Name: a strategy to identify compounds that affect cell growth and survival in cultured mammalian cells at low-to-moderate throughput
Uploaded: 2019-09-22T13:00:00
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Ce travail a été appuyé par le NINDS Intramural Research Program.

1. Culture NSC
REMARQUE : La manipulation d'une ligne NSC humaine sera décrite ci-dessous, mais n'importe quelle lignée cellulaire peut être utilisée pour ce protocole. Tous les travaux de culture cellulaire sont effectués dans un coffret de sécurité biologique.
<ol><li>Enrober une plaque de 96 puits avec la membrane du sous-sol/matrice extracellulaire (ECM).<ol>
<li>Dégel aliquot de ECM (Table of Materials), qui facilitera l'attachement de NSC, sur la glace. Diluer ...

<ol>
	<li>National Research Council. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Toxicity Testing in the 21st century: A Vision and a Strategy. , (2007).</li><li>Llorens, J., Li, A. 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P., Kozlowski, R., Slater, K. J., Fletcher, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+use+of+ATP+bioluminescence+as+a+measure+of+cell+proliferation+and+cytotoxicity.">The use of ATP bioluminescence as a measure of cell proliferation and cytotoxicity.</a> Journal of Immunological Methods. 160 (1), 81-88 (1993).</li><li>Mosmann, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+colorimetric+assay+for+cellular+growth+and+survival:+application+to+proliferation+and+cytotoxicity+assay.">Rapid colorimetric assay for cellular growth and survival: application to proliferation and cytotoxicity assay.</a> Journal of Immunological Methods. 65 (1-2), 55-63 (1983).</li><li>Berridge, M. V., Herst, P. M., Tan, A. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tetrazolium+dyes+as+tools+in+cell+biology:+new+insights+into+their+cellular+reduction.">Tetrazolium dyes as tools in cell biology: new insights into their cellular reduction.</a> Biotechnology Annual Review. 11, 127-152 (2005).</li><li>Malik, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Compounds+with+species+and+cell+type+specific+toxicity+identified+in+a+2000+compound+drug+screen+of+neural+stem+cells+and+rat+mixed+cortical+neurons.">Compounds with species and cell type specific toxicity identified in a 2000 compound drug screen of neural stem cells and rat mixed cortical neurons.</a> Neurotoxicology. 45, 192-200 (2014).</li><li>Schneider, C. A., Rasband, W. S., Eliceiri, K. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=NIH+Image+to+ImageJ:+25+years+of+image+analysis.">NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis.</a> Nature Methods. 9 (7), 671-675 (2012).</li><li>Carpenter, A. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=CellProfiler:+image+analysis+software+for+identifying+and+quantifying+cell+phenotypes.">CellProfiler: image analysis software for identifying and quantifying cell phenotypes.</a> Genome Biology. 7 (10), 100 (2006).</li><li>Cerbini, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transcription+activator-like+effector+nuclease+(TALEN)-mediated+CLYBL+targeting+enables+enhanced+transgene+expression+and+one-step+generation+of+dual+reporter+human+induced+pluriopotent+stem+cell+(iPSC)+and+neural+stem+cell+(NSC)+lines.">Transcription activator-like effector nuclease (TALEN)-mediated CLYBL targeting enables enhanced transgene expression and one-step generation of dual reporter human induced pluriopotent stem cell (iPSC) and neural stem cell (NSC) lines.</a> PLoS One. 10 (1), 0116032 (2015).</li><li>Lundholt, B. K., Scudder, K. M., Pagliaro, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+simple+technique+for+reducing+edge+effect+in+cell-based+assays.">A simple technique for reducing edge effect in cell-based assays.</a> Journal of Biomolecular Screening. 8 (5), 566-570 (2003).</li><li>Qie, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glutamine+depletion+and+glucose+depletion+trigger+growth+inhibition+via+distinctive+gene+expression+reprogramming.">Glutamine depletion and glucose depletion trigger growth inhibition via distinctive gene expression reprogramming.</a> Cell Cycle. 11 (19), 3679-3690 (2012).