракции позволяют для осмотра воды мобилизованы цветочные химические сигналы. Эти мобилизовал сигналы являются скорее всего важными компонентами инфекции суда, поскольку FE значительно увеличивает скорость инфекции16, помимо влаги, необходимых для инфекции происходят. Кроме того они представляют более естественное состояние, как цветочные стимуляции могут быть вымыты всей пологом течение увлажнения событий, как отмечалось ранее в голубики и других культур систем14,16. На основе хлороформ цветочные экстракции (ch-FE) также предоставляют ценную информацию, касающуюся возбудителя ответ на поверхности узла воски17,18, разъяснение на ранних стадиях роста конидий, однажды на хранение на восприимчивы принимающих органов (т.е. цветы, яичников и развивающегося плода). Возбудитель ответ на сезонные изменения в узел поверхности воски также может контролироваться с помощью этого протокола. Соответственно bioassays приспособлены для работы с FE на водной основе или на основе хлороформ FE для смягчения присущи различия между этими двумя материалами.
Данные, полученные от bioassays показал, что на водной основе экстракции стимулировать более высокие уровни вторичных conidiation чем на основе хлороформ извлечений где окончательное appressorial ответ, поэтому о причастности нескольких соединений в FE. Интересно, что оба этих ответов роста наблюдались, когда использование дождевой воды, бежал прочь черники и клюквы цветы, указав несколько стимулирующее соединений могут быть вымыты с поверхности цветов. Таким образом мониторинг для цветочные стимуляции даст понимание вероятности успеха возбудителя в сельскохозяйственной системы.
Конечной целью настоящего Протокола является представить методологию для создания базовых биологическая информация о возбудителей грибковых растений в ответ на цветочные химические сигналы, а также вызывающей методологий, которые могут использовать этот цветочные информации для оказания помощи в процессы управления и принятия решений конкретных заболеваний.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:932px;" width="933">
	<colgroup>
		<col />
		<col span="3" />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">0.22 &#181;m pore size, acetate sterilizing filter</td>
			<td style="width:203px;">VWR</td>
			<td style="width:203px;">101102-280</td>
			<td style="width:203px;">Blueberry floral extract (FE) clarification&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">200-1000 &#181;l pipette with tips</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, any make within range will be adequate</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">40-200 &#181;l pipette with tips</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, any make within range will be adequate</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">5-40 &#181;l pipette with tips</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, any make within range will be adequate</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Air spray gun disposable paint spray cup with connection adapter&#160;</td>
			<td style="width:203px;">Harbor Freight</td>
			<td style="width:203px;">97098</td>
			<td style="width:203px;">Blueberry rainwater (rw-)FE collection</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Autoclave</td>
			<td style="width:203px;">Amsco</td>
			<td style="width:203px;">3011</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, media preparation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Bar mesh matting (plastic mesh sheet)</td>
			<td style="width:203px;">Winco</td>
			<td style="width:203px;">BL-240</td>
			<td style="width:203px;">Passive (pass)-FE collection</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Benchtop timer</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">06-662-47</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, FE preparation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Black pressure/vacuum hose</td>
			<td style="width:203px;">VWR</td>
			<td style="width:203px;">62994-795</td>
			<td style="width:203px;">Vacuum filter component</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:324px;">Buchner funnel</td>
			<td style="width:203px;">Coors USA</td>
			<td style="width:203px;">60240</td>
			<td style="width:203px;">Vacuum filter component, accepts 55 mm filter paper disks</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Bunsen burner&#160;&#160;</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Calcium carbonate</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">C64-500</td>
			<td style="width:203px;">Media component</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Centrifuge</td>
			<td style="width:203px;">Sorvall&#160;</td>
			<td style="width:203px;">RC 5B Plus</td>
			<td style="width:203px;">Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Centrifuge tubes (15 ml)</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">05-527-90</td>
			<td style="width:203px;">Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Centrifuge tubes (50 ml)</td>
			<td style="width:203px;">VWR</td>
			<td style="width:203px;">10025-694</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, rw-FE collection</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Cheesecloth (grade 50)</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">AS240</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, FE preparation</td>