</li><li>Muelas, M. W., Ortega, F., Breitling, R., Bendtsen, C., Westerhoff, H. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rational+cell+culture+optimization+enhances+experimental+reproducibility+in+cancer+cells.">Rational cell culture optimization enhances experimental reproducibility in cancer cells.</a> Scientific Reports. 8 (1), 3029 (2018).</li><li>Carmichael, J., DeGraff, W. G., Gazdar, A. F., Minna, J. D., Mitchell, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+a+tetrazolium-based+semiautomated+colorimetric+assay:+assessment+of+chemosensitivity+testing.">Evaluation of a tetrazolium-based semiautomated colorimetric assay: assessment of chemosensitivity testing.</a> Cancer Research. 47 (4), 936-942 (1987).</li><li>Romijn, J. C., Verkoelen, C. F., Schroeder, F. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Application+of+the+MTT+assay+to+human+prostate+cancer+cell+lines+in+vitro:+establishment+of+test+conditions+and+assessment+of+hormone-stimulated+growth+and+drug-induced+cytostatic+and+cytotoxic+effects.">Application of the MTT assay to human prostate cancer cell lines in vitro: establishment of test conditions and assessment of hormone-stimulated growth and drug-induced cytostatic and cytotoxic effects.</a> Prostate. 12 (1), 99-110 (1988).</li><li>Jo, H. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+unreliability+of+MTT+assay+in+the+cytotoxic+test+of+primary+cultured+glioblastoma+cells.">The unreliability of MTT assay in the cytotoxic test of primary cultured glioblastoma cells.</a> Experimental Neurobiology. 24 (3), 235-245 (2015).</li><li>Kalinina, M. A., Skvortsov, D. A., Rubtsova, M. P., Komarova, E. S., Dontsova, O. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cytotoxicity+test+based+on+human+cells+labeled+with+fluorescent+proteins:+photography,+and+scanning+for+high-throughput+assay.">Cytotoxicity test based on human cells labeled with fluorescent proteins: photography, and scanning for high-throughput assay.</a> Molecular Imaging and Biology. 20 (3), 368-377 (2018).</li></ol>

L'objectif principal de cet article était de décrire une stratégie qui pourrait identifier efficacement et peu coûteux les composés affectant la croissance cellulaire dans un criblage à faible et modéré-débit. Deux techniques orthogonales ont été utilisées pour évaluer le nombre de cellules afin d'accroître la confiance dans les conclusions et d'offrir des informations supplémentaires qui ne seraient pas disponibles si un seul résultat était utilisé. L'un des essais a utilisé un imageur de cellules flu...

Une des caractéristiques les plus importantes qui doit être déterminée pour un composé chimique qui a un potentiel thérapeutique est sa toxicité pour les cellules animales. Cette caractéristique déterminera si un médicament est un bon candidat pour une étude plus approfondie. Dans la plupart des cas, des composés avec une toxicité minimale sont recherchés, mais il ya des situations dans lesquelles un composé avec la capacité de tuer des types de cellules spécifiques est d'intérêt, par exemple, les médicaments anti-tumorigènes. Bien que les animaux entiers soient les meilleurs systèmes modèles pour déterminer la toxicité systémique, le coût et la main-d'œuvre impliqués sont prohibitifs lorsque plus de quelques composés doivent être testés. En tant que telle culture de cellules de mammifères est généralement utilisé comme l'alternative la plus efficace1,2. Les écrans de drogue de petit à moyen débit sont une modalité importante par laquelle la toxicité peut être évaluée dans la culture cellulaire. Ces écrans peuvent être utilisés pour interroger les bibliothèques annotées ciblant les voies de signalisation individuelles. Le format général d'un tel écran est d'abord de tester tous les composés de la bibliothèque à une seule dose (généralement 10 M) dans un écran de toxicité primaire exploratoire, puis d'effectuer un écran de réponse de dose secondaire en profondeur pour caractériser pleinement la toxicité profil des hits de l'écran principal. Les méthodes de mise en œuvre de cette stratégie seront décrites ici et fourniront un moyen rapide, efficace et peu coûteux d'identifier et de caractériser les composés toxiques.
Plusieurs méthodes ont été développées pour évaluer la cytotoxicité des petits composés et des nanomatériaux dans les cellules de mammifères3,4. Il convient de noter que certains matériaux peuvent interagir avec le test fournissant des résultats trompeurs, et de telles interactions doivent être testées lors de la caractérisation des coups des écrans de toxicité4. Cytotoxicity essais comprennent trypan exclusion bleue5, lactate dehydrogenase (LDH) test de libération6, Alamar bleu essai7, calcien acétooxymethyl ester (AM)8, et l'essai ATP9. Tous ces essais mesurent divers aspects du métabolisme cellulaire qui peuvent servir de proxy pour le nombre de cellules. Bien que tous offrent des avantages, tetrazolium sel à base d'essais tels que 3-(4,5-dimethylthizol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromure (MTT), 2,3-bis(2-methoxy-4-nitro-5-sulfopheny)-2H-tetrazolium-5-carboxyanilide sel intérieur (XTT)-1, et 4-(3-[4- Iodophenyl]-2-[4-nitrophenyl]-2H-5-tetrazolio)-1,3-benzene disulfonate (WST-1)10,11 fournissent une bonne précision et une bonne facilité d'utilisation à faible coût. MTT, qui sera utilisé dans cette démonstration, est réduit à un formazan insoluble par une réductase mitochondriale et le taux de cette conversion est fortement corrélé avec le nombre de cellules. Cet exemple a été couramment utilisé à petite échelle et pour le dépistage des bibliothèques avec jusqu'à 2.000 composés12. Le comptage direct des cellules par un marqueur étiqueté offre une autre méthode pour évaluer le nombre cellulaire, et contrairement à l'analyse MTT, il peut fournir des informations supplémentaires sur la dynamique de la croissance cellulaire. Plusieurs algorithmes accessibles au public sont disponibles pour effectuer des analyses automatisées du nombre de cellules et il existe également des algorithmes propriétaires qui font partie de progiciels pour les lecteurs d'imagerie13,14. Dans cette description de méthode, une lignée de cellules souches neurales humaines (NSC) qui a été génétiquement modifiée pour exprimer de façon constitutive tdTomato15 servira de ligne d'essai pour comparer les résultats de viabilité cellulaire entre un essai de MTT et un comptage automatisé de cellules dans un écran évaluant la toxicité de 57 composés d'essai. Bien que l'objectif principal de cette stratégie était d'identifier et de caractériser les composés toxiques, elle a l'avantage supplémentaire d'identifier potentiellement les composés inhibiteurs de la croissance et la croissance et fournit ainsi une méthode efficace pour identifier les médicaments. qui peut moduler la croissance cellulaire.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:1292px;" width="1292">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">B-27 (50X)</td>
			<td style="width:237px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td align="right" style="width:119px;">17504001</td>
			<td style="width:720px;">Neural stem cell medium component.&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">BenchTop pipettor</td>
			<td style="width:237px;">Sorenson Bioscience</td>
			<td align="right" style="width:119px;">73990</td>
			<td>Provides ability to pipette compound library into a 96-well plate in one shot.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">BioLite 96 well multidish</td>
			<td style="width:237px;">Thermo Scientific</td>
			<td align="right" style="width:119px;">130188</td>
			<td>Any 96 well cell culture plate will work.&#160; We use these in our work.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Cell culture microscope</td>
			<td style="width:237px;">Nikon</td>
			<td style="width:119px;">Eclipse TS100</td>
			<td>Visual inspection of cells to ensure proper density.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Cytation 5/ Imaging reader</td>
			<td style="width:237px;">BioTek</td>
			<td style="width:119px;">CYT3MFV</td>
			<td>Used for cell imaging and absorbance readings.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">DMSO</td>
			<td style="width:237px;">Fisher Scientific</td>
			<td align="right" style="width:119px;">610420010</td>
			<td>Solvent for compounds used in screen. Dissolves MTT precipitates to facilitate absorbance measurements.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">FGF-basic</td>
			<td style="width:237px;">Peprotech</td>
			<td style="width:119px;">100-18B</td>
			<td>Neural stem cell medium component.&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">GelTrex</td>