		</tr>
		<tr height="84">
			<td height="84" style="height:84px;width:324px;">Chloroform</td>
			<td style="width:203px;">VWR</td>
			<td style="width:203px;">JT9175-3</td>
			<td style="width:203px;">Chemical, trichloromethane: assay grade, &#8805; 99% pure, for molecular biology, peroxide-free</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Corn Meal Agar (CMA)</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">B11132</td>
			<td style="width:203px;">&#160;Pre-mix media, isolate storage on slants</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Cotton-blue stain</td>
			<td style="width:203px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:203px;">61335</td>
			<td style="width:203px;">Lactophenol cotton-blue stain</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Curved forceps (45&#730;)</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">10-270</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, flower processing and coverslip inversion</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Difco Agar</td>
			<td style="width:203px;">VWR</td>
			<td style="width:203px;">90004-032</td>
			<td style="width:203px;">Media component</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Drill-press</td>
			<td style="width:203px;">Delta</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, rw-FE collection</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">EASYpure LF Ultrapure water</td>
			<td style="width:203px;">Barnstead</td>
			<td style="width:203px;">D738</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, deionized water source</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Ethanol (95%)</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Chemical</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Filter flask (500 ml)</td>
			<td style="width:203px;">Pyrex</td>
			<td style="width:203px;">No. 5340</td>
			<td style="width:203px;">Vacuum filter component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Freezer (set to -20&#730; C)</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, storage of active-FE, pass-FE, rw-FE&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Fume hood</td>
			<td style="width:203px;">Hamilton</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, chloroform usage</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Funnel (7 X 7 cm)&#160;</td>
			<td style="width:203px;">VWR</td>
			<td style="width:203px;">60820-110</td>
			<td style="width:203px;">Cranberry rw-FE collection, FE preparation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Generic glass slide&#160;</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">22-038-101</td>
			<td style="width:203px;">Bioassay conductance</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Generic plastic pump spray bottle</td>
			<td style="width:203px;">VWR</td>
			<td style="width:203px;">16126-454</td>
			<td style="width:203px;">pass-FE collection, at least 250 ml capacity</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Glass cell culture tubes</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Storage of ch-FE</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Glass coverslips (22 x 22 mm)</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">12-542B</td>
			<td style="width:203px;">Bioassay conductance</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Glass Van Tieghem cells (hand cut glass tubes)</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Chloroform (ch)-FE bioassay, (8 mm OD 6 mm ID)</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Glass-pipette (1-100 &#181;l)</td>
			<td style="width:203px;">Hamilton Co. Inc.</td>
			<td style="width:203px;">#710</td>
			<td style="width:203px;">ch-FE bioassay</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Glycerol</td>
			<td style="width:203px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:203px;">G5516</td>
			<td style="width:203px;">Lactophenol cotton-blue stain</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Hemocytometer</td>
			<td style="width:203px;">Bright-Line</td>
			<td style="width:203px;">5971R10</td>
			<td style="width:203px;">Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Incubator (set to 25&#730; C, dark)</td>
			<td style="width:203px;">Percival&#160;</td>
			<td style="width:203px;">50036</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, bioassay conductance</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Lactic acid</td>
			<td style="width:203px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:203px;">W261106</td>
			<td style="width:203px;">Lactophenol cotton-blue stain</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Laminar flow hood</td>
			<td style="width:203px;">Labconco</td>
			<td style="width:203px;">3730400</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, sterile work environment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Metal probe (generic)&#160;</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Microcentrifuge tubes (2 ml)</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">05-408-138</td>
			<td style="width:203px;">Aqueous treatment mixture storage and preparation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Microscope, Leica DMLB</td>
			<td style="width:203px;">Leica</td>
			<td style="width:203px;">020-519.010</td>
			<td style="width:203px;">Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Mortar (ceramic)</td>
			<td style="width:203px;">Coors USA</td>
			<td style="width:203px;">60313</td>
			<td style="width:203px;">Vacuum filter component</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Nitrile gloves&#160;</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">19-130-1597D</td>
			<td style="width:203px;">Flower collection</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Paper disks (cut paper towels)</td>
			<td style="width:203px;">Office Basics</td>
			<td style="width:203px;">KCC01510</td>
			<td style="width:203px;">humidity control in bioassay</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Parafilm</td>
			<td style="width:203px;">Bemis</td>
			<td style="width:203px;">PM-996</td>
			<td style="width:203px;">Plastic paraffin film&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Pestle (ceramic)</td>
			<td style="width:203px;">Coors USA</td>
			<td style="width:203px;">60314</td>
			<td style="width:203px;">Vacuum filter component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Phenol crystals</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">A92-100</td>
			<td style="width:203px;">Lactophenol cotton-blue stain</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Plastic bags (~100 mm X 152 mm)</td>
			<td style="width:203px;">Uline</td>
			<td style="width:203px;">S1294</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, flower refrigeration</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Plastic cell culture dishes (9 cm diameter)&#160;</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">FB0875712</td>
			<td style="width:203px;">(Petri dish), bioassay conductance</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Polytetrafluoroethylene (PTFE) lined caps&#160;</td>
			<td style="width:203px;">VWR</td>
			<td style="width:203px;">60927-228</td>
			<td style="width:203px;">Storage of ch-FE</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Pyrex beakers (100 ml)</td>
			<td style="width:203px;">Pyrex</td>
			<td style="width:203px;">No. 1000</td>
			<td style="width:203px;">Preparation of ch-FE</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Pyrex bread-pan</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">pass-FE collection</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Pyrex graduated cylinder</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, FE preparation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Refrigerator (set to 4&#730; C)</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, storage of ch-FE</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Sealed plastic container (30 mm X 13 mm X 7 mm)&#160;</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Bioassay conductance</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:324px;">Sharp-pointed dissecting scissors</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">8940</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, to cut cheese-cloth and paper disks</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Stainless steel mesh strainer</td>
			<td style="width:203px;">VWR</td>
			<td style="width:203px;">470149-756</td>
			<td style="width:203px;">Preparation of ch-FE</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Step drill bit (step-bit)</td>
			<td style="width:203px;">Dewalt</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Equipment, rw-FE collection</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Sterile loop (combi-loop)</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">22-363-602&#160;</td>
			<td style="width:203px;">Culture preparation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">Telephone wire (internal wires)</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Blueberry rw-FE collection</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:324px;">Test tube basket&#160;</td>
			<td style="width:203px;">VWR</td>
			<td style="width:203px;">470137-792</td>
			<td style="width:203px;">Readily available substitution for plastic mesh [strawberry] basket&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">V8 Juice</td>
			<td style="width:203px;">Campbell&#39;s Soup Company</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">Fungal media component</td>
		</tr>
		<tr height="65">
			<td height="65" style="height:65px;width:324px;">Vintage plastic mesh [strawberry] baskets</td>
			<td style="width:203px;">Donation</td>
			<td style="width:203px;">-</td>
			<td style="width:203px;">pass-FE collection, can substitute for test tube basket (470137-792)</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:324px;">Vortex Genie (Vortex)</td>
			<td style="width:203px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:203px;">12-812</td>
			<td style="width:203px;">Spore suspension preparation</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:324px;">Whatman No. 1 Qualitative 55 mm circles</td>
			<td style="width:203px;">Whatman</td>
			<td style="width:203px;">1001-055</td>
			<td style="width:203px;">Vacuum filter component</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:324px;">White plastic twist ties (100 mm)</td>
			<td style="width:203px;">Uline</td>
			<td style="width:203px;">S-566W</td>
			<td style="width:203px;">Cranberry rw-FE collection</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