			<td style="width:237px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">A1413202</td>
			<td>Neural stem cell basement membrane matrix.&#160; Allows cells to attach to cell culture plates.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Gen5 3.04</td>
			<td style="width:237px;">BioTek</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>Analysis software to determine cell counts for tdTomato expressing cells.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Glutamine</td>
			<td style="width:237px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td align="right" style="width:119px;">25030081</td>
			<td>Neural stem cell medium component.&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Microtest U-Bottom</td>
			<td style="width:237px;">Becton Dickinson</td>
			<td align="right" style="width:119px;">3077</td>
			<td>Storage of compound libraries.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">MTT</td>
			<td style="width:237px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">M6494</td>
			<td>Active assay reagent to determine cellular viability.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Multichannel pippette</td>
			<td style="width:237px;">Rainin</td>
			<td style="width:119px;">E8-1200</td>
			<td>Column-by-column addition of cell culture medium, MTT, or DMSO.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Neurobasal medium</td>
			<td style="width:237px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td align="right" style="width:119px;">21103049</td>
			<td>Neural stem cell base medium.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">RFP filter cube</td>
			<td style="width:237px;">BioTek</td>
			<td align="right" style="width:119px;">1225103</td>
			<td>Filter in Cytation 5 used to image tdTomato expressing cells.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">TrypLE</td>
			<td style="width:237px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td align="right" style="width:119px;">12605036</td>
			<td>Cell dissociation reagent.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a strategy to identify compounds that affect cell growth and survival in cultured mammalian cells at low-to-moderate throughput

La cytotoxicité est un paramètre critique qui doit être quantifié lors de l'étude des médicaments qui peuvent avoir des avantages thérapeutiques. Pour cette raison, de nombreux tests de dépistage de médicaments utilisent la cytotoxicité comme l'une des caractéristiques critiques à profiler pour les composés individuels. Les cellules en culture sont un modèle utile pour évaluer la cytotoxicité avant de procéder à un suivi des composés de plomb prometteurs dans des modèles animaux plus coûteux et à forte intensité de main-d'œuvre. Nous décrivons une stratégie pour identifier les composés qui affectent la croissance cellulaire dans une ligne de cellules souches neurales humaines (NSC) de tdTomato exprimant. La stratégie utilise deux essais complémentaires pour évaluer le nombre de cellules. Un exemple fonctionne par la réduction de 3-(4,5-dimethylthizol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromure (MTT) à formazan comme un proxy pour le nombre de cellules et l'autre compte directement le tdTomato exprimant NSCs. Les deux essais peuvent être effectués simultanément dans une seule expérience et ne sont pas laborieux, rapide et peu coûteux. La stratégie décrite dans cette démonstration a testé 57 composés dans un écran primaire exploratoire pour la toxicité dans un format de plaque de 96 puits. Trois des coups ont été caractérisés plus loin dans une réponse de dose de six points utilisant la même configuration de bout-de-vente que l'écran primaire. En plus de fournir une excellente corroboration pour la toxicité, la comparaison des résultats des deux essais peut être efficace pour identifier les composés affectant d'autres aspects de la croissance cellulaire.

Les données automatisées sur le nombre de cellules ont permis d'identifier onze composés dont la viabilité est inférieure à 25 % lorsqu'ils ont été normalisés au contrôle du DMSO, tandis que les données du MTT ont permis d'identifier ces mêmes composés plus deux autres(tableau 1 et tableau 2, rouge ombragé). Les deux composés jugés toxiques seulement dans l'assay MTT (puits F3 et G10) avaient 31% et 39%, respectivement, le nombre de cellules tdTomato-positives comme le co...