colletotrichum fioriniae development in water and chloroform-based blueberry and cranberry floral extracts

Точно контролировать фенологии в период цветения и временная динамика цветочные химические сигналы на грибковые фруктов, гниение патогенов, были разработаны цветочные извлечения методы и coverslip bioassays, используя Colletotrichum fioriniae. В черники и клюквы Этот возбудитель оптимально контролируется путем применения фунгицидов в период цветения из-за роли цветы в начальных стадиях инфекции. Протокол, здесь подробно описывает как цветочные экстракты (FE) были получены с помощью воды, хлороформ и поле дождевой воды-методы на основе для последующего использования в соответствующем bioassays coverslip стекла. Каждый FE служил предоставить другой набор информации: ответ C. fioriniae мобилизовал цветочные химические сигналы в воде (на водной основе), возбудитель ответ на цветок и поверхности воски плода (хлороформ основе) и контроль на местах за собранные цветочные дождевой воды, движущихся в vitro наблюдения сельскохозяйственной параметру. FE широко описан как либо или хлороформ водная, с соответствующей биопроб, описанные для компенсации присущи различия между этими двумя материалами. Дождевой воды, что бежать цветы были собраны в уникальных устройств для каждого урожая, намекая на гибкость и применения такого подхода для других культур систем. Bioassays, быстрый, недорогой, простой и предоставляют возможность генерировать пространственно-временных и участкам информации о присутствии стимулирующее цветочные соединений из различных источников. Эта информация будет в конечном итоге лучше информировать стратегии борьбы с болезнями, как FE уменьшить время, необходимое для инфекции происходит, таким образом обеспечивая понимание изменения рисков для возбудителя инфекции течение вегетационного сезона.

Watch this Scientific Journal Video about Colletotrichum fioriniae Development in Water and Chloroform-based Blueberry and Cranberry Floral Extracts at JoVE.com

Colletotrichum fioriniae Development in Water and Chloroform-based Blueberry and Cranberry Floral Extracts

Здесь описаны bioassays, предназначенные для наблюдения за развитием грибкового патогена, Colletotrichum fioriniae, присутствии черники или клюквы цветочных экстрактов на стекло coverslips. Вода, хлороформ-, поле дождевой воды на основе и цветочные добычи, которые подробно методы а также понять, как эта информация может быть применена.

Colletotrichum fioriniae Развитие в воде и хлороформе основе черники и клюквы цветочные экстракты

To accurately monitor the phenology of the bloom period and the temporal dynamics of floral chemical cues on fungal fruit rotting pathogens, floral ...

Этот протокол обеспечивает недорогую и адаптируемую систему для оценки временной динамики фторхимических сигналов на Colletotrichum fiorniae и других патогенных микроорганизмов растений, которые заражают термин цветения. Новые устройства сбора дождевой воды пола позволяют пользователю контролировать природные стимуляторы и условия, влияющие на развитие патогенов в почти реальном времени сайт-специфическим образом. Начните эту процедуру с культуры Colletotrichum fiorniae от естественно инфицированного хозяина, как описано в текстовом протоколе.Когда колонии начинают sporulate, полоса conidia на другой V 8 Сок агар, содержащий клеточной культуры блюдо для производства высокой плотности sporulating культуры. После семи дней роста используйте стандартную стерильную петлю, чтобы собрать небольшое количество конидии из культуры высокой плотности, слегка касаясь петли к конидиальной массе. Перемешайте это в 15 миллилитровую центрифугу, содержащую 10 миллилитров стерильной деионизированной воды.Вихрь этот образец в течение 10 секунд. Используя стандартную пипетку, окунитесь вверх и вниз много раз, чтобы еще больше смешать образец. Затем поместите каплю вихревого образца на гемоцитометр и оцените концентрацию спор.Отрегулируйте концентрацию до 0,1 миллиона конидии на миллилитр стерильной дистиллированной воды с пятимиллилитровым окончательным объемом. Это называется споры подвески и производится только непосредственно перед использованием в любом bioassay. Для выполнения хлороформной цветочной экстракции очистите все компоненты 95%этанолом дважды.Затем очистите компоненты дважды хлороформом, чтобы предотвратить загрязнение для каждой добычи. Не очищайте PTFE выстроились шапки с хлороформом, как это повредит их. После очистки отложите компоненты в сторону, чтобы высохнуть вверх дном.Комбинат одной части обработанных цветов до девяти частей хлороформа в стакан, добавив цветы, а затем хлороформ. Аккуратно вихрем в течение 30 секунд и процедить через экран из нержавеющей стали во второй стакан. Налейте экстракт на основе хлороформа из второго стакана в стеклянную трубку культуры и прикрепите крышку PTFE.Оберните крышку парафильмом, чтобы предотвратить испарение. Храните полученный цветочный экстракт на основе хлороформа в темноте, чтобы уменьшить деградацию света при четырех градусах Цельсия до экспериментального использования. Повторите извлечения с несколькими образцами для обеспечения репликаций.Чтобы создать коллекционое устройство для каждого выбранного местоположения, используйте бит шага, прикрепленный к буровому прессу, чтобы просверлить отверстие в нижней части чашки спрея. Затем вырезать прямую линию от верхней части отверстия в рот спрей чашку. Теперь просверлите четыре равносторонних отверстия достаточно большой, чтобы нить пластиковой проволоки покрытием в устье спрей чашки.Прикрепите один конец пластиковых проводов с покрытием, оставляя один конец свободным. Просверлите отверстие достаточно большой, чтобы нить краска спрей или чашки адаптер в 50 миллилитров центрифуги крышка крышкой. Печать адаптера потоков с парафильмом, чтобы предотвратить утечку.Прикрепите это как к крышке центрифуги, так и к резьбовой части чашки опрыскиватель. Затем прикрепите 50-миллиметровую центрифугу. Создайте четыре устройства сбора данных на место выборки.Развертывание устройств в выбранных местах путем сгибания распылителя чашки, чтобы поместиться на стебли. Ориентируйте разрезанную сторону чашки распылитель вверх, используя пластиковые провода с покрытием, прикрепленные к другим стеблям. Это гарантирует, что вода, проходящая над цветами, будет захвачена.Для сбора дождевой воды из клюквенные цветы, первый тепловой прокол восемь равноустойных отверстий вокруг устья воронки с помощью металлического зонда. Вставьте твист связей в четыре отверстия. Прикрепите другие концы к противоположному расположению этого отверстия, образуя аккуратный рисунок пересечения.Оберните воронку вниз парафильма и отложите в сторону. Просверлите отверстие достаточно большое, чтобы вставить воронку вниз стебель в 50 миллилитровую крышку центрифуги с шагом бит. Вставьте подготовленную воронку в крышку центрифуги.После осадков или накладных орошения, удалить и заменить нижнюю часть трубки центрифуги трубки. Трубы сбора дождевой воды должны быть быстро изменены после смачивания событий, поскольку они склонны к деградации от природных загрязняющих веществ, мобилизованных в стоке, таких как бактерии и другие грибки. Поместите два слоя бумажных дисков в блюда культуры и замочите двумя миллилитров стерильной дистиллированной воды.