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A Strategy to Identify Compounds that Affect Cell Growth and Survival in Cultured Mammalian Cells at Low-to-Moderate Throughput

Il est souvent nécessaire d'évaluer la cytotoxicité potentielle d'un ensemble de composés sur les cellules cultivées. Ici, nous décrivons une stratégie pour dépister de façon fiable les composés toxiques dans un format de 96 puits.

Une stratégie visant à identifier les composés qui affectent la croissance et la survie des cellules mammifères cultivées à un débit faible à modéré

Cytotoxicity is a critical parameter that needs to be quantified when studying drugs that may have therapeutic benefits. Because of this, many drug ...

Ce protocole offre une stratégie rapide et efficace pour utiliser simultanément deux analyses pour filtrer plusieurs centaines de composés pour leurs effets sur la croissance cellulaire. Les analyses peuvent nous fournir des informations sur la question de savoir si des composés spécifiques sont cytotoxiques, inhibent la croissance cellulaire ou améliorent la croissance cellulaire. En utilisant les deux analyses ensemble, nous sommes en mesure d’augmenter la précision et d’identifier les composés cytotoxiques.Dans les cas où les résultats des deux analyses divergent, cette stratégie peut nous permettre d’identifier le composé avec des effets uniques sur la fonction cellulaire qui peuvent être examinés plus avant par d’autres moyens. Le principal avantage de cette stratégie est qu’elle est rapide, peu coûteuse et non intensive en main-d’œuvre. Une fois maîtrisé, il permet aux chercheurs d’effectuer facilement un écran primaire de jusqu’à 200 composés en une semaine, puis d’effectuer une courbe de réponse de dose exhaustive sur 10 à 15 composés dans une autre semaine.Rohini Manickam, scientifique du personnel et boursier post-baccalauréat du laboratoire, fera la démonstration de la procédure. Tout d’abord, dans un cabinet de sécurité biologique, les cellules de culture dans un flacon T75 avec milieu NSC de sorte qu’ils seront au moins 80% confluent au début de l’essai. Et placez le flacon dans un incubateur de culture cellulaire fixé à 37 degrés Celsius et cinq pour cent de dioxyde de carbone.Une fois que les cellules atteignent 80% de confluence, retirez le flacon de l’incubateur et aspirez le milieu NSC. Ajouter trois millilitres de réaccente de dissociation cellulaire et incuber pendant cinq minutes dans l’incubateur. Après l’incubation, ajouter sept millilitres de milieu NSC dans le flacon, et pipette vigoureusement pour s’assurer que toutes les cellules se détachent.Transférer la solution cellulaire dissociée dans un tube de 15 millilitres et la centrifugeuse à 200 fois G pendant cinq minutes. Retirer le supernatant du tube et suspendre à nouveau les cellules en 10 millilitres de milieu NSC. Utilisez un compteur de cellules automatisé ou un hémocytomètre pour compter les cellules, et ajoutez un milieu NSC dans le tube pour réajuster la concentration des cellules à 200 000 cellules par millilitre.Ensuite, en utilisant six des huit fentes d’un pipettor multicanal à huit canaux pour plaquer 100 microlitres de la colonne de mélange cellulaire par colonne dans 60 puits intérieurs de trois 96 plaques de puits qui ont été enduits par matrice extracellulaire. Ajouter 100 microlitres de milieu de base ou de milieu NSC à tous les puits sans cellules afin de minimiser l’évaporation potentielle des puits ultrapériphériques contenant des cellules. Sous un microscope à culture cellulaire, inspectez visuellement au moins 10 puits sur chacune des trois 96 plaques du puits pour confirmer que les cellules sont assises à la densité prévue.Incuber à 37 degrés Celsius et cinq pour cent de dioxyde de carbone. Retirez les plaques de culture cellulaire de l’incubateur 16 à 24 heures après le fractionnement et aspirez la colonne moyenne