Затем смешайте равные объемы стерильной дистиллированной воды и цветочный экстракт на водной основе в двух миллилитровых микроцентрифугных трубках. Затем добавьте равный объем подвески споры в подготовленные двухми миллилитровые микроцентрифуговые трубки. Полученный препарат называют аквозной смесью для лечения.Для контроля, опустить цветочный экстракт часть и заменить стерильной дистиллированной воды, чтобы сохранить конидиальные концентрации последовательной. Теперь поместите предварительно очищенные стеклянные крышки поверх пропитанных бумажных полотенец в клеточной культуре блюдо. Поместите 40 микролитровую каплю акной смеси лечения на центр крышки.Повторите это для желаемого лечения, включая контроль. Затем закройте блюдо клеточной культуры. После того, как все процедуры и репликации были обойтись, поместите все реплицированные блюда клеточной культуры в запечатанный пластиковый контейнер и инкубировать при 25 градусов по Цельсию в темноте.В заранее определенные точки времени добавьте 10 микролитров фиксатора к каплям, останавливающих рост и полу-сохраняющих гору. После того, как фиксатор был добавлен, тщательно инвертировать coverslips размещения каждого из них капли стороне вниз на слайде стеклянный микроскоп для облегчения микроскопического исследования. Когда все крышки находятся на стеклянных слайдах микроскопа, оставьте их урегулировать и частично высохнуть в потоке капота в течение 20 минут.Подсчитайте все конидии, присутствующие на обложке, включая первичную конидию, проросли конидию и недавно сформированную вторичную конидию, а также аппрессорию. Работа либо в 400 раз больше, либо в 200 раз общей площадью 3,808 квадратных миллиметра. В капоте ламинарного потока добавьте два равных тома стерильной дистиллированной воды и один объем подвески спор в двухми миллилитровую микроцентрифугную трубку.Установите эту aqueous смесь обработки в сторону для хлороформ основе цветочного экстракта bioassays. В дым капот, поместите Ван T Cell на стеклянную крышку в подготовленных пластиковых клеток культуры блюдо. Выдайте 33 микролитров желаемого хлороформного цветочного экстракта в центр клетки и дайте высохнуть.Не прикасайтесь к стенам клетки. Для контрольного лечения добавьте девственную хлороформ. После того, как хлороформ на основе цветочного экстракта высохнет, обойтись 99 микролитров подготовленной аквеусной смеси обработки со стандартной пипеткой в центре Van T Cell.Затем закройте все блюда клеточной культуры и инкубировать. В заранее определенные моменты времени, добавить 15 микролитров фиксатора в Van T Cell и дайте ему сидеть, по крайней мере пять минут, чтобы обеспечить адекватное грибковое окрашивание. После этого времени, тщательно удалите Van T Cell.Выполните шаги по инверсии и сбору данных, как и прежде. При микроскопической оценке C.fiorniae в течение 24 часов после прививки, сравнение конидии в присутствии стерильной дистиллированной воды по сравнению с цветочным экстрактом на водной основе показывает резкое увеличение вторичного конидиции и образования аппрессория. Однако вторичное конидиация была не так очевидна при сравнении хлороформного биоанализа стерильного дистиллированного контроля воды с экстрактами на основе хлороформа.Скорее, рост C.fiorniae сместился в сторону апрессориального образования. В этом анализе, стерильные дистиллированной воды контроля и клюквы хлороформ основе цветочных извлечений были визуально проверены на нуле, шесть, 12 и 24 часов после прививки. Образование аппрессория началось в шесть часов в цветочном экстракте на основе хлороформа и неуклонно увеличивалось в течение последующих точек времени.Этот результат подтверждает вывод о том, что цветы сокращают время, необходимое для формирования инфекционных структур. Управление заболеванием для фруктовых гниющих грибов часто включает в себя время цветения фунгицидов приложений. Здесь экстракты клюквенного хлороформа на основе нескольких стадий роста клюквы были визуально оценены для эффективного поверхностного воска на C.fiorniae в течение 24 часов после прививки.Яичники, собранные в июне, незрелые фрукты, собранные в июле, а в августе, собранные фрукты, собранные в октябре, и стерильный дистиллированной воды контроля были проверены на аппрессориальное образование. Экстракты на основе хлороформа яичников имели наибольшую величину аппрессориального образования, что указывает на важность цветения в жизненном цикле C.fiorniae. Патоген является наиболее важным компонентом этого протокола.Грибы должны быть перемещены в свежие средства массовой информации регулярно, чтобы сохранить последовательность между испытаниями. Любая работа с хлороформом должна выполняться в дымовом капоте по соображениям безопасности. Это включает в себя подготовку материалов и стеклянной посуды, процедуры экстракции, а также проведение биоанализа на основе хлороформа.Комбинации точек времени, патогенных микроорганизмов, цветочных коллекций дождевой воды или экстракции хозяина могут быть использованы для оценки различных взаимодействий хозяина и патогена. Устройства сбора дождевой воды и связанные с ними биоанализы позволят другим работать с стимуляторами-хозяинами, мобилизованными во время дождевых событий в многочисленных системах траектории.