NSC par colonne avec un pipettor multi-puits à huit canaux, en utilisant seulement six des huit fentes multi-puits. Ajouter 95 microlitres de milieu NSC frais à chaque puits des trois plaques de répétition, et remettre les plaques dans l’incubateur.Avec un pipettor multi-puits à huit canaux, ajouter 49 microlitres de milieu NSC dans chacun des 60 puits intérieurs d’une plaque de puits vide à fond U, à fond V ou à fond rond de 96 puits. Désécèlez la plaque composée principale préparée. Pipette un microlitre du composé de la plaque principale dans chacun des 60 puits intérieurs contenant nsc moyen, et mélanger le composé dilué trois fois avec un pipettor dessus de banc.Ensuite, retirez les trois 96 plaques de puits de NSC de l’incubateur et distribuez cinq microlitres du composé dilué dans chaque puits des trois plaques qui contiennent des cellules pour produire une dilution d’un à 1000 pour la concentration composée finale de 10 micromolaires avec une concentration de DMSO de 0,1% cellules d’incubation avec composé pendant 72 heures, et procéder à des analyses de cytotoxicité. Pour effectuer l’analyse de réponse de dose, installez un puits 96. Utilisez la colonne deux pour six répliques de contrôle DMSO, et testez les triplicates de jusqu’à trois composés différents à deux dilutions en série, à six doses, en commençant par une dose élevée de 10 micromolaires.Diluer quatre microlitres de 100% DMSO ou composé d’essai dans DMSO en 196 microlitres de milieu NSC dans un tube de microcentrifugeuse de 0,5 ou 1,5 millilitre. Ajouter 25 microlitres du DMSO dilué pour contrôler les puits, et 50 microlitres des composés d’essai dilués à leurs puits correspondants. Pipette 25 microlitres de NSC moyens aux puits vides restants dans la partie intérieure de la plaque de puits 96.À l’aide d’un pipettor multicanal, transférer 25 microlitres du composé des puits de 10 micromolaires vers les cinq puits micromolaires et mélanger au moins cinq fois. Remplacez les pointes de pipette et répétez le processus en mélangeant les rangées restantes pour générer des triplicates à deux dilutions pour un total de six doses pour chacun des composés. Transférer cinq microlitres de chaque dilution dans une nouvelle plaque avec des cellules de culture qui sont testées.Placez la plaque dans l’incubateur à 37 degrés Celsius et à 5 % de dioxyde de carbone. Une fois que les cellules ont été incubées pendant 72 heures, retirez la plaque de l’incubateur et placez-la à l’intérieur du lecteur de plaque. Ouvrez le logiciel d’imageur pour configurer des fichiers de protocole et d’expérience pour l’étude.Passez au mode Manuel imager sur Task Manager et cliquez sur Capture Now. Choisissez 96 plaques de puits comme type de navire. Sélectionnez 10 fois pour le grossissement, et la protéine fluorescente rouge 531 et 593 pour l’imagerie tdTomato.Cliquez sur un puits. Cliquez ensuite sur Autofocus pour concentrer l’image, et Exposer automatiquement pour un temps d’exposition approprié. Ajustez manuellement la mise au point et l’exposition si nécessaire.Cliquez sur l’icône de la caméra pour capturer l’image. Cliquez ensuite sur Processus Analyser l’image ci-dessus pour continuer à construire le protocole. Et sélectionnez l’onglet Analyse.À droite de l’image, cliquez sur Analyse cellulaire dans Ajouter l’étape d’analyse et cliquez sur Démarrer. L’image montre les cellules surlignées pour indiquer chaque cellule individuelle. Cliquez sur la sélection Options pour modifier les paramètres afin de mieux sélectionner les cellules en fonction du seuil de fluorescence ou de la taille des cellules.Si l’imageur compte correctement les cellules, cliquez sur Ajouter étape en bas de l’écran. Cliquez sur l’icône en haut de l’écran pour créer une expérience à partir de l’ensemble d’images. Et sur la fenêtre ouverte, cliquez sur Procédure sous l’onglet Protocole.Ensuite, dans la nouvelle fenêtre qui s’ouvre, sélectionnez Lire. Cliquez sur Plaque complète pour sélectionner uniquement les 60 puits qui contiennent les cellules. Cliquez sur OK pour enregistrer les modifications.Cliquez ensuite sur OK dans la fenêtre Procédure. Cliquez sur l’icône Lecture pour exécuter la plaque. Dans l’invite, enregistrer le fichier, puis dans l’invite plaque de chargement, cliquez sur OK. À la fin de l’imagerie, téléchargez les données du nombre de cellules du logiciel imageur sur une feuille de calcul pour analyse.Dans les deux heures suivant l’achèvement de l’imagerie tdTomato, commencez l’analyse MTT. Pesez 25 milligrammes de MTT et suspendez-le en cinq millilitres de milieu NSC pour faire cinq milligrammes par millilitre de solution de stock MTT. Vortex la solution pendant plusieurs minutes, jusqu’à ce qu’il n’y ait pas de précipités visibles de MTT.Retirer les plaques de culture cellulaire de l’incubateur et aspirer hors milieu de culture cellulaire. Diluer le MTT de un à 10 dans le milieu frais du NSC et ajouter 100 microlitres du MTT dilué à chaque puits de cellules. Incuber les cellules à 37 degrés Celsius pendant deux heures.Un précipité violacé est visible à peu près proportionnellement au nombre de cellules dans le puits. Aspirez la solution MTT des plaques et ajoutez 50 microlitres de 100% DMSO à chaque puits. Déposer les assiettes sur un shaker à température ambiante pendant 10 minutes à 400 rPM.Après cela, transférez la plaque à un lecteur de plaque. Lisez l’absorption de chaque puits à la longueur d’onde prédéfinie de 595 nanomètres et exportez des données vers une feuille de calcul pour analyse, exactement comme pour les données sur le dénombrement cellulaire. L’examen des images de fluorescence de tdTomato a indiqué deux puits discordants pour la toxicité entre le MTT et l’essai de compte de cellules.Pour un puits, les données sur le dénombrement cellulaire ne laissaient aucune toxicité. Mais les données du MTT l’ont fait. Un autre puits avait surestimé le nombre de cellules par MTT par rapport au nombre de tdTomato, et semblait avoir de plus grandes cellules, tandis que dans les puits où MTT sous-estimait le nombre de cellules par rapport à tdTomato, les cellules semblaient plus petites.En résumé, l’essai de tdTomato a classé 11 composés comme toxiques, 11 comme inhibiteur de croissance, et un comme amélioration de croissance, avec 34 n’ayant aucun effet apparent sur la croissance cellulaire. L’essai de MTT a classé 13 composés comme toxiques, deux comme inhibiteur de croissance, et un comme amélioration de croissance, avec 41 n’ayant aucun effet apparent sur la croissance cellulaire. Le graphique des cellules viables pour le composé WP1066 montre une courbe relativement plate sans toxicité pour les quatre concentrations les plus faibles.La courbe tombe rapidement à la dose de cinq micromolaires, et tombe à la toxicité presque complète à 10 micromolaire, ce qui conduit à la dose létale 50 comme 4,4 et 6,0 micromolaire pour l’essai tdTomato et l’essai MTT. Il est essentiel que les composés soient correctement dilués dans l’écran de réponse à la dose afin que la courbe de réponse à la dose correcte soit générée. Les composés identifiés par cette procédure pour affecter la croissance cellulaire peuvent être davantage caractérisés par des analyses fonctionnelles pour identifier des voies de signalisation potentiellement nouvelles qui contrôlent la croissance cellulaire.Les composés toxiques pour les cellules souches neurales ont été testés comme agents thérapeutiques potentiels pour les cancers du cerveau, tels que le glioblastome et le neuroblastome. Portez toujours des gants et un manteau de laboratoire lorsque vous manipulez des cellules mammifères, du DMSO et du MTT. Éliminez DMSO et MTT selon les directives sur les déchets chimiques de votre établissement.

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