Research

JoVE Journal

Environment

Colletotrichum fioriniae Development in Water and Chloroform-based Blueberry and Cranberry Floral Extracts

EPA Method 1615. Measurement of Enterovirus and Norovirus Occurrence in Water by Culture and RT-qPCR. I. Collection of Virus Samples

EPA Method 1615 Измерение энтеровирус и Норовирус Происшествия в воде культуры и RT-КПЦР. I. Сбор образцов вирусов

EPA Method 1615 was developed with a goal of providing a standard method for measuring enteroviruses and noroviruses in environmental and drinking waters. ...

EPA Method 1615. Measurement of Enterovirus and Norovirus Occurrence in Water by Culture and RT-qPCR. Part III. Virus Detection by RT-qPCR

EPA Метод 1615 Измерение энтеровирус и Норовирус Происшествия в воде культуры и РТ-КПЦР. Часть III. Обнаружение Вирус РТ-КПЦР

EPA Method 1615 measures enteroviruses and noroviruses present in environmental and drinking waters. This method was developed with the goal of having a ...

A Duplex Digital PCR Assay for Simultaneous Quantification of the Enterococcus spp. and the Human Fecal-associated HF183 Marker in Waters

A Duplex Digital PCR Assay for Simultaneous Quantification of the Enterococcus spp. and the Human Fecal-associated HF183 Marker in Waters

Дуплексной связи с цифровой ПЦР-анализ для одновременного Количественное определение<em&gt; Enterococcus SPP.</em&gt; И человеческая Фекальные-ассоциированный HF183 Marker в водах

This manuscript describes a duplex digital PCR assay (EntHF183 dPCR) for simultaneous quantification of Enterococcus spp. and the human fecal-associated ...

Characterization and Application of Passive Samplers for Monitoring of Pesticides in Water

Характеристика и применение пассивных пробоотборников для мониторинга пестицидов в воде

Five different water passive samplers were calibrated under laboratory conditions for measurement of 124 legacy and current used pesticides. This study ...

Soil Lysimeter Excavation for Coupled Hydrological, Geochemical, and Microbiological Investigations

Почва лизиметре Выемка для связанных гидрологические, геохимические и микробиологические исследования

Studying co-evolution of hydrological and biogeochemical processes in the subsurface of natural landscapes can enhance the understanding of coupled ...

Use of a Filter Cartridge for Filtration of Water Samples and Extraction of Environmental DNA

Использование фильтра картриджа для фильтрации проб воды и экстракции ДНК окружающей среды

Recent studies demonstrated the use of environmental DNA (eDNA) from fishes to be appropriate as a non-invasive monitoring tool. Most of these studies ...

Continuous Instream Monitoring of Nutrients and Sediment in Agricultural Watersheds

Непрерывного потока мониторинг питательных веществ и осадков в бассейнах рек сельскохозяйственного

Pollutant concentrations and loads in watersheds vary considerably with time and space. Accurate and timely information on the magnitude of pollutants in ...

Measuring and Mapping Patterns of Soil Erosion and Deposition Related to Soil Carbonate Concentrations Under Agricultural Management

Измерение и сопоставление моделей осаждения, относящиеся к концентрации карбоната почвы под управление сельским хозяйством и эрозии почвы

Spatial patterns of soil erosion and deposition can be inferred from differences in ground elevation mapped at appropriate time increments. Such changes ...

Protocol for Acute and Chronic Ecotoxicity Testing of the Turquoise Killifish Nothobranchius furzeri

Protocol for Acute and Chronic Ecotoxicity Testing of the Turquoise Killifish Nothobranchius furzeri

Протокол для острой и хронической экотоксичности тестирования бирюза Пецилиевые рыбы Nothobranchius furzeri

The killifish Nothobranchius furzeri is an emerging model organism in the field of ecotoxicology and its applicability in acute and chronic ecotoxicity ...

Construction of a Low-cost Mobile Incubator for Field and Laboratory Use

Строительство недорогих мобильных инкубатора для поля и лабораторного использования

Incubators are essential for a range of culture-based microbial methods, such as membrane filtration followed by cultivation for assessing drinking water ...